Frischella perrara: FPB0191_01454
Help
Entry
FPB0191_01454 CDS
T03525
Name
(GenBank) RHS repeat-associated core domain protein
Organism
fpp
Frischella perrara
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
TEN_YD-shell
RHS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJA45271
UniProt:
A0A0A7S7L1
LinkDB
All DBs
Position
complement(1645184..1649227)
Genome browser
AA seq
1347 aa
AA seq
DB search
MINEHIKRLIIIFIITITLPLQKIAHAQLFYNDQQIISGESYDNVKLPNLEYIESNVDLR
VKVLGGEVKLNRSWVNGRWYANPAWTNLRFILDPLDNSVKTIDRAGTMYQRVKNDQLFTY
ETVAIKKIESGWRWFDQQGNWINFDDKGRLLEYGDANNVKVSFILDDEGRRIAINDHFGE
LVYRFTYNDQENLVQVTDREGRTVNYEWSGNKLVKVIDVMGNEWFYGYDANGQLNQKTSP
DGNFIKIDYTVSTPAPLTAMTSGKEGAVISQNPVITTGSINRDTKLAQVGKIIEKNGAVT
IYNRHYNRINKQFSITLTAANGEKITTEYDSKGRKLKQTINDNLTELYQRDTLNNEVKFT
NERGLNTTIQYNESNFPTKIVYPNGASEFYEYNKSNKLIKITNINGLVVTFDYDNLMRPK
EVIFALGKPEQRKISFSYDNYGQQIAAIISDGNKTIELQKTFDRYGNIITYTDGKGYQSQ
YTYNIQGQIKTVKNYLQDFWQFNYNLAGYSTEIIDPLNHSMFFTTDFMGRLTKYIDALGH
ETLFNYSFTPDGYETKVTNPLNQTTTYQYDNLYHLIKTISTTGLEKQKIYNAEGEIIQDI
DEVGNVITYEYGTKGSDLAGLVAKIVLPTYSAVFSYNNTNNITEINQLLGDNKTITKHFV
YDQMGSLTQVIDAANRLTQTDFNILGYPIKKIDAVGGQTTFERDLLGNLNKIIDANENQY
SYVYDENNNLIKETKSLGNEVEYFYNEIDQLVEQKNSNGNRVIYQYDKAGNNIKKSYLDK
AQSIPSQEIYYSYNEANQLIEVQQTGDTNTHFIYQRDALGRVIQETISYGDGNDKITKTL
KYSYDEEGNLISFNYPDNSSVNYQYDKNQLIQATLANGEIITWSNYQWLMPTKINYPSIT
QNNLYDPLLRILQINVSNNDKSLLKRDYLYDEVGNISQIETENGLINYQYDSLDRMTMSK
PSNEIQNLGVPIESYEYDLIGNRISSLQYSEEWIYNQFNQLTKLGDGENKTILTYTPNGQ
LASEVTSDKKWSYHYNAADRLISVKDENNEIASYQYDAFGRRISKMVNGEVTYFMYANEG
LIAELNNNGELIVAYGWVPNSEWGTHPLWYAKLAMNQTLQTATYNYLITDHLGTPQLAFN
NQGQPTWKIYNDAFGNVILDPNNNITLNLRFPGQYYDQETGLFYNYFRDYNPKIGRYIQS
DPIGISGGINTYIYANSNPLIYIDPNGKFGLVGAAWGAGLSFGGQLLVNYYITGNAWVSF
RCIKFQKVLVSAALGAASPGLFQLVKPGCCELGLARSDVILYHLGFTQPVKATFNKILPN
LRFGDDCECKDIDNGLFGKFSHKSTTL
NT seq
4044 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaatgaacacataaaacggttaatcataatttttataataaccatcaccttaccg
ttacagaaaatagcccacgcacaacttttttataatgatcaacaaattatatcaggcgaa
agttatgataatgttaaattacctaacctagaatacatcgaaagtaatgttgatctgaga
gtgaaagtacttggtggagaggtaaaattgaatcgaagttgggttaatgggcgttggtat
gctaatccggcttggacaaatttacgttttatacttgatcctttagataatagtgttaaa
acgattgatagagcaggtacaatgtaccaacgtgttaagaatgatcaattatttacttac
gagacagtcgcaattaagaaaattgaaagtggttggcgatggtttgatcaacaaggtaat
tggattaattttgatgataaaggaaggttacttgaatatggtgatgcaaataatgtcaaa
gttagttttatcttagatgatgaaggacgacgaattgctattaacgatcattttggtgaa
cttgtatatcgttttacctataatgaccaagaaaatcttgtacaagttacagatcgcgaa
ggtcgaacagttaattatgaatggtctggcaataagcttgtaaaagtcattgatgtgatg
ggtaatgaatggttttatggttatgatgcaaatggacagcttaatcaaaaaacatcgcca
gatggtaattttattaaaattgattatactgtttctactcctgctcctttaacggcaatg
accagtggtaaagaaggtgcagtaatttcacagaatcccgtaataacaactggttcaatt
aatcgagacactaaattagcacaagttggtaaaattattgagaaaaatggcgcagtaact
atttataatcgtcattacaatcgtattaataagcaattctcaattactctaactgctgct
aatggagaaaaaataacaactgaatatgattctaaggggcgtaaattaaaacaaactata
aatgataatttaactgaactttatcaaagggacacattaaataatgaagttaaatttaca
aatgaaagaggattaaacacaactatacagtataatgaaagtaatttcccaactaaaata
