Finegoldia magna: FMG_P0146
Help
Entry
FMG_P0146 CDS
T00661
Name
(GenBank) putative collagen adhesion protein
Organism
fma
Finegoldia magna
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpaA
SdrD_B
bMG3
CarboxypepD_reg
DUF7601
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAG09195
UniProt:
B0S4K4
LinkDB
All DBs
Position
pFMC:complement(139070..145264)
Genome browser
AA seq
2064 aa
AA seq
DB search
MDIFKKISKTFITFLLTLMLIFQSVISSFVGATTSFAGNEQNLATITIENTENGTLLFEK
TRNKSITNKKGSNIMVLVKPNFGYDTKSIKMETSDKKVLDLPVHEGKANIPVIRNAKISA
NFTKSNSEPAQVDEEAKQDDFSSSIEKEKKENEKADKEDKRDKSTKDSIEDSKIIAEILL
KSDRTKVGQGTSVVAKDIVTVANTVINMRKTKARNLDELWKDRDGDGISDDWMAVEGQFD
SIIPLYEVDENANYYVAKPNLAKIENSQLLQYIIADSNRSGTLLKTVIYEKESGLLYVPK
NILYPCDIKDKENKKDFARLGRTRIQFLLGINDEIDKTKTDVEVKIDKNDSVKGDVVVSG
KASINTMSDDTKIVLAKDSESKKSIKANSIDEIRVNGHEVNLNDVTYYEKEGVLELPLKP
AQADSIEIKMSNSLMKEITNTIGSLTSFIKPLISFAGEPSKKIEKVIYFTSTPRKGDWWH
LRGDNNTRDVNDYGARFPEPGYEKTYATNTYSDSKQRIRTTVKMILQNQLSQADADRISR
EMGTERGTQYYSRNSYVSAQTATGSGNADMIIKQGFGLSLNCAHAGVNDQFLWDPNYANE
GARSDHEGVVVRLLDTDGSSWALFAVVSPSQSTQAGYGFFGANINVTTTIDEGGGDDTGG
GSGKYGFRVKKVDDGTGEALRGATFKVTQLLTWGESAPTQYKTTGSSGILTFDGLPAGTY
EIEEVGPPTGYKKIDSTQTIKLPDEDGYRVTFRNVRKEILPPPPVRPPKKGDYAILVTKT
DGYTNTPITGYVTSTAKFRVTDPDGNIVWANKYPNSSMANAYLADESSYNRDFELDSSTG
SFGILGLTKKGTYKVEEVDAPSGYNKSFTTQTVSVSDSQEIGSLSFPNFRTPTPEPPTPE
PEPKETKLILDKKDEESRSPIEGAVFKLYKHYNGRKTEIEVASIGDGEYIEGSLDIYGRL
KAPYMTTNARGQISVKIKDAGSDYKYSFEEVSPADGYSMPYNPETDKDWVVEGSYENFEM
TNKKKNKETPPPSSGTTKILFSKKDSRTGNAIPESKRYYAEFELIDPNGNVVHLRENRKV
TKSEYNFTFPYKVEESKYTVDNYSNNTKIRLSNGITTEINGISKPGRYKIREIKPPAGYK
KANYPVDFEISRTDIDLDLMKFIEMNNEPDTPIDLTIRKIDSTNKELIKNNSAKFKLEDS
EGNRVVFKEISEGNYVVDYEADYPQTEMKLGKDGTIKISGLYQNGMYKLTELEQPSGYEL
SSSPLTFNVKQKQNTISFENKPTPKPQDGIIRVHKVDTYNESNKLKGVVFELLDSNKRTI
RVKETNAEGIAEFTGLEYGEYFIREKKPIAGYALNSTVREAKIYSYYKELDITVYNRREF
GSLTLWKFGTDSKKQIGKGALFKLYRKIDKGSIVKTEQVNLYFNKKENRYEELVLKDQLE
NPSDAESVNNILDIGKSGESEISVRVNRLSSSLLGEKVSYYFEEIKAPEGYKLPVNPKSS
EVELDNDKNNTKLINMYNEPIEKYNILVTKVDSTTNKAITDATKLQNAEFRLKDPDGKDV
YITKVSDGVYKKDSSYNYTMKLSNEGKLKIQDLDKKGKYTLTEVKAPTGYQLSNTPLVCD
VVNKDNSFTFKNTQIPKDGIVRITKKDLKTGDVLSGVVFELLDSTKQVVKTATTNSQGIA
EFTGLKYGNYYVREKSTKAGYILKTDLEQARITSTYKIEKLTIYNEKELYNLSVTKVDSK
TGKAIVDSEKLKNAEFRLKDPDGKDVYITKVSDGVYKKDSSYNYTMKLSNEGKLKIQDLD
