Flavobacterium nakdongense: RF683_02085
Help
Entry
RF683_02085 CDS
T10681
Name
(GenBank) leucine-rich repeat domain-containing protein
Organism
fnd Flavobacterium nakdongense
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF7619
LRR_4
Por_Secre_tail
LRR_8
LRR_EndoS
LRR_At1g61320_AtMIF1
LRR_LRWD1
LRR_Zer-1
CLIPPER
RSN1_TM
ORF11_beta
EF-hand_5
CHU_C
Band_7
CLIPPER_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMW78255
UniProt:
A0ABY9RCB7
LinkDB
All DBs
Position
465576..468257
Genome browser
AA seq
893 aa
AA seq
DB search
MKKFNTLSFLFLVIVTQAQIVNIPDANFKAKLLQASSSNTIASSQSPVYNATDGTLSVTS
YNNIDANNDGEIQVTETQAIKWLNIENSSILNLTGLDAFINLQYLDCGFNHLTTLDVSGL
TNLQQLYCSQNQLTSLNVSGLSNLQYLSCGNNQLTSLNVSGLSNLQDLNCDSNQLTTLNV
SGLSNLRRLDCSTNQLTTLNVLGLSNLQSLGCSTNQLTSLNVSGCTNLQYLDCSGDQLIT
LNVSGCTNLIRLYCNFNELTSLDVSGLTNLQHLFCYQNQLTTLNISGCTNLSSLSCANNQ
LTSLNVSGLSNLQYLSCGNNQLTSLNVSGLSNLLHLLCYQNQLTSLNVSGFTNLQSLSCA
NNQLTSLNVSGLSNLRTLLCFSNQLTTLFINNGNTNWQDLVFSSNPNLHYICADEEDLIL
VQNKINQYGMGSTCHVNSYCSFTPGGTFYTINGNNRLDSNNNGCDASDGLYRNLKINITN
GTQSGSLIANEAGNYSIPVQAGTHTLTPVFENPSYFNVSPATTTVSFPSQSSPFVQNFCI
TANGVHHDLEVTVVPIGVARPGFDAAYKIVYKNKGNQIENASLTFGYNDNVMDFINASVA
TTSQVVGQLSWNLGNLAPFQSGTITVSFNLNTPIETPPLNAGNVLAYTATISLIAIDETP
TDNAFTLNQTVVNSYDPNDKTCLEGPIINPSKIGDYVTYQIRFENTGTFPAQNIVVKDMI
DTAKFDVSMLQIINSSHTCYAKITGNKVEFIFENINLPFADATNDGYVVFKIKSLPTLTV
NSTVSNSASIYFDYNFPIITNTATSTYQLLNANSFVFENEFALYPNPVKDNFAIKTKNSL
EIQSLEIYNTLGQIVLAIPRFSENVDVSSLQRGTYLVKVNTEKGSSGVRIIKE
NT seq
2682 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatttaacacattatcgtttctttttcttgtaatagttacacaagcacaaata
gtaaatatcccggatgctaattttaaagcaaagttgttgcaagctagttcttctaatact
attgcttcctcacaatcacctgtttataatgctactgatggaactttgtctgtaacatca
tataacaacatagacgccaataatgacggagaaatacaagtaacagaaacacaagctata
aaatggttaaatattgaaaattcttcaattttaaacctaacaggtttagatgcttttata
aatttgcagtatttggattgtggttttaatcatttaaccaccttagatgtttccggttta
acaaatttgcagcaattgtattgttctcaaaatcaattaacctccttaaatgtttcgggc
ttatcgaatttgcagtatttgagttgtggtaataatcaattaaccagcttaaatgtttca
ggcttatcgaatttgcaggatttgaattgtgattctaatcaattgaccaccttaaatgtt
tcaggcttatcgaatttacggagattggattgtagtactaatcaattgaccaccttaaat
gttttaggtttatcgaatttgcagtctttgggttgtagtactaatcaattaacctcctta
aatgtttcgggttgtacgaatttgcagtatttggattgtagtggtgatcaattgatcacc
ttaaatgtttccggttgtacgaatttgataaggttgtattgtaattttaatgaattaacc
agtttagatgtttccggtttaacaaatttgcagcatttgttttgttatcaaaatcaatta
accaccttaaatatttcgggttgtacgaatttatcttctttgagttgtgctaataatcaa
ttaaccagcttaaatgtttcgggcttatcgaatttgcagtatttgagttgtggtaataat
caattaaccagcttaaatgtttcgggtttatcgaatttgctacatttgttatgttatcaa
aatcaattaacctccttaaatgtttcgggttttacgaatttgcagtctttgagttgtgct
aataatcaattaaccagcttaaatgtttcgggcttatcgaatttgcggactttgttatgt
ttttctaatcaattgaccaccttatttattaataacggaaatactaattggcaagatttg
gttttttcaagtaatcctaatcttcattatatatgtgcagatgaagaagatttaatctta
gtgcaaaacaaaatcaatcaatatggtatggggtcaacctgccatgtaaatagttattgt
agttttacaccaggtggcacgttttatacaattaatggcaataaccgtttagacagtaat
aataatggatgtgatgccagtgatggtttgtatcgaaatttaaaaattaatattactaat
ggtacacaatcagggagtttaattgctaatgaggcaggaaattattctattccagttcaa
gcaggtactcacacgcttactcctgtgtttgaaaacccaagttattttaacgttagccca
gcaactacaacggtaagttttccttcgcaaagtagtccttttgttcaaaatttttgtatt
acggctaatggagtgcaccacgatttagaagttacagttgttccaattggggtagctcgc
ccaggttttgatgcggcatataaaattgtatataaaaacaaaggcaatcaaattgaaaat
gcaagcttaacctttggttataacgataatgttatggattttattaacgcttcagttgct
acaactagtcaggttgttgggcaattatcttggaatttaggtaatttagcgccatttcaa
tccggaacaattactgtgagttttaatctgaatacacctattgaaacgcctccgttaaat
gctggaaatgttcttgcttatactgctacaatatcactaattgctattgatgaaacacct
actgataatgcgtttactttaaatcaaaccgttgttaattcctacgatccaaatgataaa
acgtgtttagaaggaccaataattaatccttcaaaaataggcgattatgttacctatcaa
attcgttttgaaaatacgggtacttttcctgcacaaaacattgtagtaaaagatatgatt
gataccgcgaaatttgatgtttctatgttacaaataataaatagtagtcacacttgttac
gcaaaaatcacaggtaacaaagtagaatttatttttgaaaatatcaacctaccttttgca
gatgctacaaatgatgggtatgtagtgtttaaaattaaatcgttgccaactttaacagtg
aacagtacggttagtaattcggcttctatttattttgattataattttccaattataacc
aatacggctacttctacctatcaattgttaaatgctaatagttttgtttttgaaaatgaa
tttgctttatatccaaatccggttaaagacaattttgcgattaagactaaaaatagttta
gaaatacaatctttggaaatttataatacattaggacaaatagtgctagctattccaaga
ttttcagaaaatgtcgatgtttcttcactacaaagaggcacgtatttagtaaaagtaaat
accgaaaagggtagtagtggtgtcaggataattaaagagtaa
DBGET
integrated database retrieval system