Flavobacterium pectinovorum: Q1W71_10100
Help
Entry
Q1W71_10100 CDS
T09245
Name
(GenBank) amino acid adenylation domain-containing protein
Organism
fpec
Flavobacterium pectinovorum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Condensation
AMP-binding
PP-binding
AMP-binding_C
Antitox_RHH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKL50106
LinkDB
All DBs
Position
complement(2431444..2438061)
Genome browser
AA seq
2205 aa
AA seq
DB search
MNDIGAVFYEFRLHEGAMWIDNDIIKFSIPKKFQNEETKNFFVKNKEEIVAVLKENQIFS
KEKFLSTNILSNKHLVYYPLSSAQERLWFIEQYEQGTNAYHMPRVLELDPAADIAGIKYA
LEGIVWRHEILRSTIEQRADLDHGIQVVHYKALFIEEIRLGAEEDYEIVIKSDINRPFDL
SLEYPIRAKFYILESESGGQRRFLLINMHHIASDGWSMDIFQRELLSYYKGYIDGDKTFA
LPALDIQYKDFAVWQRNYLTGEVLENQLGYWKSKLSGYVPLEFPADHIRPSQIDYRGSHQ
NFVLSKEVSEQLRLLAQKLGVTLHSVMLSSVNILLGKYTGQDDIVIGTPIANRHHRQTQD
LIGFFVNTQVNRTILSKGQSYVSLIDQVHQDQIEGQLHQDLPFEKLVEELGVDRDASRHP
IFQVMFVVESSKIDKVSPAEEIDYLKPVYFEGSYEVEKFDLSIFIDDSQESLMGSVSYAT
NLFNKDTIERFIGHYEHLLAELVKAPEQCYDQISLLLPSEYKEMVYDWNATDKDYPVDKT
IYELFQAQAESTPDSVALVYEGQELSYRELNERSNQLARHIRLEYEKRTQEALRGDSLIA
LCLDRGLEMVIGILAVLKSGGAYVPIDPEYPQDRIDYILEDTGAVLVLSQKHLLNKEDLQ
LPKDKVITIDLGGSIYDGQDISNLPQHSGAKNLAYVIYTSGTTGRPKGVMIEHAGVVNLI
MDLLDKYGIVSSERFILFANYVFDASVEQIFLAILSGSRLFLVENKFIMNTGIFVDFISN
NRITHLHSTPSYLITIDPSKLNLLKRLVFGAEYLKKDLFVKFKRYIPVVINKYGPTETTV
TSLISFNSNLLNKASIQNTRAYALDTNNQPVPVGVIGELHIGGAGLARGYLNRDDLTSER
FIGNPFATDADKSKGYDRLYKTGDLVRWLVDGNLEYIGRNDDQVKIRGYRIELGEIEHAL
SSIAGISQSSVLVRERETSGGIIKSLVGYYVAEEGDSNLDQGMILEQLSAVLPEYMIPGV
LIAMDSFPLTINGKLDKRSLPDPDFSVAAEDYQAPSTAMEILVCGIWQEVLGLERVGVTD
NFFRIGGNSILAIQVSHRMSSALGCYIKIADIFKYKTILDLLAHNVESIEAVIPKTAEKQ
SILSFSQERLWFIEQYEQGTNAYHMPRVLELDQATDIAGIKYALEGIVWRHEILRSTIEQ
SEDLDHGIQVVHDKALFIEEIRLGAEEDYESVIKSDINRPFDLSLEYPIRAKFYTVESES
GGERRFLLINIHHIASDGWSMNIFQRELLSYYKGYIDGDKAFALPALDIQYKDFAVWQRN
YLSGEVLENQLGYWKSKLTGYVPLEFPTDHLRPSQIDYRGSHQNFVLSKEVSEQLRLLAQ
RLGVTLHSVMLSSINILLGKYTGQDDIVIGSPIANRHHRQTQDLIGFFVNTQVNRTILSK
GQSYVSLIDQVHQDQIEGQLHQDLPFEKLVEELGVDRDASRHPIFQVMFVVESSNTDREV
HTQEISSFKPVYFEGSYEVEKFDLSIFIDDSQESLMGSVGYAVSLFDKDTIERFIGHYEH
LLAELVKAPEQCYDQISLLLPSEHQEMVYDWNATDKDYPQDKTIYELFQAQAESTPDSVA
LVYDGQELSYRELNERSNQLARHIRCEYQKRTQEALRADSLIALCLDRGLEMIIGILAVV
KSGGAYVPIDPEYPQERIDYILEDTGAVLVLSQKHLLDKEDLQLPKDKVITIDLGGPIYD
GQDSSNLPQHSGAKNLAYVIYTSGTTGRPKGVMIEHKAFVQFLFNFRDYVKDGFNRKQQN
VLSLTNYVFDIFGLEYGLPLIGGNKVTLSSIYKIKEEELVNIDLVQQTPSSLIYLVTHHF
NKLKNIVCLVGGEALPSLIADKLLNAFDRLINVYGPAETVIWSSSYEVKKSEEPYIGKAL
