Flavobacterium psychrophilum CSF259-93: FPSM_00355
Help
Entry
FPSM_00355 CDS
T03254
Name
(GenBank) Endoglucanase
Organism
fpc
Flavobacterium psychrophilum CSF259-93
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Calx-beta
CHU_C
RCC1_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIJ36850
LinkDB
All DBs
Position
399067..408045
Genome browser
AA seq
2992 aa
AA seq
DB search
MIKKMLLKDCFTSFFSKTPCFIFVLVLFLVQNAHAQCTAPVGCASTDFSNYGANSTNVAA
TIEYDNYSSCFHATIVRTPDGLKVWGQGMDNNGSDLVSPKLINATNFPALGSSTPLKGAL
GSGFNKNNQGILLSTNGLYAWGTEGVVLDASITSSTTFQKITIAGNTNGLPAGVTPADVK
MMFATYQSLVLTTCAGNVWVLAQDGSGFGNVASRGNGDTFVVQSGNGTSWSKVTTSAAGN
PDLTGVVSCRGSVANLIALTSSGKVYVWGRYVYLGDGSAANYQTSRATQMTLPVGITPKM
IGSTNENSVIGATFYVLATNGKLYSLGNNHKSQLGISSVGESMTWVRPIYPNGATMDNIK
WISPQEHDSSFSSINVINSNYNLYAFGADDRHSIAGNVNGFTMPIIPPGLSTSNKILAVE
TGGHTSMVVDKCETDFGYIGHRIGGSMANGSTEDIELASYTFNTTAVKICGAESDGDIIP
VMPGVDGSYSNYCSVPSIILTTTPAGGTLSLVSGPATLSGNTLNFTGPGTVVVKYAYTTS
CGVLKEVSKTFTVFGTPVAPTVSSQVFCIGAGKKVSDLVATGTGIKWYNAATGGTQYTGT
ELLVTGTYYASQTANYPVGACESARTVVAVTVSATPAPTALAQTFCKVDVKKVSDLVAIG
TGIKWYDAVTAGTQYTGAEVLATGTYYASQTINGCESARTAVAVTVNPTPGLPTASVQTF
CSVDAKKVSDLVATGTGIKWYNAVTAGVQYTGTEVLVTGIYYASQTTNGCESLRTAVSVT
VSGPIPQTVSGTNTVCVGNTTTFSATTSGGAWTSATPAVATVNSSTGVVTGVSGGVSVIN
YSVTTTGGCVNTGSRTVTVSAAPNAGTLSGPQGVCVSSTTAFSSTVSGGAWSSANTAIAT
VSAVTGEITGVSAGTTTITYTVAGTGGCSDAIATRDVTVYSPKVTLSGTTSILENSVGIN
ITATLSTATISTTTITLAYSGTATNGVDYAASSATITIPAGATTGTVTIIPIDDNINEGS
ETVIADITNVTGGCASELGVQMATVTITDNDSAPTVATISPASATEGSPVVFNFTLSNPS
AIATSYIFTLTNGTAGNLDYTTTSVTVIVPAGAIGGTVSVPTTQDTIDEPNETFTIHNGS
VSATGTILDDDNTPVATIGNVTINEGAGTVTIPVSIDVVSSVDTVINITTATGTAGTSDY
TTTVTTVTIPAGQTTVNVTVPILEDTIDEPAETFTVNGTVTSGNTINTNPTGTVTITDND
ATPVATIGNVTINEGAGTVTVPVSIDVVSSVDTVINITTATGTAGTSDYTTTVTTVTIPA
GQTTVNVTVPILEDTIDEPAETFTVNGTVTSGNTINTNPTGTVTITDNDATPVATIGNVT
INEGAGTVTVPVSIDVVSSVDTVINITTATGTAGTSDYTTTVTTVTIPAGQTTVNVTVPI
LEDTIDEPAETFTVNGTVTSGNTINTNPTGTVTITDNDATPVATIGNVTINEGAGTVTIP
VSIDVVSSVDTVINITTATGTAGTSDYTTTVTTVTIPAGQTTVNVTVPILEDTIDEPAET
FTVNGTVTSGNTINTNPTGTVTITDNDATPVATIGNVTINEGAGTVTVPVSIDVVSSVDT
VINITTATGTAGTSDYTTTVTTVTIPAGQTTVNVTVPILEDTIDEPAETFTVNGTVTSGN
TINTNPTGTVTITDNDATPVATIGNVTINEGAGTVTIPVSIDVVSSVDTVINITTATGTA
GTSDYTTTVTTVTIPAGQTTVNVTVPILEDTIDEPAETFTVNGTVTSGNTINTNPTGTVT
ITDNDATPVATIGNVTINEGAGTVTIPVSIDVVSSVDTVINITTATGTAGTSDYTTTVTT
VTIPAGQTTVNVTVPILEDTIDEPAETFTVNGTVTSGNTINTNPTGTVTITDNDATPVAT
IGNVTINEGAGTVTIPVSIDVVSSVDTVINITTATGTAGTSDYTTTVTTVTIPAGQTTVN
VTVPILEDTIDEPAETFTVNGTVTSGNTINTNPTGTVTITDNDATPVATIGNVTINEGAG
TVTIPVSIDVVSSVDTVINITTATGTAGTSDYTTTVTTVTIPAGQTTVNVTVPILEDTID
