Fusobacterium polymorphum: ERS445057_00625
Help
Entry
ERS445057_00625 CDS
T08899
Name
(GenBank) Autotransporter beta-domain
Organism
fpol
Fusobacterium polymorphum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CKG76757
LinkDB
All DBs
Position
1:637303..644769
Genome browser
AA seq
2488 aa
AA seq
DB search
MSNNLHKVEKDLRSIAKRYKSIKYSIGLAILFLMLGVGAFSEEVDSSQANGVPTREEIAS
SKENLKNSVGSLQSKIDSARAENEKGLVGLKLELIQLMEQGDQVVKSPWSSWQFGANYMY
SKWDGTYKGRGDKAEKYPYEGVYTRSSDLFLRNISTDSDVYEKYTSSINETSANSATTST
IRKKGGSLGYGIASTLPAQEPIVQIELGASVRPKKISKSPVAVTPPSITVNAVTPLSTPQ
PPGAPTPPTISIPEFNPVAPDPITVSLPTPPTFNIKLGSFCNYMTPNCEASTHQSGQHPE
NGGKNSGTAYSFDHNNGIISITESSLLGGPAVRYAWTSYNSALLKVYFDYGLNSNGMGGG
TAKVDTNLTIDSIMGNITPNANANFDWNKGKFLTGGSRVATLDNARNATIQNNKTINMMG
PLVVGYEVQSDNSTIFGGGHFWNNEVRILENSETGTLTDEIEKSDQTADNRLNDLLKVKQ
IYENGSGIHGYNPNSNGAGTVDSTTLTLPTFAGGGNLNISRDPDIGYKDENGNFITTKYG
GYTGYKIGLILTYENIDNRDSSNYILRNKGTINFQGKRSIGIQVYAPGSDNNKINAPKVT
VKNIGDKADITLGGVASYGLKLSSRVDENSIVENEGKININGDNTKSYVLDNNNPNVKTG
IYDGDADGNRDNYSLSSGIAVIEDNTLKDNSSIRAYQGKVQNKGTINVSGGQGNTGMVLK
VKANDDITNDGSGTITVTGIKNIGMRVDLGTTKTDNNPANIIPKAYNKGTITITNGEQNI
GMVANSSESSGGNIVHKAIAENKNNITFTGKASNAIGMFSQDGAEIINATNGKITGPTVG
GLEGTIGMVIQPKIAPTNVGSSGINNGEINLTGTKVTGVYNQGTFTMEGANSSITTSGKK
AISLYAIGNSSTTNINSGKIIAKDGALGLFADDTTINLGNNTAAPELEGHGKGTLLFYNY
TKNSSGSYESKGKFKINKETTAKLTTGATAFYFKDITPGSATGGATDQTTADKLNKMFAG
SIDKLKLRLDKDSTLFVLDNKIFNTGAIPLSSIQPTQINNYLGDHVSVDTNNSSKNFKAY
KTTRGTLSIDEDVQLDNHTGTAIDSYYRVDFLNSAVTVEAGKKMVGTDATEIEQVIAQAN
YEDATSDNHVKVINNGTIDFSKKGGTAIAVDYAPATNNGLIKMDAANGTNKNSIGLFGAS
SSKLTNSSTGEIQLGTRGVGIWGANKIGSSVGTWSKNINITNNGKITGLSGKEGVFGIYA
VNDIATYTGATSNIVHGVTGNIDLSQSKKSIGIYMANGTLTSSGNISVSDKSVGLDATTS
DVRISGGTHTIGKESVGFKLTNISNTKKFLGNSGNISIKDKGSVAYLIKSSVLTSGTNFK
DNLALTSTSAYTYMSLINHSMLDYMNTKTIANDDSIFVNTKDSTVSLLSGTSVTSTNKKV
TGVYSENSAVSNAGILALTGDESSALYGKAGSFLINSGKITIGKSGSGIYSIDSTGKNNG
EITIGQGSVGMRAEDAIIENGVAGKILSTGVSALGMSQSGGTQNITNKGAITLMGDKSIA
LHSKGITSPNHKVINVGNITVGDSSNILSPSIGIYSANGVNSTVENSGKVVAGKKSTAIY
AGNINLTGTSETTAGNGGIGVYSKIGNVNISENSKITVGATLGSGQEGVGVYLAGNNQTL
NSNTDKLSIGKGSFGYVMTGQGNTIRTGKIGTTGVIKLSDDSVFMYSGDKTGTIKNYNNL
KSIGNENYGVYALGSVENHGNIDFSQGIGNIGAYSYVEGATTTPNAIKNYGTIKVSKSDI
NDPDNRKYGIGMAAGYSEETPKGSGNFVTRGIGDIENHGTIKVTDPDSIGMYATGSGSKI
LNAGRIELSGPKRNIGIFAENGAEVINTGTITTVGSGNVGQIGIAIRKGAILDNRGTINI
DASKGYGLLIAGGIVKNYGEANITVDSGATKIKEIRASDTSKEIEDLRGNKVKIYSPAGA
ANGVITENGVVRKPTVVHVQAIANRKPNDIPTSSVGMYMDTSGINYTRPINNIGALRGLT
QSDIIIGVEATKYTTAKTIQLGQDIIEPYNDMIRKSGIEKFSIYSGSLTWMASITQLPDY
TIRNAYLRKIPYTVWAGKMATPIDKKDTYNFTDGLEQRYGIEGIGTRENGVFQKLNSIGN
NEEILLYQAFDEMMGHQYANVQQRVQSTGIILDKEFNYLRDEWRTASKDSNKIKTFGTNG
EYKTNTAGVIDYKYHAYGVAYVHENEDIKMGRGTGWYTGIVHNTFKFKDIGNSKEQMLQA
