KEGG   Flavobacterium psychrophilum Z2: AMR72_17420
Entry
AMR72_17420       CDS       T04556                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
fpsz  Flavobacterium psychrophilum Z2
Pathway
fpsz02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:fpsz00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    AMR72_17420
SSDB
Motif
Pfam: CHU_C PKD PKD_4 RHS_repeat BiPBP_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: ALM50509
LinkDB
Position
3935600..3941569
AA seq 1989 aa
MLKKIVYLILLCYLPAFAQKEAANWYFGNNAGLDFNFGTPLALTNGQLSQLEGCATISDS
DGNLLFYTNGIEVYNSNHQLMLNGSGLFGSQSSTQSAIIVPAPGNPDRYYIFAIDSEGGI
NGLTYSKVDMTLDNGQGGIIVGQKNIPLATPTAEKLTATYHSNGEDIWVIAHRLGTNGFL
SYLVTASGVSTIPQESNVGVIHYSSGGLGAIGYMKSSPDGKKIAIAKLIGPAITQLFDFD
NATGTVSNPININTYASYGVEFSPDSKLLYTTSTGYFNSPIYQYDITSGSQSTIQSSQIC
ITPGIFNYTALQLGIDGKIYTVASGGESVHVIQNPSATGLACNFQQNAVSLGGKTSSYGL
PPFIQNYFQYEIGYENICDGVPTQFKINTRSVIASASWNFGDPDSGNNNSSTDIEPEHIF
SSPGTYEVSVTFVTDLGYTITLTNNLTILPGPVANTPSDMRVCDVLPNDGFSTFALGNQN
AAILGSGQATGYTVSYHLSQDDAIAGEEALVSPFTNTVNPQTLHARVTSANGCYATTSFN
LIVNPVPVVTGPDALLGCEEQQGQGKAPFDLTESIPQITGGNTAINVTFYKSQANMVSNL
PIGTPGNYTNTTPYNETIYFKAANIASPECTSTGELQLKVNPLPVLKSNIAPYSLCDTNN
PGDGFEVFDLTSRYSSITNDTGLVLTYAYDNNGTLTTITDPAAFRNTVTGQQTIFVSTQN
TFNCSNSTSFTIVVNPLPVLSDNPADFIATECEELPGEADFDLDEIATAVTAGSASYVVY
FYQTQAQTLAGGADFEPGPTYLSGDADIWARVINPTTNCVRVARVELNVIPAPIATTPAP
IAECDDNNDGFARFNLTPAMQAIEAAIPDVTVSAFETQSDADLNVNVIPSPEAYDNIVAG
TQTLYLRVQSDLTDCYDTVTLVLIVNPRPDAHSPAQPYALCDDGTSDTDGIAHFNLNSQS
AEILAGLDPAQYTVDYYTDAAATPASLIGTPGNYPSATATVYAKVTNTATGCFYIVAVRL
VVNALPVLITNEYSYSLCDTTLPANKETFDLTTTIDKFITDENLNGVAVTFHTTLADAQG
GTNALTDAQAQAYENTSQVQSLYVRFTVTTTGCFRLGYLDIRVEPQPVLTLPSQDELTVC
DTDGNGIGEFNLEALKEGLANGDASLVITFHLTAEEALSGANPIGNTTDYRNDHPGTQTL
WVRAVSGTTGCFNTTPFPVTLIVTPAPQAPKLQDITLCDDTDNNGQDGALRTDLTVYETQ
IKEAVAPVEVTITYYLSQADSDAGSNGIASPARHIARDGQVIWVRVENTAGCYSLTSFTI
HINKPHQLVTPTPLAVCNEALPNDGIAEFNLTQKDDEILGPDGVGMDYVVDYFTTDPKTD
STAVAIATPDAYVNTDSNGAAQNPRTIWVRVTTTQGCVSYTTLTIRVLPLPVPNFNPAPL
EVCDQDTTVVGSEPFDLTLAQDDIRNNGTNYVFSYYTTEEDAQAGTNAIPDPTSHNSASG
SVWVRVEANTNNPSDLRCFQIVELELIVNPLPPIADLADYGICNDTPASPTAFNLKEYVE
TALGGNTGTIYTIGYFSDAALTTRATPITGYVVTGSATVYIEVVNNDTGCRIVKELELIV
EQQAVANPVADPAAVCDTDDQNDGRASGWDLTLLAPEVLGAQDPAVFLVSYYDIDPSTVP
APQPIQDPENYTNQTPESQVIWIVVTNSDTVQDTPCSATTTVTLRVERRAEPVITTADGS
DTVCIEWGASEGELELNSGVVPNGHTYLWYKDGVLLTDSDDSGSYIAKTGGVYTVVVTGP
APLECVSDESAGFTVIESGQASAIGQGYYVTNYFSDNQTITVTIEGNGEYTYQLDNGPRQ
ESPVFTNVSPGYHTVTVWDEKTDFPCQELVLNGVSIVDYPNFFTPNGDGFHDTWNIIGLS
GTGSVIYIFDRYGKLIKQISPDLESSGWDGTLNGTPVPATDYWFTVTYPEFDGTTTVTKE
FKSHFSLKR
NT seq 5970 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcttaagaaaatagtatacctcatcttgctgtgttaccttcctgcgtttgctcagaaa
gaagccgctaactggtattttggtaataatgcaggattagattttaattttggaacgccg
ttagcattaacaaatggacaattgtctcaattggaaggttgtgccactatttctgatagt
gatggtaatcttttattttacacgaatggaatagaggtatataactccaaccaccagtta
atgttaaacggaagtggtctgttcggaagccagagtagtacccagtctgcaattatagtt
