Flavobacterium nakdongensis: RF683_07250
Help
Entry
RF683_07250 CDS
T10681
Symbol
secDF
Name
(GenBank) protein translocase subunit SecDF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
fnd Flavobacterium nakdongensis
Pathway
fnd02024
Quorum sensing
fnd03060
Protein export
fnd03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fnd00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
RF683_07250 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
RF683_07250 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
RF683_07250 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
fnd02044
]
RF683_07250 (secDF)
Secretion system [BR:
fnd02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
RF683_07250 (secDF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
SecDF_P1_head
SecD_1st
Sec_GG
ACR_tran
MMPL
DUF5625
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMW77286
UniProt:
A0ABY9R7N9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1626551..1629538)
Genome browser
AA seq
995 aa
AA seq
DB search
MQNKGLIKFFAIVFTIVSIYQLSFTFVANGISEDAKAYAKGDTKKELKYLDSIGKLDVMN
LGFTKFTYNEVREKQINKGLDLEGGINVILQVSVKDILKGLANNSKNPTFNRALDRAVKE
KKGNQDYLDAFFDAFEQESNGSLKLASNEVFYNRGLEGEINLGMTDDQVKVVLRKKVAES
VESAYGVLRERIDKFGVVQPNIQKLGESGRILVELPGAKDIDRIKNLLQSTAQLEFWETY
KPEELGNFFVAANDALKKTETKAKTATTAKVEDSTVVKDEKSKVESLLKDTKKALKGAQD
LGPLFSKIVMPAQQGSPYVAVFNVKDTSVVNSYFNRPDIRGLLTVANAKFVWGKPSKKAP
EFTELYVLKGSADGLPPLSGSVIIEAKDTYDQLGKPAVSMQMNPTGARKWEEITGNVSKQ
GNAIAIVLDNQVYSAPGVSKGAISGGQSEISGNFTIEETKDLANVLRAGKLPAAAEIVQS
EVVGPSLGQEAIDNGITSSLIGLLLVSLWMVIYYGRAGWYANIALIVNLILIFGAMASFP
GGFVLTLPGIAGIVLTMGTAVDANIIIYERAKEELREGKSLENAVVAAFGWKGAMRSIID
ANVTHVLTGLILFIFGNGPIKGFATTLLIGIFTSLFTSIFIARFFIDKDIVKGRSLLFAT
NMTKNWFTGFNFDFLKIKKFTYLFSLTVVAISCWSFFTNGFDQGIDFVGGRTFQVKFDQS
VNAEEVKNALASETVFGSAEAKTFGNSSQLKITTKYKIKEENAAVDKEVNEKLYNAVKKF
YAKEISYDEFINTNEGKSIGVVQAVKVGPAVAEDIKTNAYWAVIGAMLVVCLYLVVSFRR
YQYSLGAIAAVAHDVIFVLGIYSLLYKYMPFHMEIDQHFIAAILTVIGYSMNDTVIVYDR
VREFLGGKSHHGSFNKIVNDSINTTLSRTLNTSLTMIMVLAIMFVFGGDSIRGFIFAMLV
GIIVGTYSSLFIATPVLVDTISKDDKKVIENEHNA
NT seq
2988 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagaacaaaggactaatcaaattcttcgcaattgtttttacaattgtaagtatttac
cagctttcatttacgtttgtagcaaacggaatttcagaagatgcaaaagcatatgcaaaa
ggtgataccaaaaaagaattaaagtatttagattcaattggtaaattagatgtaatgaac
ttagggttcaccaaatttacctacaatgaagtaagagaaaaacaaattaacaaaggtctt
gaccttgaaggaggaattaacgtaatcttacaagtatctgtaaaagatattttaaaagga
ttagctaataattctaaaaatcctactttcaacagagctttagatagagctgttaaagag
aaaaaaggaaatcaagattatttagatgcattttttgatgcatttgaacaagaatcaaat
ggtagtttaaaattagcttcaaacgaagtattttacaatagaggtttagaaggtgaaatt
