Flavobacterium psychrophilum V4-24: IA04_09855
Help
Entry
IA04_09855 CDS
T03660
Name
(GenBank) membrane protein
Organism
fpw
Flavobacterium psychrophilum V4-24
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF5686_C
DUF5686
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
MetallophosN
TTR_TEN1-4
UCP029691
RNA_pol_inhib
DUF7956
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIG37559
LinkDB
All DBs
Position
complement(2125789..2128254)
Genome browser
AA seq
821 aa
AA seq
DB search
MKKIILLLVVLFSGQIFSQIKGRVTDHKDLALPLVTIFIENSYNNTSSNEKGFYELNVQK
AGKYVVVFQYLGFKIRKISVTIDAFPYELNTKLIEENFAIHEVAISNKEDLAKQIMRSAI
ASKKENSASMARYNARFYSRGLMRIKEAPKKILGQKIGNFDGALDSTRTGILYLSETVSK
LNFQKPNKMKETIIASKVSGKDNGFSFNNAASVDFDFYENYLPFEINVISPLSDNAFNYY
KFKIEGSFYTQDKQQINKIKIIPRRDTEPVIEGYIYIVDDSWGIYAVDVNLKGYRLQTPF
LNNLVLKQNFSYNKTNNIWVKNTQSIDFSAGILGINMSGRFTYVYSDFDFEPKFDKKTFT
HEVLTFEKDSNKKDTVFWNSVRPIPLTTEESNDYVKKDSIQTLRKSKTYLDSIDKKENKF
HILQLLSGYHFKNSQTNTSLGYDGFLQSFQFNTVQGYRLQTGFSYNNKNKDERTYTNLGI
GFDYGFAENKLRIKGTFSKKISNHNNALFDFSAGSEATQFNQNKPISEIVNTISTLFFKD
NYTKLFDNNFVKLSYSQEIANGFSVYTNFDYSERKPLFNTTNYTFIQNDDLYTSNHPLLP
SDNLTPAIVKHNLAKGKITGKVSFGQEYWTRPDGKFNIPNDKYPVLYFTYEKGFAGSKNR
YNFDYLEAKVTQDFTLGNKGKLGTNVSTGKFFNANNIAFVDYKHFAGNQTRIGQLESYLN
VFNLMPYYANSTNNAFFEAHLEYNDKGFLVNKIPLFNKLKSNLILGYHNLSVSSKLPYHE
FSAGLDNLGFGKFKIFRLDYVRSYQNGFQTDGVIFGFKISD
NT seq
2466 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaattatcttgctattggttgttttattttcgggtcaaattttttcgcaaata
aaagggcgtgttacagaccataaggatttggctttgccactggttactatttttatcgaa
aattcgtataataatacctcatcgaacgagaaagggttttatgaattgaatgtgcaaaaa
gcaggaaaatacgtagttgtttttcagtatttaggtttcaaaatcagaaaaatttcggtt
accattgatgcgtttccgtatgagctaaacacaaaactaatcgaagaaaattttgctata
cacgaagtagctataagcaataaagaagatctggccaagcaaattatgcgcagcgctatt
gcttcaaaaaaagaaaactcggcaagcatggcaagatacaatgcccgtttttattctcga
ggactcatgcggataaaagaggcacctaagaaaattttagggcaaaaaataggtaatttt
gatggtgctttagattctacccgaaccggaattttgtacttatcggaaacggtttctaaa
ttaaattttcagaaaccaaataagatgaaggaaaccataatcgcatctaaagtaagcgga
aaagataacggttttagttttaataatgctgcgagtgtcgatttcgatttttatgaaaat
tatttgcctttcgagattaatgtaatttcgccacttagcgacaatgctttcaattattat
aaatttaaaatagaaggcagtttttatacccaagacaagcagcaaataaataaaataaaa
attattccccgccgcgatacagagccagttatagaaggatatatttatattgtagatgat
tcgtggggaatttatgcagtagatgtaaacctaaaaggttaccgactgcaaacccctttt
ttaaataatctagttttaaaacaaaattttagttacaataaaaccaataatatttgggta
aaaaacacacaaagtatcgatttttctgcgggcatattgggaataaatatgtctggccga
tttacttatgtatatagtgattttgattttgaacccaaattcgacaaaaaaacatttacc
cacgaggtgcttactttcgaaaaagattcgaacaaaaaagacaccgttttctggaactcc
gttcggccaattccgttaactaccgaagaaagtaacgattatgtaaagaaagatagtatt
caaaccttaagaaaatcgaaaacctatctagactcgatagacaagaaagaaaacaagttt
catatactacaactcttgtcagggtatcattttaaaaattcgcaaacaaatacgtcttta
ggatatgatggttttcttcaatcttttcagtttaataccgtgcaaggttataggcttcaa
acgggtttttcgtacaataataaaaacaaagacgaaagaacatataccaacttggggatt
ggttttgattatggttttgcagaaaataaacttaggataaaaggcactttttctaaaaaa
ataagcaaccataacaatgctttgttcgatttttctgcaggaagcgaagccacacagttt
aaccaaaacaaacccatatccgagattgtaaatactataagtaccttattttttaaagac
aattatacgaaattgttcgacaataattttgtaaagctaagttacagtcaagagattgca
aatggtttttcggtttacactaatttcgattattctgaaagaaaaccattgtttaatact
acaaattatacctttatacaaaacgacgatttatatacttctaatcatcctttattgccc
tcagataatttaacgccagccattgtaaaacataatttggcaaaaggaaaaattacagga
aaagtaagtttcggacaagaatactggacccgacctgacggaaaatttaacatcccaaac
gacaaatacccagttctttattttacttacgaaaaaggatttgcgggaagtaaaaacagg
tataatttcgattatctagaggcaaaagttacgcaggattttacgttgggcaacaaagga
aaattaggtacaaatgtaagcacaggaaaattctttaacgcaaacaatattgcctttgta
gattacaaacattttgcaggaaaccaaactagaataggacaattagagagttacctgaat
gtttttaacctaatgccatattatgcaaatagtaccaataatgctttttttgaagcccat
ttagaatataatgacaaaggttttttggttaataaaattccgttatttaataaattaaaa
tcgaatttaattttaggatatcataatctttcggtttctagcaagttgccttatcatgag
ttttctgcgggattagataatttaggttttggaaaatttaaaattttcagattagattat
gttcgttcctatcagaatggttttcagaccgatggtgtaatttttggattcaaaatttcc
gattaa
DBGET
integrated database retrieval system