ccggctccaggtaatcctgatagatattatatatttgctatcgacagtgaaggaggaatt
aatggtcttacctattctaaggtagatatgacacttgacaatggccagggcggaataata
gttggtcaaaaaaacattccccttgcaacgccaactgctgaaaaacttacagctacctat
cactccaacggagaagatatctgggtcattgcacatcgcttaggtacgaacggtttttta
tcctatcttgtgacggcatctggtgtaagtacaattccacaggagtctaatgttggtgtt
atacactattccagcggaggtttgggcgccattggttatatgaaatcatctcctgatgga
aaaaaaattgctattgcaaaattgatcggacctgctattacacaactttttgatttcgat
aatgctaccggaactgtatcaaatccgattaatataaatacttatgcctcctatggtgta
gaattttccccggacagtaaattgctgtatacaacttccacgggttatttcaattctcca
atatatcaatatgatataacatctggaagccaatcgactattcagtcatcacaaatttgt
ataacccccggaatatttaattatacagcgttacagttagggatagatggaaaaatttat
accgttgcttcaggtggcgaaagtgtacatgttatacaaaatccaagtgcgaccggacta
gcttgcaattttcagcaaaatgcggtaagtttaggaggaaaaacttcctcgtatgggctt
cctccatttattcaaaactatttccaatatgaaataggttatgaaaatatatgtgatggt
gtccctacacagtttaaaataaatacgcgttccgttatagcttcagcaagctggaatttt
ggtgatcctgattccggaaacaataacagttctacagacattgagcccgaacatattttt
agttctccgggcacatatgaagtttcagttactttcgttacagatttaggctataccatt
actttaactaataacttaaccatccttcccgggcctgtagccaacacgccatcggatatg
cgagtttgtgatgtgcttcccaatgatggtttttctacatttgccctgggcaaccaaaac
gccgcgatactgggcagcggacaggccacaggttatacggtaagctaccatttaagccag
gacgatgcgattgcaggggaagaagcccttgtgtcaccttttaccaatacagtaaaccca
caaacactacatgcgcgtgtaaccagtgctaacggctgttatgctacgacatcttttaac
cttattgttaacccggtcccggttgttaccggccctgatgcgcttttaggctgcgaagag
cagcaggggcagggcaaagccccttttgaccttaccgagtccatcccacagattacagga
ggtaacacagcaattaatgtcaccttttacaagtcacaggccaatatggtcagtaactta
cctattggcacaccgggtaattataccaataccacaccttacaacgagacgatttacttt
aaggcagccaatatagcctctcccgagtgcacatcaacgggcgaacttcagctaaaagta
aacccccttccggttttaaaaagcaatatagctccctacagcctttgtgataccaacaac
cccggggatggctttgaagtcttcgaccttaccagcaggtatagttccatcaccaacgat
acaggccttgtccttacctacgcctatgataataatggtacgctaaccactattactgac
ccggcagcattccgcaatacagtaaccggccagcagaccatatttgtctcaacacaaaat
acttttaattgcagtaacagcacgagctttaccattgtggtaaacccgctaccggtatta
agcgataaccctgcagactttattgccaccgagtgtgaagaactgcctggcgaggctgat
tttgaccttgatgaaattgcaacagcggtaacggcaggctccgcgagctatgtagtgtat
ttctaccagacccaggcccagacactggctgggggtgctgattttgaaccgggcccaacc
tacctttcgggcgatgccgatatctgggccagggtaattaaccctaccacgaactgcgta
agggtagcccgtgtggaactaaacgtaatccctgcccctattgccaccacccctgcacct
attgcagaatgtgatgacaacaacgacggctttgcaaggtttaaccttacaccagccatg
caggctattgaggccgctatccccgatgtaacggtaagcgcctttgagacccagagcgat
gctgacctaaatgtaaatgtaataccgtcacccgaggcctatgacaatatcgtagcaggt
acccagaccctgtacctaagggtacagtcggaccttacggactgctatgatacggtaacc
cttgtgctgattgtaaacccaaggcctgatgcccacagcccggcgcagccttatgcgctg
tgtgatgacggtaccagcgatactgatggcatagcccattttaacctgaacagccagagt
gctgagatacttgcaggcttagaccctgcgcagtacacagtagactattacaccgacgct
gcagctacacctgccagccttatcggtacaccgggcaactacccatcggcaacagctacg
gtgtatgccaaagtaaccaatacagccacaggctgtttctatatcgtagcggtacgcctt
gtggtgaatgcccttccggtgcttattaccaatgagtacagctactcgctgtgtgatacc
acactgccggccaacaaagagacctttgaccttaccactaccatcgataaattcatcacc