EPAETFTVNGTVTSGNTINTNPTGTVTITDNDATPVATIGNVTINEGAGTVTIPVSIDVV
SSVDTVINITTATGTAGTSDYTTTVTTVTIPAGQTTVNVTVPILEDTIDEPAETFTVNGT
VTSGNTINTNPTGTVTITDNDATPVATIGNVTINEGAGTVTIPVSIDVVSSVDTVINITT
ATGTAGTSDYTTTVTTVTIPAGQTTVNVTVPILEDTIDEPAETFTVNGTVTSGNTINTNP
TGTVTITDNDATPVATIGNVTINEGAGTVTVPVSIDVVSSVDTVINITTATGTAGTSDYT
TTVTTVTIPAGQTTVNVTVPILEDTIDEPAETFTVNGTVTSGNTINTNPTGTVTITDNDA
TPVATIGNVTINEGAGTVTIPVSIDVVSSVDTVINITTATGTAGTSDYTTTVTTVTIPAG
QTTVNVTVPILEDTIDEPAETFTVNGTVTSGNTINTNPTGTVTITDNDATPVATIGNVTI
NEGAGTVTIPVSIDVVSSVDTVINITTATGTAGTSDYTTTVTTVTIPAGQTTVNVTVPIL
EDTIDEPAETFTVNGTVTSGNTINTNPTGTVTITDNDATPVATIGNVTINEGAGTVTVPV
SIDLVSSVDTVINITTATGTAGTSDYTTTVTTVTIPAGQTTVNVTVPILEDTIDEPAETF
TVNGTVTSGNTINTNPTGTVTITDNDATLIVAVDDVYQPQTPSTTVAIVVGNVTANDTLN
GVIVTGTNTNVTPVTAGPLSIDANGVLTLLPNTISGNYTITYTICEVDQVTGIAVNPPNC
STATVTIEVLPSNVIIYNGVTPNGDGDNDVFYLENIEFMKESSVEIYNRWGVLVYEVSGY
DNKEKSFKGISEGRVTLERGSLLPVGTYYYIVRYVDLKNESIEKAGYLHLTR
NT seq
8979 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaaaaatgcttttgaaggattgttttacaagtttttttagtaaaacaccctgt
tttattttcgttttagtgctttttttagtgcaaaatgcacacgcccaatgtactgcaccc
gtaggctgtgctagtacagatttctctaattatggagcaaattctactaatgtagccgca
accattgagtatgataattattcatcttgttttcatgctaccatagttagaactcctgac
ggacttaaagtttgggggcagggaatggacaataatggtagtgatttggtttctccaaag
cttattaatgcgacaaattttccagcattaggttcttcaactcctttaaaaggagcttta
ggaagtggttttaataagaataatcaagggattctattaagtacaaatggtttgtatgcg
tggggaacagaaggagtagtcttagacgcatcaattacctctagtactacttttcaaaaa
attactattgcagggaatactaatggtttgcccgcaggtgtaactcctgcagatgtgaag
atgatgtttgctacttatcaatctcttgtcctaacgacttgcgcaggtaatgtgtgggtt
ctagctcaagatggatctggttttggaaatgttgcgtctaggggtaatggcgatactttt
gttgtgcaatcaggaaatgggactagttggagtaaagtaaccacaagtgctgctggcaat
cctgatttaacaggggtagtttcttgtaggggtagtgtagctaatttaatagcgctaaca
agttctggtaaagtgtatgtttggggaaggtatgtgtatttaggtgatggtagtgcggca
aattaccagactagtagagcaacacaaatgactttgcctgtaggtataacgcctaaaatg
atagggtctacaaatgagaattctgtaataggagctaccttttatgttttagccacaaac
ggtaaattgtattctttgggtaataatcacaagtctcaattaggaatcagtagtgtaggg
gaatctatgacatgggttagacctatatatccaaatggagcaactatggataacattaaa
tggattagtcctcaggagcacgatagtagtttttcatctataaatgtcattaatagtaat
tataatttatatgcctttggggcagatgaccgtcattcgatagcaggaaacgtaaatggt
tttactatgcctataatacctccgggactttctacttcaaataagatattggctgttgaa
acaggtgggcacactagtatggttgtagataaatgcgagactgattttgggtatataggg
cataggataggtggaagtatggcaaatggtagtactgaagatattgaattggcatcatat
actttcaatactactgcggtgaaaatttgcggtgctgaatcagatggtgatataatacca
gtaatgccaggtgtcgatggtagttattctaactattgctctgtgccatctattatctta
actactacgcctgctggaggtactttgtcattagtaagtggtcctgctactttgtcagga
