KEGG   Formosa sediminum: FNB79_11260
Entry
FNB79_11260       CDS       T06103                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
fop  Formosa sediminum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:fop00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:fop02000]
    FNB79_11260
Transporters [BR:fop02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   FNB79_11260
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel CarbopepD_reg_2 Plug CarboxypepD_reg SdrD_B DUF7037 SpaA
Other DBs
NCBI-ProteinID: QDO94519
UniProt: A0A516GSM5
LinkDB
Position
2604600..2606999
AA seq 799 aa
MRIYVLFLLLFCSMNAVSQQCDLTLSGTVKDLHDGSVLVGATLIIAGTDQAVQTNLDGAF
EFKNLCKGTYDIQVSHPFCLTQGFTVKLDANTSKIFKLEHHLEELNEVLVEGHTNKNKSK
TLVEAKVSNLELERNTSGTLGDALNSLSGVSSLNSGNAIVKPIVNGLHSSRVVIINNGVR
MEDQEWGSEHAPNMDVNAIGNLSLIKGAGALQYSGDAVGGVIVADAPKVPVKDSLYGKTI
LSGASNGRGGAVTSQLTKSYKNGWFGTLQGTWKRFGDFEAPDYVLSNTGTAERNASINIG
LNKFNYGIEGYYSYFKNEIGILSASHIGGASDLVSAINSDVPLIIDDFTYDISEPKQDIT
HHLARIKGFKKFEHLGTLTLQYDFQKNNRLEYDIRTGSDKGKPSVDLELTTHTLHLDLES
HLINGIKFKSGIKASYQDNFADPNTGVRRLIPDYDKYDLGAYAVLDYSINSKWLVEAGGR
FDYTYIDAYKYYKTSFWESRNYDELYPEIVVEEFDNQILTHPELYFYNPSVTIGATYTFG
KDYELFFNYALASRAPNPSELFSEGLHHSASRIEYGDLSFNSEIGHKIMLTLQRNNDVFS
FSVSPFVNTIKDFIVIEPTSIETTVRGSFQVWEYRQTNAQLLGVDLDASYAFTDKFRYNY
QFSFVKGYDRSQDEPLISMPPVNMKNEIVYLNPEVHNLRLALQSEYVFRQNEYPDNNFEV
YIPETESTEVVDISTPPDAYHLLNFNSSIDFNINTKSKLTLGFAVTNLLNTSYRDYLNSM
RYYADDLGRNFILNLKLNY
NT seq 2400 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcgaatttatgttctattcttactgctattttgtagtatgaatgctgtctcacagcag
tgtgatttaacactttctggaacagtaaaagatcttcatgacggttctgtgctcgtgggc
gcaaccttaattattgcaggaacagatcaggccgttcaaacaaatcttgatggagcgttt
gaatttaaaaatttatgtaaaggcacgtacgatatacaggtgtctcatccgttttgtctt
actcaagggtttacagtaaaactcgatgcaaatacatctaaaatttttaaattagaacat
catttagaagaactaaacgaggtattagtagaaggtcataccaataaaaataaatctaaa
actctggttgaagctaaagtgtctaatttagaattagaacgtaacaccagtggcacatta
ggagatgcattaaatagtttaagtggagtatcgtctttaaattcagggaatgccatagtt
aagcccattgtaaatgggttgcacagtagccgggttgtaattataaataatggtgtacgt
atggaagatcaggaatggggatctgaacatgctccaaatatggatgtaaatgcaatagga
aatcttagtcttattaaaggagcaggcgcacttcaatatagtggagatgctgttggaggt
gttatcgttgcagatgctccaaaagtacccgtaaaagattcattatatggtaaaacaata
cttagtggagcatctaatggaagaggtggtgcagtaacctcacagcttaccaaaagttat
aaaaatggatggtttggaactttacaaggtacctggaaacgttttggcgattttgaagct
ccagattatgtacttagtaatacaggaaccgcagaacgtaatgcatcaattaatatcgga
cttaataaatttaattacgggatagaaggttactattcttattttaaaaatgaaatcgga
attttaagtgcttcgcatataggtggtgcttcagatttagttagtgctataaatagtgat
gttccgttaataatagatgattttacttacgatatttctgaacctaagcaagatattact
caccacttagcgcgtattaaaggattcaaaaagtttgaacatttaggaacactaactttg
cagtatgattttcagaaaaataataggttagaatacgatattagaacgggttcagacaaa
ggtaaaccctcggtagatttggaacttacaacacatacgttgcatctggatttagagtcg
catttaattaatggcataaaatttaaaagcggaattaaagccagttatcaagataatttt
gcagatcccaatacaggagttagacgcttaatcccggattatgataaatatgatttaggg
gcttatgctgtattggattattctattaatagtaagtggttggtagaagctggaggacgt
tttgattacacttatattgatgcgtataaatactacaaaacatctttttgggaatcccga
aattatgacgagttgtatccagagatagttgttgaagagtttgataatcagattttaaca
catccggaattgtatttttataatccatctgtaaccataggtgcaacttacacctttggt
aaagattacgaattgttttttaattatgccttagcatcaagagccccaaacccttcagaa
ttatttagtgaaggcttgcaccattctgcatctagaatagaatatggtgatcttagtttc
aattcggaaattggacataaaatcatgttaaccttacagcgcaataatgatgtttttagc
ttttctgttagtccgtttgtaaatacgattaaggattttattgtaattgaacctacttct
atagagactactgttagaggaagttttcaggtatgggaatacagacaaacaaatgcacag
ttactaggtgtagatttagatgcttcttatgcttttacagataaatttagatataattat
cagttttcattcgttaaagggtacgatcgttctcaggacgaacccttaataagtatgcct
cctgtaaatatgaaaaatgaaatcgtatatctaaatcctgaagtccataatcttagatta
gcattacaaagcgagtacgtctttcgtcagaatgaatatccagataataactttgaagta
tacattccagaaacagaaagtaccgaagttgtagatattagtacacccccagatgcttat
catttattgaattttaactcaagtatagactttaatatcaataccaaatcaaaattaact
ttagggtttgctgttacaaacctattaaatacatcttatagagattacctaaatagtatg
cgttactatgcagacgatttaggacgaaattttatattaaatcttaaactcaattattaa

DBGET integrated database retrieval system