Flavobacterium psychrophilum Z2: AMR72_16910
Help
Entry
AMR72_16910 CDS
T04556
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
fpsz
Flavobacterium psychrophilum Z2
Pathway
fpsz02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fpsz00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
AMR72_16910
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ig_7
Por_Secre_tail
fn3
Reelin_subrepeat-B
Pur_ac_phosph_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALM50416
LinkDB
All DBs
Position
3801904..3807624
Genome browser
AA seq
1906 aa
AA seq
DB search
MKKITLLITMMLFFVTGSFAQASLYTFAQSAGTFVPITGGTLVTSATDYTPVIDDFRSTL
LTFPTPFEFGGVSYTNFSVTSNGQLGLGTTLASAGNYRVLSSNTGGNVFFAPFSVDLTAG
ASGLAEIRFEQVGNEIVVQWLNFRRYDTSESFSFQVRLNTVTKEIKFVYDGTPPFSAETS
DYPQIGIKTSNNAGNAIALTVAAGGSWNTPTVVNTTVTNGSVATLTDATGFTSGLTYTFT
PPTGCPPILSGGAASPEALSACLGNAPAAISVSGNAYIYSGIAYQWQQSAITTPATWVNA
VGGAGANSLSYVPPVFNGTAIQYRLKMTCGNTEVFSTPTVVSTQLAPTTAASALTSSNIF
NYGFSTSWTNGNGNRRVVIISPNSITDPAESGPAFEVNNVYAGSGQQIVYDGTGSSVTIT
GLTCGTAYNVKVYEYFRCGSTSPYNNLYAPAGTTNAITVSTASIVTAPLPVANNFTGFTG
TNLGTAVPGWYESAVSTPNGSTPVLAAPVTLNSAWTGSVAFANTVSAKINLFASNKNEWI
ISPKINITAASGIKFKAAITAANGSGAHATKMDGTDDKVYVMISTDGCGRTWTPLHIFSA
ANTTTLTNVLQDFTVAIPETYAGQTVQIAFVATDGTVDNDNNYDFHIANVFIDVTPQCDT
PSVTAATNVTKNSATINWTEPATGTPTGYEYIVSTTDTLPTGVGTPVTGTITSASITALA
NATTYYVFVRTVCNTDFSDWSVVGTFETFCDYQDLAGTTPGERCGAGTVDLSANSPGALY
WFTAQTGGDFLGTGTTLTTPIIQETTNFYVSSTSPVTGKNFAVGEGLATSNTNGNPFYSN
WSNMHTQHLISAQELIAAGITAGPINSIALDITSAGTLPMIDLSIKIGASTATSMTEFTD
NTGFANAYASASYMPTVGVNTFTFSTPFTWDGTSNIVVEFCHGNPSSESTMSRTIKMDPT
SFVSTVKAHVADNTAASVVCGNTSTSLASLSSRPKFIFNATGVCLSPRVAVAAVVNTPPA
FTLSADPVTICVGESTAPVTVTTGAADYTDFVWTPNTGVSGSADAGWIFNPSVTTTYTFQ
ASSATCNAVPVSVVVNVSDLPTAITLADASYCSGSVSASVGLTPFGGTNTTVLLTENFNA
ATNNWTTVNNSIGGTPANAAWTLQPNGHVYSGNVFRSNDNSQFYISNSDKQDGGDTETIL
TSPAFSTVNYQAVTVSFYHVFYDPSSESVGSVEFSSNGTDWVESNAFTGSTGSFTSFALG
TAIVPANLMNEPVVYVRFRYVAPYTYQWAIDNVTISGQKSYGYTWSPATGLYTDAAATTP
YVAGTAAAKVYAKPIVETEYTITATNPAGCISTATATVSPTSTAAPTVQAPVQTVCDAAT
VANLVATGIGIKWYTEATGGFSLSPSTLLTNGAVYYGTQTVEGCESSERVALTANIVVAS
APVVTAPTQAICTSGTVADLEAEGTGIKWYAAATGGTALAEDIVLVDGTIYYASQTLDTC
ESLTRTALTVSITLNSAPTVDAPSQIFCNEGTIADLVVTGTQVQWYTTETGGTALAEDAA
LINGTTYYASQTINGCESVTRTPKSVVFNTVTAPTGDEEQEFCASATLAQLTATGTGVKW
YSDATATTVLAPDTALVSGTTYYASQTINDCEGVSRLGVLVFIYNVVADAPADVASCNEY
VLPELENGGYFTQPNGEGTEVAAGTVVSETTTFYVYTSEGNSIVCDDENSFQVIITSVPA
PGGNTTQTINAATADTATIEDIEIIQILGSTVTWYASQEDAESGTDPLPAGTLLEEGVTY
YATQTVGECTSAAILAVTVDIVLGRDNFDSKAFTYHPNPVTDILNISYSFEITSVTVYNL
LGQQVVNKKTNANEVKIDMSGLADAAYIVNVVAGNTAKTIKVIKKQ
NT seq
5721 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaattactttactaattactatgatgttatttttcgtcaccggaagtttcgca
caggcttcgctctatacctttgcgcaatctgccggaacttttgttcctattacaggagga
acacttgtaacttctgcgacagactatacccctgtaattgatgatttcagatcgacactt
ttaacatttcctaccccctttgaatttggcggtgtaagctatacaaatttttcagtaacc
