Flavobacterium oreochromis: JJC03_03920
Help
Entry
JJC03_03920 CDS
T08111
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18989
multidrug efflux pump
Organism
foe
Flavobacterium oreochromis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
foe00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
foe02000
]
JJC03_03920
Transporters [BR:
foe02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
JJC03_03920
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
SecD_SecF_C
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYS87118
LinkDB
All DBs
Position
complement(801844..805305)
Genome browser
AA seq
1153 aa
AA seq
DB search
MSHNQKEFSISSWAVDNRVTVYIFTLIVVITGIYAYITMPREDFPEVIENKIYISSVFPG
NSAKDVEKLVIKPLEDEIKNISGVNKVTSDSYQDYGMIVVEFDDNITTDQGKALIKDKVD
VSKANVNWPVLDNGGKVEPSVFSLNISEEIPILNINLRGNYTTQQLKKYGKYLEEEIKRI
PEIKKVDILGVDTKEVEIAIDVYKMNAAQVSFDDIANAVRYENMSLSGGNLVSQGIRNNI
RITGEITNPVELENIIVKTFGGAVYLKDIATITFKEKEKTTFAREKREEVVMLNVKKRSG
QNMISAIEKVKEVINKAKETVLPKDLEISLTNDQSSKVEHKVEELSNHIIFGIILVMVVL
MFTMGLRNSLFVGAAIPLSIFIAFTILQGVGVTMNTMVLFGLVMGLGMLVDDGIVVVDNV
FANMQKGMPRVQASKIGIGEIAWPVISSTATTLMAFLPFALWPGTMGKFMMYFPLTLSVT
LGASLFVAMVTNAAMTGGSMDIVDRNISFKSLKNNTKIFLILGVVFIAIGYSFDVKIAKA
IGHISLIAIALMWLYYKKLFQWTQDFQHSFFPRMEERYKEMLANILTGKRAWKAFGIIVM
MLFFSFILVGVFPRKVLFFPNNTPNQVIAYIEYPQGTSIDKTNRATDYVEKQILSVLDKY
VDSDTKENYLANSVIAQVGVGATNPQIDLGVQSETPHKGKVTINFSEFKFRRGVNTSDVM
EEIRLKIRTIPGASVTVEKDAAGPPAGYPISIELTGTDYDLMLKEADKMIAFLNTKNIPG
VEKLKVDINKESPELSVKIDRVNAGSLGASTGMTGFTLRRAVYGQEISTYKEGDDKYNIV
MRLQDEQRKNESTLFNQPLTYRNPNTGQIMQVPIAAVSNVEKTKTYNQIKRKNYRRIMTV
YSNILTGYNGNEITKVIANELKNYKLPSDITYGFSGVQEEQGKNQNFLFFALFLALAGIT
TIIVLQFNSISKTLVIMFTVLLSFSGVFYGYVIARMDFVVLMTMMGIISLAGIVVKNGIV
LMDFFVLLMDKKVEDNGLETHDDLTLEQIKEVIIESGKSRLRPVLLTALTAVLGLIPLAI
GLNFDFFGLITDLNPHLYMGGDNVIFWGPLAWTIIFGLTYATVLTLVMVPVMFYLVKRIK
YWLRDKKLKSELK
NT seq
3462 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcacataatcaaaaagaatttagtatatctagttgggcagtcgataacagagtgacc
gtctatatatttaccttaatagttgtaattacaggtatatatgcctatataactatgcct
cgtgaagattttccagaggttatagaaaataaaatttatatatcttctgtatttcctgga
aattcagcgaaagacgttgaaaaactggtaataaaacccttagaggatgaaataaaaaat
attagtggtgtcaataaagtcacatctgattcatatcaagattatggtatgattgtagtt
gaatttgatgataatattactactgatcagggtaaagccttgattaaagataaagtagat
gtttctaaagcgaacgtaaactggcctgtattagataacggaggtaaagtagaacccagt
gtatttagcttaaatatttcagaagaaatacctattttaaatattaatttgagagggaat
tatacaactcaacaattaaaaaaatatggaaaatatctcgaagaagaaattaaaaggatt
ccagaaataaaaaaagtagatatattaggtgttgatactaaagaagttgagattgcaata
gatgtctataaaatgaatgccgctcaagttagctttgatgatatagcaaacgctgttagg
tatgaaaatatgtctctttcaggaggaaatttggtttcccaaggaattcgtaacaatatt
agaataacaggagaaataaccaatcctgtagaattagaaaacattattgtaaaaaccttt
ggaggagctgtttatttaaaagatattgcaactattacttttaaagaaaaagaaaaaacc