PNEKAYVLDTNNQPVPVGVIGELHIGGAGLARGYLNRDDLTSERFIGNPFATDADKSKGY
DRLYKTGDLVRWLVDGNLEYIGRNDDQVKIRGYRIELGEIEHALSSIAGISQSSVLVRER
ETSGGIIKSLVGYYVAEEGDSNLDQGMILEQLSAVLPEYMIPGVLIAMDSFPLTINGKLD
KRSLPDPDFSVAAEDYQAPSTAMEILVCGIWQDVLGLDRVGVTDNFFRIGGNSILAIQVS
HRMSSALDCSIKVSDIFKFSTINKLYNNKKDYLINNNIVYEEGEI
NT seq
6618 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgatataggagctgttttttatgaatttagactccatgaaggagctatgtggatt
gataatgatataattaaattttcaattccaaaaaaatttcaaaatgaagaaacaaaaaat
ttttttgtaaaaaataaggaagagatagttgcagttcttaaagaaaaccagattttttca
aaagagaagtttttaagtactaatatattaagtaataaacacttagtttattatccatta
agttcggcccaggagcgtttatggtttattgagcagtatgagcaagggaccaatgcttat
catatgcccagagtgctggaacttgaccctgctgctgatattgcagggattaagtatgct
cttgagggtattgtatggagacatgagatactgcgaagcactattgaacaaagggcagat
ctggatcatggcatccaggttgtccattataaggcactgtttattgaagagataaggctg
ggagcggaagaagactatgagattgttataaaatcggatattaaccgtccctttgattta
agtttggagtatcccatccgtgctaaattctatatactagaatcagaatcgggaggacaa
agaaggttcttgctgatcaacatgcaccatattgccagcgatgggtggtcgatggatatt
ttccagcgggagctgctgtcttattataagggttatatcgatggcgataagacttttgca
ctgcctgctttggatattcaatataaggattttgcggtatggcagaggaattacctgaca
ggagaagttttggagaatcagctgggttactggaagtccaagttatcaggatatgtgccc
ttggaattcccggcagatcatataagaccatcacagattgattacaggggatctcatcaa
aattttgttttgagcaaagaagtaagtgagcagttacgattgttggctcagaaacttggc
gttacgcttcacagtgtgatgctgagcagtgttaatattttactgggtaaatataccgga
caggatgatattgtaattgggactcctattgccaacaggcatcacaggcagacacaggac
cttatcggtttttttgtcaacactcaggtgaacaggactattttgagcaagggacaaagt
tatgtgtccctgattgatcaggtacatcaggatcagatagaaggacaattgcatcaggac
cttccttttgagaagctggttgaagaattgggagtggatcgtgatgcctcaagacatcca
atttttcaggtcatgtttgttgtggagagttctaaaatagacaaagtgtcccctgcagaa
gaaatagattatctcaaacccgtttattttgaaggttcttatgaggttgagaagtttgac
ttgtcgattttcatagatgacagccaggaatcccttatgggttctgtgagttatgccacg
aatttgtttaataaggatacaatagaaaggtttatagggcattacgagcatttgcttgcg
gagttggttaaagctcccgagcagtgctatgatcagatcagcttactgcttccatcggag
tataaagaaatggtttatgactggaatgccacagataaggattacccggtggataagact
atttatgagttattccaggcccaggccgagagtacacctgatagtgttgctttggtttat
gaggggcaggagctgagttacagggagcttaatgagaggagcaaccagctggcacgtcat
atccgtttggaatatgagaaaagaacccaagaggcacttagaggagacagtcttatcgcc
ctgtgcctggacaggggccttgagatggtaattggaatactggctgttttgaagtcaggc
ggggcttatgttccgattgatcctgagtatccccaggacaggattgattatattttggaa
gataccggtgcagtgttggttttaagccaaaagcatctgttgaataaagaggatttacag
