KEGG   Frischella perrara: FPB0191_02176
Entry
FPB0191_02176     CDS       T03525                                 
Name
(GenBank) type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family
  KO
K01153  type I restriction enzyme, R subunit [EC:3.1.21.3]
Organism
fpp  Frischella perrara
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:fpp00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:fpp02048]
    FPB0191_02176
Enzymes [BR:fpp01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.21  Endodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.21.3  type I site-specific deoxyribonuclease
     FPB0191_02176
Prokaryotic defense system [BR:fpp02048]
 Restriction and modification system (R-M system)
  Type I R-M system
   FPB0191_02176
SSDB
Motif
Pfam: SWI2_SNF2 T1R_D3-like ResIII EcoR124_C HSDR_N DEAD DUF6057 FliG_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: AJA45982
UniProt: A0A0A7S569
LinkDB
Position
2499397..2502321
AA seq 974 aa
MSQVSKDASEKVFQEKFVRELEKNKWHAPDYLDGNKQKVTVNDLTNHWRQELNRLNADQL
EGIELSDNEFKQVMAKVQQINNSYEAAKILAMEESKGKIDGIYRDDHPNITRKQITLTIF
KKAEVRGGDSSYHIAREVHTPNGNRFDIILLINGLPLINIEQKRSDKNLDEAFEQFKRYY
REGEYCNNFMAFSQMMVITSEIETRYFATPKTIADFNPKFVFHWADEFNKPINHWQKVAE
KFLVIPMAHQMVGDYLVIDEAKEEENRRHMLMRPYQVCALQAVEKAAFGADTPEKKPHGG
FVWHTTGSGKTITSFKTALFLSTRAGFDKVVFLVDRRELDRHTIIKFNNYAAYEPVSVDD
TKYTAQLHKHLKSAKNGIVVTTTFKLNSLIKELEESKDNALTNKKIIFIVDEAHRTTMGQ
MMGNIISYFKNNGLFFGFTGTPLFDENKIKGKINEKSELINTTEKLFGPKLHQYTIDEAI
ADGNVLGFHVDYINTGEFKSYDDLREKLIERIKIEKPDMSDRDIARLVQGWSELEVEKQA
VKKDILAYHDKTHIPRVVEEIIANWQTQSQQQQFNAILTVAYKERVIAYYNEFKKQLEDN
QQKINIAMTFSFGNENDPNNVAPEVIKTMFADYAQFTEIKFIAGDKKHGEKAYFEDIVER
ATLGGSGRNAKNIDLVIVADQLLTGYDSKRLNTLYVDRALELQGLIQAYSRTNRVFNSSK
EFGTIINFQLPRITEEIVNRALELYGSGGKTSKAIVDTYQVAVEKLANDFAELTLTLPDP
TDWQSLLRNIKKLNAFIVAFKVASDQLNTVQQYYEFKWDDIAFGMTENTWLNYVGAYKNL
AQKSNTPLAPIVIPALIGKTKLAGTQIIDAAHILNLIGEKVSNASGIQTVDNETLRIIYE
QIQELSNMGENQQAEILKEFVDTELITGKLSNQTHFDEAFNKWKADKIIILVSEFAKKWG
LNTDESPNDFGKNH
NT seq 2925 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagtcaggtgagtaaagatgcgtcagaaaaagttttccaagaaaaatttgttagagaa
ctagaaaaaaataaatggcatgcgcctgactatttagatggtaataaacaaaaagttaca
gttaatgatttaactaatcattggcgccaagaacttaatcgtcttaatgctgaccagctt
gaaggtattgaactaagtgataatgaattcaagcaagtaatggcaaaagtacaacaaatt
aataatagctatgaagctgccaaaattttagccatggaagagtcaaaaggtaaaattgat
ggcatctaccgcgacgatcatcctaacattacacgcaaacaaattaccttaactattttt
aaaaaagcagaagtccgaggtggagattctagttatcacattgcccgcgaagtacacacc
ccaaacggtaatcgttttgatataattttattaatcaatggattaccacttatcaatatt