KVGLLKSVPFDVNNSLNWTISGDIFVGRNTMHRKFLVVDEIFNAKSRYYTYGIGVKNEIG
KEFRLSEGFTLRPYAALKLEYGRVSKIREKSGEVRLEVKHNDYFSVRPEIGAELGFKHYF
GMKALRTTLGVAYENELGRVANGKNKARVAHTDADWFNIRGEKENRRGNVKFDLNVGLDN
TRYGVTANIGYDTKGENLRGGLGLRVIL
NT seq
7467 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaataatctacataaagtagaaaaagacttacgttcaatagcaaaaaggtataag
tcaattaaatattctattggcttggcaatcttgtttttaatgctaggagtaggagcattt
tcagaagaggttgatagttcacaagcaaatggagtaccaacaagagaggaaatagcttca
tcaaaagaaaatctaaaaaattctgttggtagtttacaatcaaaaattgatagtgcaaga
gcagaaaatgaaaaaggtttagtaggattaaaattagaattaattcaattaatggaacaa
ggagatcaagtagttaaatcaccatggtcttcatggcaatttggagctaattatatgtac
agtaaatgggatggtacatataaaggaagaggggataaagctgaaaaatatccttatgaa
ggagtttatacaagaagtagtgatttatttttaaggaatatttcaactgatagtgatgtt
tatgaaaaatatacttcatctataaatgaaacttctgctaattcagcaacaacttctact
attaggaaaaaaggaggaagtttaggttatggaatagcaagtacacttccagcacaagaa
ccaatagtacagatagaattaggtgcttctgtaagaccaaaaaaaatatctaagtcacca
gtagcagttaccccacctagcattactgtaaatgctgttacacctttgagtacaccacaa
ccacctggtgcaccaacaccaccaactataagtatacctgaatttaatccagtggcacct
gacccaataactgtatcattaccaactccacctacttttaatattaagttaggttcattt
tgtaactatatgactcctaactgtgaggcttctactcaccaaagtggtcaacatccagaa
aatggtggaaaaaattcaggaacagcttactcatttgatcataataatggtataataagt
ataacagaaagtagcttattaggtggaccagcagtaagatatgcttggacaagttataat
tctgcccttttaaaagtttattttgattatggtttaaatagtaatggaatgggtggagga
acagccaaagtagatacaaatttaactattgattcaataatgggaaatattactccaaat
gctaatgctaattttgattggaataaaggaaaatttttaacaggaggctcaagagttgct
accttagataatgcaagaaatgctacaatacaaaacaataaaacaataaatatgatggga
ccattggttgttgggtatgaagttcaaagtgataacagcacaatatttggaggaggacat
ttttggaataatgaagtaagaattttggaaaattcagaaactggaactcttacagatgaa
atagaaaaaagtgatcagactgctgataatagattaaatgacttattaaaagttaaacaa
atttatgaaaatggtagtggaattcatggttataatcctaacagtaatggagcaggtaca
gtagattcaacaacattaactttaccaacatttgcaggaggaggaaatttaaatatatca
agagatcctgatattggttataaagatgaaaatgggaactttattacaacaaaatatgga
gggtatacagggtataaaataggattaattttaacttatgaaaatattgataatagagat
agtagtaattatatattaagaaataaaggaactattaactttcaaggtaagagatctatt
ggcatacaagtttatgctccaggaagtgataataataaaataaatgctccaaaagtaaca
gtaaaaaatataggagataaagctgatataacattaggtggggtggctagttatggttta
aaattatcttctagggtagatgaaaattcaatagttgaaaatgaaggaaaaattaatata
aatggagataatacaaaatcttatgttcttgacaataataatcctaatgtaaaaacaggt
atatatgatggtgatgctgatggaaatagggataattattcgctttcatcaggtatagca
gtaatagaggataatacattaaaagacaactcttcaataagagcatatcaaggaaaagtt
caaaataaaggaactataaatgtttctggtggacaaggtaatactggaatggttttaaaa
gtaaaagctaatgatgatattactaatgatggtagtggaacaataacagttactggaatt
aaaaatattggtatgagagtggacttaggaacaactaaaacagataataatccagcaaat
attataccaaaagcatataataaagggacaattactataactaatggggaacaaaatatt