KKGKYTLTEVKAPTGYQLSNTPLVCDVVNKDNSFTFKNTQIPKDGSVTIIKKDSKNQKVL
SGVTFELLDKDKRLITTSKTGSTGIAGFSNLEYGKYYIREKETISGYKLDSRLHEVNISN
AKKSIALSLYNEPIEKTIKVIKKDNNGELLKDAEFTLFKKDGSKLTKVESKVTNTKGEIE
FSNLRIGQYVLRETKAPNGFRPYSEDMEIDLTKQVSPVYTVTLNNYKVEENIPSTGTRGA
TMFLASGLGIIMLAYIFKKRKIFA
NT seq
6195 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatattttcaagaaaattagtaaaacttttataacttttttattaacgttaatgctg
atttttcaatcagtaatatcttcatttgttggagctacaacttcctttgcgggaaatgaa
cagaatctagcaacaattactatagaaaacacagaaaatggtacgttgttgtttgaaaaa
actagaaacaaatcaataactaataaaaagggttcaaatattatggttttagtaaagcca
aactttgggtatgatacaaaatcgattaagatggaaacaagcgataaaaaggttttggat
ttaccagttcatgaagggaaggcaaacattcctgttattagaaatgctaaaatatctgca
aattttacaaaatctaatagcgaaccggctcaagttgatgaagaggctaaacaagatgat
tttagttctagtatagaaaaagaaaaaaaagaaaacgaaaaagctgataaagaagataag
agagataaaagtactaaagatagtattgaggattcgaagataattgctgaaatcctttta
aagtcagatagaacaaaagtaggtcaaggtacaagcgtagtcgctaaagatattgtcact
gttgcaaatacagtaattaatatgagaaaaacaaaagctcgaaatctagacgagctttgg
aaagacagagatggtgacggaatatcagatgattggatggcagtagaggggcaatttgat
agtataatcccattatacgaagtagatgaaaatgcaaattattatgttgctaaacctaac
ttagcgaaaatagaaaattcacagttattacaatatataattgcagattcaaaccgttct
ggtactcttttaaaaactgtaatatatgaaaaagagtcaggattattatatgttcctaaa
aacatattatatccatgcgatataaaagataaagaaaacaaaaaagattttgctagatta
ggaagaacacgtattcagtttttattaggaattaatgatgaaattgataaaacaaagaca
gatgtagaagttaagattgataaaaatgattcagtaaaaggggatgtagtagtcagcggt
aaagcatcaattaatacaatgtctgatgataccaagattgtattagcaaaagatagtgaa
tcaaaaaaatcaatcaaagcaaattctatagatgagattcgtgttaacggtcatgaagta
aatttaaatgatgtaacttattacgaaaaagaaggcgtactagaattaccgttaaagcca
gcccaagccgattcaattgaaataaaaatgtctaattctcttatgaaggaaataaccaac
acaataggttcattaacatcttttataaaaccattgatttcttttgcaggcgagccatca
aagaaaattgaaaaggtaatttattttacatcaactcctagaaaaggagattggtggcat
ctaagaggggataataacacaagagacgtaaatgattacggagcaaggtttccagaacca
ggatacgagaaaacttatgcaactaacacttatagtgattctaaacaaagaataaggaca
acagttaagatgattttgcaaaatcaactttctcaagcagacgctgatagaattagtaga
gaaatgggtactgaaagaggaacacaatattatagcagaaattcgtatgtgagtgctcag
acagcaacgggttcaggaaatgcagatatgattattaaacaaggtttcggactaagttta
aactgtgcacatgcaggcgtaaacgatcaatttttatgggatccaaattacgctaatgaa
ggagcaagaagtgatcacgaaggtgttgtagtaaggctattagatactgatggtagttct
