KEGG   Flavobacterium oreochromis: JJC03_08835
Entry
JJC03_08835       CDS       T08111                                 
Name
(GenBank) gliding motility-associated C-terminal domain-containing protein
Organism
foe  Flavobacterium oreochromis
SSDB
Motif
Pfam: DUF11 NPCBM_assoc CHU_C SpaA He_PIG SdrD_B CARDB
Other DBs
NCBI-ProteinID: QYS85361
LinkDB
Position
1861329..1870142
AA seq 2937 aa
MVEKIPKIYIDKFRNLIFLTCLVASFFLPVQKNYSQCGSGFQQGGFLMSVSNEIHAVNIR
TGKTTLISTSPFVAGGGALGLNSFATNTAAKVMYYTNTVTGATNTALYAYNIATNSHSIV
SSDVRAQGVLLGGNGVGSGGAAFDGGFLYLAIENLATGSGTADNDTVIYRCTMSADGLTL
VNAVPVMQIDPSDSMGDFGVVGNLMVRAYSGNVIEYTFPAVYTAGINTAPSFTTPGDPSY
VSQVAQDNLNNLWIVADGFRQYFPSTHTFSATTIPTTDGINNVPSPNDAGGCVAADAVIG
DRVYRDYNNNGLFDGIDVGIAGVTINIYDDFNGNGIIDAGTDTLLTIVTTGVGGIYNVSN
LLPGNYIIRVTDTGNVIGGTAVSTTGGNIQVEALSISESNLSHDFGYFTPNSDLGIVKTV
SDATPNVGSNVTFTLTVTNTGISNATGVTVNDLLPSGYTFVGSLPSVGTYNSGTGVWSIG
GLANGAIATLNIVATVKATGNYANTATVTGTELDPTLTNNSSTSTPSPKNVVDAVNDSAI
TLASGSTSVVVPGNVTTNDTLNGVAVTGTNTNVTPVTNGPLSVDANGVITLAPNTVSGTY
TVTYQLCEADPVTGNNLVPANCDTAIATVVVSNPLVATNDTLPGTGGSVLGNDTLNGVAV
TTSNTDVTPATNGPLSIDANGNVTVAANTPSGSYPITYTICETGSVPANCKTATATVVVL
NPIDAVNDTPAVVTVGDSTPSVILNDTLDGAPAVIGTNPGQVALTPVTVPAGLTLKADGT
ITVNANTPSGTYVVTYQICENGAVPANCDTATATVVVLNPIDAVNDTPAVVTVGDSTPSV
ILNDTLDGAPAVIGTNPGQVALTPVTVPAGLTLNADGRITVNPLTPSGTYVVTYQICENG
ALPNPPGNCDTATATVVVLNPIDAVNDTPAVVTGGDTTPSVILNDTLDGAPAVIGTNPGQ
VALTPVTVPAGLTLNADGRITVNPLTPSGTYVVTYQICENGALPNPPGNCDTATATVVVL
NPIDAVNDTPAVVTVGDSTSSVILNDTLDGAPAVIGTNPGQVALTPVTVPAGLTLNADGR
ITVNPLTPSGTYVVTYQICENGALPNPPGNCDTATATVVVLNPIDAVNDTPAVVTVGDST
SSVILNDTLDGAPAVIGTNPGQVALTPVTVPAGLTLNADGTITVNANTPSGTYVVTYQIC
ENGALPNPPGNCDTATATVVVLNPIDAVNDTPAVVTGGDTTPSVILNDTFNNLPAVIGTN
PGQVALTPVTVPAGLTLNADGTITVNANTPSGTYVVTYQICENGALPNPPGNCDTATATV
VVLNPIDAVNDTPAVVTVGDSTPSVILNDTLDGAPAVIGTNPGQVALTPVTVPAGLTLNA
DGRITVNPLTPSGTYVVTYQICENGALPNPPGNCDTATATVVVLNPIDAVNDTPAVVTGG
DTTPSVILNDTLDGAPAVIGTNPGQVALTPVTVPAGLTLNADGRITVNPLTPSGTYVVTY
QICENGALPNPPGNCDTATATVVVLNPIDAVNDTPAVVTGGDSTPSVILNDTFNNLPAVI
GTNPGQVALTPVTVPAGLTLNADGTITVNANTPSGTYVVTYQICENGALPNPPGNCDTAT
ATVVVLNPIDAVNDTPAVVTVGDSTPSVILNDTLDGAPAVIGTNPGQVALTPVTVPAGLT
LNADGTITVNANTPSGTYVVTYQICENGAVPANCDTATATVVVLNPIDAVNDTPAVVTVG
DSTPSVILNDTLDGAPAVIGTNPGQVALTPVTVPAGLTLNADGRITVNPLTPSGTYVVTY
QICENGAVPANCDTATATVVVLNPIDAVNDTPAVVTVGDSTPSVILNDTLDGAPAVIGTN
PGQVALTPVTVPAGLTLNADGTITVNANTPSGTYVVTYQICENGALPNPPGNCDTATATV
VVLNPIDAVNDTPAVVTVGDSTPSVILNDTLDGAPAVIGTNPGQVALTPVTVPAGLTLNA
DGRITVNPLTPSGTYVVTYQICENGALPNPPGNCDTATATVVVLNPIDAVNDTPAVVTVG
