Flavobacterium psychrophilum V3-5: IA03_08620
Help
Entry
IA03_08620 CDS
T03659
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
fpv
Flavobacterium psychrophilum V3-5
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Por_Secre_tail
DUF3244
CHU_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIG30529
LinkDB
All DBs
Position
complement(1865704..1867512)
Genome browser
AA seq
602 aa
AA seq
DB search
MTLRDSVDGTKTFALATGTLTQGTHYTVTNLPTGLTPVLAVNTNKQLTLTFTGTATSHTA
SNSGDISVKFLAAAFSGGLTGVRCNGLIFATKFIDPYGIFFVDMADVTVQGAANSWKFFA
TDFGQDYGAWRFAANQLKIETYGNKLACQTGTKNISLLVSGTIINATSNFTAPTAYPGQL
DLRTATYTAWDGKTGYVGFEHLIDGEVCYGWFKVRVDANGDGYTVLEYAYNTQPGANIVA
GMTTKIATSLSATTIYEADTNDGAIDPAGVSLKLVTNNGTYTQSSGVVAATKYTLTGVPA
GLTATLTAISNNELKLTFAGRATANALSNTANLVLTLKDAIVTGGVAGLDTSVFTIKLDF
EDPYGIFSEALTGATANATQTWKYIDLAKGDNTEYGVWRFAANNLKIETYGKRLIGTTGT
INITKLPFNSVIDGTKTFIAPGAYPNQLDLRSATYTAWAGGTTGFVGFEYFRRGRPCYGW
MQITIDANGDGYTVTKFGYNTKPNGAITTPSSLANATFDNAELLGVYPNPFANEVTISTS
EMSGKNVTLSIYNLLGQEVYNKTVTNSADSILLTTNNLDKGVYILKVTVDNEKFISKKII
KK
NT seq
1809 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgactttgcgggatagtgtcgatggtaccaaaacatttgctttagctacaggtactttg
acacaaggaacacactatactgttactaatttaccaacagggcttacgccagtacttgca
gtaaatactaacaaacaacttacacttacctttacaggtactgctacaagccataccgct
agtaattctggcgatatatcggttaaatttttggcagcagccttttcaggaggtcttaca
ggtgtaagatgtaatggtctaatttttgctacaaaatttattgatccttacggtatattt
tttgtagatatggcagatgttactgtacaaggagctgctaattcttggaagttttttgct
acagattttggtcaagattatggcgcttggagatttgcagccaatcaattaaaaattgaa
acttatggtaacaaattagcttgccaaacaggaactaaaaacattagtttattagtatct
ggaactataataaatgctaccagtaattttacagcaccaactgcctacccaggacaacta
gatttacgtactgctacttataccgcttgggatggtaaaacaggatatgtggggtttgaa
catttaattgatggtgaagtgtgctacggctggtttaaagtacgagtagatgcaaatggc
gacggatatacagtattagagtatgcttacaacacacaaccaggggctaatatagttgca
gggatgactacgaaaatagctacttcattatctgctactactatttatgaagcagacact
aatgacggtgctatagatcctgcaggagtttctttaaaattagttactaacaatggtact
tatacccaaagttcaggagttgttgctgcaaccaaatatacacttacaggtgttcctgct
ggtcttacagctacacttaccgcaattagtaataatgaattgaaacttacttttgccggt
agagctactgcaaatgcacttagtaatactgcaaatttggttttaacacttaaagacgca
attgtaacaggtggtgttgcaggtttagatacttcggtgtttacaataaaactagatttt
gaagatccttatggtatattttcagaagcacttactggagcaacggctaacgcaactcaa
acttggaaatatattgatcttgcaaaaggtgacaatacagaatatggtgtttggagattt
gctgctaataatttaaaaatagaaacttacggtaaacgattaataggtacaacaggtaca
ataaacattacaaaattaccttttaatagtgttattgatggtactaaaacatttattgcg
ccaggtgcttatccaaatcagttagatttgcgtagtgctacttatactgcttgggcagga
ggtacaacaggttttgttggttttgaatattttagaagaggaagaccatgttatggttgg
atgcaaataactattgatgctaatggtgatggttatactgttacaaaatttggatacaac
acaaaacctaatggtgctattacaaccccatcgagtttagcaaatgctacttttgataat
gcagaattattaggtgtttatccaaacccttttgcaaatgaagttactataagtacgtca
gaaatgtcaggcaaaaatgtaaccctttcgatttataatttattaggtcaagaggtgtac
aataaaacagtaaccaatagtgcagacagcattttgttaactacaaataatttagataaa
ggagtttatattctaaaagtaacagtagataatgagaaatttatttctaaaaaaataatt
aaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system