tgggcattattcgcagttgtttctccgtctcaaagtactcaagcaggatatggattcttt
ggtgctaatataaatgttacgacaacaatagatgaaggtggtggagacgatactggtggt
ggtagtggcaagtacggtttccgagttaaaaaagtagatgacggtacgggtgaagcctta
agaggggcaacatttaaagtaactcaattactaacttggggagaatctgctcctacacaa
tataaaacaacaggatctagtggaattctaacatttgatggtttaccagcgggaacgtat
gaaatagaagaggtagggccacctacaggttataaaaaaattgattcgacacaaactata
aaattgccggatgaggatggatatcgagtaacatttagaaatgtaagaaaagaaatactt
cctcctccaccagtaagaccacctaagaaaggtgattatgctatactagttacaaaaacg
gatggatatactaacacgcctataacaggttatgtgacaagtacagccaaatttagagta
actgatccggatggaaatatagtatgggctaacaaatatccaaatagcagcatggcaaac
gcatatttagctgatgaatcttcttataatagagattttgagctggattcaagtactggt
tcttttgggattttaggattaactaagaaaggaacttataaggttgaagaagtcgatgca
ccaagtggttataataagagttttacgactcaaactgttagcgtatcagatagtcaagaa
atagggtcactaagttttccgaactttaggactcctactccagagcctcctactccagag
cctgaacctaaagaaactaaattgattttagacaaaaaggatgaagaaagtagatcacct
atagaaggagctgtctttaaactttataaacattacaatggtagaaaaactgaaattgaa
gttgcttctattggagatggcgaatatattgaaggaagtcttgacatatacggaagatta
aaagcaccttatatgacaacaaatgcaagaggtcagataagtgttaaaataaaggatgct
ggaagcgattataaatacagttttgaagaggttagtccggcagatggatattctatgcct
tataatccagaaactgataaagactgggttgttgaagggtcttatgaaaacttcgagatg
acaaacaagaagaaaaacaaggaaacgccgcctccaagctctggaacaactaagattctt
tttagcaaaaaggattcaagaactggaaatgcaataccagaatctaaaaggtattatgcc
gaatttgaactaatagatccaaatggtaatgttgttcacctaagagaaaatagaaaagta
acaaagagtgagtataatttcacattcccttataaagttgaagaatccaagtatacggta
gataattattctaataacacaaagattagattgtccaatggtattactaccgagataaat
ggaatttcaaaaccaggtagatataagataagagaaattaaacctccagcaggatataaa
aaagctaattatccggtagattttgaaattagtagaactgatattgatcttgacctaatg
aagtttattgaaatgaacaatgagcctgacacaccaatagatttaacaattaggaagata
gattcaactaataaagaattaataaagaataattctgcgaagtttaagttagaagattca
gaaggaaatagagttgtatttaaagagattagcgagggtaattatgttgtagattacgag
gccgattatcctcaaacagaaatgaagctaggtaaagatggaacgataaaaatatctgga
ttatatcaaaacggtatgtataagttaacagagttagaacaaccgtcaggttatgaatta
tcgtcatctccattaacatttaacgtaaaacaaaaacagaacacgataagttttgaaaac
aaacctactccaaagccacaagatggtattattagggttcataaagtcgatacctataat
gaaagcaataaattaaagggtgttgtttttgaattgttggatagtaataaaagaacaatt
agagttaaagaaactaatgccgaaggaatagcagagtttacaggtcttgaatacggagaa
