Flavobacterium pectinovorum: Q1W71_24335
Help
Entry
Q1W71_24335 CDS
T09245
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
fpec
Flavobacterium pectinovorum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fpec00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fpec02000
]
Q1W71_24335
Transporters [BR:
fpec02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Q1W71_24335
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Plug
EMC7_beta-sandw
fn3_3
WxLIP_PGBD
TTR_TEN1-4
PEGA
DUF6795
SdrD_B
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKL48065
LinkDB
All DBs
Position
complement(5825105..5827405)
Genome browser
AA seq
766 aa
AA seq
DB search
MKYLNLKTSCFLSAICLLFSISTALAQTNGKIKGTITTSEGDPAAGVNVVLKNSKYGTVT
NDDGSFELNRVKPNTYSLQISLTGYETTEQEVVVAESETANVNLKLKVSNKELQEVVINS
KKSILSKKTDYVARMPLKNLENPQVYSVIHKELLLEQVAVNIETAIRNSPGAIPVTFPSG
GIGITFRGFTTGVNARNGMETASGRSSIDLSNVERIEIMKGPSGTLFGSSVSSFGGVVNL
VTKKPFETAANEVSYTTGSFNTNRLTADINTPLNKDKTVLFRINMAVNREKSFLDYGFNN
TLAISPSLTYKASDKLTFNIDAELFNVNNTRRTYNTYTAASGITNPTDLKIDYKKSMFHD
DNDAKTSATKIFAQAEYEISENWKSTTVFSFVDENVERSYQSYAVWSSPTQVARRVGLWG
PVFNTYTNIQENINGQFATGSIKHKLLVGGNYRLYSSNFSGGTTFTLDNIDVTTNFAPIR
RKAVDAGLVLTTIPVADQETISFYACDVVNFTDKLSAMLSLRLDNFNREKVGTTEGYHQT
ALSPKLGLVYEIIKDQVSVFGNYMNGFQNSAPVTQPDLTQLVLDPIYAVQYEGGIKAEAF
NKKLSATASYYNIKIDNATRTDAAGVTYQDAKQESKGVDLELIANPFSGLNIVAGYAYNE
NKVLKTSIAAGAPKNVVNFWTTYTLQNTLKGLGAGFGVNYVDKSYFATDNNFYMPSYTTY
NATVFYDQSSWRVGVKFNNMSNKKYWDFYGNSQAPSNLLVNLTIKF
NT seq
2301 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatatcttaatttgaaaacgtcttgttttctatctgcaatctgcttgctattttca
attagtacagcattggcccaaactaatggaaaaataaaaggaacaatcacaacttcagaa
ggagatcctgccgctggtgttaacgttgttcttaaaaattcaaaatacggtaccgttacc
aatgatgatggtagttttgaattaaacagagtaaaaccaaatacgtattctctgcaaatc
tctttaactggttacgaaacaacagaacaagaagttgttgtagccgaaagtgaaactgca
aacgtcaatttaaaactaaaggtttctaataaggaattacaagaagtggtaatcaacagc
aaaaaaagcatcttatctaaaaaaacagattacgttgcgagaatgccattaaaaaatctc
gagaatccgcaggtttatagtgtcattcataaagaacttttattagagcaggtggcagta
aatattgaaactgctatacgaaattcacctggtgctatacctgttacttttccgtctggc
ggaattggtattacatttagaggttttacaacgggagtgaatgccagaaatggtatggag
acagcatctgggcgttcttctatagatctttcaaacgtagaaagaatagaaatcatgaaa
ggaccatcaggaactttatttggatcttcggtatcttcttttggtggtgttgtcaatctg
gttactaaaaaaccatttgaaactgcagcaaacgaagtttcatataccacaggaagtttt
aatacaaaccgacttactgcagatatcaataccccgcttaacaaggataaaacggttttg
ttccgaattaatatggcggttaacagagaaaaaagctttttagactatggctttaataat
acgctggccatttctccgagcttaacttacaaggcttctgataaacttacttttaatatt
gatgcggaattatttaacgttaataataccagacgaacttataatacttatactgctgcc
tcgggaataacaaatcctactgatttaaaaatcgattataaaaaatcgatgtttcatgat
gataatgatgctaaaacttctgctactaaaatttttgcgcaggcagaatatgaaatttct
gaaaactggaaatccacaaccgtattttcttttgtagacgaaaatgtagaacgtagttac
cagagttatgcagtttggagctctcctactcaggtcgccagaagagttggtttatgggga
cctgtttttaatacttatactaatattcaggaaaatattaacggacaatttgctaccgga
agtatcaaacataaacttttggttggtggtaattacagattgtacagttctaatttttct
ggcggtactacttttactcttgataatattgatgttacgacaaactttgctcctatcaga
agaaaagctgttgatgccggtttagtgttaactacgattccggttgcagatcaggaaaca
attagtttctatgcctgtgatgttgttaattttacagataaattatcggctatgctaagt
ttacgtttagataattttaaccgtgaaaaagtaggtactacagaaggttatcatcaaacg
gcattatctccaaaattaggtttggtatatgagatcattaaagatcaggtttcggtattt
ggtaactacatgaatggttttcaaaattccgctccggttacacagcccgatttaacgcag
ttagttttagatccaatttatgccgtacaatacgaaggtggtattaaagctgaagctttt
aataaaaaactaagtgctacagcaagttattacaatataaaaattgataacgctacaaga
acagacgcagccggagttacttatcaggatgccaagcaggaaagcaaaggagttgattta
gaattaatagccaatccgttttctggtttaaacattgtggcgggatatgcttataatgaa
aataaagtactaaaaacatctatagctgcgggagcaccaaaaaatgttgtcaacttttgg
acaacttataccttacaaaacacactaaaaggccttggtgcaggttttggagtcaattat
gtagataaaagttattttgcgacagataataatttttacatgccatcttacacaacttac
aatgctactgttttttacgatcagtcttcatggagagttggtgttaaatttaataacatg
agcaataaaaaatattgggatttttacggaaattctcaagcacctagtaatttattggtg
aacttaactattaagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system