Formosa sediminum: FNB79_16430
Help
Entry
FNB79_16430 CDS
T06103
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
Organism
fop
Formosa sediminum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Plug
STN
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDO95490
UniProt:
A0A516GVT6
LinkDB
All DBs
Position
complement(3752492..3756025)
Genome browser
AA seq
1177 aa
AA seq
DB search
MNFNFTKEFYFFRKSTKNIIMRTILMLFCSTIFSFTPADIISQNAKITINQDKTVSVDEI
FDIIQSQTTYTFIYRSDLFKEIPSVTLNKSTIKVKDLLSKVISTNQYSFELLKDNTIVIE
KKVARVIQEEITGNVTDEKNSPLAGVSVLIKGTRRGTLTDFDGDFKIKGLKTTDVLIFSS
MGFEKQYIEVGDKKVINVVLKESSNELDEIVVSGKKTVNTGYQVLSKAKSIGSYEVVGSD
VIETKFQTNILDRLEGTVSGLSLYRGTPVIRGVSTLNGEDYPLIVLDGAVYEGDLESINP
NDIENVTVLKDATAASIYGVRSANGVIVVTTKRGIVGKPTLSYSSSFQIEPLPSRSYQNL
MSSPEFVDYQIDVFNATVSDTRKTSTLALDEVNTLLYAHEDGLISTEYLNSELDKLRNLD
GYDQVVDELLTPKITQQHNLALRGGTEKHQYALSLNYSSRGSFEKDRPVEQLGLNVKNYF
KFNDWFKFDISLLGSYGFSDYYSGVSGIALLGASRLPYEVLRDENGNPAEWNYIKSDSEI
ERLISLGLLDQSYYPLNQLKEVKTSSKSPSAVINVGTEIKLSESLGLELRGQLGYGKTHS
EIYASEDSYNVRNMINDATQIINGEVINNIPYGGQITETFYDRNSYTLRAQLNYSKTFKE
KHDVNVILGGERSKAVTESYGFKRYGYDPESLSFTDVDEATLVAGIQTTQSVLGTFTLGG
QTIYQNTDSRYISGYANVSYMYDDKLGFNVSARMDESNLFGKNPKYTYRPLWSFGSNYIV
DTESLSLPWLNRLKVRATYGISGNVFDNSGPFAIASISTILNEAGETQANITSPPNEDLR
WEQTYITNIGIDYELFSKKLSGSIEFYNKRTVDAVAYVDSDPILGWTSLPKNYASLNNRG
IELQISPKFITTDDFRWSGNLILSYNRNKVTEFVEERTTYVYDYVSENQLREGQELNTLY
AIRYAGLNDKGAPTAYKADGTLVNSYLDLSPEDLVDKGTYDPPYHASLSNNITYKQFNLS
FLFIYYGGHVQRDVAAGYYPTFRYPYELTRNIDKVHLNYWKQPGDEADINKSPGINWDNA
SNPNQVLSSQRNIWTYADVNVQKADYVKLRNITLAYTVPKIILDKVNLSSLRLTLDVRNP
FRWANNRNNLDPEVWTEDGSRGTAIMPTYTFAINLNF
NT seq
3534 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattttaattttactaaagaattttacttttttagaaaatcaaccaaaaacattatt
atgagaacaattttgatgttgttttgctctactatttttagttttacgcctgccgatatc
atctctcaaaatgcaaaaattacaattaatcaggataaaacagtttctgtagatgagatt
tttgatattattcagtcgcaaacaacgtatacttttatttatcgttcagatctttttaaa
gaaattccttctgttacgttaaataaaagtacaattaaagtcaaggatttattatctaag
gtcatatctactaatcagtatagttttgaactattaaaagataatactattgttatagaa
aaaaaggttgcaagagtaatacaagaagaaattacaggtaatgttaccgatgaaaaaaat
agtccattagcgggtgtaagtgttttaattaaaggtactagaagagggacgctaacagat
tttgatggtgattttaagattaaaggtcttaagactacagatgtcttaattttctcaagt
atggggtttgaaaaacaatatattgaagtaggagataaaaaagtaataaatgtagtatta
aaagaatcttctaatgagttagatgaaatagttgtctctggaaagaaaactgtaaataca
gggtatcaagtgctttcaaaggcaaaatctattggttcatatgaggttgttggatctgat
gtcatcgaaactaaatttcaaacaaatattttagatagattagaagggactgtaagtggt
ttgtctttatacagagggacacctgttattagaggagtttctacacttaatggagaagat
tatcctttaattgttttagatggtgcggtttatgaaggtgatttagagtctattaaccct
aacgatatagagaatgttacagtattgaaggatgctacagcggcttcaatttacggtgta