DSTPSVILNDTLDGAPAVIGTNPGQVALTPVTVPAGLTLNADGRITVNPLTPSGTYVVTY
QICENGALPNPPGNCDTATATVVVLNPIDAVNDTPAVVTVGDSTPSVILNDTLDGAPAVI
GTNPGQVALTPVTVPAGLTLNADGRITVNPLTPSGTYVVTYQICENGALPNPPGNCDTAT
ATVVVLNPIDAVNDTPAVVTVGDSTSSVILNDTLDGAPAVIGTNPGQVALTPVTVPAGLT
LNADGTITVNANTPSGTYVVTYQICENGALPNPPGNCDTATATVVVLNPIDAVNDTPAVV
TGGDTTPSVILNDTFNNLPVVIGTNPGQVVLTPVTVPAGLTLNADGTITVNANTPSGTYV
VTYQICENGAVPGNCDTATATVVVLNPIDAVNDTPAVVTVGDSTPSVILNDTLDGAPAVI
GTNPGQVALTPVTVPAGLTLNADGTITVNANTPSGTYVVTYQICENGAVPANCDTATATV
VVLNPIDAVNDTPAVVTVGDSTPSVILNDTLDGAPAVIGTNPGQVALTPVTVPAGLTLNA
DGTITVNANTPSGTYVVTYQICENGALPNPPGNCDTATATVVVLNPIVANPDTETITAGT
TGGVVIFGNDTLGVPKVSVGSGPGQVTLTVGSLPNGFTYNAATGTVSVAPTVADGPYTFT
YTICENGAVPANCSTTTVTITVLAKVDAVDDIYSVANGSTGGIAGYVLANDTINNQGAGS
ATLSTVSLTVITSAQPVITAPANSPVPYLDIHTGNVVVPPGTPAGEYIIKYEAALAINPG
VKDPATVIVTVNPAGGDEIVIYNHMTPNGDGYNDIFLIDGIDKFPNNTVEVYNRWGVLVY
EAIGYNNNDRAFRGISTGRVTINQLEQLPEGTYYYMFKYVNAEGVTKEKAGYLYINR
NT seq 8814 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggtcgaaaaaataccaaaaatatatatagataaatttagaaacttaatttttctaact
tgtctcgttgcgtcattctttttacctgtccaaaaaaactattcacaatgtggaagtggt
tttcaacaaggaggttttttgatgagcgtatcgaatgaaattcatgcagttaatattagg
acaggtaaaacaacattaatctctactagtccatttgtggctggaggtggtgctttagga
ttaaattcttttgctactaacacagcagctaaagtaatgtattatacaaatactgttaca
ggagctacgaatacggctttatatgcttataatatagcaactaattcgcattcaattgta
agttctgatgtaagagcacaaggtgttttgttaggaggtaatggagtcgggtctggtggt
gccgcttttgacggaggttttttgtatttagctatagaaaatttagctacagggtcaggt
acagctgataatgatactgtgatatacagatgtacaatgtctgctgatggtttaacccta
gttaatgctgtaccagtaatgcagattgatcccagtgattctatgggagattttggtgta
gtaggtaatttaatggttagagcatatagtggtaatgttattgaatatacctttccagca
gtgtatactgcggggattaatacagctccttcttttacaacaccaggagatccatcttat
gtttcgcaagtagctcaagataatttaaataatttatggatagttgcggatggatttaga
caatattttccaagtactcatactttttcagctacaactataccaactacggacggaatt
aataatgttccaagtccaaatgatgcagggggatgtgttgcagcagatgcagttatagga
gatagagtttatagagattataataataatggactttttgatggtatagatgtaggaata
gctggagtaaccattaatatttatgacgattttaatggaaatggtattatagatgcaggt
actgatactttattgactatcgttactacaggagtaggaggtatttataatgtaagtaat
ttattaccaggtaattatattatacgggttactgatacaggaaatgttataggaggaact
gccgtttcaacgacaggaggaaatatacaagtagaagcattatctatatcagagtcaaat
ttatcacatgattttggatattttacccctaattctgatttaggaatagtaaaaacagtt
agtgatgctacacctaatgtaggtagcaatgtaacttttacacttacagttactaataca
ggtataagtaatgcaacaggagtgacagtgaacgatttattaccatcgggttatactttt
gttggaagtttaccttctgtaggaacatataattcaggtacgggagtttggagtattgga
ggattggcaaatggtgccattgctacattaaatattgtggctacagtgaaagctactggt