tattttattagagaaaagaagccgatagcgggttatgctttaaatagtactgttagagaa
gcaaaaatatactcatattataaagaactagatattacagtatataataggagggagttt
ggctcattaactctttggaagtttggaacagattctaaaaaacaaataggtaagggtgct
ttgtttaagctttatagaaagatagataaaggatcaattgtaaaaacagaacaagttaat
ttatattttaataaaaaagaaaatagatatgaggaattggttcttaaagaccaattagaa
aatccttcagatgctgaatctgttaataatatcttagatataggaaaatcaggggaaagt
gaaatctcagtaagagtaaacagattaagtagctcgttattgggtgaaaaggtaagttat
tattttgaagaaataaaagctccagaaggatataagcttccggtaaacccaaaatcaagc
gaagtagaattagacaacgataagaataatacgaagctaatcaacatgtacaacgaacct
attgaaaaatataatatcttggttactaaggtggattcaacaacgaacaaagcaattaca
gatgcaacaaaacttcaaaacgcagaatttaggttaaaagacccagatggaaaagatgta
tatattacgaaagtatctgatggtgtatacaaaaaagatagttcatataactatacaatg
aaactttcaaatgaaggtaagttaaagatacaagatttggataaaaaaggtaaatataca
ctaacagaggttaaggcaccaactggatatcaattgtctaatactcctttggtttgtgat
gtagtgaataaggataactcttttacttttaaaaacacacaaattccaaaagatggaatt
gtaagaataacgaaaaaagacctaaaaacaggtgatgttttatcaggagtagtgtttgag
ttattagatagcactaaacaagtagtaaagacagcaacaacaaattcgcaaggtatagct
gaatttacgggcttaaagtatggtaattactacgttagagaaaaatcaacaaaagcagga
tatatactaaaaactgatttagaacaagctaggataacaagcacatataaaatagaaaag
ctaacaatctataatgaaaaagagctttataatttgtctgtaactaaagttgattctaaa
acaggaaaggcgatagtagattcagaaaaactaaaaaatgcagaatttagattaaaagac
ccagatggaaaagatgtatatattacaaaggtatctgatggtgtgtataagaaagatagt
tcatataactatacaatgaaactttcaaatgaaggtaagttaaagatacaagatttggat
aaaaaaggtaaatatacattaacagaggttaaggcaccaactggatatcaattgtctaat
actcctttggtttgtgatgtagtgaataaggataactcattcacatttaaaaacacacaa
attccaaaagatggttcagtaacaattattaaaaaggattctaagaatcaaaaggttcta
tcaggagttacgtttgaattgttagacaaggataaaaggttaattacgacatccaagaca
ggatcaactggtatagctggatttagtaatttagaatatggtaaatattatattcgtgaa
aaagaaactatcagtggatataaactagattcaagattacacgaagtaaatatcagtaac
gcaaagaagtcaattgcattatctttatacaatgaacctatagaaaagactataaaagta
attaaaaaagataataatggcgaacttcttaaagatgctgaattcactttatttaagaaa
gatggttcaaagttaactaaagtcgaatcaaaagtaactaatacgaaaggtgaaattgag
ttttctaatctaagaataggtcaatatgtattaagagaaacaaaagctcctaatggattt
agaccatattctgaagatatggaaatcgacttaacaaaacaagtgtctccggtttatact
gtgacattgaacaactacaaagtagaagaaaatataccttcaactggaactaggggagct
actatgttcttagcttcaggattaggtatcataatgctagcatatatctttaaaaagaga
aaaatatttgcttag
DBGET
integrated database retrieval system