Fusobacterium vincentii 3_1_27: HMPREF0405_00189
Help
Entry
HMPREF0405_00189 CDS
T03625
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
fnt
Fusobacterium vincentii 3_1_27
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
EFG33925
LinkDB
All DBs
Position
1:373838..384142
Genome browser
AA seq
3434 aa
AA seq
DB search
MPLRTEIKTRIEKEQENISQMLKEADESMKDIELKIKKLTQRGEFWVKPLEKSYQGFIFA
NWGNYSKNKNKTESNFNGPEYSASYGSSMGYGQFSNGKYYGEYGIVKNPLEFVDKIDFGA
NITPKAVTEKTIVEKAVIKKDITAPSVTPPTVEVGEITLTAPEEVAIGEMTPPNEPNPSV
TTPSTVPALQGITVAAVSEVNVTPSTPEVAAAPTINAPTVQPPATPAGFTPRLITPPEAP
EDIVITPPGEVQADLTGSGANPSVEYWWWDGNRGAISQVSLTAGTFNIEGGNTINVKGYQ
AKAFLGTNPQGTKPSNGNYNIGQQFFHTLLNVPYSEYSNGVVINNNRAGFTLINLETEGQ
VSGNLADRVSDGSITADKKTTLKGYQTYSGIKGEDNTELLFINKGIVNLNADNTTYLFTT
SHNYGNLRTNYIDNEGTISAKGKNSIIIKHSPDTSQAKAWIYSNNGTMKAEGEGSIVYGA
AYGNLGHGRAAFINDGTIEVSGKNAIGVIFPKDSQNSTMMNGHLVWLRKPISLKGEGSMG
FVAQNTNISNEKNLVKFDINATKAIGILQDVEGAGTAKTAGKIVIEGNSSGSMGIYAQQG
TLELIKPHATSGETESSIELKSGSNNIGIYAKGASTVNFDGITKITGGEGQKIALATEGS
TINLKNTVTAGDKVTNKFVKDAVPLYAAGVGSKINVVTPDSLKFYLGGNSTAVYAKDKGK
INMNRTTLPNEPTIHIKGENGKGIGLFAKDGGVINAQKHYIKVEDGSVGLSSIGEKGTDK
SNIDFSGGKLEYTGNGYAVYSDGKGEVDLKDAELNLYGSSTAFDVDLGASTLPTKLNSGT
KIKVHSDDVVAFNLKRATGLTTVGGIETSIKSKIETKLGLGSGSLNNLFTGSTSTKYKVA
AVDGGEITIGNLDKSGTKDDTDQAKRDGYQYFNRFLAQRLKATVNGSTIKAVLSSSFAND
NFNGQVVGFEMNSSKNANGVNETAINLVNSKIIADRTDAGAGAIGAFINYGLVNIDATSK
IEVEKENNVVNKQAVGVYVVNGSKIDNKGNIDVGGNQSVGILGMAYREGSSHNPIVNEFG
GKLGEGTVNITNEKDIKMSGKDAIGIYAINNNPDKTVTTHLVTNKGNIEVGDSDEKTAVG
IYVKEVNVKPEGGKIKIGKEAVGIYAEDSNVGETNKDLGTIDFNGDNGVGIYLKGSGSNL
LGNKVTLTQSKDSKNKVGILAERGTSSIIKTEVAVGNLNNVIAYYSKGDYELTVQSNVTL
NENSIGISGEGDLLYGNGTNPYIMKLGKGSTGLFGTKKIALKANTNIELNGEKSVGAYAS
GANGVITSEGKIKFLKENSIGLYGAKGATINDKTASMDFTNANAKNNIGAYLAGAKWVDS
RSGAYTFSLNHAGNNIYLFAQGGNDGTTDLGSTATLNNEFKVNPSGSATSTAKAIGMYFN
TAVKDKTTFVDNTLNMTASNAKISVTNSGIGVYAKNTTGSGKNNIINKINVSSSESGSVG
VFTDGNLKLSGTGGLIEAQNAGIGLYGNKGTVTVEGTHKVEVSSAGTGMYLTKGSHLSGG
KLELENKTAGTSAAGIYYEGTGNEVNHDTDIVVTAGENLLALYANGLKLNNNKEIIIKKG
KNNVAAYITGNSTFRNKGKIQLGHPTQNDFESGIGVYVVDGEAINESGKTIDIYDFENTA
SGGSLSVGMLANAASGKTAKVTNKGTINANGEVIGMVVEDNSEGLNDTGAEIVAKDKEDI
NAKAIGAYVKGANAKFENKGKISAENIALALQGTGANKILNSGTLNLTKTGAIGVYAKDS
VVDFNIAPTVAGANKTVALYASGTTKIKSQITSASGKAHIGVYAEGDAEFLSGSKVTVGN
GDGNDYGIGVYTKSGYNKTVNTDIQLGGEKTIGFYLGATGGTGSTVTHTGTIDVGSGIGT
YIPEHSKFIAQNTTFNVGDNGTAVYLKGGEVDLGKTGTANINFNGTNGRAIYQDGGTITT
GTGLHIQGSGSFLTLKNANSSINSLVEVGASGIGINGIYDMTGKDYTLTLESPNGHIKLG
