Flavobacterium sp. SLB02: GIY83_16065
Help
Entry
GIY83_16065 CDS
T10548
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase
Organism
flz Flavobacterium sp. SLB02
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
DUF7517
DUF5382_C
AmiA-like
SP24
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGK75531
LinkDB
All DBs
Position
4336189..4339092
Genome browser
AA seq
967 aa
AA seq
DB search
MDLSNSFQFCFDISFEKNLNHYIPTAYIVENTDDIKYLNKKATKDVLESFFIVFDQLDPE
TKKILTACESLKPEFIFKKFSTKIKSAKTIADLQKDSKIEFAIRQHLQLNLGTFYTLILQ
KQFPLSLNMSPEKDFYRSRVNTNPLHFEPQIEFNKHAEGITYTLSLKENETLFLPMNSSV
EILLDEPSWLIIDKKLGQLKDLNAKKLMPFLKKKSIEIPSKLVDNYFKSFIPEIAKKIDI
EATGFEIEHRDQIISSTIQPVFDFFKNCYYLNLYFDYNGYSFDSSKTKKTHSFVDFSVAN
EPKIIQFKRSADEALYTDKLSELGLVKIKNELFGLNSDTENPDPYVNIQFVIDHKEELES
LGFTILNLKLESKEIIAENHTISASKEETKEDWFDIRIIITIGAYTINFSEIIPNIKSKE
RLFLLPDGNYFLIPLEWLSKYGSLAKLAKKENANLLLRKSNFAALDAIPEIKDDIIHKAE
YTSSDLLKASLRPYQIDGVKWLLGHFNSNLGACLADDMGLGKTLQTLAVLVAVQEQLGFT
TKTTNFDLFQNETTIERAPLKALIVLPSSLVFNWFNEAGKFTPHFSKMQYVGNDRKLLAS
RLASTDLIFTSYSIVHRDISILEKYDFRYLILDESQYIKNKNSKIFKAITKINTAHKIAL
SGTPIENSLDDLWSQMQFINPDILGSYDFFAQNFKIPIEKKQDENTLSELKNLIQPYILR
RTKEQVLKDLPELTEQIYYCDMDPEQEKLYEKEKSKARNFLLKTDGSSPDKISIINTLMK
LRQLSNHPKMVDQESEIDSGKYNAVTNYLETLIKEKQKAIIFSSFVTNLHFYTDWCKENK
IDFCEITGETPANKREQQVKLFQEKEKPLLFFISLKAGGVGLNITKASYVLFLDPWWNPF
AEKQGVGRAHRIGQMNKVNVIRFISKNTVEEKIIKLQENKKLLSDSLLEESYINDEIQVN
LEYILSS
NT seq
2904 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggatctttcaaattcatttcaattttgttttgatatcagttttgaaaaaaatctgaat
cattatattccaactgcctacatcgttgagaataccgatgacattaaatatttaaataaa
aaagctactaaagatgtacttgaaagtttttttattgtttttgatcaattagatcctgag
acaaaaaaaatattgacggcttgcgaatcattaaagcctgagtttattttcaaaaaattt
agtacaaaaatcaaatcggcaaaaacaattgctgatttgcaaaaagattccaaaattgaa
tttgccattcgtcagcatttgcagctaaatttgggcactttttatactttaatcctacaa
aagcaatttccgttgtctcttaatatgagtcccgaaaaggacttctatagatccagagtc
aacaccaatccattgcattttgaacctcagattgaatttaacaaacatgccgaagggatt
acgtataccttatctttaaaagaaaacgaaactttatttttaccaatgaacagcagtgtc
gaaatactgctggatgagccaagctggttgattattgataaaaaactagggcagttaaag
gatcttaatgctaaaaaactgatgccgtttttaaagaaaaagtcaatcgaaataccttca
aaattagttgacaattattttaaaagcttcattcctgaaatagcaaaaaaaatagacatt
gaagctactggttttgaaattgaacatcgtgatcaaattatatcaagcacgatccaacct
gtttttgatttctttaaaaactgctattacctcaacctctattttgattataacggttat
tcgtttgacagcagtaaaacaaaaaaaacacattcgtttgttgattttagcgttgccaac
gaacctaaaatcattcagtttaaacgcagcgccgatgaagctttatacactgacaaatta
tctgagcttggtttagtaaaaatcaaaaacgagttattcggattaaattctgacacagaa
aaccctgatccttacgtcaatattcaatttgttattgatcataaagaagaactggaaagc
ttaggatttacaatcctgaatttaaaactggaaagcaaagaaatcattgcagaaaatcat
accatttcagcctcaaaagaagaaacaaaagaagactggttcgacattagaataatcatt
acaattggcgcttatacgatcaatttcagtgaaattattcccaatataaaaagcaaggaa
agactctttttattgcctgacggaaactattttctgattccgctggaatggttgagcaaa
tatggttcactggcaaaattggccaaaaaagagaacgcaaatttacttttgcgtaaaagt
aattttgctgctttggatgcgattccggaaatcaaagacgatattattcacaaagcagaa
tatacctcttctgatttattaaaagcttcattaagaccttatcagatcgatggcgtaaaa
tggcttttaggtcattttaattctaatctgggtgcttgtctggctgatgatatgggtctt
ggtaaaacattacaaaccctggccgttttagtcgcggtacaggaacaactgggatttact
actaaaacgaccaattttgacttgtttcagaatgaaactactattgaaagagcccctttg
aaagctttgattgttttaccttcttcattggtttttaactggtttaatgaggctgggaaa
ttcacaccgcatttttcgaaaatgcaatatgtgggcaatgacagaaaattattagccagc
agattagcctcaactgatttgatttttacgagctacagcattgttcatcgtgatatttca
attttagaaaaatacgattttcgttatttaattttagacgaaagtcaatacattaaaaat
aaaaattctaagatttttaaagccattaccaaaataaatacggctcataaaattgcctta
agcggtactcctatcgaaaattcgttagatgatttatggtcgcaaatgcaatttataaat
ccggatattttgggcagttatgatttttttgctcagaattttaaaatccctattgagaaa
aagcaggacgaaaacactttgtctgaactaaaaaacctcatccagccttatattttaagg
agaaccaaagaacaggttttgaaagatttaccggagttaaccgagcagatttactattgc
gatatggatcctgaacaggaaaaattatatgaaaaagaaaaatcgaaagcgcggaacttt
ttgctaaaaacagacggatcaagtccggacaaaattagcattatcaatacactgatgaag
ttaaggcagctgagtaatcatccgaaaatggtcgatcaggaatcagaaattgattccgga
aaatataatgctgtcactaattatctcgaaacgttaataaaggagaaacaaaaggcgatc
atttttagttcgtttgtgactaatttgcatttctatacagattggtgtaaggaaaacaaa
atagatttttgtgagattacaggcgaaactcctgccaataaaagagaacaacaggtaaaa
ttgtttcaggaaaaagagaagcctttattattctttatttctctcaaagcgggtggcgtt
ggtctgaatattaccaaagcttcgtatgttttgtttttagatccttggtggaatcctttt
gctgaaaagcaaggagttggaagggcacatagaattggtcaaatgaataaagtaaatgtt
atacgatttatttcgaaaaatacggtagaggaaaaaatcatcaaattgcaggaaaacaaa
aagttattatctgattcgcttttagaagagagttatatcaatgacgaaatccaagtgaat
ttagaatacattttgagttcttaa
DBGET
integrated database retrieval system