ggtatggttgctaatagttctgaaagttcaggaggcaatatagttcataaagctattgct
gaaaataaaaataatataacatttacaggaaaagcttcaaatgcaatagggatgttctca
caagatggagcagaaatcataaatgcaacaaatggaaaaatcacaggaccaactgttggt
gggcttgaaggaacaataggaatggtgatacaacctaaaatagcacctacaaatgtgggt
tcaagtggtataaataatggagaaataaatttaacaggaacaaaagttacaggagtatat
aaccaaggtacatttacaatggaaggtgctaattcttctataacaacttctgggaaaaaa
gctatttctttgtatgcaataggaaattcttctacaacaaatattaattctggaaaaata
attgcaaaagatggggcattaggactttttgcagacgatacaacaataaatttaggaaat
aatacagctgcacctgagttagaaggacatggaaaaggaactttattattctataattat
acaaaaaattcttctggttcttatgaatctaagggtaaatttaaaataaataaagaaaca
acagctaaattgacaactggtgcaacagccttttattttaaagatataacaccaggttca
gcaacaggaggagcaactgatcaaacaacagctgataaattaaataaaatgtttgcaggt
tcaatagacaaattaaagttaagattagataaagattcaactctattcgtattggataat
aaaatttttaatacaggggctattcctttaagcagtatacaacctactcaaataaataat
tatttaggtgatcatgtatcagttgatacaaataattcatcaaaaaattttaaagcatat
aaaacaacaaggggaactttaagtatagatgaagatgttcagctagataatcatacaggt
acagcaatagatagttattacagggtagatttcttaaactcagctgttactgttgaagca
ggtaaaaaaatggttggaactgatgcaacagaaattgaacaagttatagctcaagctaac
tatgaagatgcaacaagtgataatcatgtaaaagtaataaataatggtacaatagatttc
tctaaaaaaggtggaactgcaatagctgtagactacgcaccagctacaaacaatggttta
ataaaaatggatgcagctaatggtacaaataaaaatagtataggattatttggagcatct
agttcaaaattaacaaatagttcaacaggagaaattcaacttggaacaagaggagttgga
atttggggagctaataaaataggtagttcagtaggtacttggagtaaaaatataaatatt
acaaataatggtaaaattacaggactttctggaaaagaaggagtatttggtatctatgct
gtaaatgacatagcaacttatactggggctacatctaatatagttcatggagtaacagga
aatatagatttatctcaatctaaaaaaagcataggaatctatatggcaaatggaacatta
acttcatctggtaatatatcagttagtgataagagtgttgggttagatgctacaacttca
gatgtaagaataagtggtggaactcatacaataggtaaagaatctgttggtttcaaatta
acaaatatttctaacactaaaaaattcctaggaaattcaggaaatatttctataaaagat
aaaggttcagttgcctatttaattaaaagttcagttctaacatcaggaactaattttaaa
gataatttagctttgacttccacaagtgcttatacatatatgagtttaataaatcatagc
atgttggactatatgaacactaaaactattgctaatgatgattctatatttgtaaataca
aaagattcaactgttagtttattatcaggaactagtgtcacttcaacaaataagaaagta
acaggagtttattctgaaaattcagctgtatcaaatgctggaatactagcgttaacagga
gatgaatcatctgctctatatggtaaagctggttcatttttgataaatagtggtaagatt
actattggaaaaagtggttcaggaatatatagtatagatagtactggaaagaataatgga
gaaataacaataggacaaggctcggtaggtatgcgtgcagaagatgcaattatagaaaat
ggggttgctggaaaaatcctaagtacaggagtaagtgcactaggaatgtctcaaagtgga
ggaactcaaaatataacaaataaaggtgctattacattgatgggagataaatcaattgct
ttacattcaaaaggaataacttctcctaatcataaagttattaatgtaggaaatataact
gttggagattcttcaaatatattaagtccaagtataggcatttattcagcaaatggagta
aatagtacagtagaaaatagtggaaaagttgttgcagggaaaaaatcaacagcaatttat
gctggaaatataaacttaactggaacatctgaaacaacagcaggtaacggaggaatagga
