Flavobacterium pectinovorum: Q1W71_08760
Help
Entry
Q1W71_08760 CDS
T09245
Symbol
chiA
Name
(GenBank) T9SS-translocated chitinase ChiA
Organism
fpec
Flavobacterium pectinovorum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_18
CarboxypepD_reg
SdrD_B
DUF6795
EMC7_beta-sandw
CarbopepD_reg_2
SpaA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKL49860
LinkDB
All DBs
Position
complement(2099360..2104108)
Genome browser
AA seq
1582 aa
AA seq
DB search
MKHYYRLLLLLLFPLLAMAQPAHGKKVVGYYAQWSIYARDFNVPKIDGSKITHLNYSFYG
TTYDPAHPENTKLLCLDTYADFEHMEGGIPWDAPVKGNFYDLMKLKEKYPHLKILISVGG
WTKGQDLSPIAASPVARAALATDMANFITKYPFIDGFDIDWEYPLSGGTDGTEVINGAPI
PPQKYSPDDNKNLVYLLKAMRQAMPNKLVTIAAGNNVRNVAKQYLGPSNRAQYGMTEDIS
TYCDYITYFGYDFGGNWYDKTCYNAPLYASGNTNDPLYGATQSESLDELTNQYLNVVGFP
ANKLIMGLPFYGKKFDNVANNGTNPNLPGLFVAAPRYIVSGCTNPQNPTGTWDGPAACEK
SGSIEICDLVGNPVTNSHAYLDPNTMLVTPTAASAGWVRYFDNTTKVPYLYNATLKQFIS
YEDKQSMDLKVQYIKSRNLAGGMVWELSQDTRGSIPNSLLTQVDTSFGSVVPGTVSISGS
VKNGSALVTNVTVDLRNASNVILQTVVSTGGNFTFSNLTSGQNYILTAAKATYTFTPVTL
TNVTTNQTAVVINGSQPTYTVSGTVLNGATGVSGVTVTATSGATVLTAVSNASGVYSVAG
LTAGLNFTVTAAKTGFSYTPTSTVYNAIDANKTLNFAQGAPVVYYTVSGTILNGTTPVSG
VTVTATSTTGTFTATTNSSGVYSIANLPAGGNYTVTAALAGQTFTPASTVYTNLTSNITL
NFAQDVIVVPSSKISGTVKNGSTPVSGAKVELVLPWTDNTHNWKSVIAITDAQGKYSFDN
SVVAGYTTVTSLKLNSWENGEVAYFPNNLANFAIPANPTVYNFNTSSTAKAALVAANLIS
GSVKNGTTPVAGAKVEIVLPWTDNTHNWKSVLATTDASGNYTFDNSVVAGYTQILSLKLN
SWENGEVTYYPNNLANFAVPTTPTVYDFNRQAVVATKPVVTITAPTASAIAINLGSAINF
VASVGLSAADATTISSVVFSLDGQSLSATNSSGTYTAIWTPAANQFSLPHTLTVTATASN
GTTESKTYSFTLTCSGANCPNSLPVITWNSPSNTTVTQSSFQVVPISVTAVDSDGSVSGV
TITINGGTFNMTAGTNNTYTYNFTPSAYQDYPVVIKATDNKAAVTTLNNTIKIAPVSTNR
FIPLPSKIILGYAHSWENAGAPFLYFSQMVGSKFNVVDYSFVETVNRDGYTPVLTTNDTR
YLTNGVFNKQLLKNDIKSLRDSGVPVIVSIGGQNGHVVLDNVAQKNIFVNGLKAIIDEYQ
FDGVDIDFEGGSMNFNAGGLRDISYAGISAYPRLKNVVDAFKELKAYYGPGFLLTAAPET
QYVQGGYSTYTDTFGSFLPIIQNLRNDLDLLAVQLYNTGGENGLDGQYYGSAKKSNMVTA
LTDMIIKGYNIATTGMHFDGLPPSKVLIALPACPSAAGSGYLTPTEGINAMHYLRTGTTF
SGRTYTMQPGGPYPSLRGLMTWSVNWDASSCGNSSELSKAYAAYFASQSAAKTLAVDKIE
VKSNTIVYFKNNALSVTNETEDIARVDVFNTIGQNLVNHQNIQNNKEILLQNQSFSTKQM
FIVVVTDKAGNKKSFKVINFLN
NT seq
4749 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacattattacagattgctcttattgttactgtttcccttgctcgccatggcacaa
ccagctcatggtaaaaaagtagtagggtattatgcgcaatggtctatttatgcaagggat
ttcaatgtgcccaagatagatggaagtaaaattacgcatttgaattattcattttatgga
