Flavobacterium panici: NLJ00_04365
Help
Entry
NLJ00_04365 CDS
T08520
Name
(GenBank) T9SS sorting signal type C domain-containing protein
Organism
fpb
Flavobacterium panici
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ig_7
PapG_C
Por_Secre_tail
Ig_J
Y_Y_Y
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UUF15345
LinkDB
All DBs
Position
complement(943211..949132)
Genome browser
AA seq
1973 aa
AA seq
DB search
MTSNGTIVVPAGVTVMDVQAWGGGGAGGGAGGSGLLEGRSGGGGGGGAYARSNINVTASN
TLNVVVAGTVAGTINNGAAGGHSTITGYETVIYAAGGAGGLANNAGGAPAGGAGGSTAAS
FGTTKAAGEAGGTGGNVLAALLLSSGKGGNGASPGGGAGGASVPSLVLGTTVGNPGVAPG
GGGSGSMSSALAAAQPGGSGAHGQVIVSYTCPSYSITGISAVNVCSNLGTTSVVTLTSSA
ASLPTGTYTVTYSRSNPSATGLTATMTVTTAGTGTFTAAGLNTVGTSNITVTNLTSGVCS
SAISTSNVTTVTIFAPSAGGTVSGGTTICAGATSAALSLAGQTGTIQKWQYSIAPFSTWT
DIANTTNTYTSGPLSETTEFRAVVQNGVCTAANSIATTVTVNPLPQGTLSANGPFCVTGS
GQLTFTATAGTGPYTVVYKENGGADRTATGVVSGTPFAAFTSTVTATTTYTLVSVTGANT
CSRSSGFTGNTATITINSLPQGSLTANGPFCATGSGLLTFTATAGTGPYTVVYKENGGAD
RTATGVVSGTPFAAFTPTVTATTTYTLVSVTGSNTCVRNSGFTTGSATITVNSLPQGSLT
ANGPFCATGSGLLTFTGTAGTGPYTVVYKENGGADRTASGVVSGIPFATFTTPVTATTTY
TLVSVTDANTCVRSSGFTQNSATITVNPLPQGSLTANGPFCETGAGQLTFTATAGTGPYT
VVYKENGGADRTATGVVSGTPFNTFTTPVIATTTYTLVSVTGANTCVRSSGFTGNTATIT
INPLPQGSLTSNGPFCATGAGQLTFTATAGTGPYTVVYKENGGADRTATGVVSGTPFAAF
TSTVTATTTYTLVSVTGANTCVRNSGFTQNSATITVNPLPQGSLTANGPFCVTGSGLLTF
TATAGTGPYTIVYKENGGADQTAAGVVSGTPFATFTTPVTATTTYTLVSVTGANTCVRSS
GFTTGSATITVNPLPQGSLSANSPFCATGSGQLTFTATAGTGPYTVVYKENGGADRTATG
VVSGTPFATFTTQVTATTTYTLVSVTGANSCVRSSGFTAGSTTITVNPLPQGSLTANGPF
CATGAGQLTFTATSGTGPYTVVYKENGGADRTASGVVSGTPFATFTTPVITTTTYTLVSV
TGANTCARNSGFTGGSAVITINPIPTPTFTTQPAASVCVNTDVTYTTQTGQSNYVWNVPG
VLNTDYIITSGDLSVSSNTVTLQWLTAGSKTVTVGYSSIGCASNTSASNTTTVTKTERGA
VHGGNHICAGDPSPLLTLTDYTGTIVRWEYAEAIPYVWQPFANTSNTYQPGVLSTSTSYR
AVVKNGTCPEEFAIETRIDVEPKPSTPILAIITQPTCVNPNGSVHLTGLLASPNWTITQN
GTVSQTYTSSGTSYTITNLAPGNYTFTIHDINICPSLPTINLEIKAPVTNIWNGTSWSKG
SPPIVTDAVRFSGNYSTTGDLSGCSCVVDAGANVTVNSNHTLTITNSVSNNGGLLTFENN
ASLMQVNNVVNTGNIIYKRNTTPVRRYDFTYWSSPIVRTPAFTLHDLSPNTLSDKYYSHN
AISGWIINYNGTMEMSPGYGYIVRAPQNFDISAPSVYNSFLEGVPNNGTITVPLLAAEKS
HLLGNPYPSAIYADQFIFDNAANLYGTLYFWTHNSAPSSSVPGDAQFNYNSDDYAIYNLT
GSTSVGSLSGQGAGTPGNQSPPLGYIAAGQAFFVKAKTTGNAVFTNSMRIPGNNSQFFKT
AESNKETIEKHRVWLNMTNTQGLFKQLLVGYIEGATDTWDNNYDGVTINGNIYVDFYSIN
EGRKLTVQGRAVPFQDTDVVPLGYRSGIEGEFSIAIDHADGDLANHAIYLEDKWNNTTHN
LQTGKYTFNTSIGTFLDRFVLKYAAVNLGVDDFESQENNLFVSVKNKNIKVNSTHDYIKE
VSIFDISGKLIYNNKKIENTELQIPNLQSGDQVLIVKVTLENGKTTTRKITFH
NT seq
5922 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgacatctaatggaacaatagtagttcctgctggtgttactgtaatggatgtgcaggct
tggggcggaggcggtgccggtggcggcgcgggcggctcaggtttacttgaaggacgaagc
ggaggcggaggaggcggaggcgcttatgccagaagtaatatcaatgtaacagccagcaat
actttaaatgttgtagttgccggtacagtagcagggacaataaataatggagctgctggc
gggcattcaactattacaggttatgaaacagtaatatatgctgcaggtggagcaggaggt
ttggctaacaatgcaggaggagcacctgccggaggtgctggtggatctacagcagcttct
