Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25015 O#319L: BZ13_673
Help
Entry
BZ13_673 CDS
T03764
Symbol
recC
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V, gamma subunit
KO
K03583
exodeoxyribonuclease V gamma subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
fpt
Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25015 O#319L
Pathway
fpt03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fpt00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
BZ13_673 (recC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
fpt03400
]
BZ13_673 (recC)
Enzymes [BR:
fpt01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
BZ13_673 (recC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
fpt03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
BZ13_673 (recC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Exonuc_V_gamma
RecC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJI75648
LinkDB
All DBs
Position
complement(659659..662829)
Genome browser
AA seq
1056 aa
AA seq
DB search
MALYTYPSNKLEYLVQVLSKLLDVEKKDLFTPTQLIVGSRGMQHWLSMQLAQYRNIAMNL
KYDMINGYILDICYELTAKQEYKKAYTKDILAWRIFRGLDSINNPKLQEYYQNSDLKKYQ
LSVKIAETFSKYISYRSEWLQKWAQGEYINPAKPESDEDWQMLLWQKLVEDVAETPYKVQ
AEALQKLNRQNLEKLNIPSDIYIFGVNTISPKNLGFVFELAKYIDVNILYINPCSEYWYD
LHKSKISAWLDSDDYELQPLLANLGQQGKEFFNRLLENQEKQELEVFEKFDKNSLDFEKL
ADNNQTQLVSLQRNLLELDCQNHAKQKDLSISINSCHSPLREVQILHDKLLDMIKADLSI
KPRDILVMCPNIEDYSPYIDSVFSRYPTDKKLPCSIADRTLLDSEPLAASFIELLQLPES
NFEVNKILDYLSVPAIQQKFKISDEQLETIRYWLKESCIHHSNNGQTFSWSWGLKRLMLG
FSYSDSNYIVDDKLMTIAVIEGSEIAELGGLYELLELLEKYSQELLKPRSLEAWQDYLLE
MFDDVFDVTNDEQYIAKKIKDIIVKTVTTAKDVLLTEEIDLYTIRYCLISQLSEPIINNH
FLNGKVTFCSMTPMRNVPFRVIAMLGLNNGKFPRQESAISFDLMARLGRVKGDRTKRDDD
RYLFLEAITSARDYLYLSYIGRSVKTNVEQQPSLILKELTSYLDLNYGWGKADIKEYPLH
PFSSKCYADEYRSYDEAWLKLLQSEPKVFYDPKLLNNGVNLPKSLSILKLVKIFDDPIKA
YTNYGLELYLEDDFEELEDSEPFDINSLDKHKFKQDLLNTLENGKDKELTIKTAKLSGKL
PESVLTENEINKEVENIQKLLGKASLANYESKYLHKEILGYELEANYHIKDNQVLLYTTS
TFGIKHRFELYLTALLVALSGQQDISATYVYFDKDKNQADDVTFAISRLGAKELLEKYLT
NAQKIVSKPSLVHLDLAKAIMEYVKENQKKDASLVEKTTKQKQQAWENVIKSSETNYKAL
ENNSYFKLFYSEHPKIEDFEGQQIYQDFFEVINENK
NT seq
3171 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgttatacacctatccatcaaataagcttgagtatctggttcaagttttatctaaa
cttctagatgttgaaaaaaaagatttgttcacaccaacacagctaatagttggtagtcgt
ggtatgcaacattggctaagtatgcaattagcacaatatcgtaatattgcgatgaatctt
aaatatgacatgataaatggttatatacttgatatctgctatgagctcacagcaaaacaa
gaatataaaaaagcatacacaaaagatattttagcttggagaatttttagaggtttagat
agtatcaataatcctaaacttcaagaatattatcaaaatagcgatcttaagaaatatcaa
ctatctgttaaaatagccgagactttttcaaaatatatatcatatcgaagtgagtggttg
caaaaatgggcacagggcgagtatataaatcctgctaaaccagagagtgatgaagattgg
caaatgctactttggcagaagcttgttgaagatgtcgctgaaacaccatacaaagtccaa
