Flavobacterium oreochromis: JJC03_02875
Help
Entry
JJC03_02875 CDS
T08111
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
foe
Flavobacterium oreochromis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYS86955
LinkDB
All DBs
Position
584564..588418
Genome browser
AA seq
1284 aa
AA seq
DB search
MVFTALNPNTNYSFVVTNAAGCSSIQSINITINNSICAVTETTAPINGLAGGTTAPLTAN
DTLNGVNVTIGTAPGNVKITASTVPTGSGLIVNPDGTVSIPANTPSGTYTVNYTICEINN
PTNCSNVNSNILVSNPTIIAVTETTAPINGLAGGTTAPLTANDTLNGVNVTIGTAPGNVK
ITASTVPTGSGLIVNPDGTVSIPANTPSGTYTINYTICEINNPTNCSNVNSNILVSNPTI
IAVTETTAPINGLAGGTTAPLTANDTLNGVNVTIGTAPGNVKITASTVPTGSGLIVNPDG
TVSIPANTPSGTYTVNYTICEINNPTNCSNVNSNILVSNPTIIAVTETTAPINGLAGGTT
APLTANDTLNGVNVTIGTAPGNVKITASTVPTGSGLIVNPDGTVSIPANTPSGTYTVNYT
ICEINNPTNCSNVNSNILVSNPTIIAVTETTAPINGLAGGTTAPLTANDTLNGVNVTIGT
APGNVKITASTVPTGSGLIVNPDGTVSIPANTPSGTYTINYTICEINNPTNCSNVNSNIL
VSNPTIIAVTETTAPINGLAGGTTAPLTANDTLNGVNVTIGTAPGNVKITASTVPTGSGL
IVNPDGTVSIPANTPSGTYTVNYTICEINNPTNCSNVNSNILVSNPTIIAVTETTAPING
LAGGTTAPLTANDTLNGVNVTIGTAPGNVKITASTVPTGSGLIVNPDGTVSIPANTPSGT
YTVNYTICEINNPTNCSNVNSNILVSNPTIIAVTETTAPINGLAGGTTAPLTANDTLNGV
NVTIGTAPGNVKITASTVPTGSGLIVNPDGTVSIPANTPSGTYTVNYTICEINNPTNCSN
VNSNILVSNPTIIAVTETTAPINGLAGGTTAPLTANDTLNGVNVTIGTAPGNVKITASTV
PTGSGLIVNPDGTVSIPANTPSGTYTINYTICEINNPTNCSNVNSNILVSNPTIIAVTET
TAPINGLAGGTTAPLTANDTLNGVNVTIGTAPGNVKITASTVPTGSGLIVNPDGTVSIPA
NTPSGTYTVNYTICEINNPTNCSNVNSNILVSNPTIIAVTETTAPINGLAGGTTAPLTAN
DTLNGVNVTIGTAPGNVKITASTVPTGSGLIVNPDGTVSIPANTPSGTYTVNYTICEINN
PTNCSNVNSNILVSNPTIIAVTETTAPINGLAGGTTAPLTANDTLNGVNVTIGTAPGNVK
ITASTVPTGSGLIVNPDGTVSIPANTPSGTYTVNYTICEINNPTNCSNVNSNILVISPSI
NAQNDTFVTTNGSIGGIVGSIFFK
NT seq
3855 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggtttttacggctctaaatcctaatactaattatagttttgtggttactaatgctgcg
gggtgttcttctattcaatcaataaatataactataaacaattctatatgtgccgtaacc
gaaacaacagctcctattaacggccttgcaggaggaactactgcaccattaacagcaaat
gatacattaaatggagtaaatgttaccataggtacagcaccaggcaatgtaaaaataaca
gcttctacagtacctacaggatcaggactaatagtaaatccagacggaacagttagcata
ccagccaatactccttcaggaacttacaccgttaattacaccatttgtgagattaataat
ccaacaaactgtagcaacgttaattctaatatactagttagcaatccaactattatagcg
gtaaccgaaacaacagctcctattaacggccttgcaggaggaactactgcaccattaaca
gcaaatgatacattaaatggagtaaatgttaccataggtacagcaccaggcaatgtaaaa
ataacagcttctacagtacctacaggatcaggactaatagtaaatccagacggaacagtt
agcataccagccaatactccttcaggaacttacaccattaattacaccatttgtgagatt
aataatccaacaaactgtagcaacgttaattctaatatactagttagcaatccaactatt
atagcggtaaccgaaacaacagctcctattaacggccttgcaggaggaactactgcacca
ttaacagcaaatgatacattaaatggagtaaatgttaccataggtacagcaccaggcaat
gtaaaaataacagcttctacagtacctacaggatcaggactaatagtaaatccagacgga
acagttagcataccagccaatactccttcaggaacttacaccgttaattacaccatttgt
gagattaataatccaacaaactgtagcaacgttaattctaatatactagttagcaatcca
actattatagcggtaaccgaaacaacagctcctattaacggccttgcaggaggaactact
gcaccattaacagcaaatgatacattaaatggagtaaatgttaccataggtacagcacca