tttggtactacaaaagctgctggtgaagcaggaggaactggaggaaatgttttagccgca
cttttattaagttccggaaaaggaggaaatggagcaagtccgggaggaggagccggagga
gcatctgtgccaagtttagttcttggaactacagttggaaaccccggtgttgcaccagga
ggaggtggtagtggctcaatgagctctgctcttgctgctgctcagcccggaggatcagga
gctcatggtcaggttatagtaagctatacttgccctagttatagtattacaggaatttcg
gcagtaaatgtttgcagtaatcttggaactacttcagttgtaacattaacatcgtctgct
gcgtctttaccaacaggaacttataccgtgacatatagtcgaagcaatccaagtgcgaca
ggacttacagcaacaatgactgtgactactgccggaacaggaacatttacagcagcaggt
ttaaacactgttgggacaagtaatattaccgtcactaatttaacatccggagtctgttct
tcagctatatcaacatcaaacgttacaacagttacaatttttgctccttcagctggtgga
acagtttcaggcggaacaacaatttgtgctggagcaacaagtgctgctctgtctttagca
ggacaaactggtacaattcaaaaatggcaatattcaatagctccattttcaacctggact
gatattgcaaatacaacaaatacttatacttctggaccacttagtgaaacaactgaattt
agagctgttgttcaaaatggagtttgtacagctgcaaattctatagcgacaacagtaaca
gttaatcctttaccacaaggaactttatcagcaaatggtcctttttgtgtaacaggttcc
ggacaattaacttttacagctacggcaggaacgggtccatatacagttgtgtacaaagaa
aatggaggagcagaccgaactgcaacaggagtcgtgagcggaacgccttttgcagctttt
acatcaacagtgacagctacgactacatataccttagtttcagtaacaggagcaaatact
tgctccagaagttctggttttacaggaaacacagctacaataactatcaattctttaccg
cagggaagtttaacagcaaacggtccattttgtgcaactggttccggattgttaactttt
acagcaacagctggaacgggaccatatacagttgtttataaagaaaatggtggagcagac
cgaactgcgacaggagttgtcagcggaacaccttttgcagcttttactcccactgttacg
gctactacaacgtatactttagtttcagttacaggatcaaatacctgtgttagaaattct
ggttttacaacaggttcagcaacgataactgttaattcattaccgcagggaagtttaaca
gcaaatggtccattttgtgcgacaggttccgggctgttgacatttactggcacagcagga
actggcccatacacagttgtttataaagaaaacggaggagctgaccgtacagcgtcggga
gtagtgagcggaataccttttgctacttttacaacgccagttaccgcaacgacaacttat
actttagtttcggttacagatgcaaatacctgtgttagaagttctggtttcacccaaaat
tcagcaacaataaccgtcaacccattaccgcagggaagtttaacagcaaatggtccgttt
tgtgaaactggcgcaggtcaattaacttttaccgcaacagcaggaacaggtccatataca
gttgtttataaagaaaatggcggagcagaccgcactgcaacaggagttgtcagcggaaca
ccgtttaacacttttacaacgccagttatcgcaacaacaacttatacattagtttcggtt
acgggagcaaatacctgtgttagaagttcaggttttacaggaaatacagcaacaataact
atcaatccattaccgcagggaagtttgacatcaaacggcccattttgtgcaacaggagct
ggacaattgacatttacggcaacagcaggaactggtccatatacagttgtctacaaagaa
aatggcggagcagacagaactgcaacgggagttgtcagcggaacgccttttgcagctttt
acttctactgttacggctacgacaacgtatactttggtttcagttacaggagcaaatacc
tgtgttagaaactctggttttactcaaaattctgcaacaataacagttaatccattgccg
cagggaagtttaacagcaaatggtccattttgtgtaacaggttctggactgttaactttt
acggctacagcaggaacaggtccatatacaattgtttacaaagaaaatggaggggctgac
caaactgcagcgggagttgtgagcgggacaccgttcgcgacttttacaacgccagttact
gcaacaacaacttatactctagtttcagtaacgggagcaaacacctgcgttagaagttct
ggttttacaacgggttcagctacaataacggttaatccattacctcagggaagtttgagt
gccaatagcccattttgtgcaacaggctctggacaattgacatttactgccacagcagga
acaggtccatacacagttgtttataaagaaaacggaggagctgaccgcacagcaacggga
gttgtaagcggaacaccattcgccacttttacaacgcaagttaccgcaacaacaacttat
actttagtttcagtaacaggagcaaattcctgtgttagaagttctggttttacagcaggt
