Formosa sp. Hel1_33_131: FORMB_02740
Help
Entry
FORMB_02740 CDS
T04465
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein (DUF1566)
Organism
for
Formosa sp. Hel1_33_131
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Lcl_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOR27335
UniProt:
A0A1D7XVI7
LinkDB
All DBs
Position
complement(286574..289843)
Genome browser
AA seq
1089 aa
AA seq
DB search
MKKITLIALMLFTALGYAQVGINTNNPDASSALEIESTTGGILIPRLTQTQRDAIVSPAS
GLMIYQTDEVSGFYFYDGTAWAKIDGVAGPAGPQGNQGAPGPAGVDGQDGVDGAQGVQGD
QGIQGETGTQGPIGPTGSIGAAGAPGAQGPIGPTGAQGNQGVQGPVGADSTVLGPVGPVG
PVGQAGPIGPTGAQGNQGAPGPAGADGADGAQGPIGPAGAQGVQGPVGQAGPIGPAGAQG
NQGAQGLAGPIGPTGNQGAQGPAGADSTVSGPVGQVGPTGAQGQIGPAGADADTSEIAAL
SDIINNGQVAQPLSIGDFVGGGFVFWIDPTDNTKGLVSAIEDQSTGIRWYNGTHITTGAT
GTAIGTGAVNTTAIINAQGETETSYAAGLARAYNGGGYTDWFFPSKDELNEMYIKKPTLD
AISGFTPFSATVYWTSSEVANNRAWKQNFNNGGQVNDNAKHSSSAVRAIRAVSGTTTSSL
SAITAEQTTQNTAIDLKANIASPTFTGTVTTPTLIASGNTYPNTTGNANQVLTTDGSGTL
SWTTSSAETINGTVNEIEVSTSDSTTTVGLPDNTTITTSLTVDGLYFGTGSGDGDNNLAI
GSSMGSGTGKRNTAIGSRALESYSGTGFDNNTAIGYYNMRALSTGSGNTALGAENMFSLT
TGIANTSIGNQTMLNVSTGSNNTGLGQRAGESITTGTNNTLIGLDANVSSPNANNETVIG
KGAIGSGDNTVQLGNTSVTNVKTSGSITAGEITIPNTDGTSGQVLTTDGSGALSWTTSSA
GVSGSGTGNMIAKFDGSSTVLGNSSIYDDGTNVGIGTVSPAQLLHVKAALGDAKALINAY
GEGDEAHLMLRAGGINKTAIVASGISNWGRTDLRFILNSYTNANDYGLSDTKMIIKNDGK
VGIGTNSPTEKLDVAGNIKFNGALMPNNNAGSSGQVLTSSGTGVPTWTTPSSGSDSVYSV
NTFYAELGGFVIEVRDGGKHGLVVAMQDQGVSTWYPIDNLLNDITRHDTNGAKFMDWRLP
TIRELELIYLAKANISPMWGGNDYWSSTQPGYGNAYFVNMANGFGTSSNSPGANHSTNNS
KAVRAVRAF
NT seq
3270 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaatcacattaatagcacttatgctgttcacagcattgggttacgcacaagta
ggtatcaacacaaataaccctgatgcctcttcggcattagagattgaatccactacaggt
ggaattttaattccaagactcacacagacgcagcgagatgcaattgtatcaccagcttca
gggttgatgatttatcaaacggatgaagtatcagggttttatttttatgacggaacggct
tgggcaaaaattgatggtgtagccggtccagcaggtcctcaaggaaatcaaggtgctcca
ggaccagcaggtgttgatggtcaagacggagttgatggtgctcaaggtgtacaaggcgac
caaggaatacaaggcgagactggtactcagggtccaataggtccaacaggaagtataggt
gctgcaggagctcctggtgctcagggtccaataggtccaacaggagctcaaggaaatcaa
ggtgttcaaggtccagttggcgcggattcaacagttctaggtccagtaggtccagtaggt
ccagtaggtcaggcaggtccaataggtccaacaggagctcaaggaaatcaaggtgctcca
ggcccagcaggtgcagatggtgctgatggcgctcaaggtccaatcggtccagcaggagct
caaggtgttcaaggtccagtaggtcaggcaggtccaatcggtccagcaggagctcaagga
aatcaaggagcccaaggcctagcgggtccaatcggcccaacaggaaatcaaggtgctcaa
ggtccagctggtgcggactcaacagtttcaggtccagtaggtcaggtaggtccaacaggg
gctcaaggtcaaatcggtccagcaggtgcagatgcagatacaagtgaaattgctgctcta
