Formosa sediminum: FNB79_12540
Help
Entry
FNB79_12540 CDS
T06103
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein
Organism
fop
Formosa sediminum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_22
AAA_29
AAA_16
Zeta_toxin
AAA
AAA_25
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDO94755
UniProt:
A0A516GTB3
LinkDB
All DBs
Position
2865239..2867011
Genome browser
AA seq
590 aa
AA seq
DB search
MRHHRHPDMPQSKKASKVSMAQAFKTIIWPRRNLVFIGLILIVVSRLASLVLPWKSKVLL
DDVIPNKDYSQLYSLLAIVGGAILVQAITSFLLTKILSVQAQYLISELRAKVQKKVLSLP
ISFFDNTKSGVLVSRIMTDVEGVRNLIGTGLVQLVGGTFTAVISLVLLIRISPSMTLFVL
VPIAIFGVLALKAFKYIRPIFRKRGVINAEVTGRLTETLAGVRVIKAFNAEDQEHKAFET
GVDKLFQNVKKSLTATAVMTSSSTFLLGIASTGIMGIGGYKIMQGELTIGDFMFFTLLLG
FMIAPIVQMSNIGSQLTEALAGLDRTEELMNMQAEEDDESRTLEIENMKGDLVFNDVSFA
YEAGKNVLHNISFNAPSGSVTALVGSSGSGKSTIASLSATFLNPQSGYVAVDGYNLSKVK
LQSFRKHLGVVLQDEFLFEGTIRDNIMFPRPNATEKELLQAVNSAYVNEFTDRFENGLDT
LIGERGVKLSGGQRQRIAIARAILANPKVIILDEATSNLDTESEGYIQKSLNTLTKDRTT
IVIAHRLSTIRKADQILVIEEGKIKERGTHDELIAAQGRYYDLYTFQAKI
NT seq
1773 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagacatcacagacatcccgatatgccacaatctaaaaaagcttctaaagtgagtatg
gcacaagcttttaaaacaattatatggccccgaagaaacttagtatttattgggttaatt
ttaattgtggttagccgtttagcgagtttggtattaccttggaagagtaaagtattgtta
gacgatgttattccaaataaagattatagtcaattatatagcttattagctattgttgga
ggcgctatacttgtacaagccataacatcttttttattgactaaaatattaagtgtacaa
gcgcaatatttaatctcagaactacgagcaaaagttcagaaaaaagtattgtcgttacca
attagtttttttgataatacaaagtctggcgtattagtctcaagaataatgacagatgtt
gaaggtgttagaaacttaattggcacaggattagtacaattagtaggaggaacctttaca
gcagttatatccctagtattattaataagaataagcccctcaatgaccctctttgtgtta
gtacctattgctatttttggggtgttagctttaaaagcttttaaatatatacgtcctatt
tttagaaaacgtggcgtaataaatgcagaagttacaggccgattaactgaaacacttgca
ggagttcgagttattaaagcttttaatgcagaagatcaagaacataaagcttttgaaact
ggtgtagataaattatttcagaacgttaaaaaaagtttaacagcaactgctgtaatgacc
agctcgtctacatttttattaggtatagcatctacaggaattatgggtattggtgggtat
aaaatcatgcaaggcgaattaactattggagattttatgttctttacgctccttttaggt
tttatgatagcgcctatagtacaaatgagtaatatagggagccaattaacagaagctttg
gcaggattagatcgtaccgaagaacttatgaatatgcaagcagaggaagacgacgaaagt
cgtacgcttgagattgaaaacatgaaaggagatttggtgtttaatgatgtctcttttgct
tatgaagctggtaaaaacgtactacataatattagttttaatgcaccttcaggttctgtt
acagctttagtaggaagttctggttctggaaaatctacaattgcaagtttatctgccacg
tttttaaatcctcaatccggatatgtagctgtagatggttacaatttgtctaaagttaaa
ttacaaagttttagaaaacatttaggtgtggtacttcaagatgaatttttatttgaaggg
actattcgagataatattatgtttcctagaccaaatgctaccgaaaaagaattgttacaa
gctgtaaattctgcttatgtaaatgaattcacagaccgatttgagaatggtttagatact
ttaataggcgagcgtggtgtaaaattatctggaggtcaacgtcaacgaatcgctattgca
cgtgccattttagccaatccaaaagtgattattttagatgaagccacttcaaacttagat
acggaaagtgaaggttatattcaaaaaagtttaaataccttaactaaagatcgtactaca
attgttattgctcaccgcttaagtactatccgaaaagcagatcagattttagttattgaa
gaaggaaaaattaaagaacgtggcactcacgacgagcttattgcagcccaaggccgatac
tatgacttgtatacttttcaagcaaaaatataa
DBGET
integrated database retrieval system
