Fusobacterium vincentii 3_1_27: HMPREF0405_01214
Help
Entry
HMPREF0405_01214 CDS
T03625
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
fnt
Fusobacterium vincentii 3_1_27
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Synuclein
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
EFG34933
LinkDB
All DBs
Position
1:1500895..1505496
Genome browser
AA seq
1533 aa
AA seq
DB search
MKIKRLIMILLIVAATVSYADERTDTIKQIDKIIDNAITKAIESDKTNPYLKQSRIKAIK
EQILSAIKKDLDEPGLTRLDIPEILPKIDKEIKKIGDGIGPKNNYRIIQESKEVIQPVEQ
TAYEGFLRVVDTQNRMNGIKSNYWEKGNVKAQRTHNGVDLVPIAHVVYENAASDSREEPN
SNSKIRRSSHTIADLAEKGIGAFAKEDYSELPYKNSNQFYEKRFYFGAGNTVKDIVFLNK
EKFSSEVEKTKKNKNERYYIEGEYKLVTTNATEDERSKSFGAEKDVNPLDITMKEYRTRI
EGKSKAEISAFLKEKMAQKNIKNVIQEGEDLYTVDGKGRKWKVDWKLEPVSVESGSKTEY
KDTVFTTINYYSPFDDKSTTDNRGKLLYTKDGSIYAQDKNRYTNDVSLKLTETETKVETK
IKKMLKLTKNKYGPEMALTPAEFNANNEYRDPNKYYSHYDEDDNIYYVSKITRISKEFET
TDTKSIEEFKKYAQNLVEENIDKEIKENVKVKKDVTKSLNDFIATAKERAEKGEAPRNQF
DQYFYDKKHLSKEDFENKWIKPFQDEKYKVAKENYEKELAEAQKRFEIVDKEYNKYKDEE
TNFYNNPNRPSTFYGIATWEGLDTEQQKKDYLNSLSDKDRKYVETWVKLYENRINFEKEW
KKLNAEISDGIAKKYGFWDNPAATPEQRKYVGLNGLIKDLDLTRSIAGKNIEFRGIGRIE
GTVDLGEGKNTLKIAEQMTGQYGTSITLGAYAKLKNIDTVEVGGSLTLDNAQASISGRTS
LRMDIDATKKNSEGHYYQHALKDSDPNIRFIKYGTTNMDSRNDFMIELLTSKITENEAII
DMGRKIDYTWHDMKTGKDYDMTIPFVSDSIAHQLINNKKLSKNGTSLLELKTREELRRLN
SDENAVYRSIRNANKLGILSPTLTTTNKKTTFNTVDQEKEAKKKKDLLTYLKTKTDEELV
NDLSQFNLSETEKKEALELVKKLKNSDDFKSIMNKEKELKTKLDEINKLEKDSNYQNLHF
QEIASKIESDFNDLSNKVYSLYPNEKDLEKQFETDLKREDPYTLVKKAVLLADRNPELKA
KLNSIKNELKTKLNDTRELLKKDLATVKELKAKYPNSKFGEIEKTIETILSGDNLEKMVL
SSRDYNKNSDLAALVSDFKKLVSDISLQLKEKENIVKALEENDASIEQPRYADYHRLKSK
IFYTMREEEVLSELKNMLNQLSDRNIYSKLNKISKNEISTYTTIPFEVTHALTDKKHIAR
GGFISNRTVQDNFKGNIYTAYGLYETTANSNTKYGVLFGGANTKHNEVYQRSLTTVATES
EIKGVSAYVGGYFNKPVINNLNWITGIGTQYGRYKVKREMRNNYQDLHSDGKVNTASLNT
YSGFIINYPIQEDVFVQLKGLLAYTMVKQNKVNESGDLPLDINGKTYHYVDGEAGISFNK
IFYGEDLKSSISAGTYGILGLSGYKNSNLEGKIDGSSSSFGIKGDRVKRDAIKIHLDYNV
QTDAGYTYGLEGTYITNSKENNVKIGIKGGYTF
NT seq
4602 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaataaaaagattaataatgatattattgatagtagctgccacagtttcttatgct
gatgaaagaacagatactattaaacaaattgataagataatagacaatgcaataactaag
gcaatagaaagtgataaaactaatccttatttaaaacaaagtaggataaaagctattaaa
gaacaaatattatctgctataaaaaaagatttagatgagcctggtttaactcgtcttgat
attccagaaatattaccaaaaatagataaagaaattaaaaaaattggagatgggataggt
cctaaaaataattatagaataattcaagaaagtaaagaagttatacaacccgtagaacaa
acagcttatgaaggatttttaagagtagtagatactcaaaatagaatgaatggtataaaa
tcaaactattgggaaaaaggaaatgtaaaagcccaaaggacacataatggagttgattta
gttcctattgctcatgtagtttatgaaaatgctgcctcagattcaagagaagaacctaat
tcaaattcaaagattagaagaagttctcacactattgcagatttagctgaaaaaggtatt
ggagcttttgctaaggaagactattctgaattaccttacaagaacagtaatcaattctat
gaaaagagattttattttggagcaggaaatactgtaaaagatattgtgttcttaaacaaa
gaaaaattttcatcagaagtagaaaaaactaaaaagaataaaaatgaaagatactatata
gaaggtgaatataaacttgtaacaactaatgctaccgaagatgaaagatcaaaaagtttt
ggagcagaaaaagatgtaaatcctttggatataactatgaaagagtacagaactagaata
gaaggaaaatctaaggcagaaatttcagctttcttaaaagaaaaaatggcacaaaaaaat
ataaaaaatgtaattcaagaaggagaagatttatatacagttgatggtaaaggtagaaaa
tggaaagtagattggaagttagaacctgtatctgttgaaagtggaagtaagactgaatat
aaagatactgtttttacaactattaattattatagcccctttgatgataaatcaactact
gataatagaggaaaattattatacacaaaagatggcagtatttatgcacaagataaaaat
agatatactaatgatgtaagtttaaaacttactgaaactgaaactaaggttgaaactaaa
ataaaaaagatgcttaaacttactaaaaataagtatggacctgaaatggcacttacacca