gtttaccctaacggtgccagtgagttttatgaatataataaatcaaataaactaataaaa
ataaccaacataaatggtttagtagttacatttgactatgacaatttaatgagacccaag
gaggtaatctttgcactaggtaaacctgaacaacgtaaaattagttttagttatgacaat
tatggtcaacaaatagcagcgattatcagtgatggcaataaaacaattgaattacaaaag
acttttgatagatatgggaatattattacttacactgatggtaaagggtatcaatctcaa
tatacttataacatccaaggacaaattaaaactgtaaagaattatttacaggacttttgg
caatttaattataatttagctgggtattccacagaaatcattgatccacttaatcatagc
atgttttttacaaccgattttatgggacgcttaacaaagtatattgacgcattaggtcat
gaaacactttttaattatagctttactccggatggatatgaaactaaagttaccaatcca
ctcaatcaaacaactacatatcagtatgataatttatatcatcttattaaaactataagt
actacaggattagagaaacaaaaaatttataatgcggaaggagaaataattcaagatata
gatgaggtaggtaatgtcatcacttatgaatatggaactaaaggatctgatttggcaggt
ttggtagctaaaatagtccttcctacttattcagcagtatttagttataataacacaaat
aatatcacggaaattaatcaattattgggtgacaacaaaacaataacaaaacattttgtt
tacgatcaaatgggttctttaactcaagtaattgatgctgcgaataggttaacacaaact
gattttaatattttaggttatcctataaaaaaaattgatgctgtaggaggtcaaacaact
tttgagagagacttattaggtaacttgaataaaattatagatgccaatgaaaatcaatat
tcttacgtttatgacgaaaacaataatcttattaaggaaacaaaatccttaggcaatgaa
gtagagtatttttataatgaaattgatcagttagttgagcaaaaaaatagtaatggaaac
cgcgtcatatatcagtatgataaggctggaaataatattaaaaaaagttatcttgataaa
gcacaatcaatacccagtcaggaaatttattattcttataatgaggcaaatcagttaata
gaagtacaacaaacaggcgatacaaacactcattttatttatcagcgtgatgctttaggg
cgagttatacaagaaaccattagttacggtgatggaaatgataagattactaaaacactt
aaatatagttatgatgaagagggaaatttaatttcctttaattatccagataacagttct
gtcaactatcagtatgataaaaatcaattaattcaagcaaccttagcaaatggtgaaata
attacttggagtaattaccaatggcttatgccaactaaaataaattatccaagtattact
caaaataatttatatgatcccttgttacgaattttacagataaatgtatcaaacaatgat
aaatctttacttaagcgtgattatttatatgatgaggttggaaatatttcacaaattgaa
actgaaaatggtctcattaattatcaatatgattcacttgatcgaatgaccatgtctaaa
ccatcaaatgaaattcaaaatttgggtgtaccaattgaatcttatgaatatgacttgata
ggtaatcgaatcagtagtttacaatattcagaggaatggatttataaccaatttaatcaa
ctcacaaaattaggagatggtgaaaataaaacgatattaacttatacaccaaatggtcag
ttagcctcagaagtaacaagcgataaaaaatggagttatcattataatgcagctgatcgt
ctcatcagcgttaaagatgaaaataatgaaatagcaagttaccaatatgatgcatttggt
cgtagaatcagtaaaatggttaacggtgaagttacctattttatgtatgcaaatgaagga
ttaatagctgaattaaataataacggtgaactgatcgtggcctatggttgggtacccaac
tcagaatggggtactcacccattatggtatgctaaattggcaatgaatcagacactgcaa
acagcaacttataattacttaattactgatcatttaggtaccccgcaactagcgttcaac
aaccaaggacaaccgacatggaaaatatataatgatgcctttgggaatgttattttagat
cctaataataatattactttaaatttgcgatttcctggacaatattacgatcaagaaaca
ggattgttctataattactttcgtgattataatccaaagataggtcgttatatacaaagt
gatcctataggtatttctggcggtattaatacctatatctatgctaacagtaacccatta
atttatatagatccaaatgggaaatttggtttagtaggagcagcttggggagctggcttg
agttttgggggacaattattggtaaactactacataaccggtaatgcatgggtttctttt
cgttgtattaaattccaaaaagttttagtctctgctgctttaggtgcagcaagccctggc
ttatttcaactagtaaaacctggatgttgtgaattgggtttagcacggtctgacgtaatt
ctatatcacttaggctttacccagcccgtcaaagcgacttttaacaagatattaccaaat
ttaagatttggagatgactgcgaatgtaaagatattgataatggccttttcggaaagttt
tcacacaagtcaactactttataa
DBGET
integrated database retrieval system