aatacgcttaattttacaggaccaggtactgttgttgtaaaatatgcttacactacatct
tgtggagtgcttaaagaggtttcaaaaacatttacagtatttgggactccagttgcacca
actgtttcgtcacaggttttctgtataggagcgggaaaaaaagtaagcgatttagtggct
actgggactggaatcaaatggtacaatgcggcaacaggaggaacacaatatacaggaaca
gaacttttagtaacaggaacatactatgcaagtcaaactgcaaattatcctgttggtgca
tgcgagagcgcaaggacggtggttgcggtaacggtaagtgctaccccagcaccaacagca
ttagcgcaaactttttgtaaagtagatgttaaaaaagtaagtgacttagtggctatcggt
actggaatcaaatggtacgatgccgtaacggccggaacacaatatacaggagcagaagtt
ttagcaacaggaacatactatgcaagtcaaacgataaatggatgtgagagtgcaagaact
gcggttgcggtaacggtaaatcctaccccgggactgccaacagcatcagtacaaactttt
tgttcagtagatgctaaaaaagtaagcgacttagtggctaccggtactggaatcaaatgg
tacaatgccgtaacagcaggagtacaatatacaggaacagaagttttagtaacaggaata
tactatgcaagtcaaaccacaaatggatgtgagagtctaagaacggcagttagcgtaacg
gtaagtggaccaatacctcaaacagtatctggaacaaacacagtttgtgttggaaacaca
acaacattcagtgccaccacttcaggcggagcatggacaagtgccacaccagcagtagct
accgttaattcaagcacgggagttgtaacaggagtttcaggaggagtaagtgtaatcaat
tatagtgtaaccactacgggaggttgtgtaaatacaggatcaagaactgtgacggtaagt
gcagcgccaaatgcaggaacgttatctggaccacaaggggtttgtgtaagtagtacgaca
gcattttcttcaactgtttcaggtggagcatggagttctgcaaatactgctattgcaaca
gttagtgcagtaacaggagaaataacaggagtttcggcaggaacgactactatcacatat
acggtagctggaacaggaggttgttcagatgcaatagcaacaagagatgttactgtctat
tcaccaaaagttactttgtcagggactacttctattttagaaaattcagttgggattaac
ataactgctactttgtctacagcaacaatcagtacaacaacaattacattagcgtattct
ggaacagctacaaatggtgtagattatgcagctagttctgcaacaattactataccagca
ggcgcaactacaggaacggttacaattattccaatagacgataatattaatgaggggtca
gaaacagttattgctgatattactaatgttacaggtggatgcgctagtgagttaggtgtt
caaatggcaactgtaaccattaccgacaatgatagtgcgccaacagttgcaacaatcagt
ccagcgagtgcaacagagggaagtccagtggtttttaatttcactttgagtaatccaagt
gctatagcaacgagttatatctttactttaaccaatggcacagcgggtaatttagattac
acgaccacatcggttactgtaattgtgccagcaggcgcaattgggggtacggtaagcgta
ccaacgacacaagatactatagacgaaccaaacgaaacatttaccatccataacggatca
gtaagtgctacgggtacgattttagatgatgacaatacaccagtggcaactatcggaaat
gtaacgatcaatgaaggagcaggaacagtaaccatccctgtaagtatcgatgttgtaagt
tcagtagatacggtgattaacatcacgaccgctacaggcactgccggcacctcagattat
accaccacagttaccacagttacaattccagcaggacaaactacggtaaatgtaacggta
ccaattttagaagatactatcgatgaaccagcagaaacatttacagtaaacggaacggta
accagtggcaacaccatcaataccaatccaacaggcacagtaaccattaccgataacgat
gctacaccagtggcaactatcggaaatgtaacgatcaatgaaggagcaggaacagtaacc
gtccctgtaagtatcgatgttgtaagctcagtagatactgtgattaacatcacgaccgct
acaggcactgccggtacctcagattataccaccacagttaccacagttacaattccagca
ggacaaactacggtaaatgtaacggtaccaattttagaagatactatcgatgaaccagca
