Flavobacterium psychrophilum V4-24: IA04_02520
Help
Entry
IA04_02520 CDS
T03660
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
fpw
Flavobacterium psychrophilum V4-24
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fpw00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fpw02000
]
IA04_02520
Transporters [BR:
fpw02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
IA04_02520
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Phage_integrase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIG36224
LinkDB
All DBs
Position
complement(565403..567610)
Genome browser
AA seq
735 aa
AA seq
DB search
MKSFLVALLLGFAIFCNAQNKITGAITNSENKILETVLVSIPELNKETISDSNGNFLFLD
LPKGKFKISFSLVGYDEKLVSVFINKAEINLNIRLESSSNHLEEVKIAATIFNKIQSQNV
MKIEHKSIRELQQKGAVTLMEGLASIAGVSQVSTGTSIGKPVVRGLSGNRVLVYTQGVRL
ENQQFGEEHGLGLNESGIESVEVIKGPASLLYGSDALGGVLYFNPEKFAKPNSYLADFSQ
KYFSNTNGSNTSFGLKSSSENWKFLIRGAYNNHGDYKMPSDSLVTNTRFEEADVKTALGF
SNSKFSSVLRYNLNHLNLGIPEQIGLQTTKRDPDYPRQGVVNHILSLHNNFYFRNSKFDA
DFGYISNSRKEFADSTIPVLDMNLNTLNYDLKYYLPNIGKLEAIIGVQGMSQSNKNLGSE
LLIPDAKTNDIGALLTTNYEWKSNVIQAGFRYDTRKINTESHGIIGDEGYFEAISKKYTS
FNASVGYKTKLTDNLSFRLNVASGFRSPNLAELTSNGVHEGSNRYEIGNSNLKNEQNIQT
DLNLEYGNSHFEFFANGFYNNISNYIFIAPNGSIMADNDVYDYVQANAKLYGGEFGVHFH
PHPLDWLHITSSFETVTGLKENGEYLPLIPANKWNNNIRTEFNLNNWIKKGFATLNIESV
FKQNNNSTFETKSKDYRLVNVGLGGNININKLKFDISINSNNMLNKSYISHLSRLKTDRI
SNIGRNIVLGVSFFL
NT seq
2208 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatcatttttagttgccctattgttagggtttgccattttttgtaatgcacaaaat
aaaattacaggtgctattactaattccgaaaataaaattttagaaactgtcttggtttct
attcctgagttaaataaagaaacaatctctgatagtaacgggaatttcttgtttttagat
ttgccaaaaggaaaatttaaaatatctttttctcttgtgggttatgatgaaaaattggtt
tctgtttttataaataaagcagagattaatttaaatattaggctagaatcttcctcgaat
catttagaagaagtgaaaatagcggctactatttttaacaaaattcaatcgcaaaatgtg
atgaaaattgaacacaaaagtattagagaattacaacaaaaaggagccgtaacgctcatg
gagggattggcttctattgctggagtttcgcaggtatctacaggaacatctataggaaaa
cctgttgttcgtgggttaagcgggaatcgtgttttggtgtacacacaaggtgtacggtta
gaaaatcagcaatttggagaagagcatggtttgggtcttaacgagagtggtatagagagt
gtagaggttataaaaggccctgcttcgttgttgtatggctctgatgcgttggggggggta
ttgtattttaatcctgagaaatttgctaaaccgaactcttatttggcagattttagtcaa
aaatatttttccaatacaaatggaagtaacacttcatttggtttgaaatcatcttctgaa
aattggaaatttttaattcgtggagcttataataaccatggcgattataaaatgccaagt
gatagcttggttaccaacactcgttttgaagaagctgatgtaaaaactgctcttggtttt
agcaattctaagttttctagtgttttgcgatataatttgaatcatttaaatttaggaatt
ccagagcaaataggtttgcaaactacaaagagagatcctgattatcctaggcaaggtgtg
gtgaaccatattttgagtttgcataataatttttatttcagaaactcgaaatttgatgcc
gattttggatatatttctaacagtcgtaaggaatttgcagatagtacgattcctgtttta
gatatgaatttgaacactttaaactatgatttaaaatattatttgccaaatattggaaaa
ttagaagctattattggtgtgcaaggaatgagtcaaagtaataaaaatttggggtcagaa
ttattaattcctgatgccaagactaatgacattggtgctttgttaaccacaaattacgaa
tggaaatcgaatgttatacaggccggatttcgctatgatactagaaaaattaataccgaa
agccacggaattataggcgatgaaggttattttgaagcgattagcaaaaaatatacgagt
tttaatgcttctgtgggttataaaacaaaactaacagataatttgtcttttagattgaat
gttgcctcaggttttagatctccaaatttggccgaactaacctcaaacggtgttcatgaa
ggtagtaatagatacgagattggaaattctaatttaaaaaatgaacaaaatattcaaact
gatttaaatttagaatatggaaattctcattttgaattttttgccaacgggttttacaat
aatattagcaactatatttttattgcgccaaacggaagtataatggcagataatgatgtg
tacgattatgtgcaagccaatgcaaaattatatggaggagaatttggtgttcattttcat
ccgcatccgctagattggttgcatattaccagtagtttcgaaaccgtaactggtctgaaa
gagaacggagaatatttacctcttattcctgcaaacaaatggaataataacattcgtaca
gaatttaacctcaataattggattaaaaaaggatttgcaaccttaaatattgaaagtgtt
tttaaacaaaataacaatagcacttttgaaacaaaaagtaaggattataggctggtaaat
gtaggtttaggtggaaatataaacatcaataaactaaaatttgatatttctataaattcg
aataatatgctgaacaaaagctatatttcgcatctttctagactaaaaacagatcgtatt
tctaatattggaagaaatattgttttgggagttagtttcttcttataa
DBGET
integrated database retrieval system
