Flavobacterium psychrophilum v4-33: IA06_03330
Help
Entry
IA06_03330 CDS
T03661
Name
(GenBank) phage-shock protein
Organism
fpk
Flavobacterium psychrophilum v4-33
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Toast-rack_PspC-Cterm
LiaI-LiaF-TM_PspC
PspC
HAAS
Ephrin_rec_like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIG40901
LinkDB
All DBs
Position
734774..736555
Genome browser
AA seq
593 aa
AA seq
DB search
MNKTVNMNLGGFFFHIDEDAYQKLNRYFDAIKKSLSSDGREEIMNDIESRVSELFSEKLT
GAKQVISLKEVDDVIAVMGQPEDYKIEDEAPRQPNYNYASSGSRKLYRDKENGIIGGVLA
GLGYYFGIDKVWLRLIMLVLLLSFGTGFLLYIILWIVMPEAVTTTEKLEMQGEPINISNI
EKKVKEEFENLSEKFKNADVNFKDGMDTVSEKVKIFSNDFSDKMKSNSSRVGSNLGDVII
SILGIFAKFLGAFIVMVASISLLGFFVASIVMLFSSTMPDSFALNYISTPIGLEIPLWIQ
GILFLLVFGIPFFFLLILGLKLLVTNLKSIGSIAKYSLLSLWIIALAILIVLGIKEATQL
AFDGKVVQKQSINISPTDTLFVKFKNNDFYSKDIDNHDDFRLMQDEHGKEIVYSNNVSIE
IMPTDEKLPYLQIEKLANGKTPDEAQKRAEKIIYNLKIEGNKLILDNYLLHNVKNRFRDQ
RVALFLYLPKGTYLKPDSSLRRYEETNGDYFSWNPESKNDVYKVEDNKVKCTNCPANENE
ESDYEQDDDTNIRTPNVTINEDGISIKNDTTISSAKDFKELKINKDGIIIKTK
NT seq
1782 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaacagtaaacatgaatttaggaggttttttcttccatatagatgaagacgct
tatcagaaattgaatcgctattttgatgctataaagaaatctctttctagcgacggtcgt
gaggaaattatgaacgatatagaaagtagagtttctgaacttttttcggagaaattaact
ggtgcaaaacaagttattagtctgaaagaggtagatgatgttattgcggtgatggggcag
cctgaggattacaaaattgaagacgaggcaccaagacaacctaattataattatgcatca
tcaggttctagaaaattatatcgtgataaagaaaacgggataattggtggggttttagct
ggtttagggtattattttgggatagataaagtttggttacgactaattatgttggtctta
ttgttaagttttggaacgggttttttactttatattatcctctggattgtcatgccagaa
gcagtaactactaccgaaaaattagaaatgcagggcgagcctataaacatttctaatatc
gaaaaaaaagtaaaggaagagtttgaaaacttatctgaaaagtttaaaaatgccgatgtg
aattttaaagacggtatggatacggtttctgaaaaagtgaaaatttttagtaatgatttt
agcgacaaaatgaaatctaattcgtctagagtaggaagtaatttaggcgatgttattatc
agtattttgggtatttttgcaaaatttttaggcgcttttatcgtaatggttgcatcaata
tcattacttggtttttttgttgcaagtatagtgatgcttttttcctcgacaatgcctgat
agttttgcactcaattacatatcaactcctattggtctggaaatcccgttatggattcag
ggaatattatttctattagttttcggaattcctttctttttcttattaatattaggatta
aaattacttgtcacaaacttaaaatcgataggaagtatcgctaagtatagtttgctttcc
ctttggataatcgctcttgcaattcttattgtcctaggaataaaagaagctacacaactt
gcttttgatggcaaagtggttcaaaaacaaagtattaatattagtccaaccgatactctt
tttgtaaaatttaaaaacaatgatttttattctaaagatatagataatcatgatgatttt
agattaatgcaagacgagcatggtaaagaaatagtatattctaacaatgtatctatcgaa
attatgccaaccgatgagaaattaccctacttacaaatcgaaaaactagccaacggaaaa
acgccagatgaagctcagaaaagagccgaaaaaataatctacaatttaaaaattgaagga
aataaattaattttagataattatttgttgcacaacgttaaaaacaggtttagagaccag
cgtgtagcattgtttttataccttcctaaaggaacttacttaaaaccagatagttcatta
agacgttatgaagaaacaaatggtgattatttttcttggaatccagaatctaaaaatgat
gtatataaagtagaagacaataaagtaaaatgcacgaactgtcctgctaacgaaaacgaa
gaatcagattatgaacaagatgatgatacaaacattcgcacgccaaatgtaaccatcaat
gaagacgggatttctattaaaaatgacactacaatatctagtgctaaagattttaaagaa
ttaaaaataaataaagacggaatcattataaaaactaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