tcagatattattaataatggtcaagtagctcagccattatctattggtgattttgtaggg
ggcggatttgtattttggatagacccaacagataacactaagggtttagttagtgctata
gaagaccagagtacagggattcgatggtacaatggcactcacatcacaactggagcaaca
ggtaccgcgataggaactggagcagtcaatacaacggctattataaacgcccaaggtgaa
acggaaacgagttatgctgcaggtttagcaagggcatataatggtggaggttataccgac
tggttttttccttcaaaagacgaattaaatgagatgtatataaaaaaaccaacgttagat
gcaatctctggatttacaccattttcagctaccgtatactggacttcttcggaagttgct
aataatcgcgcatggaaacagaatttcaataatggaggtcaggtcaatgataacgctaag
cactcttcaagtgctgttcgtgctattcgtgctgtgagtggtactacaacaagttctttg
tctgcgattaccgccgagcaaaccacccaaaatacggcaatagatttaaaagctaatatt
gcttcaccaacctttacaggaacggtaaccactccaacattaattgctagtggaaacacc
tatccgaatacgactggtaatgccaatcaagttttaacaacagatggttctggaacactt
tcgtggacaacttcttcggcagaaacaattaatggaacagtaaatgaaattgaagtttct
acatctgattctacaaccaccgttggattgcctgacaacacaacaataacgactagtctt
actgttgatggcttatattttggcacaggatctggtgatggcgataacaatttagccatc
ggatcttcgatgggttcgggaacaggaaagcgaaatactgcaataggatcgagagctctc
gaatcttactcaggaactgggtttgataacaatactgcaattggatactacaatatgaga
gcattatcaacaggtagtggaaatacagctttgggtgccgaaaatatgttttcattaact
acaggaattgctaatacatcaataggaaatcaaacaatgcttaacgtttctacaggaagc
aataatactggtttaggacaaagagcaggagaatcgataacaacaggtacaaacaacact
ttgattggacttgatgcaaatgtgagttcacctaatgcaaataatgaaactgtaataggt
aaaggtgctattggctctggcgataatacagttcaattgggtaatacaagtgttacgaat
gtaaaaacaagtggatcaataactgcaggagagattacaattccaaacactgacggtaca
agcggacaggttttaacaacggatggttctggagcactatcgtggacaacttcttcggca
ggggttagcggttcaggaactggtaatatgatagccaaattcgatgggtcttcaacagta
ctaggaaatagctcaatttatgatgatggtacaaatgttggtattgggacagttagtcct
gcacaacttttacatgtaaaggctgctttaggtgatgctaaagcattaattaatgcgtat
ggtgagggtgatgaggctcaccttatgttgagagcaggtggtattaataaaacggctatt
gttgcatcaggaattagtaattggggtagaacggatttacgttttatactaaatagctat
actaacgccaatgattatggattatcagacactaaaatgataataaagaatgatggtaaa
gttggaataggaactaattcaccaaccgaaaagttagatgttgcaggcaatattaaattc
aatggtgcacttatgccaaataataatgcaggttcatcggggcaggtattaacatcctcg
ggaacaggagttcctacatggacgactccatcaagtggttcagattctgtatatagtgtc
aacactttctatgcagagttaggtgggtttgtaattgaagtccgtgatggtggaaaacac
ggtttggtggtcgcaatgcaagaccaaggtgtctctacatggtatccaattgataatctt
ttaaatgatatcacaagacacgatactaacggcgctaaatttatggattggcgcttaccc
actattagagagttagaattaatttatttagctaaagcaaatatttctccaatgtggggc
ggtaatgattattggagttccactcaacctggttacggtaacgcatattttgttaatatg
gcaaatggttttggaacttcttctaatagccctggagcaaaccactcaactaataattca
aaagctgtacgtgctgtacgggcgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system