Francisella philomiragia GA01-2801: LA02_1362
Help
Entry
LA02_1362 CDS
T03621
Name
(GenBank) transporter, betaine/carnitine/choline transporter family protein
KO
K02168
choline/glycine/proline betaine transport protein
Organism
fpj
Francisella philomiragia GA01-2801
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fpj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fpj02000
]
LA02_1362
Transporters [BR:
fpj02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
LA02_1362
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
BCCT
DUF7027
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJI56554
LinkDB
All DBs
Position
1331032..1332978
Genome browser
AA seq
648 aa
AA seq
DB search
MQREKGAYAPVFYPAIILAIVLSLSGIFYPNQFASHIQNLQNLILEKFGWAYILAMSVFL
CLCLILMFSRFGDIKLGQEHDLPEYSNISWFAMLFAAGMGIGLMFYGVAEPLKHFLAPPN
MSSDELVLVKEAMNTTFFHWGIEAWSVYAIVGLSLAYFAYRHDLPLLPRSVLYPILGRHI
YGPLGHAIDVFAVLGTLFGVATSLGFGAMQVSAGMSFLTGLPDTVNMQVIYIVVIVALAT
ISVGLGLEKGIKALSNFNIILAVLLLVFILLLGNSSVLVRDYIQNIGYYLSTIVNQTFNL
YAYNQENQEWLKSWTLFYWGWWIAWSPFVGMFIAKVSRGRTIRQFTIGVLFIPVGFTFLW
MTVFGNSAIEIAMNGNGEALKDAVNNNIPVALFEFLQHFPFSTLLSVLAVFLIVTFFVTS
ADSGALVIDILATGNAKQSITLQRIAWSVLSGLLAISLILAGGLQALQSATIISAFPLLF
ILFLMCVSLIKSLRLDYLRLKSIETHSTVVQFAKANTSWQKRLEAIAHKPSKDQAIEFLQ
KDVTTAIIEVADEMEKNGINTEVIRDHDHIQLAISIEGNEDFIYSVMLRSYQSKLGNYNR
VEVLLSHGGQYYDIMGYSKDQVIADIVNQYDKHLHYLHLVVADKDIVN
NT seq
1947 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaacgagaaaaaggtgcttatgctccagttttttatcctgctattattttagctatt
gtcttgtcattgtcaggaattttttatccgaatcaatttgctagtcatatccaaaatcta
caaaatttaattctagaaaaatttggttgggcttatatattggcaatgagtgttttttta
tgtttatgtttgatcctaatgttcagtcgctttggcgatatcaagttaggtcaagaacat
gatttacctgagtactctaatatttcatggtttgctatgctgtttgcagcgggtatggga
attggtttgatgttttatggagtagcagaaccattgaagcattttttagctcctcctaat
atgtcttcagatgagttagtacttgttaaagaagctatgaataccacatttttccactgg
ggtatagaagcatggtcagtatatgcaattgtaggtttatcattagcatattttgcttat
agacatgatttacctttattacctcgatcggtactttatccaatattaggcagacatata
tatggtcccttaggtcatgccattgatgtttttgcagtactaggaacattgtttggtgta
gcaacatctctaggatttggtgcaatgcaggtgagtgctgggatgagctttttgacaggt
ttaccagatactgtaaatatgcaagttatttatatcgtagttatagttgcattagcaaca
atatctgtaggattaggacttgaaaaaggcattaaggcactaagtaattttaatattata
ttggcagtattattactagtttttatactattgttgggtaattcatcagtattggtacgc
gattatattcaaaatattggttactatttaagtactatagtaaatcagacctttaatttg
tatgcttacaatcaagaaaatcaagaatggctaaaaagttggacattattttattgggga
tggtggatagcttggtcgccatttgtcggaatgtttattgccaaagtatctagaggtaga
acaatccgccagtttactataggtgtattgtttatccctgttggatttacatttttatgg
atgactgtttttggcaattctgctattgaaatagctatgaatggtaatggtgaagctttg
aaagatgccgtgaataataatatacccgtagcattgtttgaatttttacaacattttcca
ttctcaacactattatcagttttggcagtatttttaatagtgacattttttgtaacatct
gctgatagtggagccttagttatagatattttagctacaggtaatgccaaacaatcaata
acattacagcgtattgcttggtcagtacttagtggtttacttgcaatatcattaatttta
gcaggtggtttacaagctttacaatcagctactataattagtgcttttccattgttgttt
attttatttttgatgtgtgtttcactaattaaatctttaagattagattatttaaggctt
aaaagtattgagacacattcaactgttgttcaatttgcaaaagcaaacacatcttggcag
aaaagattagaagctattgctcataaaccatcaaaagatcaggctatagagtttttacaa
aaagatgttacaacagctataattgaggttgcagatgaaatggaaaaaaatggtattaat
acagaagttattagagaccatgatcatatacaactagctatttcaatagaaggtaatgaa
gattttatatatagtgtgatgctaagatcatatcagtcaaaattaggtaattataatagg
gtagaagtacttctaagtcatggaggtcagtattatgatattatggggtattcaaaagac
caagtcattgcagatattgtcaaccaatatgataagcatttgcactatttgcacctagtt
gttgcagataaggatattgttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system