Flavobacterium psychrophilum V4-24: IA04_06980
Help
Entry
IA04_06980 CDS
T03660
Name
(GenBank) histidine kinase
Organism
fpw
Flavobacterium psychrophilum V4-24
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
Response_reg
HisKA
TPR_12
TPR_2
TPR_1
TPR_8
HEAT_Nup120
TPR_NPHP3
PDE8A_N
ARM_TT21_C
PTM1-like_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIG37040
LinkDB
All DBs
Position
1503378..1505567
Genome browser
AA seq
729 aa
AA seq
DB search
MPKQLFVFLFFIFSLSAFSRNAEEPILKTDSSTFYTKKANYFKTNKRFDKALENAKKSIA
FGKKNNNKSVVANGYYCLSTVYIDLKKYDIAIENLLRTVCILNTVPVNSKLALTYYNLGL
CYMQKESFNKAESYFQKANLVYESINLSNAINMVNLEKGLMYLNKKQVNQAENIFLQISK
LPIGKDKFKLQSEALYQLGLIKSKEKTYNLAVNYLNRGYKLSVENDNTSQQLKISKKLSD
VYDNMKQTRNSLNFLKIYTQLKDSLNSVLKNSDKTLIKVDDMIASLDKLDKEKKQQEKSN
KFSKLINILSIALITILSLLSLSLYKNNIIRNKSNELLRDKNNELEIAKERIEKASKARA
EFLSTVSHELRTPLNAINGISHILLDDNPKPRQIEYLKSLKFSGNHLLTYINEILEINRI
ESDNIEIENISFNLKELLNNIQNSLKEQARQNNNHFILTIDNDAPEILIGDPTKLSQIFI
NLISNALKFTENGNIIVNARVVNRDDTSCLVKFEVKDNGIGIPTDKQESIFESFSQGSVE
INRKYGGTGLGLTIVKRLLALMNGKIEVHSQIGIGSTFTFNLSFTIGQEIIPSTLNNLID
EKIFINKNVLLVEDNKINQMITRKFLEKKKIRCQICETGEDAIIKMQTNNYDLVLMDVHL
PGINGTIATAEIRKFNTTTPIIALTAISLNENREILLSYGMNDVITKPFNPDNFYKVIEC
ALLIEPNIV
NT seq
2190 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcccaaacaattattcgtatttttattttttattttttcactttctgccttctcaaga
aacgcggaagaacccatattaaaaacagacagttctactttttacacaaaaaaagccaat
tattttaaaacaaacaagcggtttgacaaagcactagaaaacgcaaaaaaatcgatcgct
tttggcaaaaaaaacaataataaaagcgtagtagcaaacggctactattgtttgtctaca
gtgtatatagatttaaaaaaatacgatattgctattgaaaatttattacgaacagtttgt
atcctaaataccgttcctgttaattctaaattagcactaacttactacaatctaggcttg
tgctatatgcaaaaagaaagctttaacaaagccgaatcctattttcaaaaagcaaattta
gtttacgaaagcatcaatttatctaatgcaataaatatggtaaaccttgaaaaaggactt
atgtatttaaacaaaaaacaagtaaatcaagccgaaaatatatttctacaaatttcaaaa
ttacctataggaaaagacaaatttaaactacaatctgaagcattatatcaattaggacta
ataaaatcaaaagaaaaaacatataatcttgctgtaaattatttaaatagaggctacaaa
ttaagtgttgagaatgacaataccagtcagcaattaaaaattagcaaaaagctaagtgac
gtttacgacaatatgaagcaaactagaaattcacttaattttttaaaaatttatacccaa
ctaaaagattctttaaattctgtattaaaaaacagcgataaaactttaattaaagttgat
gatatgatagcttctttagataaattagacaaagaaaaaaagcagcaggaaaaatcgaat
aagttttctaaattaattaatatattgagtattgcattaatcactattctttcgctttta
agtttgtctctttataaaaataatatcatcagaaacaaatcgaacgaattgcttcgagat
aaaaataatgagctcgaaattgcaaaagaaagaatcgaaaaagcatcgaaagcccgtgcc
gaatttttatcgacagttagtcacgaattaagaactccactaaatgccatcaatggaatt
tcgcatattttgctagatgacaatccaaaaccaagacaaatagaatatttaaaatcattg
aagttttcgggaaatcatttgcttacttacattaacgaaattcttgagataaacagaata
gaatctgataatatcgaaatagaaaatattagctttaatcttaaagaattactaaacaat
attcaaaattcacttaaagaacaagcccgacaaaataacaatcattttattttaactata
gataatgacgctcccgaaattttaattggcgatcctacaaaattatctcaaatatttata
aacctaataagtaatgctttaaaatttaccgaaaacggaaatatcattgtaaatgctagg
gttgtaaatagagatgataccagttgcctcgttaaatttgaagttaaagataatggaatt
ggtattccaacagacaaacaagaatctatttttgaaagtttctcgcaaggatctgtagaa
attaaccgaaaatatggtggcacaggattggggctaaccattgtaaaaagattgcttgca
ttaatgaatggaaagatagaagtgcacagtcaaattggtatcggatctacgtttacattc
aatttaagtttcaccattggtcaggaaatcattccttcaactttaaacaaccttattgat
gaaaaaatatttatcaataaaaatgttttattagtagaagacaataaaataaaccaaatg
attaccagaaaattcctagaaaagaaaaaaatacgttgccaaatatgcgaaactggcgaa
gatgcgataataaaaatgcaaactaataattacgacttagtcttaatggatgtgcatttg
cctggaataaatggaactatagctactgccgagattagaaaatttaatactaccacgcca
atcattgcacttacagcaatttctctgaacgaaaacagagaaatactactttcttatggt
atgaatgatgtgattaccaaaccttttaatcctgataatttttataaagttatagagtgt
gcattattaatagagcctaatattgtataa
DBGET
integrated database retrieval system
