Formosa sp. Hel1_33_131: FORMB_11150
Help
Entry
FORMB_11150 CDS
T04465
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
for
Formosa sp. Hel1_33_131
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
for00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
for02000
]
FORMB_11150
Transporters [BR:
for02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
FORMB_11150
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOR28162
LinkDB
All DBs
Position
1196759..1198582
Genome browser
AA seq
607 aa
AA seq
DB search
MKTKLCLSLFVLSVFSSHNVWAQQPSEAQKLDSITITSTAIELPFKKNSRTITIISSKVI
KQSPATNLAELLQQEAGIDVRRQGVNGMQADLYIRGGSFDQTLLLIDGIKVEDPQTGHHT
LNMALPLEVIERVEIIKGPAARVFGQNAFTGAINIVTKSNADAVNSVGYKTGSYNQQQAS
GTLGTNLKNTTLIGHASLNTSDGYRHNTDFENQNYFVKGRFNTTTNPIDVIGYFAKRDFG
ANQFYAVESGSDQYEETQSSLVGASTKFKTENFKITPRIYWKRTQDMYLYVREDPSVYRN
LHLSNKVGVQVNASYTSSAGITGFGIDAAKVFMTSTNLGERDRLMANLFVEHRFSLVDNT
LDITPGVSVNYFSDFKFHAFPGVDVGYSIDDVFKAYANVGYTYRVPTYTDLYYVGRTDLG
NANLEPEKALSGEIGVRYFGVNVNAYIAVFNRSSNNLIDYTKENVDDKWLATNLKSLTST
GVELNLSSSFKSGLYTQNISLGYTYLDENLNDIKTAYSKYVLNALTHHFTATVRSKFLKN
VSQSIVYKFAERASGTSYSVVDVKATLKLSDLELSVIGNNILNTEYVETGFVPMPKGNIL
LGVNYAF
NT seq
1824 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagactaaactttgtttatcactattcgtacttagtgttttttcatctcataatgta
tgggcgcagcaaccttcagaggcgcaaaaattagattccattacgattacttcgacggcg
attgaattgccttttaaaaagaattctcgcacgataacaattatttcatcaaaagttata
aagcaaagtcctgcgactaatttggcagagctactgcaacaagaagcgggcattgatgta
aggcgccaaggtgtcaatggaatgcaagcagatttatacattcgtggagggagttttgat
caaacactccttttgattgatggaattaaagttgaagaccctcaaacaggccaccataca
ttaaacatggcactgcctctggaagtaatcgaacgggttgaaattatcaaaggacctgca
gcacgtgtttttggacaaaatgcttttacgggagccattaatatcgtcacaaaatcaaat
gctgatgctgtaaattcagtgggatataaaacggggtcttacaatcaacaacaagcctct
ggaaccttagggactaacttaaaaaacacaacgcttataggacatgcttctctaaatact
tctgatggctatcgacataataccgattttgaaaatcaaaattattttgtaaaaggacgt
tttaatactactacaaatcctattgatgtgattggttattttgccaaacgagactttggt
gcgaatcagttttatgctgttgaaagtggcagtgatcaatatgaagaaacacaaagcagt
cttgtgggagcttctacaaaatttaaaactgaaaactttaaaatcaccccacgaatctat
tggaaacggactcaagatatgtacttatatgttcgcgaagacccctctgtttatagaaac
ttgcatctctccaataaggtaggggtacaagtcaatgcctcttacacttcaagtgctgga
ataacgggttttgggattgatgctgcgaaggtgtttatgaccagtactaatttaggggag
cgcgaccgactgatggcaaatctgtttgttgagcatcggttttctttagtagataatact
ttagatattacgccaggggtctcggtaaattatttctctgattttaaatttcatgccttt
ccaggcgtcgatgtcggctactctattgatgatgtatttaaagcgtatgcaaatgtgggc
tatacctatagagtaccaacctataccgatttgtattatgtaggaagaacggatttaggg
aatgcaaatttagagcctgaaaaagcactttctggagaaattggagtaagatattttgga
gtaaacgttaatgcttatatcgctgtatttaatcgatcttctaataatttgattgattat
accaaagaaaatgtagatgataaatggctcgctacaaatctaaaaagtttaacctcaaca
ggcgtagaattgaatttgtcttccagctttaaatcggggctgtacactcaaaatattagt
ttgggatatacgtatttagatgaaaatttaaacgacatcaagaccgcctattctaaatat
gtgctcaacgcattgacgcatcattttacggcgacggttcgttcgaagtttctaaaaaat
gtatcacaaagtatcgtttataaatttgccgaacgtgcttcaggaaccagttatagcgtg
gtggacgtaaaagccactttgaagctttcagaccttgaactttctgtcattggaaataac
attctcaacacagaatatgtggaaacaggctttgtccctatgccaaaaggaaatatttta
ttgggtgttaattatgcgttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
