Flavobacterium oreochromis: JJC03_02375
Help
Entry
JJC03_02375 CDS
T08111
Name
(GenBank) peptidylprolyl isomerase
KO
K03770
peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D [EC:
5.2.1.8
]
Organism
foe
Flavobacterium oreochromis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
foe00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03110 Chaperones and folding catalysts [BR:
foe03110
]
JJC03_02375
Enzymes [BR:
foe01000
]
5. Isomerases
5.2 cis-trans-Isomerases
5.2.1 cis-trans Isomerases (only sub-subclass identified to date)
5.2.1.8 peptidylprolyl isomerase
JJC03_02375
Chaperones and folding catalysts [BR:
foe03110
]
Protein folding catalysts
Peptidyl prolyl isomerase
Cyclophilin
JJC03_02375
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Rotamase_3
SurA_N_2
Rotamase
Rotamase_2
SurA_N_3
DUF365
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYS86879
LinkDB
All DBs
Position
complement(483661..485751)
Genome browser
AA seq
696 aa
AA seq
DB search
MAVLSKIRQRSLLVAGIVGLSLLAFVVGALIENGSSMFNSRNAGTINGVDITFEDFRNKV
DALQKNQQGVSFTQAGNSIWEQEIRRVLLEDQFEKTGLRIGDDQLINVIKEDPQFSQNPQ
FLNAAGKFDKTKFNEFLNSMKKQPESWNQWLNYEKSVAQFAKEQMYNSMIKGAYYTTQAE
GKFNYELENNKVTFNLVSVPYSTVEDKKVELTDDEIISYMKKNEKKYEAEPSRELEYVVI
EDKPSAADEKAVKDKVNALMNASVVYNAKTGKNDTVAGFRNTSNVIEFVNTNSDIKYDST
YIAKKDLPVDHAEALFNTAPGATYGPYIFGQYYCISKAMGKKAGINAKASHILLSFKGSA
GPQANRTKEEAKAKATALLAQAQANPSSFAMLAMTNSDDNSKQQGGDLGYFSKGQMTKNF
ENFVYGNPVGKIGLVETEFGYHVIQVTDKQDGIRLATIAQKILPSEATSDAAFTKASKFE
ILANEKGFDNAVKAEKLTVAPAARVFALDENIPGVGAQREIVRWAFSADKNDVKRFQTPN
AHVIVKLKSINDSGLMSIEEAKNAFGYKLRNEKKVKMIEDKMKGATLEAVAKATGSPVKE
AKDVSAAGSFIESIGPEPKVVGEAFSLKQGVVSPTIAGNSGVFKIKVIGSKKAAPSKDFK
EIIARLGVQSKSSSAARLLFLLKRDAKIEDNRAQFN
NT seq
2091 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagttttatcaaaaattagacagcgttctctattggtagccggtattgtaggtttg
tcattacttgcattcgtagtaggtgccctaattgaaaatggatcttctatgttcaattca
agaaatgcaggtactataaacggtgtagatattacttttgaggattttagaaataaagta
gatgctttacaaaaaaatcagcaaggagtttcatttacacaggcaggtaatagtatttgg
gaacaggaaattagaagagttttattagaagatcaatttgaaaaaacaggattaagaatt
ggagatgatcaattaattaatgtaattaaagaagatccacagttttcacaaaatcctcag
ttcttaaatgcagctggtaaatttgataaaacaaaattcaatgagtttttaaactctatg
aaaaaacagcctgaatcatggaaccaatggttgaattatgaaaaatcagtagctcaattt
gcaaaagaacaaatgtataattcgatgattaaaggggcttattatactacacaagcggaa
ggtaaatttaattatgagttagaaaataataaagttacttttaacctagtctcagttcct
tattcaacagtagaagataaaaaagttgagttaacggacgacgaaattatttcttatatg
aagaaaaacgagaagaagtacgaagcagaaccttctcgtgagttagagtacgttgtaatt
gaagacaagccatcagctgctgatgaaaaagctgttaaagacaaagtaaatgctttaatg
aatgcttcagtagtatataacgcgaaaacaggtaaaaatgatactgtagcaggattccgt
aatacatctaatgtgattgaatttgtaaatactaattctgatattaaatatgattctact
tatattgctaaaaaagatttaccagtagatcatgcagaagctttatttaatacagctcct
ggtgcaacttatggaccttatatttttggtcagtactattgtatttctaaagctatggga
aaaaaagcaggaattaatgctaaagctagccatatattattatcatttaaaggttcagca
ggaccacaagctaatagaactaaagaagaagcaaaagcaaaagcaactgctttgttagca
caagcacaagcaaatccaagttcttttgctatgttagcaatgactaattctgatgataat
tctaagcaacaagggggcgatttaggttatttctcaaaaggacaaatgactaaaaatttc
gaaaattttgtgtatggaaatccagttggaaaaataggtttagttgaaacggaatttggt
taccatgtaattcaagtaacagataagcaagatggaatacgcttggctactattgctcaa
aaaatacttccttcagaagctacaagcgatgctgcgtttactaaggcatctaaatttgaa
attttagccaatgaaaaagggtttgataatgcagtaaaggcagaaaaattaaccgttgct
ccagcagcaagagtgtttgctttagatgaaaatattcctggtgtaggagcacagagagaa
attgtacgttgggcattttcagctgataaaaatgatgttaaacgttttcagactccaaat
gctcatgttatcgtgaaattaaaatctatcaatgattcagggttaatgtctattgaagaa
gctaaaaatgcttttggatataaattaagaaacgagaaaaaagtgaaaatgattgaagac
aaaatgaaaggagctactttagaagctgtggctaaagcaacaggttcgccagttaaagaa
gcaaaagatgtatctgcagcaggatctttcattgaatcaataggtccagaaccaaaagta
gtaggtgaagctttttcattaaagcaaggagtagtgtcgccaacaattgctggtaattct
ggagtatttaaaataaaagtgataggttctaaaaaagcagctccatcaaaagattttaaa
gagatcatagcacgtttaggagtacaatcaaaaagttcttcagcagctaggttacttttc
ttattaaaacgtgatgctaaaattgaagataatagagcacagtttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system