Flavobacterium psychrophilum JIP02/86: FP2299
Help
Entry
FP2299 CDS
T00548
Symbol
gspD
Name
(GenBank) Putative bacterial general secretion pathway protein D precursor
KO
K02666
type IV pilus assembly protein PilQ
Organism
fps
Flavobacterium psychrophilum JIP02/86
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fps00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
fps02044
]
FP2299 (gspD)
02035 Bacterial motility proteins [BR:
fps02035
]
FP2299 (gspD)
Secretion system [BR:
fps02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
FP2299 (gspD)
Bacterial motility proteins [BR:
fps02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
FP2299 (gspD)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Secretin
Secretin_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAL44354
UniProt:
A6H1Y0
LinkDB
All DBs
Position
complement(2639808..2641970)
Genome browser
AA seq
720 aa
AA seq
DB search
MKTIITLLLLFIFQISFSQDIRIQQIKNNIEAINTESLGLNEKVNINIKEASLSSFLLAV
SEVHKVNISVAPSLAQISIVNNFTDVTVADLLVFLCKEYNLTIDFTGNILSIKPYEKPIE
KAIIKTIDVQYDGANDLVSFDLKEDKLYDAFKKIMNESGKNLVFAPGLENQLLTAYIKNM
PFDAALNKLAYANNLSLTKSRDNFYLFDTLEGNYSLENSSEKNNTTVRQNKPQRSRKSNF
FFNVIDAENKLLEVDFENTPIASIVYDIGHELGIDMFISSPLESAGNATFKAKNISFDNL
LVKLFESKMDSKTVANNSSQPQQFSNDTSSNSAGDSYTFMKNGSIYYFGTKNQLVVRNVK
VIPLMHRSIELLGNPTSEGRSSGRLNNSNTNNYTNNSSDNKSNSNTNNYQSQGNDSSSGK
DNASSQSILSIVPAEITKDLDIKVDKELNSFVVNGPAANIDRFESFIKYIDKAVPVILIE
VMLLEVSKSATIETGFSAGIGDKPVTTKGTVFPNSDIVLGAQTINKIINSFDGFGSLNIG
SVVPNFNLSLKAMESNGNLKIRSAPRLSTLNGHKAYLSIGETTYYVVTNQNFYGSQIPQT
SEVKNYQPIDAELSVTIMPLVSGDGQITMDIKVIQSSFNGQKVDKNAPPGINSREFTSII
RVKDQDLIVLGGLEEKVKNDSGSGVPILARIPIIKWLFSSRKREDSNKKLTVLIKPTVIY
NT seq
2163 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaattataacattactattactttttatttttcaaatttctttttcccaagac
attaggattcaacaaattaaaaacaatattgaagctatcaataccgaatctttaggcttg
aatgaaaaagtaaatatcaacattaaagaagcttctttatctagttttttactagctgtt
tctgaagttcataaagtaaatattagtgtagcacctagtttagctcaaattagtattgta
aataattttaccgatgttaccgttgccgatctgttggtatttctttgtaaagaatacaat
cttaccatcgattttacaggtaatattctctctataaaaccgtatgaaaaaccaatagaa
aaagctattataaaaactattgatgttcagtatgatggcgctaatgatttggtttcattc
gatttaaaagaggataaactttacgatgctttcaaaaaaatcatgaatgaaagtggcaaa
aatttagtttttgctccaggattagaaaatcagttattgaccgcatatattaaaaacatg
ccttttgatgcggctttaaacaaattggcttatgctaataatttgagcttaactaaatca
cgtgataatttctatttgtttgacaccttagagggtaattattcccttgaaaacagctct
gaaaaaaacaatactactgttagacaaaacaaacctcaacgttctagaaaatcaaacttt
tttttcaatgtaattgatgcagaaaataaattattagaagttgattttgaaaatacccct
attgccagtattgtatatgatataggccatgagttgggtattgacatgtttatttcaagc
cctttagagagtgcaggaaatgccactttcaaagcaaaaaatatttcgtttgacaatctt
ttggttaagttattcgaatctaaaatggacagtaaaacagttgcaaataatagttctcaa
ccacagcaattcagtaatgacacctcttctaattcggcaggagatagttatacttttatg
aaaaatggtagtatttattattttgggactaaaaatcaattggttgttagaaatgttaag
gtaatcccattaatgcatcgttctattgaattgttaggtaatcccaccagcgaaggcaga
agctcgggaagattgaataattcaaatacaaacaattacaccaataactcttcagataat
aaaagtaattctaataccaataattatcaatctcaaggaaatgattcatcatctggaaaa
gacaacgctagttcacaatctattttatcaatcgttccagccgaaattactaaagattta
gatattaaagtcgataaagaactcaatagttttgtggtaaatgggccagcagcgaatatt
gaccgttttgaatcttttattaaatacatagacaaagctgttcctgttattttaattgaa
gtgatgttacttgaagtgagtaaaagcgctacgatagaaacgggttttagtgctggaatt
ggtgacaaacctgtaaccacaaaaggaacagtttttccaaattcagacattgtacttgga
gctcaaactattaataaaattatcaatagctttgatggtttcggttctttaaacattgga
agcgtggttcctaactttaatttaagtcttaaagcgatggaatctaatgggaacttaaaa
attcgttccgctccaagattatctactttaaacggacacaaagcgtacttatcgataggt
gaaactacttattatgttgtcaccaatcagaatttttatggctcgcagatacctcaaaca
tcagaagtaaaaaactaccaacccattgatgcagaattgtcagtaactattatgccttta
gtttcaggtgatggacaaattactatggatattaaagtgattcaatctagttttaatggg
caaaaagtagataaaaatgcacctcctggaattaattcgagagaatttacttctataatc
cgtgtaaaagatcaagatttaatcgtcttgggtggtcttgaagagaaagtgaaaaatgat
tcaggttctggcgtacctatattggctagaattccaattattaagtggttgtttagctcc
agaaaaagagaagattccaataaaaaattaactgttttaattaaaccgactgttatttac
taa
DBGET
integrated database retrieval system