aattatgcaaatacggctacagtaacaggaactgaacttgatcctacactgactaataat
tcatctactagtacaccaagcccaaaaaatgtagttgatgcagtaaatgattcagctata
accttagcaagtggtagtacttcagtagtagttccaggaaatgtaacaacaaatgatacc
ttaaacggagtagctgttacaggtacaaatactaatgtaaccccagttactaatggtcct
ttaagtgtagatgctaatggcgttataacattagcaccaaatacagtttcaggaacgtat
accgtaacgtatcagttgtgtgaagcagatccagttacaggaaacaatttagttccagcc
aattgtgatacagcaatagctacagtagttgtaagtaatccattagtggcaacaaatgat
acattgccaggaaccggaggaagtgttttagggaatgataccttaaatggagttgcagtt
acaacatctaatacagatgtaacacctgctactaatggtccattatctatagatgcaaat
ggtaatgtaacagtagcagccaatacaccatcaggtagttatcctattacatacactatc
tgtgaaacaggatcagttccagctaactgtaagacagcgacagcaacggtagtcgtattg
aatccaattgatgctgtaaatgatactccagctgtagtaacagtaggtgatagcacacca
agtgttatcttaaatgatacgttagacggtgctccagcagtaatcggaactaacccaggt
caagttgcattaacaccagtaaccgttccagcaggtttaactttaaaagctgatggtact
atcacagtaaatgcaaacacgccatcaggaacgtatgtagttacttaccaaatttgtgaa
aatggagcagttccagcaaattgtgatacagctacagcaacagtagtggtattgaatcca
attgatgctgtaaatgatactccagcagtagtaacagtaggtgatagcacaccaagtgtt
atcttaaatgatacgttagatggtgctccagcagtaatcggaactaacccaggtcaagtt
gcattaacaccagtaaccgttccagcaggtttaactttaaacgctgatggtagaattacc
gttaatccattaactccatcaggaacgtatgtagttacttaccaaatctgtgaaaatgga
gcgttaccaaatccaccaggaaattgtgatacagctacagcaacagtagtggtattgaat
ccaattgatgctgtaaatgatactccagcagtagtaacaggaggagatacaactccaagt
gttatcttaaatgatacgttagatggtgctccagcagtaatcggaactaacccaggtcaa
gttgcattaacaccagtaaccgttccagcaggtttaactttaaacgctgatggtagaatt
accgttaatccattaactccatcaggaacgtatgtagttacttaccaaatctgtgaaaat
ggagcgttaccaaatccaccaggaaattgtgatacagctacagcaacagtagtggtattg
aatccaattgatgctgtaaatgataccccagcagtagtaacagtaggtgatagcacatca
agtgttatcttaaatgatacgttagatggtgctccagcagtaatcggaactaacccaggt
caagttgcattaacaccagtaaccgttccagcaggtttaactttaaacgctgatggtaga
attaccgttaatccattaactccatcaggaacgtatgtagttacttaccaaatctgtgaa
aatggagcgttaccaaatccaccaggaaattgtgatacagctacagcaacagtagtggta
ttgaatccaattgatgctgtaaatgataccccagcagtagtaacagtaggtgatagcaca
tcaagtgttatcttaaatgatacgttagatggtgctccagcagtaatcggaactaaccca
ggtcaagttgcattaacaccagtaaccgttccagcaggtttaactttaaacgctgatggt
actatcacagtaaatgcaaacacgccatcaggaacgtatgtagttacttaccaaatttgt
gaaaatggagcgttaccaaatccaccaggaaattgtgatacagctacagcaacagtagtg
gtattgaatccaattgatgctgtaaatgatactccagctgtagtaacaggaggagataca
actccaagtgtaattttaaacgatacttttaataaccttccagcagtaatcggaactaac
ccaggtcaagttgcattaacaccagtaaccgttccagcaggtttaactttaaacgctgat
ggtactatcacagtaaatgcaaacacgccatcaggaacgtatgtagttacttaccaaatt
tgtgaaaatggagcgttaccaaatccaccaggaaattgtgatacagctacagcaacagta
