Formosa sediminum: FNB79_16280
Help
Entry
FNB79_16280 CDS
T06103
Name
(GenBank) response regulator
Organism
fop
Formosa sediminum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
HATPase_c
Response_reg
HTH_18
Y_Y_Y
HisKA
HTH_AraC
SGL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDO95755
UniProt:
A0A516GWA3
LinkDB
All DBs
Position
complement(3707627..3711754)
Genome browser
AA seq
1375 aa
AA seq
DB search
MFGQYSNLKFENLNTEEGLSSSTCLELFQDSQGFLWFGTIDGLNKYNGYDFEIFRPLLND
STSISNNRINAIQEDKQENLWIGTNNGLNFYHRDTQLFTHIPLFNQPLKLNNPKKIINTL
LYDDIANIVWVGTSDGLVKLVLSDDSSQVDQLEPVHYAFNLEHEYTIDNNNINSIGKDRD
GFIWVETNGQHLNKYNPLTDRFERVLIKHKKPYELNHIPKRLFIDSDNDFWIGNDLSNII
LWDKSKNSFKELALTQESIPFYTIYEDTAGIIWIVTDGSGIYLYDKDKDKLTNIVNNPSD
PFSLPGNQVSDVIEDKDGIFWIATYNEGISKLDVKKSSFGHYYYQKGRENGLNEKIVQSV
LQDSKGRIWLGAYNGGLNYFDEETATFTAYSHDPDDSSSLSSNKIMYTFEGNEGDIWVCT
LDRGVSKFNPETKTFKSYYHLENSNSTIGQNSVWSGIEDKNNRVWLGLRDEGLDVFNKQD
QTFHHFKIGENKQKGLLSNFVFSLFIDSNNRLLVGTSLGLNYVSLDSIGTQIPKFITFEE
VNIHGISGNRINDITEDEMHNIWLGTDIGIYKLDANLNLVKTYFTTDGLPNNLITGIKED
FNNNFWVTTRSGLSFINPTTNTIKNFNTHDGIQGMEFQSKSIDRTKDGRILAGGINGFNI
FKPSEIIMASSEKLYPRISGLKINNQYVKTGERINKKFVLTETISDTKQLELDYKQTNLS
FNYLALHFKNQEQVKYAYKMEGLDDDFIYAGTNRLVNYSNLQPGVYTFKVKATVDGDWDN
APVRSLNIRLQSPPWKTWTAYTIYAIIFLVSLWYLNKYFTNRIKEEKEHEFDQMKLEFFI
NVSHEFRTPLTLILNPLDKLMAGYNDPAVVKSSAKSIQRSARRLLYLVNQLLDYRKMEVG
MAPLQLQKGDIVKFSNDIFALFKGLALKKNIGYTFTSTTDQLYSYFDFDKIEKILTNLIS
NAIKFTNNGGEIVVSINKVLEKKKQGNFLGQSKRLTDYIEIIVEDTGIGLDKDQLNQVFS
RFYNVDVNKTGTGIGLNFCKGLVELHGGEIFVESEYGVGSKFVVRIPYNKKAETAVVEDV
KDEFLINSMKSVEYDMLISEDLDLVDDTEVSQVKDKCKILVVEDNKELREHLKSELRARY
EIIEAINGEEGLKMVHKHYPDLVVSDVMMPKMDGFELCKQLKSEFETCHIPVILLTARAL
EEDRIEGYKTGADGYLGKPFNMRVLKARISNLLETKRVLREKFSKLGAVIPSKEVTNNSI
DEAFLEKTTKIILDNISDTEFKLEHLLKEVGIGRSQFYRKIQSITGQNPSHFIRTIRLKY
ASDLLLKGMHTIKEVTHMSGFNSAAYFGKTFKELYNMTPSEYVEAHKKEVSEIED
NT seq
4128 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atttttgggcaatattctaaccttaaatttgagaatttaaatacagaagaaggactctct
agtagcacgtgcttagagctatttcaagatagtcaaggatttttgtggtttgggactatt
gatggattaaataaatataatggatatgattttgagatatttagacccttattaaacgat
tctacctctataagtaataaccgaataaatgccatacaagaagataagcaagaaaattta
tggataggtacaaataatggcttaaacttttatcatcgggacacacaactttttacacat
attccgctgtttaatcagccgcttaaactcaataatccaaaaaaaataattaatacgtta
ttatacgatgatatcgcaaatattgtttgggttgggactagtgatggtctcgttaaattg
gtgttaagtgacgattctagtcaggtagatcaattagaaccagtacattatgcgtttaat
ctagaacatgaatatacaatagataacaacaacataaactctattggaaaagatagagat
ggctttatttgggtagagaccaatggacaacatttaaataaatacaaccctttaacagac
cgttttgaacgtgttttaataaagcataaaaaaccttacgaattaaatcatattcccaaa
cgtttatttattgactctgataatgatttctggattggaaacgatttgtctaacattatt
ctttgggacaaatccaaaaatagttttaaagaacttgcgctaactcaagaaagtattcca
ttttatacaatatacgaagatactgcaggaattatttggattgtgaccgatgggtctgga
atatatttatatgataaggataaagacaagttaaccaatattgttaataatccatcagat
cccttttcgttacctggaaatcaagtgtcagatgtaattgaagataaagatggtattttc
tggattgcaacttataacgaaggcattagcaaattagatgtaaaaaaatcaagtttcgga
cattattactaccagaagggtagagaaaatggattaaatgaaaaaattgtacaatctgta
cttcaagactcaaaaggacgcatttggttaggtgcttacaatggtggtttaaattatttt