gaaacatttacagtaaacggaacggtaaccagtggcaacaccatcaataccaatccaaca
ggaacagtaaccattaccgataacgatgctacaccagtggcaactatcggaaatgtaacg
atcaatgaaggagcaggaacagtaaccgtccctgtaagtatcgatgttgtaagctcagta
gatacggtgattaacatcacgaccgctacaggcactgccggcacctcagattataccacc
acagttaccacagttacaattccagcaggacaaactacggtaaatgtaacggtaccaatt
ttagaagatactatcgatgaaccagcagaaacatttacagtaaacggaacggtaaccagt
ggcaacaccatcaataccaatccaacaggcacagtaaccattaccgataacgatgctaca
ccagtggcaactatcggaaatgtaacgatcaatgaaggagcaggaacagtaaccatccct
gtaagtatcgatgttgtaagttcagtagatacggtgattaacatcacgaccgctacaggc
actgccggcacctcagattataccaccacagttaccacagttacaattccagcaggacaa
actacggtaaatgtaacggtaccaattttagaagacactatcgatgaaccagcagaaaca
tttacagtaaacggaacggtaaccagtggcaacaccatcaataccaatccaacaggcaca
gtaaccattaccgataacgatgctacaccagtggcaactatcggaaatgtaacgatcaat
gaaggagcaggaacagtaaccgtccctgtaagtatcgatgttgtaagttcagtagatacg
gtgattaacatcacgaccgctacaggcactgccggcacctcagattataccaccacagtt
accacagttacaattccagcaggacaaactacggtaaatgtaacggtaccaattttagaa
gacactatcgatgaaccagcagaaacatttacagtaaacggaacggtaaccagtggcaac
accatcaataccaatccaacaggcacagtaaccattaccgataacgatgctacaccagtg
gcaactatcggaaatgtaacgatcaatgaaggagcaggaacagtaaccatccctgtaagt
atcgatgttgtaagttcagtagatacggtgattaacatcacgaccgctacaggcactgcc
ggcacctcagattataccaccacagttaccacagttacaattccagcaggacaaactacg
gtaaatgtaacggtaccaattttagaagacactatcgatgaaccagcagaaacatttaca
gtaaacggaacggtaaccagtggcaacaccatcaataccaatccaacaggcacagtaacc
attaccgataacgatgctacaccagtggcaactatcggaaatgtaacgatcaatgaagga
gcaggaacagtaaccatccctgtaagtatcgatgttgtaagttcagtagatacggtgatt
aacatcacgaccgctacaggcactgccggcacctcagattataccaccacagttaccaca
gttacaattccagcaggacaaactacggtaaatgtaacggtaccaattttagaagatact
atcgatgaaccagcagaaacatttacagtaaacggaacggtaaccagtggcaacaccatc
aataccaatccaacaggcacagtaaccattaccgataacgatgctacaccagtggcaact
atcggaaatgtaacgatcaatgaaggagcaggaacagtaaccatccctgtaagtatcgat
gttgtaagttcagtagatacggtgattaacatcacgaccgctacaggcactgccggcacc
tcagattataccaccacagttaccacagttacaattccagcaggacaaactacggtaaat
gtaacggtaccaattttagaagacactatcgatgaaccagcagaaacatttacagtaaac
ggaacggtaaccagtggcaacaccatcaataccaatccaacaggcacagtaaccattacc
gataacgatgctacaccagtggcaactatcggaaatgtaacgatcaatgaaggagcagga
acagtaaccatccctgtaagtatcgatgttgtaagttcagtagatacggtgattaacatc
acgaccgctacaggcactgccggcacctcagattataccaccacagttaccacagttaca
attccagcaggacaaactacggtaaatgtaacggtaccaattttagaagatactatcgat
gaaccagcagaaacatttacagtaaacggaacggtaaccagtggcaacaccatcaatacc
aatccaacaggaacagtaaccattaccgataacgatgctacaccagtggcaactatcgga
aatgtaacgatcaatgaaggagcaggaacagtaaccatccctgtaagtatcgatgttgta
agttcagtagatacggtgattaacatcacgaccgctacaggcactgccggcacctcagat