gtatattctaagataggaaatgttaatatttctgaaaattctaagataactgttggagct
acattaggcagtggtcaagaaggagttggagtatatttagctggaaataatcaaactctt
aatagcaatactgataaattaagtattggaaaaggttcgtttggttatgtaatgactgga
caaggaaatacaataagaacaggaaaaattggaacaacaggagttataaagctttctgac
gattcagtatttatgtattcaggagataaaacaggaactataaaaaattataataattta
aaatcaataggaaatgaaaactatggtgtctatgcactaggttcagttgaaaatcatggg
aatattgactttagccaaggtataggaaatataggagcatatagctatgtagagggtgca
actacaacacctaatgctataaaaaactatggaactataaaagtatctaaatcagatatt
aatgatccagataatagaaaatatggaataggtatggcagctggatatagtgaagaaact
cctaaaggctctggaaacttcgtaacaagaggaataggagacatagaaaatcatggaact
ataaaagttacagatcctgatagtataggaatgtatgcaacaggttcaggttcaaaaatt
ttaaatgcaggtagaatagaattaagtggacctaagagaaatataggtatatttgctgaa
aatggagcggaagtaattaacacaggaactataacaactgttggttcaggaaatgtaggg
caaataggtatagcaataagaaagggagctattttagataatagaggaactataaatata
gatgcttctaagggatatggattacttatagctggtggaatagtaaagaactatggggaa
gctaatataactgttgatagtggtgcaacaaagataaaagaaataagagcgtctgatact
tcaaaagaaatagaagatttaagaggaaataaagtaaaaatttactcaccagcaggagca
gctaatggagttataacagaaaatggtgtagttagaaagccgacagtagtccatgtacaa
gcaatagcgaacagaaaacctaacgatataccaacatcatcagtaggtatgtatatggat
acatcagggataaattatacaagacctataaataatattggtgctttaagaggattaact
caatcagatataattataggagtagaagctactaaatatactactgctaaaactatacaa
ttaggtcaagatataattgagccatacaatgatatgataagaaaatcaggaatagaaaaa
tttagtatttattcaggttcattgacttggatggcatcaataactcaactacctgattat
acaataagaaatgcttatttaagaaaaataccatatacagtttgggctggtaagatggca
acacctattgataaaaaagacacatataatttcacagatggattggaacaaagatatggt
attgaaggaattggaacaagagaaaatggagtattccaaaaattaaattctattggaaac
aatgaagaaatcttactataccaagcctttgatgaaatgatgggacatcaatatgcaaat
gtacaacaaagagtacaatcaacaggaataatcttagataaagaatttaattatttaaga
gatgaatggagaacagcttcaaaagattcaaataagataaagacatttggaactaatgga
gaatataaaacaaatacagcaggagtaatagattataaatatcatgcttatggtgtagct
tatgtacatgaaaatgaagatatcaaaatgggaagaggaacaggctggtatacaggtata
gttcataatacatttaagtttaaagatataggaaattcaaaagaacaaatgttacaagca
aaggtaggattattaaaatcagtaccatttgatgttaataatagtttgaattggacaata
tcaggagatatctttgtaggacgtaatacaatgcatagaaaattcttagtagtagatgaa
atatttaatgcaaaatcaagatattatacttatggaataggtgtaaagaatgaaatagga
aaagaatttagattaagtgaagggttcacattaagaccttatgcagcattaaaactagaa
tatggaagagtatctaagataagagaaaaatcaggagaagtaagattagaagtaaaacat
aatgattatttctcagtaagaccagaaataggagcagaattaggattcaaacactacttt
ggaatgaaagcattaagaacaacattaggagtagcttatgaaaatgagttaggaagagtt
gcaaatggaaaaaataaagcaagagtggctcatacagatgcagattggtttaatataaga
ggagaaaaagaaaatagaagaggaaatgtaaaatttgacttaaatgttggattggataac
acaagatatggagtaactgcaaatataggatatgatactaagggagaaaacctaagagga
ggtttaggactaagagttatattataa
DBGET
integrated database retrieval system