Formosa sediminum: FNB79_03880
Help
Entry
FNB79_03880 CDS
T06103
Name
(GenBank) VCBS repeat-containing protein
Organism
fop
Formosa sediminum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FG-GAP_3
FG-GAP
Dockerin_1
Beta-prop_BBS7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDO93151
UniProt:
A0A516GNP6
LinkDB
All DBs
Position
complement(859190..860311)
Genome browser
AA seq
373 aa
AA seq
DB search
MKYIFLALLSGCIYSAHAQESNFFNNSRTILGIHKERTASMGIGDIDNDGDMDIVVANGR
HWPGQNKIFINNGRGIFTVSKNLGTEQETSYSTELVDFNGDGFLDIAVGNDMAPNYIFFN
DGKGNFTKGNAFGEKYGHTRNIVVADLDNDGDMDILITNRGSENEICLNNGKGVFTEVIG
FGNKKDSTIDVEVADMNADGHLDLILANRDDQPNYVYLNDGHLNFTKKIPYGTGNDVTRS
VAVTDIDNDGYNDIITANIGEPNVIYFGSKKGTYDRKVVFDSSSDKSYSLSIADLNGDGK
TDIIIGNVGAPNTVFINSGDATSWEKINLKDVEYSTYDILTADLNGDGKLDIIESNSDEL
NLYYFNRFTPKFP
NT seq
1122 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtatattttcttagcacttctttcgggttgcatatattctgctcatgcccaagaa
tcgaatttttttaataacagccggactattctaggaatccataaagaacgtacagcgtca
atgggaataggtgatattgataatgatggagatatggatattgttgttgctaatggtaga
cattggccaggacaaaataaaatatttataaataacggtcgaggaatttttacagtctcg
aagaatttgggcacagaacaagaaacaagttactctacagaacttgtagattttaatggc
gatggttttttagacatagctgtaggtaacgatatggctccaaattacattttttttaac
gatggaaaaggaaactttactaaaggaaatgcgtttggagaaaaatatggacataccaga
aacattgttgtagccgatttagataacgatggagatatggacattttaattaccaataga
ggtagtgaaaacgaaatttgtttaaataacggaaaaggtgtttttacagaagttattggg
tttggtaataaaaaagattctactatagatgttgaggttgcagatatgaatgcagacggg
catttagatttgattttagccaatagagatgatcaaccaaactatgtgtatttaaatgat
ggacatctaaattttactaaaaaaataccttatggaacaggtaacgatgtcactcggtct
gtagccgttacagatatagataatgatggttataacgatattattactgctaatattggt
gagccaaatgttatttattttggcagtaaaaaggggacttacgatcgtaaagttgtattc
gacagcagttcagataaatcttactctttatctatcgctgatttaaatggcgatggaaag
acagatattataataggaaatgttggggcgcctaatacagtgtttattaattctggagat
gcaacctcttgggagaaaattaatttaaaagatgtagagtatagcacttacgatattctc
acagcagacttaaatggagatggtaaattagatattattgaaagtaattcagacgagtta
aacttgtattacttcaatagatttactccaaaattcccttga
DBGET
integrated database retrieval system