gatgaaaacctaaacggtgtagcggtaaccttccataccacccttgccgatgcgcaaggg
ggcaccaatgcccttaccgacgcccaggcacaggcgtatgagaacacttcacaggtacag
agcctttatgtgcgctttacggtaaccactacaggctgcttcaggcttggctaccttgat
atcagggtagagccgcagccggtacttacccttccctcacaggatgagctaacggtatgt
gataccgatggcaacggtatcggtgagtttaaccttgaagccttaaaagagggccttgcc
aatggtgatgcaagccttgtgatcaccttccacctaacggcggaagaagcactatcgggg
gccaacccgatcggtaatacgaccgactacaggaatgaccacccgggcacacaaaccctt
tgggtaagggcagtgagtggtaccacaggctgctttaacaccacgccattcccggttacc
cttatagtaacccctgcaccgcaggcaccaaagctacaggatatcaccctttgtgatgat
accgacaacaatgggcaggacggggcgctaaggacagaccttacagtatatgaaacacag
ataaaagaagcagtagcccctgtggaagtaaccatcacctattacctgtcacaggctgat
tccgatgccggtagtaacggtattgccagccctgcaaggcatattgccagggatgggcag
gtgatctgggtaagggtagagaataccgcaggctgctatagccttacgagcttcaccatc
catatcaacaagccacaccagttggtaaccccaacaccccttgccgtatgtaacgaggca
ttgccaaatgacggtattgcggagtttaaccttacacaaaaagacgatgagatactgggc
cctgatggggtaggcatggactacgttgtagactactttaccaccgacccaaaaacagac
agcaccgccgtggcaatcgccaccccggatgcctatgtaaatacagacagcaatggagca
gcccaaaacccaaggacgatctgggtaagggtaaccaccacccaggggtgtgttagctat
accaccctgaccataagggtgcttccgctacctgtacccaactttaacccagccccactt
gaggtatgcgaccaggatactacagtagtaggcagtgagccctttgaccttacccttgca
caggatgatatccgcaacaacggtactaactatgtgttcagctattataccacagaagag
gatgcccaggcaggcaccaatgcgatacctgacccaaccagccacaacagtgccagtggc
agtgtatgggtaagggttgaggccaatactaataacccatctgatttgaggtgcttccag
atagtggagcttgaactaatagtgaacccactgccaccgatagccgaccttgccgactat
ggtatctgtaacgacacccctgcatcccctacagcctttaacctgaaggagtatgtagag
acagcccttggcggcaatacaggtaccatttacactataggctactttagcgatgcagcc
cttaccacacgtgccacgccaataacagggtatgtagtaacaggcagtgcaacggtatac
atagaagtagtgaacaacgacacagggtgcaggatcgtaaaagagcttgagcttatcgta
gagcagcaggcagtagccaaccctgtggcagaccctgcggcggtatgtgataccgacgac
cagaatgacggcagggcctcaggatgggatttaaccctacttgcacctgaagtacttggc
gctcaggacccggctgtgttccttgtaagctattacgatattgacccgtctacagtacct
gcaccgcaaccgatacaagaccctgaaaactataccaaccagactccggagagccaggtg
atctggatcgtagtaaccaacagcgatacggtacaggacactccatgcagtgccaccact
acggtaaccctaagggtagagcgcagggcagagcctgttatcaccacagcagatggcagc
gatacagtatgtatcgaatggggggcaagcgaaggcgagctggaacttaacagtggtgta
gtaccaaacgggcacacctatctttggtacaaagacggggtactgctaaccgatagtgat
gactcaggaagctacatcgccaaaacaggcggcgtatacaccgtagtagtaacgggccct
gcgccactggaatgtgtgtcggatgaatcggcaggctttacggtaatcgaatcagggcag
gcatcagcaataggccaggggtactatgtaaccaactactttagcgataaccagaccata
acggtaaccatagaaggaaacggggagtacacctaccagctggataacggcccaaggcag
gaatctccggtattcaccaatgtatccccgggctaccacacggttacggtatgggatgag
aaaacagattttccatgccaggagctggtcttaaatggagtaagcattgtagactaccct
aacttctttacccctaacggtgatggtttccatgacacgtggaacatcataggcttaagc
ggtacaggatcggtgatctatatctttgaccgctacggcaagcttatcaaacagataagc
ccggaccttgagagcagcggatgggacggaacactaaacggtaccccggtaccggcaacg
gactactggttcaccgttacctaccctgagtttgatggcaccacaacggtaaccaaagaa
tttaaatcgcatttctcactgaagagataa

DBGET integrated database retrieval system