agatctgccaatggagttattgtggtaactaccaaaagaggtattgttggtaaaccaact
ttaagttactcatcatcatttcaaatagagccattaccaagtagatcatatcaaaactta
atgtcttctccagaatttgttgattatcagatagatgtttttaatgcaacagtgtccgat
acacgaaagacttcaaccttagctttagacgaagttaatacattattatatgcacatgaa
gatggtttaatttcaacagaatatttaaattcagaattagataaactaagaaacttagat
ggttatgatcaagttgtagatgagttgttaactccaaaaattacacaacaacataacctt
gcattaagaggtggtactgaaaagcatcaatatgcattatctcttaattattcgagtaga
ggttcttttgaaaaagatagacctgttgagcaattagggctaaacgtaaaaaactatttt
aaatttaatgactggtttaaatttgatatttctcttttaggtagctatggtttttcagat
tattattcaggggtttcaggtattgctttattaggagcttcacgacttccttatgaagtg
cttagagatgaaaatggaaatccagcagaatggaattacattaaaagtgatagcgagatt
gagaggcttatttcgttaggattattagatcaatcgtattatccgcttaatcaattgaag
gaagtaaaaacatcaagtaaaagtccttctgctgttataaatgttggaacagaaattaaa
ctttcagaatctttaggcttggaattaagaggtcagttagggtacggtaaaacccatagt
gagatttatgcatcagaagatagttataatgttcgtaatatgataaacgatgctactcaa
ataattaatggtgaggttattaataatattccttacggtggtcagattacagaaaccttt
tacgatagaaattcatatactttacgagcacaacttaattactctaaaacatttaaagaa
aaacatgatgtaaatgtaattttagggggagagagaagcaaagcagttacagaatcatat
ggatttaaacgttatggttatgatccagaaagtttaagttttacagatgtagatgaggct
accttagtggcagggattcagacaacacaatctgttctagggacttttactttaggagga
caaactatttaccaaaatacagatagtagatatatatctggttatgcaaatgtttcttac
atgtatgatgataaattaggatttaatgtaagtgcaagaatggatgaatctaatttattt
ggtaaaaaccctaaatatacatatagaccactttggtcttttggatctaactatattgta
gatacagaatctttatctttaccatggcttaatagattaaaagttagagctacatatgga
ataagtggtaatgtttttgataatagtgggccatttgccatagcatcaatttctactatt
cttaatgaggctggagaaacacaagcaaatataacttctcccccaaatgaagatttaaga
tgggaacaaacatacataaccaatataggtatagattacgagttattttctaaaaaatta
tcaggtagtatagaattttataataagagaaccgtagacgctgtagcttatgtagactca
gaccctattttaggttggacaagccttcctaaaaattatgcttcattaaacaacagaggt
attgaattgcaaattagtccaaaatttataactaccgatgattttagatggagtggtaat
ttaatacttagttataatagaaataaagttacagagttcgtagaagaaagaactacatat
gtatatgattatgtttctgaaaatcaactaagagaagggcaagaattaaatacactttat
gctatacgttatgctggcctaaatgacaaaggagctccaacagcttataaggcagatggt
actcttgttaatagttacctagatttaagtccggaagatttagtagataaaggaacttac
gacccaccatatcacgcatctttatctaataatattacttataaacaatttaatctttca
tttttatttatctattatggaggacacgttcagagagatgtagccgcagggtactatcca
acatttagatatccatatgaattaactcgtaatatagataaagtacatttaaattattgg
aaacagccaggtgatgaggccgatataaacaaatctccaggaataaattgggataatgct
tcaaaccctaatcaagttctaagttctcaaagaaatatttggacatatgcagatgtaaat
gttcaaaaagcagattatgttaagttaagaaatataacattagcttatactgtacctaaa
ataatcttagataaagttaatttatctagtttaagactaactttagatgtaagaaaccca
tttagatgggcgaataatagaaataatctagatcctgaagtttggacagaagatggtagt
agaggtacagcaattatgccaacatatacttttgcaattaatttaaacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system