aacttaggaatgactgacgatcaagttaaagttgttttaagaaaaaaagtagctgaatct
gtagaaagtgcatacggtgttttaagagagcgtatcgataaatttggtgtagtacaacct
aatattcaaaaattaggagagtctggacgaatcttggttgaattaccgggagctaaagat
attgaccgtattaaaaatttattacaatctacagcacaattagagttttgggaaacctat
aaacctgaagaattagggaacttttttgttgcagctaatgatgcattaaagaaaacagaa
acgaaagctaaaacagctactactgctaaagtggaagattctactgtggtaaaagatgaa
aaatctaaagtagagtcgttattaaaagatactaaaaaagcacttaaaggggcgcaagat
ttaggtcctttatttagtaaaattgtaatgcctgcacaacaaggttcgccatatgttgca
gtatttaatgttaaagatacatcagttgtaaattcatattttaatagaccagacattaga
ggtttattaacagtagcgaatgcaaaatttgtttggggtaaaccttctaaaaaagcgcca
gagtttacagaattatatgtgttaaaaggaagtgcagatggattgccaccattaagtgga
agtgtaattattgaagcaaaagatacctatgaccaattaggaaaacctgcagttagtatg
caaatgaatcctactggtgcaagaaaatgggaagaaattacaggaaatgtatctaaacaa
ggtaatgctattgctattgtgttagataaccaagtgtattctgctcctggtgttagtaaa
ggtgctatttctggaggacaatctgaaatttcaggaaactttactattgaagaaacaaaa
gatttagcaaacgtattacgtgcaggtaagttaccagctgctgcagaaattgttcaatct
gaagttgtaggaccatctttaggtcaagaagctattgataatggtattacatcttcatta
attggtttactattagtatcactttggatggtaatttactatggtagagcaggttggtat
gcaaacattgcattgattgtaaacttaattttaatatttggtgctatggcaagtttccct
ggtggattcgtgttaactttaccaggtattgcaggtattgtattaacaatgggtacggca
gtagatgctaacattattatctatgagcgtgcaaaagaagaattgcgtgaagggaaaagt
ttagagaatgccgttgttgctgctttcggatggaaaggtgctatgcgttctattattgat
gctaacgttacacacgtattaacaggtttaatattatttatttttggtaacggacctatc
aaaggtttcgcaactacattattaattggtatttttacctctttatttacttcaattttt
attgcaagattctttattgataaagatattgttaaaggcagatcattactatttgctaca
aacatgacaaaaaattggtttactggatttaatttcgatttcttaaaaattaaaaaattc
acgtatctattttctctaactgttgtagctattagctgttggtcattctttacaaacgga
tttgaccaaggtattgattttgtaggaggaagaacattccaagttaaatttgaccaatca
gtaaatgctgaagaagttaaaaatgcacttgcttctgaaacagtttttggaagtgcggaa
gcaaaaacttttggaaattcatctcaattaaaaattactacaaaatataaaattaaggaa
gagaatgcagctgtagataaagaagtaaatgagaaattatacaatgcagtgaaaaaattc
tatgcaaaagaaatttcttatgacgaatttatcaatacaaatgaaggaaaaagtattggt
gtcgttcaagcggttaaagttggacctgccgtagctgaagatattaaaacaaatgcatat
tgggctgttattggtgctatgttagtagtttgtttatacttagtagtatcattccgtaga
tatcagtactctttaggagccattgctgcggtggcgcatgatgttatatttgtattagga
atctattcgttattgtataaatatatgcctttccatatggaaattgaccaacactttatt
gcggcaattttaacagttattggatattctatgaatgatacggttattgtatatgataga
gttcgtgaattcttaggtggtaaatcacatcacggtagcttcaataaaattgtaaatgat
tctattaacacaaccttgtcacgtacattgaatacttcgttaacaatgattatggtattg
gctattatgtttgtatttggaggtgattctatcagaggatttatctttgctatgttagta
ggtattattgtaggaacatattcgtcgttatttatagctacgccagtattagtagataca
atttcaaaggatgataaaaaagttattgaaaatgagcataatgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system