gctgagtttaatgctaacaatgaatatagggatcctaataaatattattcacattatgat
gaagatgataatatatattatgttagtaaaattactagaatatctaaagaatttgaaaca
actgatactaaaagtatagaagaatttaaaaaatatgctcaaaatctagttgaagaaaat
attgataaagaaattaaagaaaatgtaaaagtcaaaaaagatgtaacaaaatctttaaat
gattttatagcaacagccaaagaaagagctgaaaaaggggaagctcctcgtaatcaattt
gatcaatatttttatgacaaaaaacatttatcaaaagaagattttgaaaataaatggatt
aaacctttccaagatgaaaaatataaggttgctaaggaaaattatgaaaaagaattagca
gaggctcaaaaaagatttgaaattgttgataaagaatataacaagtataaagatgaagaa
acaaatttttataataatccaaatagaccttccactttttatggaatagcaacttgggaa
ggattagatactgaacaacaaaaaaaagattacttaaatagtttatctgataaagataga
aaatatgttgagacttgggttaagctttatgaaaatcgtataaattttgaaaaagaatgg
aaaaaattaaatgctgaaatatctgatggtattgctaaaaaatatggtttctgggataat
cctgctgctactcctgaacaaagaaaatatgtaggattaaatggacttataaaagattta
gatttaactagaagtattgctggtaaaaacattgaatttagaggaataggaagaatagaa
ggaacagttgatttaggagaaggtaaaaatacattaaaaatagcagagcaaatgactgga
caatatggaactagcataacattaggagcttatgcaaaacttaaaaatatagatactgtt
gaagttggtggctcattaactcttgataatgcacaagcttcaatatcaggtagaacttct
ttaagaatggatatagatgccactaaaaagaatagtgaagggcattattatcaacatgct
ttaaaagattctgatccaaatataagatttataaaatatggaacaactaatatggatagt
agaaatgattttatgattgagttattaacaagtaaaatcactgaaaatgaagctattata
gatatgggaagaaaaatagattacacttggcacgatatgaaaactggaaaagactatgat
atgactattccatttgtatcagattcaatagctcatcaattaattaataataaaaaatta
tctaaaaatggaacttcacttttagaactaaaaacaagagaagagttaagaagattaaat
agtgacgaaaatgccgtatatagaagtattagaaatgcaaataaattaggtattctttct
cctactcttacaacaacaaataaaaagactacttttaatactgttgatcaagaaaaggaa
gctaagaaaaagaaagatctactaacttatttaaaaactaaaactgatgaagagttagta
aatgatttatcacaatttaatttaagtgaaacagaaaagaaagaggcattagaattagtt
aaaaaattaaaaaatagtgatgattttaaatctattatgaataaggaaaaagagttaaaa
acaaagttagatgaaattaataaattagaaaaagattctaattatcaaaatttacacttt
caagaaattgctagtaaaatagaatcagattttaatgatttatcaaataaagtatactca
ctatatccaaatgaaaaagatttagaaaaacaatttgaaacagaccttaaaagagaagac
ccttatacacttgtaaagaaagcagttttattagctgacaggaatcctgaattaaaagct
aaattaaattctataaaaaatgaattaaaaactaaattaaatgatactagggaactttta
aagaaagatttagcaactgtaaaagaattaaaagctaaatatcctaattctaaatttgga
gaaatagaaaaaacaatagaaactatcttatcaggtgataatttagaaaaaatggtgtta
tcatcaagagattataataaaaattcagatcttgctgctcttgtatctgatttcaagaaa
ttagtttctgatatttctttacaactaaaagaaaaagaaaatattgtaaaagcattggaa
gaaaatgatgctagtatagaacaacctcgttatgcagattatcatagattaaaatctaaa
atattctacactatgagagaagaagaagttttatcagaattaaaaaatatgcttaaccaa
ttaagtgatagaaatatttattctaagttaaataaaatttctaaaaatgaaatttcaact
tatacaactatcccatttgaagtaactcatgccttaactgataagaaacatatagcaaga
ggtggatttatttctaatagaacagttcaagataatttcaaaggaaatatttatacagct
tatggactttatgaaacaactgctaactcaaatactaagtatggagttttatttggagga
gccaatacaaaacataatgaagtatatcaaagaagtcttacaactgttgcaactgaatct
gaaataaaaggtgtctctgcctatgttggaggatattttaataaaccagttataaataat
ttgaattggattactggaattggtactcaatatggaagatataaagtaaaaagagaaatg
agaaacaattatcaggatttacattcagatggtaaagttaatacagcttcattaaataca
tatagtggatttataataaattatcctatacaagaagatgtatttgtacaattaaaggga
cttttagcatatactatggtaaaacaaaacaaagtaaatgaaagcggagatttacctctt
gatataaatggaaaaacttatcattatgttgatggagaagcaggaattagctttaataaa
attttctatggagaggatttaaaaagtagtatttcagcaggaacctatggaattttaggt
ctatctggatataagaatagtaatttagaaggaaaaattgatggaagttcatcttcattt
ggaatcaaaggagatagagttaaaagagatgctataaaaattcatttagattacaatgtt
caaactgatgctggatatacttatggacttgaaggtacatacataactaattctaaggaa
aataatgtaaaaattggtatcaaaggcggatatacattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