ctgccaaaggacaaggttattaccattgaccttggcggatctatatatgatgggcaggat
atttcaaaccttccccagcacagcggtgcaaagaacctggcatatgttatttatacctcc
ggtacaacaggcaggcctaaaggggtgatgattgagcatgcaggcgttgttaatttgata
atggatttgttagataaatatggtatagtatcttcggaaagatttattcttttcgctaat
tatgtttttgatgcctcagttgagcaaatatttttagcgatattgtcagggtcaagatta
tttctagttgagaataaatttattatgaatactggtatttttgttgattttatatcaaat
aacagaattacccatttgcattctactccatcatatttaattacaattgatccttcgaag
cttaatttattaaaaagattagtatttggggctgaatatttaaagaaagatttatttgta
aagtttaaaagatatattccagtagttattaataaatatgggcccaccgaaactacggta
acaagccttatttcatttaattcaaacttattgaataaggcaagtattcaaaacacgaga
gcttatgccttagacactaataaccagccagttccggtgggggtgattggggagttacat
ataggaggtgccggattggctcgcggttatctgaaccgcgatgatttgacatcggaacgt
tttatcggcaatccgtttgctacagatgcagacaagtcaaagggttatgacaggctttac
aagacaggggatcttgtccgctggcttgtggatggcaatctggaatatatcggcaggaat
gatgaccaggtgaagatccgcggttacaggatcgagcttggagagatcgagcatgccctt
tcatcgattgccggtatctcgcaatcgagtgttttggtcagggaaagagaaacgtcaggg
ggtataatcaaatccttggttggttattatgtagccgaggaaggtgattcgaatttggac
cagggtatgatcttagaacagctgtctgctgttcttccagaatatatgatcccgggcgtt
ttgattgcgatggattcctttcctttgaccatcaacggcaagctggacaagcgttctctg
cctgaccctgattttagtgtagcggcagaggattatcaggcaccaagcactgctatggag
attttggtatgcggtatctggcaggaagtcctgggactggagagggtcggggtaacggat
aatttcttcaggataggaggtaattctatcctggcaatccaagtgtcgcatcgtatgagc
agtgcactgggttgttatataaaaatagcggatattttcaagtacaaaacaattttggat
ttattggctcataatgttgaaagtattgaggcagtaatccctaaaacggcagaaaaacaa
agcatattatccttttcccaggagcgtttatggtttattgagcagtatgaacaaggtacc
aatgcttatcatatgcccagggtgctggaacttgatcaggctacggatattgcagggatt
aagtatgctcttgagggtattgtatggagacatgagatactgcgaagcactattgagcaa
agtgaagatttggatcatggtatccaggttgtccatgataaggcattgtttattgaagag
ataaggctgggagcggaagaagactatgagtctgttataaaatcggatattaaccgtcct
tttgatttaagtttggagtaccccataagggctaaattctatacagtagaatcagaatcg
ggaggagaaagaaggttcttgctgatcaacatccaccatattgccagtgacggctggtcg
atgaatattttccagcgggagctgttgtcttattataagggttatattgatggcgataag
gcttttgcacttcctgctttggatattcaatataaggattttgcggtatggcagaggaat
tatctcagtggagaagttttggagaatcagctgggttactggaagtctaagttaactgga
tatgtgcctttggagtttccaactgatcatctcagaccatctcagattgattacagggga
tctcatcaaaattttgttttgagcaaagaagtaagtgaacaattacggttattggcccaa
agactaggtgttacgcttcacagtgtaatgttgagcagtattaatattttactgggtaaa
tataccggacaggatgatattgtaattgggagtcctatagccaacaggcatcacaggcag
acgcaggaccttatcggattttttgtcaacacgcaggtgaacaggaccattctaagcaag
