Formosa sp. Hel1_33_131: FORMB_17010
Help
Entry
FORMB_17010 CDS
T04465
Name
(GenBank) terminase
Organism
for
Formosa sp. Hel1_33_131
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LAGLIDADG_3
Terminase-T7_RNaseH-like
Hom_end
Terminase_6C
Mur_ligase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOR28740
LinkDB
All DBs
Position
complement(1793467..1795986)
Genome browser
AA seq
839 aa
AA seq
DB search
MSLSNEEIYELEQLLYQEDVDNSKDDLFKFTQTTFKKFKPEWFHKTFYDILNRFAHKEIK
NLIVTMPPQHGKKIIDSVLVLTTKGFKQHGNLKRGDFVFDRFGKPTKVLNVLNKSDKPDC
EFLITFTDGQKIQCHAQHEWVVFDRSKGREIKCETQYLFSQKYFSGTFKKRCRFQVDSNY
LVLFDKKELTIHPYFLGLWLGDGQVSAPTITHHFDDYKSIDKIISLGYKKTSFSVHKDTG
VITSRFFGDTFQSFKKINFAHPKGDIKHIPLEYKLSTVNDRLELLAGLIDSDGYVYLNNG
RVTFSNINKRLIYDVKDICVSLGFRTTICEFEPIVSTSGIIGRNKVYQLSFNPDIEIPTA
IDRKKIILKNPLKRKRGIISIEKVKPKKGKCITVEGGVYLVGRNLIPTHNSEGSTRRLPS
FLAGYRPDDKIAVVSYAATKAQKFGREIMTIMREKEYKDIFPNTKYPERGYTGAKSNTNI
ERESINSDGSMKFVGVDGPLTGDTVDVLILDDLYKGWKDANSPVTQRSVWDWYLTVADSR
LHNDSQQLITFTRWSDQDVIAKLIELGLVVVYDGTEDLEEVIKNLDDKFLLINFQALKEG
KLSEFDPRKEGDALWPDKHSKKKHESSRVKDPDKFDCLYQGNPQNKEGLLYSNNFKTYKD
LPDLKIIKNYTDTADSGKDYLCSIVYGVPLASTDPHKYVIDVLYTQKGMEITEPLTAKML
NRNNVNKVNIESNGGGRGFARNLEKLVNKGVNIFWFHQSNNKEARIYSNSASVNNEVVFP
SDWHIRWPVFYKHVTKYKKIFSANDFDDAQDTLTGIIEIEENTEVVHETEANADDLGLF
NT seq
2520 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcctgagcaatgaagaaatatatgaacttgaacaactgctataccaggaagatgta
gataatagtaaagatgatttattcaagttcactcaaacaacatttaaaaagtttaagccc
gagtggtttcataaaacgttctatgacatattaaatcggtttgcacataaggaaataaaa
aaccttatagtaacaatgccaccgcaacacgggaaaaaaattattgactctgtcttggtt
ttaacaacaaaaggatttaaacagcacggaaatctaaaaagaggtgattttgtttttgat
agatttggaaaaccaaccaaagtgttaaatgttttaaacaagagcgataaaccagattgt
gaatttttaataacctttacagatgggcaaaaaatacaatgtcatgcccaacatgaatgg
gttgtttttgatagatctaaaggaagagaaataaaatgcgaaacacaatatttattttcg
caaaaatatttttcaggaactttcaaaaagagatgtagatttcaagtagattcaaattat
ttggtcttatttgataaaaaggaattgacaatacacccctattttttagggctatggctt
ggagatggtcaagtttcggcaccaacaataacacatcattttgatgattataaatcaatt
gataaaattatttctttaggctataagaaaacatcgttttcagttcataaagatacaggt
gtaataactagtagattttttggagatacatttcaatcttttaaaaaaatcaattttgcg
catccaaaaggagatattaagcacattcctttagaatacaaactatcaacagtaaatgat
agactagaattgttagcgggattgattgatagtgatggatacgtttacctaaacaatgga
agggtaacgttttcaaatataaacaaaaggctaatatatgatgtgaaagatatttgtgta
agtctagggtttagaactacaatatgcgagtttgaaccaattgttagcactagtggaatt
attggaagaaataaagtttatcaattatcttttaatccagacattgaaatacctacggca
attgacagaaagaaaataatattaaaaaatcctttaaaaagaaaacgaggtattatttct
attgaaaaagtgaaacctaaaaaaggcaaatgtattactgttgaaggtggtgtttatttg
gtgggtaggaatttaattcctactcataatagtgaaggtagtactcgaagattaccgtca
tttttagcaggatatagacctgatgataaaatagcagtagttagttatgcagcaacaaag
gcacagaagtttggtagagagataatgaccataatgcgtgaaaaggagtataaagatata
tttcctaacaccaaataccctgaaagaggatatacaggcgcaaaatctaacaccaacata
gaaagggaatctatcaattctgatggttctatgaagtttgtaggtgtagatggtccatta
actggagatactgttgatgtattaattcttgatgatctatacaaaggctggaaagatgct
aattcgccagtaactcaaaggtctgtatgggattggtatttaacagtagcagattcaaga
ttgcataatgattctcaacagcttatcacatttacacgttggagtgaccaagatgttatt
gcgaaactaattgaattagggttggtagttgtttatgatggtaccgaagacttagaagaa
gttattaagaatttagatgataagtttttgcttataaattttcaagccttaaaagaaggt
aaactatcagagtttgacccaagaaaggaaggcgatgcgctatggccagataaacattcc
aagaaaaaacatgaaagctcaagagtaaaagaccctgataagtttgattgtttgtatcaa
ggtaatccgcaaaataaagaggggcttctttatagtaataattttaaaacttacaaggat
ttaccagacttgaaaattattaagaattatactgatacagcagattcaggcaaagattat
ctatgtagcattgtgtatggtgttccattggctagtacagatcctcacaagtatgtgatt
gatgtattgtacactcaaaaaggaatggaaatcacagagcctttgactgctaaaatgtta
aaccgaaataatgtcaacaaagtcaatattgaaagtaatggcggcggtagaggatttgca
agaaatttagagaagcttgtaaacaaaggagtaaatatattttggtttcatcaatcgaat
aataaggaggctagaatatatagcaatagtgcaagtgtgaataatgaggtggtgtttcct
agtgattggcatattagatggccagtattttataaacacgtaaccaagtataaaaaaata
tttagtgcaaatgattttgatgatgctcaagacacattaactggaataatcgaaatcgaa
gaaaacacagaagtagtacacgaaacagaagcaaacgcagacgatttaggtctgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system