GNKATGIAAVAKSTVGPNKVNVINKGTIETTSGEKTTGIYGKGANIENVTGAKINIGAKG
VGIYTTNDNSLEDTTLNNAGEINLIGDEAAGIVAVKAKTNQDFIVGKISGTKDKLVGAYF
KDSQAVTKVKDFNISLGTNAKGLVFNEGKDFTITSSSTNKVTIGATTGNSRGIGIAALGV
NGNISKTDVVVGKGSLGLYVKNKKLTFDLASGKLESSDANRSSILAYADGNNSEVALNGG
GTLKVGANGIALGTKGGKITANATTTVEVDGVKGLGAYVENGGSIDNNFDIKVKSAEGIG
MYAKGGALTSVAKVSELKGNKSIGYVFENITSAITMPNSVQLTDTNATGQVGVVAKGTGN
GLTVAGVSVVGSGNTGVYSSTGKAVINNGTLNVGDSTGDSSIGIYSKGGAVTSTGNATIG
KNSIAIYGKDTAATLNGNLNIGEKGVGLYVDNTATSKGDTAVNGNITVGANGAIGIQTTN
SKVNLTGDLSVASGDSKGIFSMGAGNVETTGNITVGSNSVGIYKNGSGEIKTALGSIGKT
LTVADSGYGVFSKGAKLINNMNVTVGVDAIGAYVDGNDLTSTGTVTVADKGVGLLVKGTG
KTLTSTGNITVGSNNSVGLYAGDNANIAQSGNITVANNNGIGVYSKGSGNVSTIGAITVG
KDSIGVYKDGKGTMNINASSPIQTMTIAEKGYGLYYKGNSRADSIINSNMNMTLGKEAVG
IYAKNTTVNHTGDITVGETTIGSSGFTTPSDNKNSIGIFGDNSNINFKGNMLVDKPLSVG
IYGANGGSITVKSGSTITVKNGATGIMTGSKVENITLESGSTLNVDGKVDTNVYTNATKS
NVSFGIAAYSGLIDNQGTINVKNGATGIYLAGTASLKNGATGTINIDATSKSTAKPDTKA
SAELGGIKVTDKGVVTINNKVINGGTLNVKGALNMEGLGLDISTGKTVVDAKSISGVAEV
LPSFSKGNSEQKVTIKDVFRTGVVGAFSGDVKSKSVSWIAKISKEPGSSTTTSDITMVRI
PYNSLISGERYKNLASGLEDIRSKIGKDSSSPIFKSLDNISSHRDFARAIANIRGDVYSN
IQERMKTVENSFDKSYNELLSSYNKTRNVDKFSVIYTGGEHKDSTLGVSGYEYKSTGVLY
LNDREAFTYGGKYGWSAGIVGSNFEFKGDTNKGSKERVVSGKLGLHYQAPLNKDDDNARL
RWLTRGEITVNNHRTKRYSQVGADTYQNKASFYSTELSWKNVISYDYDINTNWTVKPYTG
IDISYGHIFNIKEKNEGLPLEVKGKDYFVITPNVGVETKYVLPLGATHQVFAKVDTEFNY
DVTKLYHGVNQAKMKNASTGYYDLSKPERRRARVAVGAELGLEKENAYGITFRAEYQGYK
KSQLNYGVRLNYKF
NT seq
10305 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgccattaagaacagaaataaagacaagaatagaaaaagaacaagaaaatatatctcaa
atgctaaaagaagcagatgaaagcatgaaagatatagaattaaaaataaagaaattgaca
caaagaggagaattttgggtaaaaccattagaaaaatcatatcaaggatttatctttgct
aattggggaaattatagcaaaaataagaataaaacagaaagtaactttaatggacctgaa
tattcagcttcttatggaagtagtatgggatatggacaattttctaatgggaaatattat
ggagaatacggaatagtaaaaaatccattggaatttgttgataaaatagattttggagca
aatattacaccaaaggcagtaactgaaaaaacaatagttgaaaaagcagtaataaaaaaa
gatattacagcaccaagtgtcacaccaccaacagttgaagtgggagaaataacattaaca
gctcctgaagaagttgcaataggtgaaatgacacctcctaatgaaccaaatccaagtgta
actacaccaagtacagtaccagcattacaagggataacagttgcagcagtgtcagaagtg
aatgtaactccaagtacaccagaggtagcagcagcaccaacaataaatgcaccaacagtg
caaccacctgctacaccagctgggtttacaccaagattaattacacctcctgaagcacca
gaagacatagttataacaccacctggagaggttcaagcagatttaactggctcaggtgct
aatccaagtgttgagtattggtggtgggatggaaatagaggagcgatttcacaagtatca
ctaactgctggaacatttaatattgaaggtggtaatacaattaatgtaaaggggtatcag
