Flavobacterium pectinovorum: Q1W71_00220
Help
Entry
Q1W71_00220 CDS
T09245
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
fpec
Flavobacterium pectinovorum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fpec00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fpec02000
]
Q1W71_00220
Transporters [BR:
fpec02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Q1W71_00220
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
TTR_TEN1-4
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKL48209
LinkDB
All DBs
Position
47839..50904
Genome browser
AA seq
1021 aa
AA seq
DB search
MKPKLLLMVLLLFTSFAFSQTFDVNGTVLDGSGLSLPGVNVKVKSSSQSTTTDFDGSFKL
SGVSNGTILVLSYIGYRTQEVVVSGPKVTVKMSDDTRSLDEVVVIGYGSQKKRELTGAVS
VLDSKTLDILKPARIEQALQGTISGVNVTTQSGAPGAPIDVRIRGIATNGQNGPTTIIDG
YVGDLNVLNPNDIETITVLKDAQAAIYGTIGANGIILVTTKMGKKNSKTRISFNSYTGFQ
EASRKLSILDATEYALLLNESYANGGRAIPYPNVSGLGKGTDWQKEVLGKGVPLLNSDLT
ISGGSEKITYSISGSHLDQEGVVGGDKSGYLRNTARIALGADLSDKFKLKTNVIYTYFNR
KTINENGLGSVLFNALNVPATLSPYDANGNFTLVPSTTGFGTEIINPLAQIENTYNDYNY
KKLNGNFGLDYKIFKGFVLSSSIGFNTANSESKTFDPQISYGGKVFDVQRSSVTQRTVND
NDYSFDIYGTYNTKIAENHNITATLGNTIYKQWGNSAVATGYDVPNNSWEFADLSLTKGL
PTALNTGGYVYDQRRISYFGRAQYDYKGKYLFSAMIRRDSSTKFGPGNKVGYFPSFTAGW
VASDEGFFGESQTFNFLKFRVSYGTLGNDQIPNNGYLSILNGEATYVFDGLLVNGAATGQ
IPNPDLKWEEAKKFDAGLDLRLFNDKVSVVADYFIDTRKDLLIPNIPVSGIIGVGAPGAS
APTMNAGTVRNSGFEFAIDYKEKFSDSFSMTLGYNVTFLKNEVIEVNNGTGFIEQGSFGV
GQPAAARMEAGKPIGYFYGYKTDGIFQNQAEVEAHPSQLALGANASPGDIRYVDINGDGV
IDTKDRTDIGDPIADATMGFNIQLNYKNIDFAVYTFASVGNDMVRNYERTLSDANRLDYV
LDRWTGEGTSNSVPKVTTGATANNVLSDYFVEDASYLRIQNVQLGYTLDPKVTQKAGITK
LRLYAGVNNLYTFTKYKGFDPGASFGPTNRDGVSQSPIGAGIDYGFYPVPRTYLLGLNIN
F
NT seq
3066 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaccaaaattattattaatggtattgttactgtttacatcttttgcgttctcgcaa
acttttgatgtaaacggaactgtactggatggctcaggtttatcattgccgggcgtaaat
gtaaaagttaaaagttcttctcaaagcacaaccacagacttcgacggatcttttaaactt
agcggtgtttcaaacggcaccatacttgttttaagttatattggttatcgaacgcaggaa
gttgtggtttcaggaccaaaagttacggtaaaaatgagcgacgacaccagatccttagac
gaagttgttgtcatagggtatggtagtcaaaagaaaagagagctaactggagcagtttct
gttctggatagtaaaacacttgatatcctgaaaccggcaagaattgagcaggcgttacaa
ggaacaatttcgggtgtaaacgttacaacacaatccggagctccgggcgcacctatagac
gttcgtattcgtggtattgctacaaatggacaaaacggacccactacgattattgacggc
tatgttggagacctgaatgttttaaacccgaacgatattgaaaccataacggttttaaaa
gatgctcaagcagccatttatggaacgattggtgcaaacgggattattttggttacaacc
aaaatgggaaagaaaaactcaaaaacaagaatttcttttaatagctacaccggatttcag