gtggtattgaatccaattgatgctgtaaatgatactccagctgtagtaacagtaggtgat
agcacaccaagtgttatcttaaatgatacgttagatggtgctccagcagtaatcggaact
aacccaggtcaagttgcattaacaccagtaaccgttccagcaggtttaactttaaacgct
gatggtagaattaccgttaatccattaactccatcaggaacgtatgtagttacttaccaa
atctgtgaaaatggagcgttaccaaatccaccaggaaattgtgatacagctacagcaaca
gtagtggtattgaatccaattgatgctgtaaatgatactccagcagtagtaacaggagga
gatacaactccaagtgttatcttaaatgatacgttagatggtgctccagcagtaatcgga
actaacccaggtcaagttgcattaacaccagtaaccgttccagcaggtttaactttaaac
gctgatggtagaattaccgttaatccattaactccatcaggaacgtatgtagttacttac
caaatctgtgaaaatggagcgttaccaaatccaccaggaaattgtgatacagctacagca
acagtagtggtattgaatccaattgatgctgtaaatgatactccagctgtagtaacagga
ggagatagcacaccaagtgtaattttaaacgatacttttaataaccttccagcagtaatc
ggaactaacccaggtcaagttgcattaacaccagtaaccgttccagcaggtttaacttta
aacgctgatggtactatcacagtaaatgcaaacacgccatcaggaacgtatgtagttact
taccaaatttgtgaaaatggagcgttaccaaatccaccaggaaattgtgatacagctaca
gcaacagtagtggtattgaatccaattgatgctgtaaatgatactccagctgtagtaaca
gtaggagatagcacaccaagtgttatcttaaatgatacgttagatggtgctccagcagta
atcggaactaacccaggtcaagttgcattaacaccagtaaccgttccagcaggtttaact
ttaaacgctgatggtactatcacagtaaatgcaaacacgccatcaggaacgtatgtagtt
acttaccaaatttgtgaaaatggagcagttccagcaaattgtgatacagctacagcaaca
gtagtggtattgaatccaattgatgctgtaaatgatactccagcagtagtaacagtaggt
gatagcacaccaagtgttatcttaaatgatacgttagacggtgctccagcagtaatcgga
actaacccaggtcaagttgctttaacaccagtaaccgttccagcaggtttaactttaaac
gctgatggtagaattaccgttaatccattaactccatcaggaacgtatgtagttacttac
caaatttgtgaaaatggagcagttccagcaaattgtgatacagctacagcaacagtagtg
gtattgaatccaatagacgcggttaacgataccccagcagtagtaacagtaggtgatagc
acaccaagtgttatcttaaatgatacgttagacggtgctccagcagtaatcggaactaac
ccaggtcaagttgcattaacaccagtaaccgttccagcaggtttaactttaaacgctgat
ggtactatcacagtaaatgcaaacacgccatcaggaacgtatgtagttacttaccaaatt
tgtgaaaatggagcgttaccaaatccaccaggaaattgtgatacagctacagcaacagta
gtggtattgaatccaattgatgctgtaaatgatactccagcagtagtaacagtaggtgat
agcacaccaagtgttatcttaaatgatacgttagacggtgctccagcagtaatcggaact
aacccaggtcaagttgctttaacaccagtaaccgttccagcaggtttaactttaaacgct
gatggtagaattaccgttaatccattaactccatcaggaacgtatgtagttacttaccaa
atctgtgaaaatggagcgttaccaaatccaccaggaaattgtgatacagctacagcaaca
gtagtggtattgaatccaattgatgctgtaaatgatactccagctgtagtaacagtagga
gatagcacaccaagtgttatcttaaatgatacgttagatggtgctccagcagtaatcgga
actaacccaggtcaagttgcattaacaccagtaaccgttccagcaggtttaactttaaac
gctgatggtagaattaccgttaatccattaactccatcaggaacgtatgtagttacttac
caaatctgtgaaaatggagcgttaccaaatccaccaggaaattgtgatacagctacagca
acagtagtggtattgaatccaattgatgctgtaaatgatactccagctgtagtaacagta