gcaaaggcttttttaggaacaaatccacaaggaactaaaccatcaaatgggaattataac
ataggacaacaatttttccacactttgttaaatgtcccttattcagagtattcaaatgga
gtagttattaacaataatagggcaggctttactttaattaacttagaaacagaagggcaa
gttagtggaaatttagctgatagagtcagtgatggctcaattacagcagataagaaaaca
actttaaaaggatatcaaacttactctggaattaaaggagaagataatactgaattactt
tttataaataagggaatagtaaatctaaatgcagataatactacctatttatttactact
tcccataattatggaaacttgagaacaaattacatagataatgagggaactatttctgca
aaaggaaaaaattctattattattaaacatagtccagatacaagtcaagcaaaagcgtgg
atttattctaataatggaacaatgaaagcagagggagaaggctctatagtttatggagca
gcttatggtaatttaggacacgggagagctgcttttataaatgatggaactattgaagtt
agtggaaaaaatgcaataggagttatttttccaaaagatagtcaaaatagtactatgatg
aatggacatttagtttggctaagaaaacctatttcactaaaaggagaaggctcaatgggg
tttgtagctcaaaatactaatatttctaatgagaagaatttagttaaatttgatataaat
gcaacaaaagccattggaattcttcaagatgtagagggtgctggaacagctaaaacagct
gggaaaatagtgattgaagggaattcttcaggaagcatggggatttatgcacaacaagga
acattagaattaataaaacctcatgctacatcaggtgaaacagaaagtagtatagaatta
aagtcaggaagtaacaatataggaatttatgcaaaaggagcaagtactgtaaactttgat
ggaattacaaaaataacaggtggagaaggacaaaaaattgctttggcaactgagggaagt
actattaatttaaaaaatacagtaacagctggagataaagttacaaataaatttgtaaag
gatgcagttcctttatatgcagcaggggtagggtcaaaaataaatgtagtaacaccagat
tcacttaaattttatttaggtggaaattcaacagcagtatatgcaaaagataaaggtaaa
ataaacatgaatagaacaactttaccaaatgaacctactattcatataaaaggtgaaaat
ggaaaagggataggtttatttgcaaaagatggtggagttattaatgcacaaaaacattat
ataaaagttgaagatggaagtgtgggattatcttctattggagaaaagggtacagataaa
tctaatattgatttttctggtggtaagttagaatacacaggaaacggttatgcagtatat
tcagatggaaaaggagaagtagatttaaaagatgctgaattaaatttatatggaagttca
actgcttttgatgttgatttaggagcttcaactttaccaacaaaattaaattcaggaaca
aagataaaagtacactctgatgatgttgttgcatttaatttaaaaagagcaacaggatta
acgacagttggtggaatagaaacaagtataaaaagtaaaatagaaactaaattgggctta
ggatcaggttctttaaataacttatttactggaagtacatcaactaaatataaagtagca
gcagtagatggtggagaaataactattggaaatcttgataaatctggaacaaaagatgat
actgaccaagctaagagagatggataccaatattttaatagatttttagctcaaagatta
aaagctactgtaaatggaagtacaataaaagctgttctaagtagtagttttgcaaatgac
aatttcaatggtcaagtagttggttttgaaatgaactcaagtaaaaatgcaaatggagta
aatgaaacagctattaatttagttaattcaaaaataatagcagatagaacagatgcagga
gcaggggcaataggagcatttattaactatggtttagtaaatattgatgcaacatcaaaa
atagaagttgaaaaagaaaacaatgtagttaataagcaagctgtgggagtatatgtagta
aatggttctaaaatagataataaaggaaatattgatgtaggtggaaatcaatcagtaggt
atcttgggaatggcatatagagaaggcagctctcataatccaatagtaaatgaatttgga