acaacttatgatcccgctcatccggaaaacacaaagttgttatgtttagacacttatgcc
gattttgagcatatggaaggtggaattccgtgggatgctcctgtaaaaggaaacttttat
gacttaatgaaacttaaggagaagtatccgcatcttaaaattttaatttctgttggagga
tggacaaaaggtcaggatctttctccaattgcagcaagtcctgttgcaagagccgctttg
gccacagatatggcaaacttcattactaaatatccatttattgatggatttgatatcgac
tgggaatatcctctttctggtggaacagacggtaccgaagtaattaacggagcgccaatt
cctccacaaaagtacagcccggacgacaacaaaaatctggtttatttattgaaagcaatg
cgtcaggcaatgccaaataaattagtcactattgctgccggaaacaatgttcgaaatgtt
gccaaacaatatttaggaccatcaaacagagcacaatacggaatgacagaagatatttcg
acttattgtgattacattacttattttggatatgattttggtggaaactggtatgataaa
acgtgctacaatgctcctttatatgcaagtggaaacacaaacgatcctctttacggcgca
acacaatcagaatcattagacgaattaacgaatcaatatttgaatgttgttggttttcct
gcgaataaattaatcatgggactgcctttttacggaaaaaaattcgataatgttgccaat
aacggaaccaatccaaatttacctggattatttgttgccgcacctagatatatcgtttca
ggatgtacaaacccccaaaatccaacaggaacatgggatggtcccgcagcctgcgaaaaa
tcaggaagtatcgaaatttgtgatcttgtcggaaatccggttacaaattcacatgcttat
ttagatccaaatactatgttggttacgccaactgcagcttctgcaggatgggtacgatat
tttgacaatacaacaaaagttccttatttgtacaatgctactttaaaacagtttatttct
tatgaagataagcaatcaatggatttaaaagtgcagtatattaaatcgagaaatcttgcc
ggaggtatggtttgggaattatctcaggatacaagaggttcaattccaaactcattatta
actcaggttgatacatcttttggaagtgtagttcctggaacagtaagtatttccggttct
gtaaaaaacggatcagctttagttaccaatgttacagttgatttgcgtaatgcaagcaat
gtaatattgcagacagtagtttctacaggaggaaattttactttcagcaacttaacttca
ggacaaaattatatacttacagctgcaaaagcgacttatacttttactccggtaacgtta
accaatgtaacaacgaaccaaacggcagttgttattaacggatctcagcctacatatact
gtaagcggaacagttttgaacggagcaacaggagtttctggtgtaaccgttacggcaact
tcaggagctacagttttaacagcagtttctaatgcaagcggggtttacagcgttgcaggt
ttaacagccgggcttaacttcaccgttacagctgcaaaaacaggattctcctacacgcca
acttcaacagtttataatgcaattgatgccaacaaaacgttgaattttgctcagggtgca
ccagtggtttattacacagtaagcggaactattcttaacggaacaactccggtttcaggc
gtaacagttacggcaacttcaacaaccggaacttttacagcaactacaaattcaagcgga
gtttattcgattgctaatttgcctgcaggcggtaattataccgtaacggcagctttggca
ggacaaacatttactccggcttcaacagtttatacgaatctgacttcaaacataacatta
aacttcgcgcaagatgttattgtagttccttcaagtaaaattagcggaacagttaaaaac
ggatcaactccggtttctggtgcaaaagtagaattagttttaccttggacagataacaca
cacaactggaaaagtgtaattgcgataacagatgcacaaggaaaatacagctttgataat
tcagttgtagcaggttataccaccgttacaagtttaaaattaaactcttgggaaaacgga
gaagtagcttacttccctaataatctggccaactttgcaattcctgcaaacccaacggtt
tataacttcaatacaagttctactgcaaaagcagcattggtagcggcaaacttgattagc