gatgaagaaacagcaacatttacagcttatagtcacgatccagacgatagtagttcttta
agttcaaataaaataatgtacacgtttgaaggtaatgagggcgatatttgggtgtgtact
ttagatcgaggtgtaagtaaatttaacccagaaactaaaacttttaaaagttattaccat
ctagaaaactctaattctacaatcggacaaaattctgtatggagtgggattgaagataaa
aataatagagtttggcttggtttaagagacgagggtttagatgtgtttaataaacaagat
cagacatttcatcattttaaaataggggaaaacaaacaaaaaggattactaagtaatttt
gtattttctttatttatagattctaataatcgcttattagtcgggacgtctttaggttta
aactatgtgagtttagatagtataggaactcaaattccaaaatttataacgtttgaagaa
gtaaatatacacgggatctctggaaaccgtataaacgatataaccgaggatgaaatgcat
aatatttggttaggtacagatataggtatttataaactagatgctaatcttaatctcgta
aaaacttactttactacagatggacttcctaacaatttaattacaggaataaaagaagac
ttcaataataatttttgggtcacaacccgaagcggactatcttttataaatccaactaca
aataccataaaaaattttaatacacatgatggaattcaaggtatggaattccaaagtaaa
tctatagaccgaactaaagatggtcgcattttagctggaggaattaatgggtttaatatt
tttaaaccttcagagattatcatggcgtcttcagagaaattatacccaagaatttctggc
ctaaaaattaataatcaatatgttaagacgggcgaacgcataaataaaaaattcgtactt
acagaaactatttcagacactaagcagttagaattagattataagcaaaccaatttatct
tttaattatttagcacttcattttaaaaatcaagagcaagtaaaatatgcatataaaatg
gaaggcttagacgatgattttatatatgcaggaactaacaggcttgtaaactattctaat
ttacagcccggagtgtatacatttaaagttaaagcaacggtagatggcgattgggataat
gcacctgtaagatctttaaatattagattgcaatcaccaccatggaaaacgtggacagcc
tatactatttatgctattattttcttggtgtctttatggtatttaaataaatattttaca
aatagaattaaagaagaaaaggaacacgaattcgaccaaatgaaactagaattctttata
aatgtttcacacgaatttagaacacctctaactttaattttaaatccgttagataaatta
atggcaggttataacgatcctgcagttgtaaaatcttctgctaaatctattcagcgtagt
gccagaagattgttgtatttagtaaatcaattactagattatagaaaaatggaagtagga
atggctccgcttcaattgcaaaaaggagatattgtaaaatttagtaacgatatttttgct
ctgtttaaaggcttagcccttaaaaagaacataggatatacatttacgtctactacagat
caattgtattcttattttgattttgataaaattgaaaaaatattaaccaatttaatttca
aacgctataaaattcacaaataatggaggagaaattgtagtgtcaattaataaggtttta
gaaaagaaaaaacaaggaaattttttaggtcaatctaaacgtttaacagattatatcgag
attattgttgaagatactgggattggattagataaagatcagctcaatcaagtgttttct
agattttataatgtagatgtaaataagacaggtacaggtataggattaaatttttgcaaa
gggttagtagaattacacggtggagaaatttttgtagaaagtgaatatggggtaggaagt
aagtttgttgttagaattccttataataaaaaagcagaaacagctgtagtagaagatgta
aaggatgaattcttaattaactctatgaagtctgtagaatacgatatgcttatttctgaa
gatttagatttagtagacgatactgaagtttctcaagttaaggataaatgtaaaatttta
gttgtagaagataataaggaactacgtgaacatttaaaaagtgaattgcgtgcgcgttat
gagattattgaagctataaatggagaagaaggattaaaaatggttcataaacactatccc
gatcttgtagttagtgatgttatgatgccaaaaatggatggatttgagctatgtaaacaa
cttaaatctgagtttgaaacatgtcatattcctgttattttattaacggctcgcgcttta
gaagaagatagaattgaagggtacaaaacaggtgcagatgggtatttaggtaaaccattt
aacatgcgtgtgttaaaagctagaatctctaatttattagagacgaaacgtgtgttacgt
gaaaaattctcgaaattaggagccgtaattccatctaaagaagttacaaataattctata
gatgaagcgtttctagaaaaaacaactaaaattatccttgataatattagtgacaccgaa
tttaaattagagcatttattaaaagaagttggtattggtcgttctcaattttatagaaaa
atacagtccattacagggcaaaatccaagtcattttataagaacaattcgtttaaaatat
gcatcagatttactacttaaaggcatgcatacaataaaagaagttacacatatgtccgga
tttaattcggcagcatattttggtaagacctttaaagaactttataatatgacgccaagt
gaatatgttgaagcccataaaaaagaagtctccgaaattgaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
