Formosa sediminum: FNB79_11260
Help
Entry
FNB79_11260 CDS
T06103
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
fop
Formosa sediminum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fop00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fop02000
]
FNB79_11260
Transporters [BR:
fop02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
FNB79_11260
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
SdrD_B
DUF7037
SpaA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDO94519
UniProt:
A0A516GSM5
LinkDB
All DBs
Position
2604600..2606999
Genome browser
AA seq
799 aa
AA seq
DB search
MRIYVLFLLLFCSMNAVSQQCDLTLSGTVKDLHDGSVLVGATLIIAGTDQAVQTNLDGAF
EFKNLCKGTYDIQVSHPFCLTQGFTVKLDANTSKIFKLEHHLEELNEVLVEGHTNKNKSK
TLVEAKVSNLELERNTSGTLGDALNSLSGVSSLNSGNAIVKPIVNGLHSSRVVIINNGVR
MEDQEWGSEHAPNMDVNAIGNLSLIKGAGALQYSGDAVGGVIVADAPKVPVKDSLYGKTI
LSGASNGRGGAVTSQLTKSYKNGWFGTLQGTWKRFGDFEAPDYVLSNTGTAERNASINIG
LNKFNYGIEGYYSYFKNEIGILSASHIGGASDLVSAINSDVPLIIDDFTYDISEPKQDIT
HHLARIKGFKKFEHLGTLTLQYDFQKNNRLEYDIRTGSDKGKPSVDLELTTHTLHLDLES
HLINGIKFKSGIKASYQDNFADPNTGVRRLIPDYDKYDLGAYAVLDYSINSKWLVEAGGR
FDYTYIDAYKYYKTSFWESRNYDELYPEIVVEEFDNQILTHPELYFYNPSVTIGATYTFG
KDYELFFNYALASRAPNPSELFSEGLHHSASRIEYGDLSFNSEIGHKIMLTLQRNNDVFS
FSVSPFVNTIKDFIVIEPTSIETTVRGSFQVWEYRQTNAQLLGVDLDASYAFTDKFRYNY
QFSFVKGYDRSQDEPLISMPPVNMKNEIVYLNPEVHNLRLALQSEYVFRQNEYPDNNFEV
YIPETESTEVVDISTPPDAYHLLNFNSSIDFNINTKSKLTLGFAVTNLLNTSYRDYLNSM
RYYADDLGRNFILNLKLNY
NT seq
2400 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgaatttatgttctattcttactgctattttgtagtatgaatgctgtctcacagcag
tgtgatttaacactttctggaacagtaaaagatcttcatgacggttctgtgctcgtgggc
gcaaccttaattattgcaggaacagatcaggccgttcaaacaaatcttgatggagcgttt
gaatttaaaaatttatgtaaaggcacgtacgatatacaggtgtctcatccgttttgtctt
actcaagggtttacagtaaaactcgatgcaaatacatctaaaatttttaaattagaacat
catttagaagaactaaacgaggtattagtagaaggtcataccaataaaaataaatctaaa
actctggttgaagctaaagtgtctaatttagaattagaacgtaacaccagtggcacatta
ggagatgcattaaatagtttaagtggagtatcgtctttaaattcagggaatgccatagtt
aagcccattgtaaatgggttgcacagtagccgggttgtaattataaataatggtgtacgt
atggaagatcaggaatggggatctgaacatgctccaaatatggatgtaaatgcaatagga
aatcttagtcttattaaaggagcaggcgcacttcaatatagtggagatgctgttggaggt
gttatcgttgcagatgctccaaaagtacccgtaaaagattcattatatggtaaaacaata
cttagtggagcatctaatggaagaggtggtgcagtaacctcacagcttaccaaaagttat
aaaaatggatggtttggaactttacaaggtacctggaaacgttttggcgattttgaagct
ccagattatgtacttagtaatacaggaaccgcagaacgtaatgcatcaattaatatcgga
cttaataaatttaattacgggatagaaggttactattcttattttaaaaatgaaatcgga
attttaagtgcttcgcatataggtggtgcttcagatttagttagtgctataaatagtgat
gttccgttaataatagatgattttacttacgatatttctgaacctaagcaagatattact
caccacttagcgcgtattaaaggattcaaaaagtttgaacatttaggaacactaactttg
cagtatgattttcagaaaaataataggttagaatacgatattagaacgggttcagacaaa
ggtaaaccctcggtagatttggaacttacaacacatacgttgcatctggatttagagtcg
catttaattaatggcataaaatttaaaagcggaattaaagccagttatcaagataatttt
gcagatcccaatacaggagttagacgcttaatcccggattatgataaatatgatttaggg
gcttatgctgtattggattattctattaatagtaagtggttggtagaagctggaggacgt
tttgattacacttatattgatgcgtataaatactacaaaacatctttttgggaatcccga
aattatgacgagttgtatccagagatagttgttgaagagtttgataatcagattttaaca
catccggaattgtatttttataatccatctgtaaccataggtgcaacttacacctttggt
aaagattacgaattgttttttaattatgccttagcatcaagagccccaaacccttcagaa
ttatttagtgaaggcttgcaccattctgcatctagaatagaatatggtgatcttagtttc
aattcggaaattggacataaaatcatgttaaccttacagcgcaataatgatgtttttagc
ttttctgttagtccgtttgtaaatacgattaaggattttattgtaattgaacctacttct
atagagactactgttagaggaagttttcaggtatgggaatacagacaaacaaatgcacag
ttactaggtgtagatttagatgcttcttatgcttttacagataaatttagatataattat
cagttttcattcgttaaagggtacgatcgttctcaggacgaacccttaataagtatgcct
cctgtaaatatgaaaaatgaaatcgtatatctaaatcctgaagtccataatcttagatta
gcattacaaagcgagtacgtctttcgtcagaatgaatatccagataataactttgaagta
tacattccagaaacagaaagtaccgaagttgtagatattagtacacccccagatgcttat
catttattgaattttaactcaagtatagactttaatatcaataccaaatcaaaattaact
ttagggtttgctgttacaaacctattaaatacatcttatagagattacctaaatagtatg
cgttactatgcagacgatttaggacgaaattttatattaaatcttaaactcaattattaa
DBGET
integrated database retrieval system