Flavobacterium psychrophilum V3-5: IA03_11380
Help
Entry
IA03_11380 CDS
T03659
Name
(GenBank) general secretion pathway protein GspD
KO
K02666
type IV pilus assembly protein PilQ
Organism
fpv
Flavobacterium psychrophilum V3-5
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fpv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
fpv02044
]
IA03_11380
02035 Bacterial motility proteins [BR:
fpv02035
]
IA03_11380
Secretion system [BR:
fpv02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
IA03_11380
Bacterial motility proteins [BR:
fpv02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
IA03_11380
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Secretin
Secretin_N
STN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIG31025
LinkDB
All DBs
Position
complement(2444942..2447104)
Genome browser
AA seq
720 aa
AA seq
DB search
MKTIITLLLLFIFQISFSQDIRIQQIKNNIEAINTESLGLNEKVNINIKEASLSSFLLAV
SEVHKVNISVAPSLAQISIVNNFTDVTVADLLVFLCKEYNLTIDFTGNILSIKPYEKPIE
KAIIKTIDVQYDGANDLVSFDLKEDKLYDAFKKIMNESGKNLVFAPGLENQLLTAYIKNM
PFDAALNKLAYANNLSLTKSRDNFYLFDTLEGNYSLENSSEKNNTTVRQNKPQRSRKSNF
FFNVIDAENKLLEVDFENTPIASIVYDIGHELGIDMFISSPLESAGNATFKAKNISFDNL
LVKLFESKMDSKTVANNSSQPQQFSNDTSSNSAGDSYTFMKNGSIYYFGTKNQLVVRNVK
VIPLMHRSIELLGNPTSEGRSSGRLNNSNTNNYTNNSSDNKSNSNTNNYQSQGNDSSSGK
DNASSQSILSIVPAEITKDLDIKVDKELNSFVVNGPAANIDRFESFIKYIDKAVPVILIE
VMLLEVSKSATIETGFSAGIGDKPVTTKGTVFPNSDIVLGAQTINKIINSFDGFGSLNIG
SVVPNFNLSLKAMESNGNLKIRSAPRLSTLNGHKAYLSIGETTYYVVTNQNFYGSQIPQT
SEVKNYQPIDAELSVTIMPLVSGDGQITMDIKVIQSSFNGQKVDKNAPPGINSREFTSII
RVKDQDLIVLGGLEEKVKNDSGSGVPILARIPIIKWLFSSRKREDSNKKLTVLIKPTVIY
NT seq
2163 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaattataacattactattactttttatttttcaaatttctttttcccaagac
attaggattcaacaaattaaaaacaatattgaagctatcaataccgaatctttaggattg
aatgaaaaagtaaatatcaacattaaagaagcttctttatctagttttttactagctgtt
tctgaagttcataaagtaaatattagtgtagcacctagtttagctcaaattagtattgta
aataattttaccgatgttaccgttgccgatctgttggtatttctttgtaaagaatacaat
cttaccatcgattttacaggtaatattctctctataaaaccgtatgaaaaaccaatagaa
aaagctattataaaaactattgatgttcagtatgatggcgctaatgatttggtttcattc
gatttaaaagaggataaactttacgatgctttcaaaaaaatcatgaatgaaagtggcaaa
aatttagtttttgctccaggattagaaaatcagttattgaccgcatatattaaaaacatg
ccttttgatgcggctttaaacaaattggcttatgctaataatttgagcttaactaaatca
cgtgataatttctatttgtttgacaccttagagggtaattattcccttgaaaacagctct
gaaaaaaacaatactactgttagacaaaacaaacctcaacgttctagaaaatcaaacttt
tttttcaatgtaattgatgcagaaaataaattattagaagttgattttgaaaatacccct
attgccagtattgtatatgatataggccatgagttgggtattgacatgtttatttcaagc
cctttagagagtgcaggaaatgccactttcaaagcaaaaaatatttcgtttgacaatctt
ttggttaagttattcgaatctaaaatggacagtaaaacagttgcaaataatagttctcaa
ccacagcaattcagtaatgacacctcttctaattcggcaggagatagttatacttttatg
aaaaatggtagtatttattattttgggactaaaaatcaattggttgttagaaatgttaag
gtaatcccattaatgcatcgttctattgaattgttaggtaatcccaccagcgaaggcaga
agctcgggaagattgaataattcaaatacaaacaattacaccaataactcttcagataat
aaaagtaattctaataccaataattatcaatctcaaggaaatgattcatcatctggaaaa
gacaacgctagttcacaatctattttatcaatcgttccagccgaaattactaaagattta
gatattaaagtcgataaagaactcaatagttttgtggtaaatgggccagcagcgaatatt
gaccgttttgaatcttttattaaatacatagacaaagctgttcctgttattttaattgaa
gtgatgttacttgaagtgagtaaaagcgctacgatagaaacgggttttagtgctggaatt
ggtgacaaacctgtaaccacaaaaggaacagtttttccaaattcagacattgtacttgga
gctcaaactattaataaaattatcaatagctttgatggtttcggttctttaaacattgga
agcgtggttcctaactttaatttaagtcttaaagcgatggaatctaatgggaacttaaaa
attcgttccgctccaagattatctactttaaacggacacaaagcgtacttatcgataggt
gaaactacttattatgttgtcaccaatcagaatttttatggctcgcagatacctcaaaca
tcagaagtaaaaaactaccaacccattgatgcagaattgtcagtaactattatgccttta
gtttcaggtgatggacaaattactatggatattaaagtgattcaatctagttttaatggg
caaaaagtagataaaaatgcacctcctggaattaattcgagagaatttacttctataatc
cgtgtaaaagatcaagatttaatcgtcttgggtggtcttgaagagaaagtgaaaaatgat
tcaggttctggcgtacctatattggctagaattccaattattaagtggttgtttagctcc
agaaaaagagaagattccaataaaaaattaactgttttaattaaaccgactgttatttac
taa
DBGET
integrated database retrieval system