KEGG   Flavobacterium psychrophilum CSF259-93: FPSM_02420
Entry
FPSM_02420        CDS       T03254                                 
Name
(GenBank) General secretion pathway protein D
  KO
K02666  type IV pilus assembly protein PilQ
Organism
fpc  Flavobacterium psychrophilum CSF259-93
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:fpc00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:fpc02044]
    FPSM_02420
   02035 Bacterial motility proteins [BR:fpc02035]
    FPSM_02420
Secretion system [BR:fpc02044]
 Type II secretion system
  Pilin secretion/fimbrial assembly protein
   FPSM_02420
Bacterial motility proteins [BR:fpc02035]
 Pilus system
  Pilus assembly proteins
   FPSM_02420
SSDB
Motif
Pfam: Secretin Secretin_N STN
Other DBs
NCBI-ProteinID: AIJ38915
UniProt: A0A076P5G2
LinkDB
Position
complement(2667251..2669425)
AA seq 724 aa
MTPSMKTIITLLLLFIFQISFSQDIRIQQIKNNIEAINTESLGLNEKVNINIKEASLSSF
LLAVSEVHKVNISVAPSLAQISIVNNFTDVTVADLLVFLCKEYNLTIDFTGNILSIKPYE
KPIEKAIIKTIDVQYDGANDLVSFDLKEDKLYDAFKKIMNESGKNLVFAPGLENQLLTAY
IKNMPFDAALNKLAYANNLSLTKSRDNFYLFDTLEGNYSLENSSEKNNTTVRQNKPQRSR
KSNFFFNVIDAENKLLEVDFENTPIASIVYDIGHELGIDMFISSPLESAGNATFKAKNIS
FDNLLVKLFESKMDSKTVANNSSQPQQFSNDTSSNSAGDSYTFMKNGSIYYFGTKNQLVV
RNVKVIPLMHRSIELLGNPTSEGRSSGRLNNSNTNNYTNNSSDNKSNSNTNNYQSQGNDS
SSGKDNASSQSILSIVPAEITKDLDIKVDKELNSFVVNGPAANIDRFESFIKYIDKAVPV
ILIEVMLLEVSKSATIETGFSAGIGDKPVTTKGTVFPNSDIVLGAQTINKIINSFDGFGS
LNIGSVVPNFNLSLKAMESNGNLKIRSAPRLSTLNGHKAYLSIGETTYYVVTNQNFYGSQ
IPQTSEVKNYQPIDAELSVTIMPLVSGDGQITMDIKVIQSSFNGQKVDKNAPPGINSREF
TSIIRVKDQDLIVLGGLEEKVKNDSGSGVPILARIPIIKWLFSSRKREDSNKKLTVLIKP
TVIY
NT seq 2175 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgactccttccatgaaaacaattataacattactattactttttatttttcaaatttct
ttttcccaagacattaggattcaacaaattaaaaacaatattgaagctatcaataccgaa
tctttaggcttgaatgaaaaagtaaatatcaacattaaagaagcttctttatctagtttt
ttactagctgtttctgaagttcataaagtaaatattagtgtagcacctagtttagctcaa
attagtattgtaaataattttaccgatgttaccgttgccgatctgttggtatttctttgt
aaagaatacaatcttaccatcgattttacaggtaatattctctctataaaaccgtatgaa
aaaccaatagaaaaagctattataaaaactattgatgttcagtatgatggcgctaatgat
ttggtttcattcgatttaaaagaggataaactttacgatgctttcaaaaaaatcatgaat
gaaagtggcaaaaatttagtttttgctccaggattagaaaatcagttattgaccgcatat
attaaaaacatgccttttgatgcggctttaaacaaattggcttatgctaataatttgagc
ttaactaaatcacgtgataatttctatttgtttgacaccttagagggtaattattccctt
gaaaacagctctgaaaaaaacaatactactgttagacaaaacaaacctcaacgttctaga
aaatcaaacttttttttcaatgtaattgatgcagaaaataaattattagaagttgatttt
gaaaatacccctattgccagtattgtatatgatataggccatgagttgggtattgacatg
tttatttcaagccctttagagagtgcaggaaatgccactttcaaagcaaaaaatatttcg
tttgacaatcttttggttaagttattcgaatctaaaatggacagtaaaacagttgcaaat
aatagttctcaaccacagcaattcagtaatgacacctcttctaattcggcaggagatagt
tatacttttatgaaaaatggtagtatttattattttgggactaaaaatcaattggttgtt
agaaatgttaaggtaatcccattaatgcatcgttctattgaattgttaggtaatcccacc
agcgaaggcagaagctcgggaagattgaataattcaaatacaaacaattacaccaataac
tcttcagataataaaagtaattctaataccaataattatcaatctcaaggaaatgattca
tcatctggaaaagacaacgctagttcacaatctattttatcaatcgttccagccgaaatt
actaaagatttagatattaaagtcgataaagaactcaatagttttgtggtaaatgggcca
gcagcgaatattgaccgttttgaatcttttattaaatacatagacaaagctgttcctgtt
attttaattgaagtgatgttacttgaagtgagtaaaagcgctacgatagaaacgggtttt
agtgctggaattggtgacaaacctgtaaccacaaaaggaacagtttttccaaattcagac
attgtacttggagctcaaactattaataaaattatcaatagctttgatggtttcggttct
ttaaacattggaagcgtggttcctaactttaatttaagtcttaaagcgatggaatctaat
gggaacttaaaaattcgttccgctccaagattatctactttaaacggacacaaagcgtac
ttatcgataggtgaaactacttattatgttgtcaccaatcagaatttttatggctcgcag
atacctcaaacatcagaagtaaaaaactaccaacccattgatgcagaattgtcagtaact
attatgcctttagtttcaggtgatggacaaattactatggatattaaagtgattcaatct
agttttaatgggcaaaaagtagataaaaatgcacctcctggaattaattcgagagaattt
acttctataatccgtgtaaaagatcaagatttaatcgtcttgggtggtcttgaagagaaa
gtgaaaaatgattcaggttctggcgtacctatattggctagaattccaattattaagtgg
ttgtttagctccagaaaaagagaagattccaataaaaaattaactgttttaattaaaccg
actgttatttactaa

DBGET integrated database retrieval system