ggatcagttaaaaacggaacaactccggttgctggtgcaaaagtagaaatcgttttacca
tggacagataacacacacaactggaaaagcgttcttgccactacagatgcatcaggaaac
tatactttcgataattcagttgttgcaggttatacacaaattttgagtttaaaattaaac
tcatgggaaaatggtgaagtgacttattatccaaataacttagccaactttgcagttcca
acaactccaacggtttatgatttcaatagacaagcggtagttgcgactaagccagtggtt
actattacagcgccaacagcttctgcgattgctataaatttaggatcagcaattaatttt
gttgcaagtgttggattaagtgccgctgatgccactacaatctcatctgttgtatttagt
ttagatggacaaagcctgagtgctaccaattcttcgggaacttataccgcgatttggaca
ccggcagcaaatcagttttcgcttcctcataccttaaccgttacggctactgcatcaaac
ggaacaacagaatcaaaaacttatagttttacattaacttgttcaggtgcaaactgccca
aattcattgccggtaattacatggaattcaccatcgaatactactgtaacccagagttct
tttcaggttgtaccaatttcagttacagctgttgatagtgacggatcggtttcaggtgtt
actattacaataaatggaggtacatttaacatgacagcaggtacaaataatacctatacg
tataattttacaccatctgcttatcaggattatccggttgtaatcaaagcaacagataat
aaagctgctgtaactacattaaacaatacaattaaaattgctccggtgagcacgaataga
ttcattccgcttccatctaaaattattttaggatatgcacattcctgggaaaatgcaggt
gctccatttttatatttttctcaaatggtaggaagtaagtttaacgtagtcgattattct
ttcgtagaaaccgttaatcgtgatggttatacgccagtattaactacaaatgacactaga
tatttgaccaatggcgttttcaataaacaattgttgaaaaacgatataaaatccttaaga
gatagcggcgttccagttattgtctctattggaggtcaaaatggtcatgttgttttagac
aatgtagctcaaaaaaatatttttgttaacggtctaaaagcaattattgatgagtatcaa
tttgatggagttgatattgattttgaaggcggatcgatgaattttaatgcaggaggttta
agagatatttcttatgcgggtatttctgcttatccaagattaaaaaacgtagtagatgct
ttcaaagaattaaaagcttactatggtcctggatttttattaactgcagctcctgaaaca
caatacgtacaaggaggatattctacctatacggatacttttggttccttcctgccaatc
attcaaaatttgcgtaatgatttggatttgttagcggtacaattgtataatacaggagga
gaaaacggattagatggtcaatattatggttcagctaagaaatcaaacatggtaacagcc
ctaaccgatatgattataaaaggatataacattgctacaacaggaatgcattttgatggt
ttaccgccctcaaaagttcttattgcattaccagcttgtccaagtgcagcaggtagcggt
tatttaacgccgacagaaggaattaatgctatgcattatttaagaaccggaaccactttt
tcaggaagaacatacactatgcagccaggcggaccatatccttctttaagaggtttaatg
acttggtctgtaaactgggatgcctcttcttgcggtaattcatctgaattatctaaagcg
tatgcagcttatttcgcatcacagtcagcagcaaaaacattggcagttgataaaattgaa
gtaaaaagtaatacaattgtttactttaaaaacaatgccttatcagttacaaacgaaacg
gaagatattgctcgtgtagacgtatttaatacaattggacaaaatttggtaaaccaccaa
aacatccaaaataataaagagattctgctacaaaaccaaagtttctcaactaaacaaatg
tttatagttgtagtaacagacaaagcaggaaacaaaaaatcattcaaagtaataaacttt
ttaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
