Flavobacterium oreochromis: JJC03_05220
Help
Entry
JJC03_05220 CDS
T08111
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
foe
Flavobacterium oreochromis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4175
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYS87318
LinkDB
All DBs
Position
complement(1063206..1066565)
Genome browser
AA seq
1119 aa
AA seq
DB search
MESKQLIFVKLESFIKKYYTNELLRGSLFFIGLGLLYFLFTSFIEYFLWLQPTGRTILFW
LFITVELFLLIRFIIIPLFKLFKLQKGLSYEQASFIIGKHFTEVNDKLVNFLQLVNNSNQ
SELLLASIDQKAKSLQPIPFVNAIDFRKNKKYIPLALIPFLIILFFMISGKEEYLAQGMH
RVVNYDQHFSPPAPFELFIKDSLITQQNKDFTLTVFSKGKVNPDKAIIVIGNEQYFMENT
AAGTFQYTFENPLADTDFYIQSNEVISKNYHLKVNSVPAITHFEMLLNFPNYLGKKPELI
RGTGNAVIPEGTTITWSIKAQSTEIVRMNINNSLSSFNFKNNNFIFSKKINQNSEYQIVT
SNKDVKDFEKLTYSLNVIKDQYPSIKIETIPDSLHVSKPYLIGQIADDYGFHRLSIIYFP
KDKMSQAKRGTLSFKQGIYDKFIFNFPGSLPIDRGVQYDYYFEISDNDFLNGFKTSKSAV
FSHRESTEEEKQEEFLQQQNDNINSLSKSLKLQDKQQLELEKIEQVGKEKKELNYKEQQK
INDFIKRQKEQEELLKNYSEKIKENLDQFKPTSKDLKKEELENRLDNVQQDLDKNKKLLD
ELKNLNEKLQHEELFDKIEKFQQKSKNQTKSLEQLVELTKRYYIEQKAKQLVDKLEKLAD
QEEELSNNKDNNEKEQNELNSSFDRLQKELNDLDKENKKLKKPLKIPSDIEKQNSIDNDM
KNASNELKNKNNAKASTKQKSAARKMRQMSQSIEKDMQGGDKEQMNEDIKMLRQIVDNLL
RFSFSEEKLMNNFKSINGTSASFSKYIKTQQDLKNQFKHVDDSLFTMSLRNPKIGEKVTK
EIGTIYYNLDKSIDYFTENQLARGVSSQQYTFTSANNLANLLADVLDNMQMSMSGSGSGQ
GNPSPGKGKGSGMQLPDIIMRQEELAKKMSKDKSNKPSSSGSSGSGEGKEPNGNGNKSGG
QGGSSSKDGNSKQNNSSETNEGNAQDIIDILKEQQQLRDALEKELHKQGLGSQGQNAIEQ
MKQLEKQLITKGFNKQLVQKALNLKYELLKLQEAAQQQNQDNKREGVTNKKEFQNSSPAL
PQKLQEYLNSIEILNRQSLPLRSQFNKRIQEYFKKNDKL
NT seq
3360 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggaatcaaaacagctcatattcgttaaattagaaagttttattaaaaaatattatact
aatgaattacttcgtggtagcttattttttattggattaggtttattatattttttattt
actagttttattgaatattttttgtggttacaacccacaggaagaaccatattattttgg
ttatttatcactgtggaattgtttttacttattcgttttataataataccattatttaaa
ttatttaaacttcaaaaaggattaagctatgaacaagcatcatttataataggtaaacac
tttactgaggtaaatgataagttagttaatttcttacagttagtaaataattcaaatcaa
tcagaattactattagcttctatagatcaaaaagcaaaaagcttgcaacctattcctttt
gtgaatgcaatagattttagaaaaaataaaaagtatattccattggctttaattcctttt
cttattattttattttttatgatttcaggaaaagaagaatatttagcacaaggtatgcat
cgtgtagttaattatgatcaacatttctctcctcctgctccatttgaattattcattaaa
gattcattaattacccaacaaaataaagattttactttaactgttttttctaaaggtaaa
gtaaatccagataaagcaattattgttataggtaatgaacaatattttatggaaaataca
gcagcaggtacttttcaatatacttttgaaaatcctttagctgatactgatttttatatt
caatcaaatgaagtaataagtaagaattatcatttaaaagttaattcagttccagctatt
actcattttgaaatgctattaaatttccctaactatttaggtaaaaaaccagagttaata