agtaatggtcagttaggccttggtactactttggcatcagcgggaaattacagggtttta
agttctaacactggtgggaatgttttttttgcgcctttctctgtcgatcttactgccggt
gcaagcgggcttgctgagatcaggtttgagcaggtaggtaacgaaatagttgtacaatgg
cttaattttaggcgatatgatacatcagaatcatttagctttcaggtgagattaaacaca
gtaacaaaagaaattaaatttgtgtatgatggcacgcctccttttagtgcagagacttct
gattatccgcagatcggtataaaaacgagtaacaacgccggtaatgctattgcacttacg
gtagctgcaggtggttcatggaatacgccaaccgttgtaaatactacggtaaccaatgga
agtgttgcgacattaacagatgcaacaggttttacaagtggattaacatacacatttact
ccgcccacaggttgtcctccgattttatcaggtggtgctgccagcccggaagcattgtcg
gcatgtttaggaaatgctcctgcggcaatcagcgtttcgggtaatgcttatatttattcg
ggaattgcataccaatggcaacaatcagcaataacaacacctgcaacatgggtaaatgct
gttgggggtgcaggggctaacagcctatcttacgtgccacctgtgtttaacggtacggcg
atacaatatagattaaaaatgacatgtggaaatacagaagtattttcaactcctacagta
gtaagtacccaattagctccaactacggccgcatcggcacttacttcatccaatatattt
aattacggttttagtacttcatggactaatggcaacggaaatagaagggtagttataata
agtccaaattcaattacagatccggctgaaagtggacctgcttttgaagtaaacaatgtt
tatgccggttcaggtcagcaaattgtatatgacggaacaggaagtagtgttaccattaca
ggtttaacctgtggtaccgcttacaatgttaaagtatatgaatattttcgttgtggtagt
acaagtccgtacaataatctgtacgcacctgcgggtactacaaatgctattactgtatct
acagctagtatagtaaccgctccactacccgtagcaaataattttacaggatttacaggt
acaaatttaggtacagcagtaccgggatggtatgagtcggctgtatctacacctaatgga
agtactcccgtacttgcagccccagttactttaaattctgcatggactggcagcgttgct
tttgctaatacagtttctgccaagataaacctctttgccagcaataagaacgaatggatt
attagtcctaagataaatataacggctgcatcgggaataaagtttaaagcggccattaca
gcggctaacggatctggtgcgcatgcaactaaaatggatggtactgatgataaggtttat
gtaatgatttctacagatggatgtgggagaacctggacgcccctgcatatatttagtgca
gcaaacacgacaacacttacaaatgtattacaggattttacagtcgccattcctgaaacc
tacgcgggccaaacagtgcaaattgcatttgttgcgacagacggtactgttgacaatgat
aataactatgatttccatatagcaaacgtatttatagatgtaacgcctcagtgtgatacc
ccttcagttactgctgcaacaaatgttactaaaaattcagcaactataaactggacagaa
cctgctacagggacacctacaggatatgaatatatagtttctacaactgatactttgcct
acaggtgtaggtactccagttacaggaactattaccagtgctagtattactgccctggca
aatgctacgacatattatgtttttgtgagaacagtatgtaatactgattttagtgactgg
tctgtggtaggaacatttgaaactttctgcgattatcaagatcttgcaggaacaactccg
ggcgaaagatgtggcgcaggtacagtagatttatcggcgaattcgccgggagctctttat
tggtttacagctcaaaccggcggggattttctaggtacaggtactacacttacaacgccc
attatacaggagacaactaatttttatgtgagtagtacttctccggttacagggaagaat
ttcgctgtaggtgaaggtttagctacatctaatacaaatggaaatcctttttattctaac
tggagtaatatgcatacacagcacctaatatctgcacaggagttgattgcagcgggtatt
acagccggacctatcaattcaattgctcttgatataacatcggcaggtacgctgcctatg
atagatctatcaattaagataggtgcaagtacagcgacttcaatgactgaatttacagat
aatacaggtttcgcgaatgcgtacgccagtgcgtcgtatatgcctacggttggcgtaaat
acatttactttttcgacaccgtttacatgggacggaacatcaaatattgtagtagagttt
tgtcatggtaatccttcatcagaatctaccatgagcaggacaattaagatggatcctaca
agctttgtatcaacggtaaaagctcacgtggctgataatacagctgcttcagttgtatgt
ggaaacacatcaactagtctggcatcgctttcttcaaggccgaaatttatatttaatgca