acttttgcaagagaaaaaagagaagaagttgtaatgcttaacgtaaaaaaacgttctggg
caaaatatgatttcagctatagaaaaagtaaaagaagttattaataaagcaaaagaaacc
gttttacctaaagatttagaaattagtttaacaaatgaccaatcttctaaagtagaacat
aaagtagaagagctttcaaaccatattatttttggaataatattagttatggttgtttta
atgtttacaatgggattacgtaattcattgtttgttggagcagctattcctttatcaata
tttatagcttttacaattcttcaaggagtaggagttactatgaatacgatggtattattt
ggtcttgtaatgggcttaggtatgttagttgatgatggtatagttgtggtcgataatgtc
tttgcaaatatgcaaaaaggaatgcctcgagttcaagcttctaaaataggtattggagaa
attgcttggcccgtaatttcttcaactgcaactacccttatggcctttttaccttttgca
ttatggcctggtactatgggaaaatttatgatgtattttccattaaccctgtctgtaaca
ttaggagcttcattatttgtagctatggttactaatgctgctatgacaggaggttctatg
gatattgtagacagaaatatatcttttaaatcacttaagaataatacgaaaatattttta
attctgggtgttgtttttatagccataggatattcttttgatgtaaaaatagcaaaggca
ataggacatatttcattaattgcaattgcattaatgtggttatattataaaaaactattt
caatggactcaggattttcaacatagtttctttcctcgaatggaagaaagatacaaagaa
atgttggcaaacattttaacaggaaaaagagcatggaaagcatttggaataattgtgatg
atgttatttttctcttttatattagtaggtgtttttccaagaaaagtacttttcttccct
aataacactcctaatcaggtaatagcatatattgaatacccacaagggacctctattgat
aagactaatagagctacagattatgttgaaaaacaaattttatctgttttagataagtat
gtagactcagataccaaagaaaattaccttgctaattcagttattgcacaagttggggta
ggagctactaaccctcaaatagatcttggagtacagtcagaaacaccacataaaggaaaa
gtaacaattaatttttctgagtttaaatttagaagaggggttaatacttctgatgtaatg
gaagaaattagattaaaaatcagaacaattccaggagcttcagtaacagttgaaaaagat
gcagcaggaccacctgctggttatcctattagtatagaattaacaggtactgattatgat
ttgatgttaaaagaagcagataaaatgattgcctttttaaacacaaaaaatatacctgga
gttgaaaaactaaaagtagatataaacaaagaaagtccagagttatctgttaaaattgat
agagtgaatgctggaagtttaggagcttctacaggtatgactggttttactcttcgtcgt
gctgtatacggtcaagaaatttcaacatacaaagaaggagatgataaatataatatagta
atgcgcttacaagatgaacaacgtaaaaatgagagcacattatttaaccaacctttaact
tatagaaatcctaatacagggcagattatgcaagttcctattgctgctgtatcaaatgtt
gaaaaaacaaagacatataatcaaattaaaagaaaaaattatagacgtattatgactgtt
tactctaatattctaacagggtataacggaaatgaaattacaaaagtaatagcaaatgag
ttaaagaactataaacttccaagtgatataacttatggtttttctggagtacaggaagaa
caaggtaaaaatcaaaactttttgttctttgccctattcttagctttagcaggtattaca
actattattgttttacaatttaattctatttctaaaactttagtaattatgtttactgtc
ttattaagttttagtggtgttttttatggttatgtaattgctcgaatggattttgttgtg
cttatgaccatgatggggattatttcgttagcaggtattgttgtgaaaaatggtattgta
ttaatggacttttttgtattactaatggataaaaaagtagaagataacggattagaaact
catgatgatttgacattagaacaaataaaagaggttattatagagtcaggaaaatctcgt
ttacgtcctgtattgttaaccgcattaaccgctgtattaggattgataccattagcaatt
ggattaaattttgatttctttggattaattacagatctcaatccgcacttgtatatggga
ggggataatgtaattttctggggacctcttgcttggactattatttttggtttgacttat
gcaactgtcttaacattagtaatggtgcccgtaatgttttatttagttaaacgtattaaa
tactggttaagagataaaaaattaaaaagtgaattaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