ggaaaattaggagaaggaactgttaatatcacaaatgaaaaagatataaaaatgtcaggt
aaggatgctattggtatctatgcaataaataacaatcctgataagacagtaacaactcat
ttagtaacaaataaaggaaatattgaagtaggagattcagatgaaaagacagcagtagga
atttatgttaaggaagtaaatgtaaagccagaaggtggaaaaataaaaataggtaaagaa
gcagtaggaatttatgcagaagattctaatgttggagaaacaaataaagatttaggaact
atagactttaatggagataatggagtaggtatttacttaaaaggtagtggttcaaactta
cttggaaacaaagttacattaacacaatcaaaagattctaaaaataaagtaggaatactt
gctgaacgtggaacaagttctataattaagacagaagtagcagtaggaaatcttaataat
gtaatagcatattactcaaaaggagattatgaattaactgttcaatcaaatgtaacattg
aatgaaaatagtattggtatttcaggagaaggagatttactatatggtaatggaacaaac
ccatatattatgaaattaggtaaaggttctactggattatttggtacaaaaaagatagct
ttaaaagctaatacaaatattgaattaaatggagaaaaatctgttggagcttatgctagt
ggagcaaatggagtaattacttctgaaggaaagataaaattcttaaaagaaaattctatt
ggtttatatggagcaaagggggcaactataaatgataaaacagcttcaatggactttact
aatgcaaatgctaaaaataatataggagcatatttagcaggtgctaaatgggtagacagt
agaagtggagcatatacattcagtctaaatcatgctggaaataatatatatttatttgca
caaggtggaaatgatggaacaacagatttaggaagtacagcaacattaaataatgaattt
aaagttaatccaagtggaagtgcaacttcaacagctaaagcaataggtatgtactttaat
actgctgtaaaagataaaacaacttttgtagataatactttgaatatgacagcttcaaat
gctaaaatttctgtcacaaatagtggtataggagtttatgcaaaaaatactactggaagt
ggtaaaaataatataataaataaaataaatgtttcttcaagtgaaagtggttctgttgga
gtatttactgatggtaacttaaaacttagtggaactggtggattaattgaagctcaaaat
gctggaataggactttatggaaataaaggaacagttactgttgagggaacacataaagtt
gaagtttcttctgctggaacaggtatgtatttaactaaaggtagtcatctaagtggagga
aaattagaactagaaaataaaacagcaggaacatcagcagctggaatatattatgaaggt
acaggcaatgaagttaatcatgatacagatatagtagtaacagctggagaaaatttactt
gctttatatgctaatggcttaaaattaaataacaataaagaaattattataaaaaaagga
aaaaataatgttgctgcatatataacaggaaattctacatttagaaataaaggaaaaata
caattaggacatcctacacaaaatgattttgaaagtggtattggagtatatgtagtagat
ggtgaagcaataaatgaatcaggaaaaacaatagatatttacgactttgaaaatacagca
tcaggaggttctctatcagtaggaatgcttgcaaatgcagccagtggcaaaacagcaaaa
gttactaataaaggaactattaatgccaatggtgaagttattggaatggttgtagaagac
aattcagaaggtcttaatgatactggtgcagaaatagttgcaaaagataaagaagatatt
aatgcaaaagcaataggagcatatgtaaaaggagctaatgctaaatttgaaaataaagga
aaaatttctgctgaaaatatagctcttgcacttcaaggaacaggtgctaataagatttta
aattcaggtactcttaatttaacaaagacaggagcaattggagtatatgcaaaggattct
gttgtagattttaatattgcaccaacagtagcaggggcaaataaaacagttgccttatat
gcatcaggaactactaaaattaaaagccaaataacatcagctagtggaaaagctcatata
ggagtatatgcagaaggtgatgcagaattcctatcaggttcaaaagtaacagttggtaat
ggtgatggaaatgattatggaataggagtctatacaaaatcaggatataataaaactgta