ggacaaagttatgtgtcgctgatcgatcaggttcatcaggatcagatagaaggacaattg
catcaggaccttccttttgagaagctggttgaagaattgggagtggatcgtgatgcctca
agacatccaatttttcaggtaatgtttgttgtggagagttccaatactgacagagaagtt
catacgcaggagattagttctttcaaaccagtttattttgaaggttcttatgaggtagag
aagtttgacttgtcaatttttatagatgacagccaggaatcccttatgggttctgttggt
tatgccgtgagtttgtttgataaggatacgatagaaagatttataggacattacgagcat
ttgcttgcggagttggttaaagctcccgagcagtgctatgatcagatcagcttgctgctt
ccatcggagcatcaagaaatggtttatgactggaatgccacggataaggattatcctcag
gataagactatttatgagttattccaggcccaggccgagagtacccctgatagtgttgct
ttggtttatgatggccaggagctgagttacagggagcttaatgagaggagcaaccagctg
gcgcgccatatccgttgtgaataccaaaagagaacccaggaggcacttagggctgacagt
cttattgccctgtgcctggacaggggccttgagatgatcatcggaatactggcagtggtg
aagtcgggtggtgcttatgttccgattgatccggaatatccccaggagaggattgactat
attctggaggatacaggagccgtgttggttttaagccaaaagcatctgttggataaagag
gatttacagctgccaaaggacaaggttattaccattgaccttggcggaccgatatatgac
gggcaggacagttccaaccttccccagcatagcggtgcaaagaacctggcatatgttatt
tatacctccggtacaacaggaaggcctaaaggggttatgattgagcataaagcatttgtt
cagttcctttttaactttagagattatgtaaaagatggatttaatcgaaaacaacaaaat
gttttaagtttaacaaattatgtttttgatatatttggattagaatatggacttccatta
attggaggtaataaagttactttatcatctatttataagattaaagaagaagaattagtc
aatattgacttagtacagcaaaccccaagtagtttaatatatttagtaactcatcatttt
aataaattaaagaatattgtttgtctagttggaggagaagctcttccatctttgatagca
gacaaattacttaatgcgtttgatagattgattaatgtatacggaccagcagaaacagta
atatggagttcttcttatgaagtcaaaaaatcggaagaaccatatattggcaaggcatta
ccaaatgaaaaggcttatgtcttagacacgaataaccagccagttccggtgggggtgatt
ggggagttacatataggaggtgccggattggctcgcggttatctgaaccgcgatgatttg
acatcggaacgttttatcggcaatccgtttgctacagatgcagacaagtcaaagggttat
gacaggctttacaagacaggggatcttgtccgctggcttgtggatggcaatctggaatat
atcggcaggaatgatgaccaggtgaagatccgcggttacaggatcgagcttggagagatc
gagcatgccctttcatcgattgccggtatctcgcaatcgagtgttttggtcagggaaaga
gaaacgtcagggggtataatcaaatccttggttggttattatgtagccgaggaaggtgat
tcgaatttggaccagggtatgatcttagaacagctgtctgctgttcttccagaatatatg
atcccgggcgttttgattgcgatggattcctttcctttgaccatcaacggcaagctggac
aagcgttctctgcctgaccctgattttagtgtagcggcagaggattatcaggcaccaagc
actgctatggagattttggtatgcggtatctggcaggatgtccttggactggacagggtc
ggggtaacggataacttcttccggatcggaggtaattctatcctggcgattcaggtctca
caccgtatgagcagtgcattggactgttctataaaggtatctgacatatttaaattttcg
acgattaataaactttacaataataaaaaagactacttaataaataacaatatagtttat
gaagaaggagaaatataa
DBGET
integrated database retrieval system