gcagaagcactccaaaagcttaatcgacaaaacttagaaaagctaaatataccaagtgat
atctatatatttggggttaatactatatctcccaaaaatcttggctttgtatttgagttg
gctaaatatattgatgttaatattttgtatattaacccatgcagtgagtattggtatgat
ttacacaagagtaaaatctcagcttggctagatagtgatgactatgagcttcaacctctt
ttggcaaatctaggtcaacaaggtaaagagttttttaatcggcttttagagaatcaagaa
aagcaagaattagaagtttttgaaaagtttgataaaaattcgttagattttgagaaactt
gctgataataatcaaacacagctagtaagcctacagcgaaatctattggaactagattgt
caaaaccacgctaagcaaaaagatttaagcatcagtattaactcatgccatagtccactt
agagaggtgcagattctacatgataaacttttggatatgatcaaagcagatcttagcatt
aagcctcgagatattttggtaatgtgtccaaatattgaagattattcaccgtatattgat
agtgtgttctcaagatatccaacagataaaaagctcccttgttctatagctgatagaacg
ctacttgattcagagcctttagctgccagttttattgagcttttgcaattaccagagagt
aactttgaggttaataagatactagactatttatcggttccagcaattcagcaaaagttc
aaaattagcgatgagcaattagaaactattcgctattggttaaaagagtcatgtatccat
catagtaataatggtcaaaccttctcatggagttggggacttaagaggttgatgctagga
tttagctatagtgatagtaactatattgtcgatgataagctgatgactatagctgtgatt
gaaggtagtgagattgccgaacttggtggcttgtatgagttgctagagctgctagaaaaa
tattcacaagagttgcttaaaccaagaagtttagaagcatggcaggactatcttttggag
atgtttgatgatgtctttgatgtaactaatgatgagcaatatattgctaagaaaatcaaa
gatataatcgtaaagacagtcactacagctaaagatgtattgctaacagaagagattgat
ttgtatacaattagatattgtctgatttcgcagttatctgaaccaattattaataaccat
ttcttaaatggtaaagtaacattctgctcaatgacaccaatgcgtaatgttccttttaga
gtgatagcgatgttgggtttaaataatggtaagttcccacgccaagaatctgcgatcagc
tttgatttgatggcaagacttggaagagttaaaggcgatagaaccaaacgagatgatgat
agatatttatttctagaggctattacatctgcacgtgattatttgtatcttagttatatc
ggtagaagtgttaagactaatgttgagcaacaaccaagtctaatactcaaagagttgact
agctatttggatttgaattatggctggggaaaggctgatattaaagaatatccattacat
ccatttagttccaaatgttatgctgatgaatacagaagttatgatgaagcttggttgaag
ttgttacagtctgagcctaaggtattttatgatccaaagttattaaataatggtgtcaat
ttaccaaagagtttaagcatcttaaaacttgtcaaaatctttgatgatcctattaaggct
tatacaaattatggcttagaactatatttagaggatgactttgaagagctagaagacagt
gaaccatttgatatcaatagtttagataagcataaatttaaacaagatttactaaacact
cttgagaatgggaaagacaaagaattaaccataaaaacagctaagctaagtggtaagctt
ccagaatctgtgcttactgaaaatgagattaataaggaagtcgagaatattcaaaagtta
ttaggtaaggcgagtttagcaaattatgagtctaaatatttgcataaagagatattagga
tatgagctagaggctaattatcatatcaaagataatcaagttttgctatatacgacttca
acttttggtattaagcatcgatttgaattgtatttgacagcactattagtggcattatca
gggcaacaagatatctctgctacttatgtttattttgataaagacaaaaatcaagcagat
gatgttacttttgctataagtcgtttaggtgcaaaagagttattagaaaaatatctcaca
aatgctcaaaagatagtatctaagccaagtttagtacatttagatttagccaaagccata
atggaatatgtaaaagaaaaccagaaaaaagatgcaagtcttgttgaaaaaacaactaag
caaaagcaacaagcttgggagaatgtaattaagtcttcagagactaattacaaagcatta
gagaataatagttatttcaaacttttttatagtgagcatccaaaaatagaagactttgag
ggtcagcaaatatatcaagatttctttgaggttataaatgaaaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system