ggcaatgtaaaaataacagcttctacagtacctacaggatcaggactaatagtaaatcca
gacggaacagttagcataccagccaatactccttcaggaacttacaccgttaattacacc
atttgtgagattaataatccaacaaactgtagcaacgttaattctaatatactagttagc
aatccaactattatagcggtaaccgaaacaacagctcctattaacggccttgcaggagga
actactgcaccattaacagcaaatgatacattaaatggagtaaatgttaccataggtaca
gcaccaggcaatgtaaaaataacagcttctacagtacctacaggatcaggactaatagta
aatccagacggaacagttagcataccagccaatactccttcaggaacttacaccattaat
tacaccatttgtgagattaataatccaacaaactgtagcaacgttaattctaatatacta
gttagcaatccaactattatagcggtaaccgaaacaacagctcctattaacggccttgca
ggaggaactactgcaccattaacagcaaatgatacattaaatggagtaaatgttaccata
ggtacagcaccaggcaatgtaaaaataacagcttctacagtacctacaggatcaggacta
atagtaaatccagacggaacagttagcataccagccaatactccttcaggaacttacacc
gttaattacaccatttgtgagattaataatccaacaaactgtagcaacgttaattctaat
atactagttagcaatccaactattatagcggtaaccgaaacaacagctcctattaacggc
cttgcaggaggaactactgcaccattaacagcaaatgatacattaaatggagtaaatgtt
accataggtacagcaccaggcaatgtaaaaataacagcttctacagtacctacaggatca
ggactaatagtaaatccagacggaacagttagcataccagccaatactccttcaggaact
tacaccgttaattacaccatttgtgagattaataatccaacaaactgtagcaacgttaat
tctaatatactagttagcaatccaactattatagcggtaaccgaaacaacagctcctatt
aacggccttgcaggaggaactactgcaccattaacagcaaatgatacattaaatggagta
aatgttaccataggtacagcaccaggcaatgtaaaaataacagcttctacagtacctaca
ggatcaggactaatagtaaatccagacggaacagttagcataccagccaatactccttca
ggaacttacaccgttaattacaccatttgtgagattaataatccaacaaactgtagcaac
gttaattctaatatactagttagcaatccaactattatagcggtaaccgaaacaacagct
cctattaacggccttgcaggaggaactactgcaccattaacagcaaatgatacattaaat
ggagtaaatgttaccataggtacagcaccaggcaatgtaaaaataacagcttctacagta
cctacaggatcaggactaatagtaaatccagacggaacagttagcataccagccaatact
ccttcaggaacttacaccattaattacaccatttgtgagattaataatccaacaaactgt
agcaacgttaattctaatatactagttagcaatccaactattatagcggtaaccgaaaca
acagctcctattaacggccttgcaggaggaactactgcaccattaacagcaaatgataca
ttaaatggagtaaatgttaccataggtacagcaccaggcaatgtaaaaataacagcttct
acagtacctacaggatcaggactaatagtaaatccagacggaacagttagcataccagcc
aatactccttcaggaacttacaccgttaattacaccatttgtgagattaataatccaaca
aactgtagcaacgttaattctaatatactagttagcaatccaactattatagcggtaacc
gaaacaacagctcctattaacggccttgcaggaggaactactgcaccattaacagcaaat
gatacattaaatggagtaaatgttaccataggtacagcaccaggcaatgtaaaaataaca
gcttctacagtacctacaggatcaggactaatagtaaatccagacggaacagttagcata
ccagccaatactccttcaggaacttacaccgttaattacaccatttgtgagattaataat
ccaacaaactgtagcaacgttaattctaatatactagttagcaatccaactattatagcg
gtaaccgaaacaacagctcctattaacggccttgcaggaggaactactgcaccattaaca
gcaaatgatacattaaatggagtaaatgttaccataggtacagcaccaggcaatgtaaaa
ataacagcttctacagtacctacaggatcaggactaatagtaaatccagacggaacagtt
agcataccagccaatactccttcgggaacttacaccgttaattacaccatttgtgagatt
aataatccaacaaactgtagcaacgttaattctaatatactagttatttctccaagtatc
aatgctcaaaatgacacttttgtgactacaaatggaagtataggagggatagtagggtct
atttttttcaaataa
DBGET
integrated database retrieval system