ggagatagcacaccaagtgttatcttaaatgatacgttagatggtgctccagcagtaatc
ggaactaacccaggtcaagttgcattaacaccagtaaccgttccagcaggtttaacttta
aacgctgatggtagaattaccgttaatccattaactccatcaggaacgtatgtagttact
taccaaatctgtgaaaatggagcgttaccaaatccaccaggaaattgtgatacagctaca
gcaacagtagtggtattgaatccaattgatgctgtaaatgataccccagcagtagtaaca
gtaggtgatagcacatcaagtgttatcttaaatgatacgttagatggtgctccagcagta
atcggaactaacccaggtcaagttgcattaacaccagtaaccgttccagcaggtttaact
ttaaacgctgatggtactatcacagtaaatgcaaacacgccatcaggaacgtatgtagtt
acttaccaaatttgtgaaaatggagcgttaccaaatccaccaggaaattgtgatacagct
acagcaacagtagtggtattgaatccaattgatgctgtaaatgatactccagcagtagta
acaggaggagatacaactccaagtgtaattttaaacgatacttttaataaccttccagta
gtaatcggaactaacccaggtcaagttgtattaacaccagtaaccgttccagcaggcttg
acgttaaatgctgacggtactatcacagtaaatgcaaacacgccatcaggaacgtatgta
gttacttaccaaatctgtgaaaatggagcagttccaggaaattgtgatacagctacagca
acagtagtggtattgaatccaattgatgctgtaaatgatactccagcagtagtaacagta
ggtgatagcacaccaagtgttatcttaaatgatacgttagatggtgctccagcagtaatc
ggaactaacccaggtcaagttgcattaacaccagtaaccgttccagcaggtttaacttta
aacgctgatggtactatcacagtaaatgcaaacacgccatcaggaacgtatgtagttact
taccaaatttgtgaaaatggagcagttccagcaaattgtgatacagctacagcaacagta
gtggtattgaatccaattgatgctgtaaatgatactccagcagtagtaacagtaggtgat
agcacaccaagtgttatcttaaatgatacgttagatggtgctccagcagtgatcggaact
aacccaggtcaagttgcattaacaccagtaaccgttccagcaggcttgacgttaaatgct
gacggtactatcacagtaaatgcaaacacgccatcaggaacgtatgtagttacttaccaa
atctgtgaaaatggagcgttaccaaatccaccaggaaattgtgatacagctacagcaaca
gtagtggtattgaatccaattgtagcgaatccagatacagaaactattacagcaggtaca
acaggtggtgtagtgatatttggaaatgacactttaggtgttccaaaggtttcggtaggt
tcaggtccaggacaggtgactttaacagtaggttcacttccaaatggatttacttataac
gctgctacaggtactgtgtcagtagcacctacggttgcagatggtccatatacttttacg
tatactatttgtgaaaatggagcagttccagcaaattgtagtacaactaccgtgactatt
actgtacttgctaaggtagatgctgtggatgatatatactctgtggctaatggaagtaca
ggaggaattgcaggatatgttctagcaaatgatacgatcaataatcaaggagcgggatca
gctactttgtctactgtttcgctaacagtgattacttctgctcagccagtaattactgct
ccagctaattcgcctgtaccatatttagacatacatacaggaaatgttgtagttcctcca
ggaactcctgcaggagagtatataataaagtatgaggctgctttagcaattaatccaggt
gtaaaagatccagctacagttatagtaactgtgaatccagctggaggagatgagattgta
atttataaccatatgactcccaatggagatggttataatgatattttcttgatagatggt
atagataagtttcctaataatactgtagaggtttataaccgttggggagtattagtttat
gaggcaattggttataacaataatgaccgtgcattccgaggaatatctacaggaagagtt
acgattaatcagttagagcaattaccagaagggacgtattattatatgttcaaatatgtt
aatgcagaaggggtaaccaaagaaaaagcaggttatttatatatcaatagatag

DBGET integrated database retrieval system