KEGG   Flavobacterium psychrophilum v4-33: IA06_02560
Entry
IA06_02560        CDS       T03661                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
fpk  Flavobacterium psychrophilum v4-33
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:fpk00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:fpk02000]
    IA06_02560
Transporters [BR:fpk02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   IA06_02560
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug CarbopepD_reg_2 CarboxypepD_reg Phage_integrase
Other DBs
NCBI-ProteinID: AIG40757
LinkDB
Position
complement(576540..578747)
AA seq 735 aa
MKSFLVALLLGFAIFCNAQNKITGAITNSENKILETVLVSIPELNKETISDSNGNFLFLD
LPKGKFKISFSLVGYDEKLVSVFINKAEINLNIRLESSSNHLEEVKIAATIFNKIQSQNV
MKIEHKSIRELQQKGAVTLMEGLASIAGVSQVSTGTSIGKPVVRGLSGNRVLVYTQGVRL
ENQQFGEEHGLGLNESGIESVEVIKGPASLLYGSDALGGVLYFNPEKFAKPNSYLADFSQ
KYFSNTNGSNTSFGLKSSSENWKFLIRGAYNNHGDYKMPSDSLVTNTRFEEADVKTALGF
SNSKFSSVLRYNLNHLNLGIPEQIGLQTTKRDPDYPRQGVVNHILSLHNNFYFRNSKFDA
DFGYISNSRKEFADSTIPVLDMNLNTLNYDLKYYLPNIGKLEAIIGVQGMSQSNKNLGSE
LLIPDAKTNDIGALLTTNYEWKSNVIQAGFRYDTRKINTESHGIIGDEGYFEAISKKYTS
FNASVGYKTKLTDNLSFRLNVASGFRSPNLAELTSNGVHEGSNRYEIGNSNLKNEQNIQT
DLNLEYGNSHFEFFANGFYNNISNYIFIAPNGSIMADNDVYDYVQANAKLYGGEFGVHFH
PHPLDWLHITSSFETVTGLKENGEYLPLIPANKWNNNIRTEFNLNNWIKKGFATLNIESV
FKQNNNSTFETKSKDYRLVNVGLGGNININKLKFDISINSNNMLNKSYISHLSRLKTDRI
SNIGRNIVLGVSFFL
NT seq 2208 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaatcatttttagttgccctattgttagggtttgccattttttgtaatgcacaaaat
aaaattacaggtgctattactaattccgaaaataaaattttagaaactgtcttggtttct
attcctgagttaaataaagaaacaatctctgatagtaacgggaatttcttgtttttagat
ttgccaaaaggaaaatttaaaatatctttttctcttgtgggttatgatgaaaaattggtt
tctgtttttataaataaagcagagattaatttaaatattaggctagaatcttcctcgaat
catttagaagaagtgaaaatagcggctactatttttaacaaaattcaatcgcaaaatgtg
atgaaaattgaacacaaaagtattagagaattacaacaaaaaggagccgtaacgctcatg
gagggattggcttctattgctggagtttcgcaggtatctacaggaacatctataggaaaa
cctgttgttcgtgggttaagcgggaatcgtgttttggtgtacacacaaggtgtacggtta
gaaaatcagcaatttggagaagagcatggtttgggtcttaacgagagtggtatagagagt
gtagaggttataaaaggccctgcttcgttgttgtatggctctgatgcgttggggggggta
ttgtattttaatcctgagaaatttgctaaaccgaactcttatttggcagattttagtcaa
aaatatttttccaatacaaatggaagtaacacttcatttggtttgaaatcatcttctgaa
aattggaaatttttaattcgtggagcttataataaccatggcgattataaaatgccaagt
gatagcttggttaccaacactcgttttgaagaagctgatgtaaaaactgctcttggtttt
agcaattctaagttttctagtgttttgcgatataatttgaatcatttaaatttaggaatt
ccagagcaaataggtttgcaaactacaaagagagatcctgattatcctaggcaaggtgtg
gtgaaccatattttgagtttgcataataatttttatttcagaaactcgaaatttgatgcc
gattttggatatatttctaacagtcgtaaggaatttgcagatagtacgattcctgtttta
gatatgaatttgaacactttaaactatgatttaaaatattatttgccaaatattggaaaa
ttagaagctattattggtgtgcaaggaatgagtcaaagtaataaaaatttggggtcagaa
ttattaattcctgatgccaagactaatgacattggtgctttgttaaccacaaattacgaa
tggaaatcgaatgttatacaggccggatttcgctatgatactagaaaaattaataccgaa
agccacggaattataggcgatgaaggttattttgaagcgattagcaaaaaatatacgagt
tttaatgcttctgtgggttataaaacaaaactaacagataatttgtcttttagattgaat
gttgcctcaggttttagatctccaaatttggccgaactaacctcaaacggtgttcatgaa
ggtagtaatagatacgagattggaaattctaatttaaaaaatgaacaaaatattcaaact
gatttaaatttagaatatggaaattctcattttgaattttttgccaacgggttttacaat
aatattagcaactatatttttattgcgccaaacggaagtataatggcagataatgatgtg
tacgattatgtgcaagccaatgcaaaattatatggaggagaatttggtgttcattttcat
ccgcatccgctagattggttgcatattaccagtagtttcgaaaccgtaactggtctgaaa
gagaacggagaatatttacctcttattcctgcaaacaaatggaataataacattcgtaca
gaatttaacctcaataattggattaaaaaaggatttgcaaccttaaatattgaaagtgtt
tttaaacaaaataacaatagcacttttgaaacaaaaagtaaggattataggctggtaaat
gtaggtttaggtggaaatataaacatcaataaactaaaatttgatatttctataaattcg
aataatatgctgaacaaaagctatatttcgcatctttctagactaaaaacagatcgtatt
tctaatattggaagaaatattgttttgggagttagtttcttcttataa

DBGET integrated database retrieval system