Flavobacterium nakdongense: RF683_04945
Help
Entry
RF683_04945 CDS
T10681
Name
(GenBank) glycoside hydrolase family 3 N-terminal domain-containing protein
Organism
fnd Flavobacterium nakdongense
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_3
Beta-lactamase
Glyco_hydro_3_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMW78793
UniProt:
A0ABY9RD46
LinkDB
All DBs
Position
complement(1104753..1107644)
Genome browser
AA seq
963 aa
AA seq
DB search
MKRLYILFFLVLIQFVFSQTNKKIQPEPIWVDSIYNSLTFDEKVGQLFMVAAYSNKNETH
AQDLEKLISQYKIGGLIFFQGGPVRQAKLTNRFQSQSKIPLLIGNDAEWGFSMRLDSTVK
YPWNMTLGAVQDMKLIEKMGMQMAKQAKRLGVHFTFGPVVDINTNPSNPIIGNRSFGEDK
ENVTKRALAYMKGLQENGVFATAKHFPGHGDTETDSHHTLPVVKFDKARLDDVELYPYKE
LIKNGLASVMVAHLNVPSIEPREGYPTSLSYHVVTNILKNELKFEGLIFTDALNMKGASN
FKQPGDVDLEAFLAGNDVMLFAENVPKAIEKFNQAYQANVFSEERLAHSVKKILTYKYRA
GLHNYKAIDLVNLYSDLNDVSYDALNYQLFENAVTVLKNESKIIPIHKLEKEKIAYVKLG
DGANDTFLTKLKEYASVTEITAFDLDTALLDLANYSKVIIGYHKPDGAWRKNELTFRELN
WIDKISKENETILAFFTKPYSLLKFPNFHHTETVIQAYQNTDMVQTIVAEIIFGAKTAKG
KLPVSIKDNFLVNEGIVINEIKRLGYNIPENVGMDSKKLAQIETLANYAITQKTTPGLQV
LVARKGQIIYQKSFGYHTYDTIQKVKNTDIYDVASLTKVLATLPVFMKQYDKRRISFDTR
LCEMLPRFENTNKANATVLDMLTHQARFQPWIPFYKATLDSLKRPDSLYYRTSYSEEFPT
KVAWNLYLRKAYNDTILNLIAKSPLLPSKQYKYSDFSFILLKEYLEHALHKKLDVLADEN
FYSSLGATTMTYNPLQKFEVTRIAPTEIDTYFRYQTLQGYVHDMAAAMQGGVSGHAGLFS
SAIDVAKMMQLYLQKGTYGDHDYFSEKTFNDFNTCYFCKDGNRRGVGFDKPQLGNEGPTC
GCVSMTSFGHTGFTGTMAWADPEKEIVYVFLSNRTFPNADVNKLSKLSIREKIQQIIYES
IIE
NT seq
2892 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacgcctatatattttattttttttagtattaattcaatttgttttttcacaaact
aacaagaaaatacaaccagaacctatttgggttgatagcatatataactcactaacattt
gatgaaaaagtaggacaattatttatggttgctgcttattcaaacaaaaatgaaacccat
gctcaagacttagaaaaattaattagtcaatataaaattggtggtttaattttttttcaa
ggtggtccagtaagacaagctaaattaaccaatagatttcaatctcagtcaaaaattcct
ttactcattggcaatgatgctgaatgggggtttagtatgcgtttagattctactgtaaaa
tatccatggaacatgacacttggagctgtccaagatatgaaattgattgaaaaaatggga
atgcaaatggctaaacaagcgaaaaggttaggcgtacattttacatttggccctgtagta
gatattaatacaaatcctagcaatccaattataggaaatcgttcatttggtgaagataaa
gaaaatgttaccaaacgggcactcgcttacatgaaaggtttacaagagaatggtgttttt
gcaaccgccaaacattttccaggtcatggcgataccgaaaccgattcgcaccatacctta
cctgtagttaaatttgataaagcccgattagatgatgttgaattgtacccctataaagaa
ctcattaaaaatggtttggctagtgtaatggtggcgcacttaaatgtgccaagtatagag
ccgcgcgaaggatatcctacttctttatcttatcacgtggtgacaaatattcttaaaaat
gaactaaaatttgaagggcttatttttacagatgcactaaatatgaagggcgctagtaat
tttaagcaacctggcgatgttgatttagaagcctttctggcaggaaatgatgtcatgttg
tttgctgaaaatgtacccaaagccatagaaaaatttaatcaagcgtatcaagcaaatgtt
ttttcagaagaacgtttagcgcattcggtaaaaaaaatattaacctataaatacagagcg
ggcttacataattataaggctattgatttagtaaacttatattcagatttaaatgatgtt
tcctatgacgcattgaactatcaattatttgaaaatgcagttacagtattaaaaaatgaa
tcaaaaattattcctattcataaattagaaaaagagaaaatagcttatgtaaaattaggc
gatggtgctaatgatacttttttaactaaattaaaagaatatgcttcagttacagaaatt
actgcctttgatttagatacagccttattagatttagcaaattattctaaagtcattatt
ggctatcacaagccagatggagcatggcgaaaaaatgaacttacttttagagaactcaac
tggattgataaaatttctaaggaaaatgaaactattttagctttttttactaagccgtat
tccttattaaaattcccaaattttcatcatacagaaacagttattcaggcgtatcaaaat
acagatatggtgcaaaccatagttgccgaaattatttttggtgccaaaaccgctaaaggt
aaattacccgtttctattaaagataattttttagttaacgaaggaattgtaattaatgaa
attaaaagattaggctataatatccctgaaaatgtaggcatggattcaaaaaaattagcc
caaattgaaacccttgctaattatgctataactcagaaaacaacgccaggtttacaggta
cttgtcgctagaaaaggacaaataatttatcaaaaatcatttggttaccatacgtatgat
acaattcaaaaggttaaaaatacggatatatatgatgttgcgtcattaacaaaagtatta
gctacattacctgtattcatgaaacaatatgataaaagaagaataagttttgatactcgt
ttatgtgaaatgttacctcggtttgaaaatacaaataaagcaaatgcaactgttttagat
atgctaactcatcaagctagatttcaaccttggattcctttttataaagcaacattagat
tctttaaaaagacctgattcattatattatagaacaagttattctgaagaatttccgacg
aaagtggcgtggaatttatatttaagaaaagcgtataatgatacgatacttaatttaatt
gcgaaatcacccttattgccttcaaaacaatataaatacagtgatttttcatttatcctt
ttgaaagaatatttagaacacgcattacataaaaaattagatgtgcttgcagatgaaaat
ttttattcttcattaggtgctaccaccatgacatataatcctttacaaaaatttgaagtt
acacgaattgcaccaacagaaattgacacctattttagataccaaacccttcaaggctac
gttcatgatatggcggcagcaatgcaaggtggggttagtgggcatgcaggacttttttca
agtgctatcgatgtagcaaaaatgatgcaactttatttacagaaaggaacctatggcgat
catgactacttttctgaaaaaacctttaatgattttaatacgtgctacttttgtaaagat
ggtaatagaagaggcgtaggctttgataaaccacaattaggtaacgaaggtcctacttgc
ggttgtgtatccatgacaagttttgggcatacaggatttacaggaactatggcttgggca
gacccagaaaaagaaattgtgtatgtttttttatctaatagaacatttccaaatgcagat
gtgaacaagttatctaaattaagtattagagaaaaaattcaacaaattatatacgaatca
attattgaataa
DBGET
integrated database retrieval system