Fusobacterium vincentii 3_1_27: HMPREF0405_00973
Help
Entry
HMPREF0405_00973 CDS
T03625
Name
(GenBank) glycogen debranching enzyme GlgX
KO
K01214
isoamylase [EC:
3.2.1.68
]
Organism
fnt
Fusobacterium vincentii 3_1_27
Pathway
fnt00500
Starch and sucrose metabolism
fnt01100
Metabolic pathways
fnt01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fnt00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
HMPREF0405_00973
Enzymes [BR:
fnt01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.68 isoamylase
HMPREF0405_00973
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
ISOA1-3_C
Isoamylase_C
hDGE_amylase
DUF5696
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
EFG34695
LinkDB
All DBs
Position
1:1229713..1231650
Genome browser
AA seq
645 aa
AA seq
DB search
MYYNFNQYINLGANLEKDGCNFAIYVKEVKTLSLNFFNSSEDTIPYKKYILNPSEHKLGD
IWSIFLKDIKEGTLYNWEINGISILDPYALSYTDNDIIENKKSIVLTRIGTETKHILIPK
KDTMIYETHIGLFTKSPSSNTLNRATYSAFEEKIPYLKELGINVVEFLPIFEWDDYTGNL
DRESFFLKNVWGYNPINFFALTKKYSSSNDKNSADEIKEFKKLISSLHKNGIEVILDVVY
NHTAEGGSGGKVYNFKAMDENTFYIKNKNNIFVNFSGCGNTLNCNHKVVKDMIIQSLLYW
YLETGVDGFRFDLASVLGRDSNGQWAKHSLLHELIEHPILSHAKLIAESWDLGGYFVGAM
PSGWSEWNGAYRDTVRQFIRGDFNQVPELIKRIFGSVDIFHANKNGYQSSINFICCHDGF
TMWDLVSYNSKHNLLNGENNQDGDNNNHSYNHGEEGLTHNLQIISLRKQQIKNMILILYI
SQGIPMLLMGDEMGRTQLGNNNAYCQDNPTTWVDWDRKKDFEDVFLFTKNMINLRKSYSV
FKKETPLIEGEEVILHGIKLYQPDLSYHSLSIAFQLKDIETDTDFYIAFNSYSEQLCFEL
PILENKSWYLLTDTSKIDSCDFKEIKWEVSSYCVLSKSSVILISK
NT seq
1938 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtattataattttaatcagtatataaatttaggagctaatttagaaaaagatggttgt
aattttgctatctatgtaaaagaagttaaaactctttctttaaatttttttaattcttca
gaagacactattccttataaaaaatatatattaaatccttctgaacataaattaggagat
atttggagtatatttttgaaagatataaaggaaggtactttatataattgggagataaat
ggaatttctatacttgatccttatgcactttcttacactgataatgatatcatagaaaat
aaaaaatctattgttcttacaagaataggaactgaaacaaaacatattcttattccaaaa
aaggatacgatgatttatgaaactcatatagggttatttacaaaatctccaagttctaat
actttaaacagagctacatattctgcttttgaagaaaaaataccttatttaaaagaatta
ggtatcaatgtggtagaatttttaccaatttttgaatgggatgactatactggaaattta
gatagagaatcttttttcctaaaaaatgtttggggctataatcctataaatttttttgcc
ttaacaaaaaaatattcttcttcaaatgataaaaattctgctgatgaaatcaaagaattt
aaaaaattgatttcatctctccataaaaatggtatagaagtcattttagatgttgtctat
aatcatacagctgagggtggctctggtggcaaagtatataattttaaagctatggatgaa
aatactttttatataaaaaataaaaataatatttttgttaatttttcaggatgtggaaat
actttaaattgtaatcataaagttgttaaagatatgattattcaatctttattatattgg
tatttagaaacaggtgttgatggctttcgttttgatttagcttctgtcttaggtagagat
tctaatggtcaatgggctaaacattcattgcttcatgaattgatagaacaccctatatta
tctcatgctaaattaattgcagaaagctgggatttaggtggatattttgtaggagctatg
ccaagtggctggtctgaatggaatggagcatacagagatacagttaggcaatttataaga
ggagatttcaatcaggttcctgaactcattaaaagaatttttggaagtgtggatattttt
catgccaataaaaatggttatcaatcaagtataaattttatttgttgccatgatggtttc
actatgtgggatttggttagctataattcaaaacataaccttttaaatggtgaaaataat
caagatggagataataataatcattcatataatcatggtgaagaaggtttaactcataat
cttcaaattatttctttgagaaaacagcaaattaaaaatatgattcttattttatatatc
tcacaaggtattccaatgttacttatgggagatgaaatgggtagaactcaactaggtaat
aataatgcctattgtcaagataatcctactacttgggttgattgggatagaaaaaaagat
tttgaagatgtttttcttttcactaagaatatgataaatttaagaaaatcttattcagtt
ttcaaaaaggaaactccattaattgaaggagaagaagtgattttacatggtattaaatta
tatcaaccagatttaagttatcattcactttctattgcttttcagctaaaagatatagag
actgatactgatttttatatagcatttaactcatatagtgaacagctttgttttgaatta
cctatacttgaaaataagtcttggtatcttctaactgatacttcaaaaattgatagttgt
gattttaaagaaattaagtgggaagtttcttcttattgtgtactttcaaaatcatcagta
attttaatatctaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