tataccaccacagttaccacagttacaattccagcaggacaaactacggtaaatgtaacg
gtaccaattttagaagatactatcgatgaaccagcagaaacatttacagtaaacggaacg
gtaaccagtggcaacaccatcaataccaatccaacaggcacagtaaccattaccgataac
gatgctacaccagtggcaactatcggaaatgtaacgatcaatgaaggagcaggaacagta
accatccctgtaagtatcgatgttgtaagttcagtagatacggtgattaacatcacgacc
gctacaggcactgccggcacctcagattataccaccacagttaccacagttacaattcca
gcaggacaaactacggtaaatgtaacggtaccaattttagaagacactatcgatgaacca
gcagaaacatttacagtaaacggaacggtaaccagtggcaacaccatcaataccaatcca
acaggcacagtaaccattaccgataacgatgctacaccagtggcaactatcggaaatgta
acgatcaatgaaggagcaggaacagtaaccgtccctgtaagtatcgatgttgtaagttca
gtagatacggtgattaacatcacgaccgctacaggcactgccggcacctcagattatacc
accacagttaccacagttacaattccagcaggacaaactacggtaaatgtaacggtacca
attttagaagacactatcgatgaaccagcagaaacatttacagtaaacggaacggtaacc
agtggcaacaccatcaataccaatccaacaggcacagtaaccattaccgataacgatgct
acaccagtggcaactatcggaaatgtaacgatcaatgaaggagcaggaacagtaaccatc
cctgtaagtatcgatgttgtaagttcagtagatacggtgattaacatcacgaccgctaca
ggcactgccggcacctcagattataccaccacagttaccacagttacaattccagcagga
caaactacggtaaatgtaacggtaccaattttagaagacactatcgatgaaccagcagaa
acatttacagtaaacggaacggtaaccagtggcaacaccatcaataccaatccaacaggc
acagtaaccattaccgataacgatgctacaccagtggcaactatcggaaatgtaacgatc
aatgaaggagcaggaacagtaaccatccctgtaagtatcgatgttgtaagttcagtagat
acggtgattaacatcacgaccgctacaggcactgccggcacctcagattataccaccaca
gttaccacagttacaattccagcaggacaaactacggtaaatgtaacggtaccaatttta
gaagacactatcgatgaaccagcagaaacatttacagtaaacggaacggtaaccagtggc
aacaccatcaataccaatccaacaggcacagtaaccattaccgataacgatgctacacca
gtggcaactatcggaaatgtaacgatcaatgaaggagcaggaacagtaaccgtccctgta
agtatcgatcttgtaagttcagtagatacggtgattaacatcacgaccgctacaggcact
gccggcacctcagattataccaccacagttaccacagttacaattccagcaggacaaact
acggtaaatgtaacggtaccaattttagaagacactatcgatgaaccagcagaaacattt
acagtaaacggaacggtaaccagtggcaacaccatcaataccaatccaacaggcacagta
accattaccgataacgatgctacactgatagttgctgtagatgatgtttatcaaccacaa
acaccaagtaccacagtggcaatcgtagtaggaaatgttaccgccaacgatactttgaac
ggtgtaattgtaacaggaactaataccaatgtaaccccagtaacggcaggaccattaagt
atagacgctaatggtgtattaacattattgcctaatacaatatcaggaaattacacaatt
acttatacgatatgtgaagtagatcaagtaacaggaattgcggtaaacccacccaattgt
agtacagcaaccgttacaattgaagttttaccaagtaatgtcatcatttataatggtgta
acaccaaatggtgatggagataatgatgtattttatttagaaaacattgagtttatgaaa
gaatcttctgttgaaatttataacagatggggggttttagtatatgaagtatcaggatac
gataataaggaaaaatcttttaaaggtatttcagaaggacgtgtaacactagaaagaggc
tcattattgccagtagggacttattattatattgtgagatatgttgatttgaaaaacgaa
tcaattgagaaagctggttatttgcatttaactagatag
DBGET
integrated database retrieval system