Formosa sp. Hel3_A1_48: FORMA_12870
Help
Entry
FORMA_12870 CDS
T04482
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
foh
Formosa sp. Hel3_A1_48
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOR26448
UniProt:
A0A1D7XSZ1
LinkDB
All DBs
Position
complement(1335471..1338371)
Genome browser
AA seq
966 aa
AA seq
DB search
MKTFLKIFTLLFGVFSFAQTTVTGTINDESGLPLPGANIIVVGTSSGAISDFDGKFSLTV
NQEPPFTVQISSVGFTSANEEITSNNQNITVVLLEGSFLDEVVVTASRVPQRIFESPITV
EKYSLKQIQRTPSADFFEGLQNVKGVQMNQTGLVFSQVNTRGFGTAYNEGFVTLVDGMNT
QAPVFGFAVGNLIGINELDVLSVELLPGSASALYGMDAYKGIMSIQSKNPFEHEGISGYY
RSGTTQQKVGGNNAFTDFGIRLAKKLSDKWAVKLSFSAKEGTEWAAGDRRHKRECSNCGD
GSIVENYDPRSPDFDAVNEYGQRLIDSPTIWQAVAGFTQQLDPTGATAQAVLNAGAAAPN
YWDDIRSTGYMEQDLFGNEARNIKGNAGIYFRPNDDTEISFSSLIGTGEAPLPAGNARYN
IKDFVVQLHKLELKSGGLTALAFYTKEDAGKTTQSTALGTSVANAMPGGIQNGWGAAYLG
NYLGVLAGGAANIPAFLGQILGDVGTGGQDINDLVGPENSLNAHFISRYGNPALGITGAN
ELMLQPGTDAFNTAISNSTNQALLTFNDNGDLGALIKDISTVSTFEANYDFEDKISFANV
IVGGLYRNFTLDTDGTLYTDYDDPIEYDEFGVYAQVQKDLFNENVSMTASMRYDKQSVME
DANVTPRLGLLFKLSEQSNIRVSGQVGYRNPTNQDKFIGLYNGEEVLLGSTKENIDRFNT
NLGGFDWTGSQVFETALNKSAFDTDGSIVSEELSYVEAEKVTSYDLGYRYNSRNFTLDMN
AYYSQYENFIGTNSVYVPAAIGQPAAVAMGLGAYAQFGVDANLDVPFDTYGFSLEAIQRL
NASTSMNFIYEYNELDYEAKANSDFELSWNTPKHRIKLGLTSNVSENLTISANARYNSEY
YYESSFIDATIRENTVVDAKVTFGINALSNVKFEIGGNNIAGREYVSIPGSGNIGSLYYG
GAKIQF
NT seq
2901 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacatttttaaagatttttacattactctttggtgtattttcctttgcacaaaca
actgtaacaggaaccatcaatgacgaaagtggattaccgcttcctggagcaaacattatt
gtcgtcggcacatcatctggagcgatttcagattttgacggtaaattctcgctaaccgtt
aatcaagaaccgccttttacagttcaaataagtagtgtagggtttacttctgcaaacgaa
gaaatcacttcaaataaccaaaacattacagttgtgctactcgagggcagcttcctcgac
gaagttgtggttacggcttcaagagttcctcaaagaatttttgaatctccaatcacagtt
gaaaaatacagcttaaagcagattcagcgcacaccttctgcagatttctttgaagggttg
caaaacgttaagggcgttcaaatgaaccaaacaggtttagtttttagtcaggtaaacact
agaggttttggaaccgcttacaacgaaggtttcgtgacattagttgatgggatgaataca
caagcacctgtttttggatttgctgtaggtaacctcattggaataaacgaacttgatgtc
ctaagtgtagaattgcttccagggtcagcttccgctctttatggtatggatgcttataaa
ggaattatgtcaattcaaagtaaaaatccttttgaacacgaaggtattagtggttattac
cgctcaggaactacccaacaaaaagttggtgggaataacgcctttacagacttcggaatt
cgcttggcaaaaaaattatctgacaaatgggctgttaaattatccttttcggccaaagag
ggtacagaatgggccgctggagacagaagacacaaaagagaatgctctaattgtggtgac
ggcagtatcgtagaaaattacgatccaagatcacctgatttcgacgcagtaaatgaatac
gggcaaagactgattgactcccctacaatatggcaagctgtagcaggttttacccaacaa
ttagacccaactggagctactgctcaagcagttctaaatgcaggagcagcagcacctaat
tattgggatgatattcgctcaacaggttacatggaacaagatttatttggaaatgaagcg
agaaacataaaaggtaacgctggaatttatttccgcccgaatgatgacactgaaatctct
ttctcttcacttattggaacaggggaagcaccactgcctgctggtaatgcacgctacaac
atcaaggattttgtagtacaattacataaattagaacttaaatcaggtgggttaaccgca
ctagctttttacacaaaagaagatgcaggtaaaacaacacaaagcaccgctttaggaact
tcagttgccaacgcaatgccaggagggatccaaaatggttggggcgcagcttatttagga
aactacctaggcgtcttagcgggtggagcagctaatattcctgcatttttagggcaaata
ttaggtgatgtaggtactggtggacaggatattaatgatcttgttggtcctgaaaatagc
cttaatgcacacttcatatctagatatggaaatcctgccttaggaataactggagcaaat
gaattaatgctgcaacctggaacagatgcatttaatacagcaatatcaaattctacaaat
caagctttattgacttttaacgataatggtgatttaggcgcacttattaaagacatctca
acagtatccacatttgaagccaattatgactttgaggacaaaataagttttgccaatgta
attgtaggcggtttatacaggaattttacattagatactgatggaaccctgtacactgat
tatgatgacccgattgaatacgacgaatttggagtttacgctcaagtacaaaaagattta
ttcaatgaaaatgtttccatgaccgcatcgatgcgttacgacaaacaaagtgtgatggaa
gacgctaatgtaacgcctagactagggttgttgtttaaattatctgaacaatcaaacatt
agagtttctggacaagttgggtacagaaacccaaccaatcaagataaatttattggccta
tacaatggtgaagaggtgttacttgggtctactaaagaaaatattgacagatttaatact
aatttaggtggttttgattggacaggaagtcaagtttttgaaactgctttgaacaaaagt
gcttttgatacagatggaagcatagtttcagaagaattaagttatgttgaagcagaaaaa
gtaacttcttacgatcttggttaccgctacaactcaagaaattttactcttgatatgaat
gcttattacagccaatatgaaaattttataggaactaatagtgtttatgtgcctgcggca
attggacagcctgcagcagtagctatgggtctaggtgcgtacgctcaatttggagttgat
gctaacttagacgttccatttgatacttacggattcagcttagaggccattcaacgctta
aacgcctctacttcaatgaatttcatttacgagtataatgagttagattacgaagccaaa
gcaaattctgattttgaattatcttggaatacgcctaagcaccgaataaaattggggctt
acttctaatgttagtgaaaaccttacaatctctgcaaatgcacgatacaattctgaatat
tattatgaatcttcatttattgacgcgacgattagagaaaacacggtcgtagatgcgaag
gttacatttgggataaatgcattaagcaacgttaagtttgaaatcggaggaaacaatatc
gctggacgcgaatatgtcagtatccctggttcaggaaatattggttctctatactatgga
ggtgccaaaatccaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system