Flavobacterium psychrophilum JIP02/86: FP1457
Help
Entry
FP1457 CDS
T00548
Name
(GenBank) Probable TonB-dependent outer membrane receptor precursor
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
fps
Flavobacterium psychrophilum JIP02/86
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fps00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fps02000
]
FP1457
Transporters [BR:
fps02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
FP1457
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAL43530
UniProt:
A6GZK7
LinkDB
All DBs
Position
587194..589056
Genome browser
AA seq
620 aa
AA seq
DB search
MTLRNYILFCLIFLCQLVLAQNDTITNLKEVVVSDTYLHNNNKSQSIQVLNDSVIIKNQS
SLASLLNYNSTIYFKEYGRGMLSTVSFRGTTSAQTAVIWNGININSQLNGSTDFNTVTGN
DYATISVKAGGGSVIYGSGAVGGSVHLNNNLSFKKQFTNTLQLSYGSFDTSGINYKTLLS
NEKWSTQIGFSYHESKNEYPYIELFNWKGAQRKNLNGEYLNTSLNANIGYKINSNNLIKL
YSQTSNTDRHLSLVSESDTKTKYVNSFSRNLLEYDSNFYQYSINLKSAYIIEEYQYFANI
ASDYFSFGKSESAIAKLDFSYQILKSLKINTILDYSQTKGYGTSFGNNTRKIGSAALLVK
QQLGKKWQNELGIRQEITDNYKSPLLLSAGTSRFLNNWYTVKINFSRNYRMPTFNDLYWE
GTSDHGNPNLKVESSYQAEVGNVFSFKKIKLSQTFYYNKIKDLISWKPGDGGGWTPQNTN
KVTTYGLETVLGWANNIGKHLFSMSGSYAYTISQDEETKKQLFFVPFHKITASVGYSYKN
FAVNYQFLYNGFVYTRSDNDPKEIIKSYKVSNIGIDYDFKFLSNSKLGFQVLNLFNKKYQ
TLEDRPSPGRNFNIYITLKF
NT seq
1863 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactttaagaaattatattttattctgcttaatttttctttgtcaattggttttggca
caaaatgatactataacaaatttaaaagaagttgtggtgtcagatacttatctgcataac
aataacaaatcgcaatctattcaggttttaaatgattcggtaataattaaaaatcaatct
tcacttgctagtttgcttaattacaatagcaccatttattttaaagaatatggtcgtggt
atgttatctacggtttcttttcggggaacaacatcagcacaaacagccgtgatttggaat
gggataaatattaattcacaactaaatggcagcacagatttcaacaccgtaacgggaaac
gattatgctacaattagtgttaaggctggtggtggtagtgtgatttacggtagtggtgct
gtgggtggtagtgtgcatttaaacaataatttgagtttcaaaaaacagtttactaatacc
ctacaattatcttacggtagtttcgatacatctggaataaactataaaacgctactatct
aacgagaaatggagtactcaaattggtttttcttaccatgagtcgaagaacgaatatcct
tacatcgagctgtttaattggaaaggagcgcaaagaaaaaatttaaacggagaatattta
aatacaagtttgaatgctaatattgggtataaaattaattcgaataatctcattaaattg
tacagtcaaacctcaaataccgacaggcatttgtctttagtgtctgaatccgatacaaaa
acaaaatatgtaaacagttttagtcgtaacttattagagtatgatagtaatttttatcaa
tattctatcaatcttaaatcagcatatattatagaagaatatcaatattttgcaaatata
gcaagtgattattttagttttggaaagtcagaaagtgccattgcaaaattagattttagc
tatcaaatattaaaatctttaaaaataaatacaattttagattatagtcaaactaaaggt
tatggtacaagttttggtaataacacaagaaaaattggttcggcagcactattagtcaaa
caacagttgggtaaaaaatggcaaaatgagttaggtattcgtcaagaaattacagataat
tacaaaagtccgttgctgctttctgcgggaacgtctcgctttttgaataactggtacact
gtaaaaataaatttttccagaaattacagaatgcccactttcaatgatttgtattgggaa
ggaacttcagatcacggaaatccaaatctaaaagtagaaagttcttatcaagctgaggtt
ggaaatgtattttcgttcaaaaaaattaagctttctcaaacattttactacaataaaata
aaagacctaataagttggaaacctggagatggtggtggttggacaccacaaaacacaaat
aaagttacaacatacggattagaaacagtattgggttgggcaaataatattggcaaacat
ctttttagtatgagcgggagctatgcttatacaatatctcaagacgaggaaacaaaaaaa
caattgttttttgttccttttcataaaattacagcatcagtaggttattcgtataagaat
tttgctgtaaattatcagtttttatacaacggatttgtatatacaagatccgataatgac
cccaaagaaatcataaaatcgtataaagtatcaaacatagggatcgattatgattttaaa
tttttaagcaattcaaaattaggttttcaagtacttaatttattcaataaaaaataccaa
accctagaagacagaccatctccaggtagaaattttaatatatacataacccttaaattt
taa
DBGET
integrated database retrieval system