tcaactacaataacagtaaatccattaccacagggaagtttaacggctaacggtccgttt
tgtgcaactggggcgggacaattgacatttactgctacttcaggaactggcccatacaca
gttgtttataaagaaaatggtggagcagatcgcacggcttcaggagttgtaagcggaact
ccattcgctacttttacaactccagttataacaacaacaacttatactctagtttcagta
acaggtgcaaatacttgtgccagaaattctggttttactggaggctcagcagtaataaca
attaatccaattccaacaccaacatttacaacgcagccggctgcttcggtttgtgtaaat
acagatgttacgtatacaacacaaaccggacaatcaaattatgtttggaatgttccggga
gttttgaatacagattatattattacctcaggagatttatctgtatcaagtaataccgta
acattacaatggcttaccgctggaagtaaaacagtaactgttggttattcttcaatagga
tgtgcctcaaatacaagcgcaagcaatactacaacggtaacaaaaacggaacgtggtgca
gtgcatggaggaaatcatatttgtgcgggagatccaagtccgttattaactttgacagat
tatacgggaacaattgtaagatgggaatatgcagaagcgattccatacgtttggcagcct
tttgcaaatacatctaatacgtatcagccgggagtattatcaacaagtaccagctataga
gctgtggtaaaaaacggaacttgccctgaagaatttgcaatagaaacaagaattgatgtg
gaaccaaaaccttctacaccaatattggcaattattacgcagccaacttgtgttaatcca
aacggaagcgtacatctgactggcttattggcatcaccaaattggacaattacacaaaac
ggaacagtttctcaaacctatacttcatcaggaactagttataccataacaaatctggct
cccggaaattatacttttacaatacacgacataaatatttgtccttctttaccaactatt
aatttggagataaaagctccggttacaaatatttggaatggtacaagttggtcaaaagga
agtccgccaatagttacagatgcagttcggttttcgggcaattattctacaacaggtgat
ttgagcggttgttcttgtgttgttgatgcgggtgcaaatgttaccgtaaattctaatcat
actttaacgattaccaattcagtgagcaacaacggaggtttattgacttttgaaaataat
gccagtttaatgcaggttaataatgtcgtaaatacgggtaatattatatataaacgaaac
accacaccagttcgaagatatgattttacgtattggtcttcgccaattgtgcgtacaccg
gcttttacattacacgatttgtcaccaaacacattatcagataagtattatagccataat
gctattagtggatggataataaattataatggaacgatggaaatgagtcctggatatggt
tatattgtcagagcacctcaaaatttcgatatatccgctccctcagtttataattcattt
ttagaaggagttcctaataatggtacaattaccgtccctttattagctgcagagaaatct
catttgcttggcaatccatatccttcggcaatatatgcagatcaatttatttttgataat
gcggctaatttgtatggaacattatatttttggactcataactccgcaccaagcagctct
gttcccggtgatgctcaatttaattataatagcgatgattatgctatttataatttaacc
ggaagtacaagtgtaggcagtctgagtggacaaggagcaggaacacccggaaatcaaagt
cctccattaggatatatagcagctggtcaggcttttttcgtaaaagcaaaaactactgga
aacgctgtttttacaaattcaatgagaattcccggaaacaacagccagttttttaaaaca
gcagaaagcaataaagaaacaattgaaaaacacagagtctggcttaatatgacaaatact
caggggctttttaaacagttgttggtaggatatatagaaggagcaactgatacctgggac
aataattatgatggagttaccataaacggaaatatatatgtagatttttacagtattaac
gaaggaagaaaattaacggttcagggtcgcgctgtaccttttcaggatactgatgttgta
cctttaggatacagatctggaattgaaggcgaattttcaatagcaatagatcatgcagat
ggtgatttagcaaatcatgccatttatttagaagataaatggaacaatacgacacataat
ctgcaaacaggaaaatatacttttaatacatcaatagggacttttctggaccgctttgtt
ctgaaatatgctgcagtaaatttaggagttgatgattttgaaagtcaggaaaacaatctt
tttgtttcggttaagaataaaaacattaaagtaaattcaacgcatgattatataaaagaa
gtttccatttttgatatttcaggaaaattgatttacaacaataaaaagattgaaaatacc
gaattacagattccaaatctgcagtcaggagatcaggttttgattgtaaaagtgactttg
gaaaacggaaaaacaaccaccagaaaaattacgtttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system