aatactgatattcaattaggtggagaaaagactattggtttctatcttggagcaacagga
ggtacaggttcaacagtaactcatactggaactattgatgttggaagtggaataggaact
tatattcctgaacattcaaaatttattgctcaaaatactacttttaatgtaggagataat
ggaacagcagtttatctaaaaggtggagaagtagatttaggaaaaactggtactgcaaat
attaattttaatggaacaaatggaagagcaatatatcaagatggaggaactataacaact
ggaacaggattacatatacaaggttctggaagtttcttaacacttaaaaatgctaattct
agtattaattctcttgtagaagtaggagcaagtggaataggtattaatggtatttatgat
atgacaggtaaagactacacacttactttggaaagtccaaatggtcatataaaactaggt
ggaaataaagcaacaggaatagcagcagtagctaaaagtactgttggtccaaataaagta
aatgtcataaataaaggaactattgaaactacttctggtgaaaaaactactggaatatat
ggaaaaggtgcaaatatagaaaatgtaacaggagcaaaaataaatataggagctaaagga
gttggaatttatacaactaatgacaacagtcttgaagatactactctaaataatgctggt
gaaattaatttaattggtgatgaagcagcaggaatagtagcagttaaagcaaagactaac
caagattttattgtaggaaaaatttctggaacaaaagataaattagttggagcatatttt
aaagatagtcaggcagttacaaaagttaaagactttaatatttctttaggaactaatgca
aaaggattagtttttaatgaaggaaaagattttacaataacatcatcatcaactaataaa
gtaacaataggagctacaacaggaaatagtcgtggaataggaattgcagctcttggagta
aatggaaatatttctaaaacagatgttgtagttggtaaaggttcattaggattatatgta
aaaaataaaaaattaacatttgacttagctagtggaaaattagaatcatcagatgcaaat
agaagctcaattttagcttatgctgatggaaataactcagaagttgctctaaatggtgga
ggaacattaaaagtaggggcaaatggtattgcattaggaactaagggtggaaaaattact
gctaatgctacaactactgttgaagtagatggagtaaaaggattaggagcttatgtagaa
aatggtggaagcatagataataactttgatattaaagttaagagtgctgaaggtattgga
atgtatgcaaaaggcggagctttaacatctgttgcaaaagttagtgaattaaaaggaaat
aaatcaataggatatgtttttgaaaatataacaagtgctattactatgccaaactcagtt
caattaactgacactaatgcaactggacaagtaggagtagtagcaaaaggaactggaaat
ggactaacagtagcaggagtttctgttgttggaagtggtaatacaggagtatacagttcc
acaggtaaagcagttataaataatggaactcttaatgttggagattcaacaggagattct
tcaataggtatttattcaaaaggtggagcagtaacaagtacaggtaatgctacaataggt
aaaaattctattgccatctatggaaaagatacagctgctacattaaatggaaatctaaat
ataggagaaaaaggtgttggattatatgttgataatactgcaacaagtaaaggagataca
gctgtaaatggaaatattacagtaggagcaaatggagcaataggaatacaaactactaac
tctaaggttaacttaacaggagatttaagtgtagcttctggagatagtaaaggtatattc
tcaatgggtgctggaaatgttgaaactactggtaatataactgttggaagtaattcagtt
ggtatttataaaaatggtagtggagaaataaaaacagctcttggatctattggaaaaact
ttaacagtagcagatagcggatatggagtattctcaaaaggtgcaaaactaattaataat
atgaatgttacagttggtgttgatgcaataggagcttatgtagatggtaatgatttaact
tcaacaggaacagttacagtagcagataaaggagtaggtttacttgttaaaggaacagga
aaaactttaacttcaacaggaaatattacagttggttctaataattcagtaggactttat
