Francisella opportunistica: CGC45_05690
Help
Entry
CGC45_05690 CDS
T06355
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K03286
OmpA-OmpF porin, OOP family
Organism
foo
Francisella opportunistica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
foo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
foo02000
]
CGC45_05690
Transporters [BR:
foo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CGC45_05690
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
OMP_b-brl
Glucodextran_B
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXH34007
UniProt:
A0A345JTR8
LinkDB
All DBs
Position
complement(1159207..1160388)
Genome browser
AA seq
393 aa
AA seq
DB search
MMRLKSIVIATSVLLGTATVSIAADSDNMDISANTNSATTQSSDFTSNTFIAPFANTYSS
LTNKDNTWGPQDRTGQWYLGVQANGLAGTPNSPSGAGANFILGYNINKYFAVQYNQLVGR
DFAGLGEGVINFSNNTMFTPYAAGGAGWANLAGQATGAWDVGGGLKFELSRNVQASVDYR
YIQTMAPSNISGANGRAGTNMIGAGLTWFFGGKNTTNNDTGKIQDNGATTAAQTIAMPTI
DESKYVLPEGIKQCEGNFNLTEDGVACYTVNGNDVTVYLDTKFAYDEATLNAKGKNAIAS
FVKFIKDSNIASVTVKGYASQGQTGSEFDIYNQKLSEKRAQAVANYMKQLGLDSEKIITK
GFGYNDTLGGIHKSDPRNQRVEASVSAPLKEDK
NT seq
1182 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgatgagattaaaaagtattgttatagctacatctgtgctactaggtacagctacagta
tcaatcgcggcagattctgataatatggatatatcagcaaatacaaattcagccactact
caaagcagtgattttacttctaatactttcattgctccctttgcaaatacttatagttct
ttaactaataaggataatacttggggccctcaagatagaactggtcaatggtacttaggt
gttcaggctaatggtcttgcaggaactcctaattcaccgtcaggtgcaggagctaacttt
atcttaggttacaatattaacaaatactttgcagttcaatataaccagttagttggtaga
gattttgctgggttaggtgaaggtgttattaactttagtaataatactatgtttactcca
tatgctgcaggtggtgctggttgggcaaacctagcaggtcaagcaactggtgcttgggat
gttggtggaggtcttaagtttgaactttctagaaatgttcaagcaagtgttgactataga
tatatccaaacaatggcacctagtaatatttctggtgctaatggtagagcaggtactaat
atgattggtgctggtttaacttggttcttcggcggcaaaaacactactaataatgatact
ggtaaaatccaagataatggtgctactacagctgcacaaactattgctatgcctactatt
gatgagtctaagtatgttttgcctgaaggtattaaacagtgtgaaggtaactttaaccta
actgaagatggtgttgcatgctatacagttaatggtaatgatgtaacagtttatttagat
actaagtttgcttacgatgaagctactttaaatgctaaaggtaaaaatgctatagcttct
tttgttaagtttatcaaagatagtaacatcgcttctgtgacggttaaaggttatgcttct
caaggccaaactggtagtgagtttgatatctataaccaaaaactttctgagaaaagagca
caagctgttgctaattacatgaagcagttaggtttagatagtgaaaagataatcactaaa
ggtttcggttataatgacactttaggtggtattcataagtctgaccctcgtaaccaacgt
gtagaagctagtgtatcagctcctcttaaagaagataaataa
DBGET
integrated database retrieval system