gaagcttcgagaaaattgtccattctggatgcaacagaatacgctttgttattaaatgaa
agttatgccaatggcggaagagcaattccttatccaaatgtaagcggtttaggaaaagga
acagactggcaaaaagaagttttaggaaaaggcgttccgttattaaacagcgatttgaca
atttccggaggatctgaaaaaatcacctattctattagtggctcacacctggatcaggaa
ggtgttgttggcggcgacaaatcaggttacctgagaaatactgccagaatagcattagga
gcagatttgagtgataaattcaaactaaaaacgaatgtaatctatacctattttaataga
aaaacaattaatgaaaacggattaggatctgtattatttaatgccttaaacgtgccggct
acattaagtccgtacgatgcaaacggcaattttacattagtaccaagtacaacaggattt
ggaacagaaattattaatccgctggcacaaattgaaaacacatacaacgattataattat
aaaaaactaaacggaaactttggtttagattataaaattttcaaaggatttgtgttatca
agctccataggatttaataccgcaaatagtgaaagcaaaacatttgatccgcaaataagt
tatggaggaaaagtttttgatgttcagagaagttctgtaacgcaaagaactgtaaacgat
aatgactattcatttgatatttatggaacttataatactaaaatagcagagaaccataat
attacagcaacattaggtaatacaatctataaacaatggggaaattctgccgttgcaaca
ggttatgatgtgccaaataattcatgggagtttgcagatctttctttaactaaaggtttg
ccaactgctttaaatacgggtggttacgtttacgatcaaagaagaatttcttattttgga
agagcacaatatgattataaaggaaagtatcttttttcagcaatgatcagacgagattcc
tcaacaaaatttggcccgggtaataaagtaggatattttccgtcttttacagcaggatgg
gttgcttctgatgaaggtttttttggagaatcacaaacgtttaacttcttaaaattcaga
gttagttatggaactttaggaaatgatcaaataccgaataatgggtatttaagtatttta
aatggtgaagcaacttatgtatttgatggtttattagtaaatggtgcggcaacgggacaa
ataccaaatccggatttaaaatgggaagaagccaaaaagtttgatgctggtttagattta
agattattcaatgataaagtttctgtagttgcagattattttatcgataccagaaaagat
ttattaataccaaatattccggtttcaggaattataggagttggtgctccgggggcaagt
gctccaacaatgaatgctggtactgtgagaaattcaggatttgaatttgcaatagactac
aaagagaaattttcagattcattttcaatgacattaggttataatgtaacctttcttaaa
aatgaagttatagaagtaaataacggaaccggttttatcgaacaaggttcttttggagta
ggtcaaccagctgcagcacgcatggaagccggaaaaccaattggatatttttatggatat
aaaaccgatggaatttttcagaatcaggccgaagttgaggctcatccatcgcaattagct
ctaggagcaaatgcttctccgggtgatattcgttacgtagacataaatggtgatggagta
attgataccaaagacagaacagatattggcgatccaatcgcagatgctacaatgggtttc
aatattcagttaaattataaaaacattgattttgccgtatatacatttgcatcagtagga
aatgatatggttcgtaactacgaaagaacactttcagatgccaatcgtcttgattatgtt
ttagacagatggacaggtgaaggaacaagtaattctgtaccaaaagtgactacaggagct
acagcaaacaatgtgttatcagattattttgttgaagatgcttcttatctcagaattcaa
aatgtacaattaggatatacacttgatccgaaagtgactcaaaaagctggaattacaaag
ctaagactttatgccggagtaaataatctatacacatttactaaatacaaagggtttgat
ccgggtgcttcatttggacctacaaatcgagacggagtttctcaatcaccaattggtgcc
ggaatcgattacggattttatcctgttccaagaacttatttattgggcttaaacattaat
ttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
