Fusobacterium polymorphum: ERS445057_01035
Help
Entry
ERS445057_01035 CDS
T08899
Name
(GenBank) N-formylmethionyl-tRNA deformylase
Organism
fpol
Fusobacterium polymorphum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
SNF2_assoc
Helicase_C
ResIII
ERCC3_RAD25_C
SWI2_SNF2
DUF6078
AAA_14
AAA_22
DUF7226
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CKG87607
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(1045618..1047837)
Genome browser
AA seq
739 aa
AA seq
DB search
MNINEYEMKLFNKLARESLVLLEDKFFEIFSFFQDKLEHFNISEEYLDLIKNYSNKKPKI
YLDINSDGDLIFKLEYKNHFVNTNLIQIVEIFEMLNPNIIKNLKNYINFYQKVYEINETM
IIEKKSEIDKFIEDIIPLLHTYADIYLSQSIKNFNKTRKINYSVGVKVTSNFLELDFSST
DLDKGEIIDILNQYRAKKKYYRLKKGEIILMDQEQLEFLDDFIKDFNIKDADLKKGNIKI
PNFRAYQLNALQNKYMNIEKNPDFNKLFEQKIEEIPAKYKKILREYQIVGVEWMLKLRSM
NLGGILADDMGLGKTLQVITYLESIERERPCLIITPASLILNWENEFNKFNSSVSILSVY
GDRKNREGLLSNLKNEVVITSYDYLKRDIDLYENINFNTIILDEAQYIKNHKTKIAQAVK
KINSEFKLALTGTPLENSLAEIWSIFDFLMNGYLFNYDYFYKNYEKAIVLQDEKNIIERL
KNMVEPFILRRLKKDVLKELPEKIEETYFIEMNQEEKNLYQANLIKINETLAQNIDVNTN
KIEVLAMLTKLRQICIDPRLLYEDISSSSSKINACIELIKKSIENKQRILLFSSFTTVLD
LVAEECDNLSIPYFMLTGETNKVKRNQLVEDFQNEAVPLFLISLKAGGTGLNLTKASVVI
HLDPWWNISAQNQATDRAHRIGQEDTVQVFSLIIKNTIEEKILNLQNKKKELSDIFVENS
KGSFSSLTKEELFDLFKLE
NT seq
2220 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatatcaatgaatatgaaatgaaattatttaataaattagcaagagaaagtttagta
ttgttagaagataaattttttgagattttttcattcttccaagataaattagagcatttt
aatatttcagaagaatatttagatttaattaaaaattattcaaataaaaaacctaaaatt
tatttagatattaatagtgatggggatcttatctttaagttagaatataaaaatcatttt
gtaaatacaaatttaattcaaattgtagaaatatttgaaatgttaaatcccaatattatt
aaaaacttaaaaaattatataaatttttatcaaaaggtatatgaaataaatgaaactatg
attatagagaaaaaatcagaaattgataaatttattgaagatattattccattacttcat
acctatgctgatatatatttaagtcaatctattaaaaactttaataaaactagaaagatt
aattattctgttggagttaaagtaacttctaattttttagaattagatttctcttcaact
gacttagataaaggagaaattattgatatattaaatcagtatagagctaaaaagaagtat
tatagattaaaaaaaggtgaaataatactgatggatcaggagcaacttgaatttttagat
gattttataaaagattttaatataaaagatgctgatttaaaaaaaggaaatataaaaatt
ccaaattttagagcttatcaattaaatgctcttcaaaataaatatatgaatatagagaaa
aatccagattttaataaattatttgaacaaaaaattgaagaaattcctgctaaatataaa
aaaattttaagagaatatcaaattgttggtgttgaatggatgttaaaattaagatctatg
aatttaggtgggatactagcagatgatatgggacttggtaaaactttgcaagttattacc
tatttagaaagcattgaaagagaaagaccttgtttaattattacaccagcttctctaatt
ttaaactgggaaaatgaatttaataaatttaattcatcagtttcaatattatcagtatat
ggagatagaaaaaatagagaggggcttctttctaatttaaaaaatgaagtggtaataact
tcttatgattacttaaaaagagatattgatttatatgaaaatattaactttaatactatt
atcctagatgaagctcaatatattaaaaatcataaaacaaaaatagctcaggctgtaaaa
aagataaactcagaatttaagctagcacttacaggaacaccattagaaaatagtttggct
gaaatatggtctatttttgattttctaatgaatggttatctattcaactatgattatttt
tataaaaactatgaaaaagctattgttttacaagatgaaaagaatattatagaaagatta
aaaaatatggttgagccatttatactgagaagattgaaaaaagatgtgcttaaagaatta
ccagaaaaaattgaagaaacatactttattgaaatgaatcaagaagaaaaaaatctatat
caggcaaatcttataaaaattaatgaaactttagctcaaaatatagatgtcaatactaat
aaaattgaagtcttggctatgctaacaaaattgagacaaatctgtatagatccaaggttg
ttatatgaagatataagctcttcttcttcaaaaattaatgcttgtatagagttaattaaa
aaaagtatagaaaataagcagagaatattactattttcttcatttacaactgtacttgac
ttagttgcagaggaatgtgataatctatcaattccatattttatgctgactggagaaacg
aataaagtgaaaagaaatcaattagttgaggattttcaaaatgaagcagtacctttattt
ttaatttctttaaaagcaggtggaactggtttaaatttaactaaggcaagtgtagttatt
cacctagatccttggtggaatatatctgcacaaaatcaagcaacagatagagcacatagg
ataggacaagaagatactgttcaagtatttagccttattataaaaaatacaatagaagaa
aaaattttaaatctacaaaataaaaagaaagaattaagtgatatttttgtagaaaattct
aagggaagtttttctagtttgacaaaagaagagttatttgatttattcaagctggaataa
DBGET
integrated database retrieval system
