Flavobacterium psychrophilum CSF259-93: FPSM_02420
Help
Entry
FPSM_02420 CDS
T03254
Name
(GenBank) General secretion pathway protein D
KO
K02666
type IV pilus assembly protein PilQ
Organism
fpc
Flavobacterium psychrophilum CSF259-93
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fpc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
fpc02044
]
FPSM_02420
02035 Bacterial motility proteins [BR:
fpc02035
]
FPSM_02420
Secretion system [BR:
fpc02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
FPSM_02420
Bacterial motility proteins [BR:
fpc02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
FPSM_02420
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Secretin
Secretin_N
STN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIJ38915
UniProt:
A0A076P5G2
LinkDB
All DBs
Position
complement(2667251..2669425)
Genome browser
AA seq
724 aa
AA seq
DB search
MTPSMKTIITLLLLFIFQISFSQDIRIQQIKNNIEAINTESLGLNEKVNINIKEASLSSF
LLAVSEVHKVNISVAPSLAQISIVNNFTDVTVADLLVFLCKEYNLTIDFTGNILSIKPYE
KPIEKAIIKTIDVQYDGANDLVSFDLKEDKLYDAFKKIMNESGKNLVFAPGLENQLLTAY
IKNMPFDAALNKLAYANNLSLTKSRDNFYLFDTLEGNYSLENSSEKNNTTVRQNKPQRSR
KSNFFFNVIDAENKLLEVDFENTPIASIVYDIGHELGIDMFISSPLESAGNATFKAKNIS
FDNLLVKLFESKMDSKTVANNSSQPQQFSNDTSSNSAGDSYTFMKNGSIYYFGTKNQLVV
RNVKVIPLMHRSIELLGNPTSEGRSSGRLNNSNTNNYTNNSSDNKSNSNTNNYQSQGNDS
SSGKDNASSQSILSIVPAEITKDLDIKVDKELNSFVVNGPAANIDRFESFIKYIDKAVPV
ILIEVMLLEVSKSATIETGFSAGIGDKPVTTKGTVFPNSDIVLGAQTINKIINSFDGFGS
LNIGSVVPNFNLSLKAMESNGNLKIRSAPRLSTLNGHKAYLSIGETTYYVVTNQNFYGSQ
IPQTSEVKNYQPIDAELSVTIMPLVSGDGQITMDIKVIQSSFNGQKVDKNAPPGINSREF
TSIIRVKDQDLIVLGGLEEKVKNDSGSGVPILARIPIIKWLFSSRKREDSNKKLTVLIKP
TVIY
NT seq
2175 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgactccttccatgaaaacaattataacattactattactttttatttttcaaatttct
ttttcccaagacattaggattcaacaaattaaaaacaatattgaagctatcaataccgaa
tctttaggcttgaatgaaaaagtaaatatcaacattaaagaagcttctttatctagtttt
ttactagctgtttctgaagttcataaagtaaatattagtgtagcacctagtttagctcaa
attagtattgtaaataattttaccgatgttaccgttgccgatctgttggtatttctttgt
aaagaatacaatcttaccatcgattttacaggtaatattctctctataaaaccgtatgaa
aaaccaatagaaaaagctattataaaaactattgatgttcagtatgatggcgctaatgat
ttggtttcattcgatttaaaagaggataaactttacgatgctttcaaaaaaatcatgaat
gaaagtggcaaaaatttagtttttgctccaggattagaaaatcagttattgaccgcatat
attaaaaacatgccttttgatgcggctttaaacaaattggcttatgctaataatttgagc
ttaactaaatcacgtgataatttctatttgtttgacaccttagagggtaattattccctt
gaaaacagctctgaaaaaaacaatactactgttagacaaaacaaacctcaacgttctaga
aaatcaaacttttttttcaatgtaattgatgcagaaaataaattattagaagttgatttt
gaaaatacccctattgccagtattgtatatgatataggccatgagttgggtattgacatg
tttatttcaagccctttagagagtgcaggaaatgccactttcaaagcaaaaaatatttcg
tttgacaatcttttggttaagttattcgaatctaaaatggacagtaaaacagttgcaaat
aatagttctcaaccacagcaattcagtaatgacacctcttctaattcggcaggagatagt
tatacttttatgaaaaatggtagtatttattattttgggactaaaaatcaattggttgtt
agaaatgttaaggtaatcccattaatgcatcgttctattgaattgttaggtaatcccacc
agcgaaggcagaagctcgggaagattgaataattcaaatacaaacaattacaccaataac
tcttcagataataaaagtaattctaataccaataattatcaatctcaaggaaatgattca
tcatctggaaaagacaacgctagttcacaatctattttatcaatcgttccagccgaaatt
actaaagatttagatattaaagtcgataaagaactcaatagttttgtggtaaatgggcca
gcagcgaatattgaccgttttgaatcttttattaaatacatagacaaagctgttcctgtt
attttaattgaagtgatgttacttgaagtgagtaaaagcgctacgatagaaacgggtttt
agtgctggaattggtgacaaacctgtaaccacaaaaggaacagtttttccaaattcagac
attgtacttggagctcaaactattaataaaattatcaatagctttgatggtttcggttct
ttaaacattggaagcgtggttcctaactttaatttaagtcttaaagcgatggaatctaat
gggaacttaaaaattcgttccgctccaagattatctactttaaacggacacaaagcgtac
ttatcgataggtgaaactacttattatgttgtcaccaatcagaatttttatggctcgcag
atacctcaaacatcagaagtaaaaaactaccaacccattgatgcagaattgtcagtaact
attatgcctttagtttcaggtgatggacaaattactatggatattaaagtgattcaatct
agttttaatgggcaaaaagtagataaaaatgcacctcctggaattaattcgagagaattt
acttctataatccgtgtaaaagatcaagatttaatcgtcttgggtggtcttgaagagaaa
gtgaaaaatgattcaggttctggcgtacctatattggctagaattccaattattaagtgg
ttgtttagctccagaaaaagagaagattccaataaaaaattaactgttttaattaaaccg
actgttatttactaa
DBGET
integrated database retrieval system