agaggtactggtaatgcagttattcctgaagggactactattacttggagtattaaagct
caatcgacagaaatagttcgtatgaatatcaataattcattgagtagttttaattttaaa
aataataactttattttttcaaaaaaaatcaatcaaaattcagaatatcaaatagttact
tcaaataaagatgtaaaagacttcgaaaaactcacatattctttgaatgttattaaagat
cagtatccaagtataaaaatagaaacgattccagatagtttacatgtttctaaaccttat
ttaattggtcaaattgcagatgattatggtttccatcgtttgagtattatatattttcca
aaagataaaatgagtcaagcaaaacgtggaacactatcttttaaacaaggtatttatgat
aaatttatttttaattttcctggttcattacctatagatagaggagttcagtatgattat
tattttgaaatttctgataatgattttttaaatggttttaaaacttctaagtctgctgta
ttttcacaccgtgagtctacagaagaagaaaaacaagaagaatttttacaacaacaaaac
gataatattaatagcctttctaaatctttaaaattacaggataaacaacaattagaatta
gagaaaatagaacaagtgggtaaagagaaaaaagaactgaattataaagaacaacaaaaa
attaatgattttataaaacgtcaaaaagaacaagaagaattattaaaaaattattctgaa
aaaataaaagaaaatttagatcaatttaaacctacttctaaagatcttaaaaaagaagaa
ttagaaaatcgcttagataatgtgcaacaagatttagataaaaacaagaaactattagat
gaattaaaaaatctaaatgaaaaattacagcatgaagaattatttgataaaattgaaaag
tttcagcaaaaatctaagaatcaaactaaaagtttagaacagttagtagaattgactaag
cgttattatattgaacaaaaagcaaagcaacttgtagataaattagaaaaactagcagat
caagaagaagaattatctaataataaagacaataatgaaaaggaacagaatgaattaaat
tcttcttttgatcgtttacaaaaagaattaaatgatttagataaagaaaataaaaagcta
aagaaacctttaaaaataccttccgatatagaaaagcagaatagtattgataatgatatg
aagaatgcaagcaatgaattaaaaaataaaaataatgctaaagctagtactaaacaaaaa
agtgctgctcgaaaaatgcgtcagatgtcgcaatcaatagaaaaagatatgcaaggtggt
gataaagaacaaatgaatgaagatattaaaatgcttcgtcaaattgtagataatctactt
agattttcattttcagaagaaaaattaatgaataatttcaagagtattaatggaacatct
gcgtcattttctaaatatataaagacacaacaagatttaaaaaatcagtttaaacatgta
gatgatagtttatttacgatgtcattacgtaatcctaaaataggagaaaaagttacaaaa
gaaataggtactatttattataacttagataaatcaatagattattttacagaaaatcaa
cttgctcgcggtgtttctagtcaacaatatacatttactagtgctaataatttagctaat
ttattagcagatgttttagataatatgcaaatgtctatgtcgggatcaggatcaggtcaa
ggtaatcctagtcctggaaaaggaaaaggttctggtatgcaattaccagatataattatg
agacaagaagagttagctaaaaaaatgagtaaagataaatctaataaacctagttcatca
ggatcttctggtagtggtgaaggaaaagaaccaaacggaaatggtaataaatcaggtggt
caaggaggttctagttctaaagatggtaattcaaaacaaaataattctagtgaaactaat
gagggtaacgcacaagatattatagatattttaaaggagcaacagcaattacgagatgct
ttagaaaaagaattacataaacaaggattaggttcacaagggcaaaatgctatagaacaa
atgaaacaattagaaaagcaattgataacaaaaggtttcaataaacagttggttcaaaaa
gcattaaatttaaaatatgaactattaaaattacaagaagccgctcaacaacaaaatcaa
gataataaaagagaaggagtaactaataaaaaagaatttcaaaactcctctcctgcccta
ccgcaaaagttacaagaatatttaaatagtatagaaatattaaatagacaaagcttacct
ttgcgctcgcaatttaataaacgtattcaagaatattttaaaaaaaatgataaattataa
DBGET
integrated database retrieval system