gcaggagataatgcaaatattgctcaatctggaaatatcacagtagctaataataatgga
ataggagtttattcaaaaggtagtggtaatgtatcaacaataggagctataacagttggt
aaagattcaataggagtttacaaagatggtaaaggaactatgaatataaatgcaagctca
cctattcaaacaatgactattgctgaaaaaggttatggactttactataaaggaaattca
agagctgatagtataattaatagtaatatgaatatgactcttggaaaagaagcagtagga
atctatgctaaaaatacaactgttaatcatacaggagatatcacagtaggagaaacaact
ataggttcaagtggatttactacacctagtgacaataaaaactctattggaatatttgga
gataattcaaatattaactttaaaggaaatatgttagttgataaaccattatcagtaggt
atctatggagcaaatggaggaagcataacagttaaatctggttcaacaataactgtcaaa
aatggagcaactggtataatgacaggttcaaaagttgaaaatataacactagaaagtggt
tcaactcttaatgttgacggaaaagtagatacaaatgtttatactaatgcaacaaagagc
aatgtatcatttggaattgcagcatatagtggattaattgataaccaaggtacaattaat
gttaaaaatggagcaacaggaatatatcttgctggtacagcttcattgaaaaatggagca
acaggaacaataaatattgatgctacttcaaaatcaacagctaaaccagatacaaaagca
agtgctgaacttggaggaataaaagtaactgataaaggtgtagttacaataaataataaa
gtaataaatggaggaactcttaatgttaagggtgctttaaatatggaagggctaggatta
gatataagcacaggaaagacagtggttgatgctaaatctatttcaggagttgcagaagta
ttacctagtttctcaaaaggtaactcagaacaaaaagttactattaaagatgtattcaga
acaggagtggttggagcattctcaggagatgttaaatctaaatctgtatcttggatagca
aaaatatctaaagaaccaggttcatctacaacaacaagtgatataactatggtaagaata
ccttataatagtttaatatctggtgaaagatataagaacttagctagtggattagaagat
attagatcaaagattggaaaagattcatcatcaccaatatttaagtcattagataatata
agttcacatagagattttgcaagagcaatagcaaatatccgtggagatgtttattctaat
attcaagaaagaatgaaaacagtagaaaattcttttgataaatcatataatgaacttcta
tcatcatataataaaactagaaatgtagataaatttagtgttatctatacaggtggagaa
cataaggatagtacattaggagtttcaggatatgagtataaatcaactggtgtattgtac
ttaaatgatagagaagcatttacatatggtggaaaatatggatggtcagctggtatagta
ggaagtaattttgaatttaaaggagatactaataaaggttctaaggaaagagtagtatca
ggaaaattaggattacattatcaagctccattaaataaagatgatgacaatgctagatta
agatggttaacaagaggagaaataacagtaaataatcatagaactaagagatatagtcaa
gtaggagcagatacttatcaaaataaagcaagcttctattcaacagaattatcttggaaa
aatgtaatttcttatgattatgatattaatacaaattggacagtaaaaccatatactggt
attgatatttcttatggtcatatcttcaatataaaagaaaagaatgaaggtttaccatta
gaagtaaaaggtaaagattactttgtaataactccaaatgttggtgttgaaacaaaatat
gtattgccattaggagcaacacatcaagtatttgcaaaagtagatacagaatttaactat
gatgtgacaaaactatatcatggtgtaaatcaagctaagatgaaaaatgcttcaactgga
tattatgatttatctaaaccagaaagaagaagagcaagagtagcagtaggagctgaatta
ggtttagaaaaagaaaatgcatatggaataacatttagagctgaatatcaaggttacaag
aaatctcaattaaactatggagtaagattaaattataagttctaa
DBGET
integrated database retrieval system