gaacaaaaacgttcggacaaaaatttagacgaagcatttgagcaatttaagcgttattat
cgcgagggtgaatattgcaataactttatggctttttcgcagatgatggtaatcacatcc
gagatcgaaacgcgctattttgctacaccgaaaactattgctgattttaatccgaagttt
gttttccattgggcggacgagtttaataagccaattaaccactggcaaaaggtagcggaa
aaatttttagtgataccaatggcacatcaaatggtcggtgattatttggtaatcgatgaa
gcaaaagaagaagaaaaccgtcgccatatgttaatgcgtccttatcaagtatgtgcttta
caagctgttgaaaaagccgcatttggagcagatacccctgagaaaaaacctcatggtggg
tttgtttggcatactaccggctcaggtaaaaccattactagttttaaaactgcactattt
ttatctacccgagcaggatttgataaagtggtttttttagtggatcgacgtgaattagat
aggcacacaataatcaaatttaataattatgccgcttatgaacccgtttcggttgatgat
accaaatataccgcccaattacataaacatcttaaatcagccaaaaacggtattgtagta
accaccacattcaaattaaatagtttaattaaagagctagaagaatctaaagataatgct
cttactaataaaaaaataatttttattgtcgacgaagcccatcgaaccacaatggggcaa
atgatgggtaatataataagttactttaaaaacaatgggttattttttggtttcacaggt
acccctttatttgatgaaaataagatcaaaggcaaaattaatgaaaaaagtgaattgatt
aataccactgaaaaactatttggtccaaaacttcatcaatatactatagatgaagctatt
gcagatggtaatgtgctcggtttccatgtcgattatattaacactggggaatttaaaagt
tatgatgatctccgtgaaaaactcattgaaaggataaaaatagaaaaaccagatatgtcc
gaccgagatattgctcgcttggtacaaggctggagcgagttagaagtcgaaaagcaagcg
gtaaaaaaagatattttggcatatcatgataaaactcatattccccgcgttgttgaagaa
attattgctaattggcaaactcaatcacaacaacagcaatttaatgctattttaactgtt
gcctataaagaacgggtgattgcttactataatgaatttaaaaaacaactagaagataat
cagcaaaaaatcaatatagcaatgacatttagctttggtaatgaaaatgatccaaataat
gttgctcccgaagtaattaaaaccatgtttgcggattatgcacaatttaccgaaattaag
tttattgctggcgataaaaaacatggtgaaaaagcttattttgaagacattgtcgagaga
gcaactttgggaggaagtggtcgcaatgctaaaaatattgatttagtgattgtggcagat
caactattaaccggttacgactcaaaacgattaaataccctctatgtagatcgagcatta
gaactacaaggattaattcaagcttattcacgtactaatcgtgtatttaactcaagtaaa
gaatttggcacaattatcaattttcagttaccaagaattactgaagagatagttaaccga
gcattagaattatatggcagtggcggtaaaactagcaaagctattgtggacacttatcaa
gttgcggtagagaaattggcaaatgattttgcagagctcacgttgactttacccgatcca
acagattggcagagtttattgcgaaatattaaaaagttaaatgcatttatagtcgctttc
aaagttgcttctgatcaacttaataccgttcaacaatattatgaatttaaatgggatgat
attgcttttggtatgacagaaaatacttggttaaattatgttggcgcctataaaaactta
gctcaaaaatctaatacaccattagccccaatagttatacccgctttaattggcaaaact
aagttagctggaacacaaataattgatgcggcacatatattaaacctgattggcgaaaaa
gtatctaatgcttctggcatccagacggttgataatgaaactttacgtattatttatgaa
caaattcaagaattgagtaatatgggggaaaatcagcaagcagaaatactaaaagagttt
gttgatacggaactaataaccggtaagctttctaatcaaacgcattttgatgaagcattt
aacaaatggaaagcagataaaatcattattctggtcagtgaatttgctaaaaaatgggga
cttaatactgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaa

DBGET integrated database retrieval system