accggtgtatgtctttcaccacgcgtagctgtcgctgctgttgtaaacactccacctgca
tttacgcttagtgcagatcctgtaactatttgtgtaggcgagtctacagcacctgttaca
gtcacaacaggtgctgctgattatactgatttcgtatggacaccaaatacaggtgtaagc
ggatcggctgatgcaggatggatatttaacccttccgtaactacgacatatacttttcag
gcgtcttcagctacttgtaatgctgtcccggtgtcagtcgttgttaacgtaagcgactta
cctacagcaataacgttagcagatgcaagttactgttcaggttcagtttcagcttctgta
ggattgactccttttggaggaacaaatacaactgttctgcttacagagaactttaacgct
gctactaataactggacaaccgtaaataattctataggcggtacacctgcaaatgctgca
tggacattacagccaaacgggcatgtttattcaggtaatgttttccgtagtaatgataat
tctcaattttatatatctaatagtgataaacaagatggtggtgatacagaaacaatctta
acttcgccggcattcagcaccgttaattatcaagcggtaacggtttcattttatcatgtt
ttttatgatccatctagcgaaagtgtcggatctgttgaattctcgtctaacgggacagat
tgggtagaatccaacgcctttacgggatcgacaggtagttttacgtcatttgctttagga
actgctattgtacctgcaaatttaatgaacgagcctgttgtttatgtccgatttagatat
gtagcaccatatacttatcaatgggctatagataatgtaactatatcaggtcagaaaagt
tatggttacacatggtctcctgctacagggttgtatacagatgctgcggctacaacaccg
tatgtggcaggtacagcagctgcaaaagtatatgctaagcctatagtagaaacagaatat
actattactgctactaatcctgccggatgtataagcactgctaccgctacggtttcacca
actagtacagctgcaccaacggtacaggctcctgtacaaacggtttgtgacgctgctacg
gttgctaatctcgttgctacaggtataggtattaaatggtatacggaagcaactggaggc
ttttctttatcgccatcaacattgcttaccaacggtgcggtttattacggcacacaaacg
gtagaagggtgtgaaagttcagagagggttgctttaactgcgaatatcgttgtggcttcc
gcgcctgtcgtaacagctccaacacaggccatatgtacttcgggtacggttgctgatttg
gaagctgaaggtactggtattaaatggtatgctgccgctacaggcggaactgctctggct
gaagatatagttctggtagatggcactatctactacgcgtcacaaactttagatacatgt
gaaagtttaacaaggacagcgcttacagttagcataacgttaaacagcgctccgacagtg
gatgctccgtctcaaatattttgtaatgaaggtactatagccgacttggttgttacgggg
acgcaagttcaatggtatacaactgaaacagggggaactgcgcttgcagaagatgcagcc
cttattaacggaactacctattatgcttcacaaactatcaacggatgcgaaagtgttacc
agaactcctaaaagtgtagtgtttaatactgttacagctccaacaggcgatgaagaacag
gaattttgtgcttctgctacacttgcacagcttactgctacaggtacaggcgtaaaatgg
tatagtgatgctacagcaacaactgttctggcaccggatacagctcttgtaagcggaact
acctattatgcttcccaaacaataaatgattgtgagggtgtttcaagattaggagtactt
gtatttatatataatgttgttgcagatgctccagcagacgtagccagctgtaatgagtac
gttcttcctgagctggaaaacggaggctattttacacaaccaaatggtgaaggaactgaa
gttgctgcaggtactgtggttagcgagactacaacattctacgtatatacttctgaaggt
aatagtatcgtttgtgatgatgaaaattcatttcaggttattataacatctgttccggct
cccggcggaaatactacgcagactataaacgctgctacagctgatactgcaacaattgag
gatattgagattattcagattttaggtagtacagtaacatggtatgcttctcaggaagat
gctgaatcaggaaccgatccgcttccggctggcacgctacttgaagaaggcgtcacttac
tatgcaacacaaacggtaggcgaatgtacaagtgctgcaatattagcagtaacggtagat
atcgttcttggtagggataattttgatagtaaagcattcacatatcatccaaatccggta
acagacatactgaatatttcttactcgtttgagattacttcggtaaccgtttacaatttg
ttaggacaacaggttgtaaataaaaaaactaatgctaatgaggttaagatagatatgtcg
ggtcttgcagatgctgcttacatagtaaatgtagtcgcaggcaacacggcaaaaacaatt
aaagtcattaaaaagcaatag
DBGET
integrated database retrieval system