| Entry |
|
|---|
| Name |
(GenBank) General secretion pathway protein D
|
|---|
| KO |
| K02666 | type IV pilus assembly protein PilQ |
|
|---|
| Organism |
fpc Flavobacterium psychrophilum CSF259-93
|
|---|
| Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:fpc00001]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:fpc02044]
FPSM_02420
02035 Bacterial motility proteins [BR:fpc02035]
FPSM_02420
Secretion system [BR:fpc02044]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
FPSM_02420
Bacterial motility proteins [BR:fpc02035]
Pilus system
Pilus assembly proteins
FPSM_02420
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
complement(2667251..2669425)
|
|---|
| AA seq |
724 aa
MTPSMKTIITLLLLFIFQISFSQDIRIQQIKNNIEAINTESLGLNEKVNINIKEASLSSF
LLAVSEVHKVNISVAPSLAQISIVNNFTDVTVADLLVFLCKEYNLTIDFTGNILSIKPYE
KPIEKAIIKTIDVQYDGANDLVSFDLKEDKLYDAFKKIMNESGKNLVFAPGLENQLLTAY
IKNMPFDAALNKLAYANNLSLTKSRDNFYLFDTLEGNYSLENSSEKNNTTVRQNKPQRSR
KSNFFFNVIDAENKLLEVDFENTPIASIVYDIGHELGIDMFISSPLESAGNATFKAKNIS
FDNLLVKLFESKMDSKTVANNSSQPQQFSNDTSSNSAGDSYTFMKNGSIYYFGTKNQLVV
RNVKVIPLMHRSIELLGNPTSEGRSSGRLNNSNTNNYTNNSSDNKSNSNTNNYQSQGNDS
SSGKDNASSQSILSIVPAEITKDLDIKVDKELNSFVVNGPAANIDRFESFIKYIDKAVPV
ILIEVMLLEVSKSATIETGFSAGIGDKPVTTKGTVFPNSDIVLGAQTINKIINSFDGFGS
LNIGSVVPNFNLSLKAMESNGNLKIRSAPRLSTLNGHKAYLSIGETTYYVVTNQNFYGSQ
IPQTSEVKNYQPIDAELSVTIMPLVSGDGQITMDIKVIQSSFNGQKVDKNAPPGINSREF
TSIIRVKDQDLIVLGGLEEKVKNDSGSGVPILARIPIIKWLFSSRKREDSNKKLTVLIKP
TVIY |
|---|
| NT seq |
2175 nt +upstreamnt +downstreamnt
ttgactccttccatgaaaacaattataacattactattactttttatttttcaaatttct
ttttcccaagacattaggattcaacaaattaaaaacaatattgaagctatcaataccgaa
tctttaggcttgaatgaaaaagtaaatatcaacattaaagaagcttctttatctagtttt
ttactagctgtttctgaagttcataaagtaaatattagtgtagcacctagtttagctcaa
attagtattgtaaataattttaccgatgttaccgttgccgatctgttggtatttctttgt
aaagaatacaatcttaccatcgattttacaggtaatattctctctataaaaccgtatgaa
aaaccaatagaaaaagctattataaaaactattgatgttcagtatgatggcgctaatgat
ttggtttcattcgatttaaaagaggataaactttacgatgctttcaaaaaaatcatgaat
gaaagtggcaaaaatttagtttttgctccaggattagaaaatcagttattgaccgcatat
attaaaaacatgccttttgatgcggctttaaacaaattggcttatgctaataatttgagc
ttaactaaatcacgtgataatttctatttgtttgacaccttagagggtaattattccctt
gaaaacagctctgaaaaaaacaatactactgttagacaaaacaaacctcaacgttctaga
aaatcaaacttttttttcaatgtaattgatgcagaaaataaattattagaagttgatttt
gaaaatacccctattgccagtattgtatatgatataggccatgagttgggtattgacatg
tttatttcaagccctttagagagtgcaggaaatgccactttcaaagcaaaaaatatttcg
tttgacaatcttttggttaagttattcgaatctaaaatggacagtaaaacagttgcaaat
aatagttctcaaccacagcaattcagtaatgacacctcttctaattcggcaggagatagt
tatacttttatgaaaaatggtagtatttattattttgggactaaaaatcaattggttgtt
agaaatgttaaggtaatcccattaatgcatcgttctattgaattgttaggtaatcccacc
agcgaaggcagaagctcgggaagattgaataattcaaatacaaacaattacaccaataac
tcttcagataataaaagtaattctaataccaataattatcaatctcaaggaaatgattca
tcatctggaaaagacaacgctagttcacaatctattttatcaatcgttccagccgaaatt
actaaagatttagatattaaagtcgataaagaactcaatagttttgtggtaaatgggcca
gcagcgaatattgaccgttttgaatcttttattaaatacatagacaaagctgttcctgtt
attttaattgaagtgatgttacttgaagtgagtaaaagcgctacgatagaaacgggtttt
agtgctggaattggtgacaaacctgtaaccacaaaaggaacagtttttccaaattcagac
attgtacttggagctcaaactattaataaaattatcaatagctttgatggtttcggttct
ttaaacattggaagcgtggttcctaactttaatttaagtcttaaagcgatggaatctaat
gggaacttaaaaattcgttccgctccaagattatctactttaaacggacacaaagcgtac
ttatcgataggtgaaactacttattatgttgtcaccaatcagaatttttatggctcgcag
atacctcaaacatcagaagtaaaaaactaccaacccattgatgcagaattgtcagtaact
attatgcctttagtttcaggtgatggacaaattactatggatattaaagtgattcaatct
agttttaatgggcaaaaagtagataaaaatgcacctcctggaattaattcgagagaattt
acttctataatccgtgtaaaagatcaagatttaatcgtcttgggtggtcttgaagagaaa
gtgaaaaatgattcaggttctggcgtacctatattggctagaattccaattattaagtgg
ttgtttagctccagaaaaagagaagattccaataaaaaattaactgttttaattaaaccg
actgttatttactaa |
|---|
