KEGG   Francisella philomiragia GA01-2794: LA55_1546
Entry
LA55_1546         CDS       T03620                                 
Symbol
recC
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V, gamma subunit
  KO
K03583  exodeoxyribonuclease V gamma subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
fpz  Francisella philomiragia GA01-2794
Pathway
fpz03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:fpz00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    LA55_1546 (recC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:fpz03400]
    LA55_1546 (recC)
Enzymes [BR:fpz01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     LA55_1546 (recC)
DNA repair and recombination proteins [BR:fpz03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     LA55_1546 (recC)
SSDB
Motif
Pfam: Exonuc_V_gamma RecC_C RloB
Other DBs
NCBI-ProteinID: AJI54265
UniProt: A0A0B6CZI0
LinkDB
Position
complement(1564619..1567924)
AA seq 1101 aa
MALYTYPSNKLEYLVQVLSKLLDVEKKDLFTPTQLIVGSRGMQHWLSMQLAQYRNIAMNL
KYDMINGYILDICYELTAKQEYKKAYTKDILAWRIFRGLDSINNPKLQEYYQNSDLKKYQ
LSVKIAETFSKYISYRSEWLQKWEQGEYINPAKPESDEDWQMLLWQALVKEVPDTPYKVQ
REALQKLSRQNLEKVNIPSDIYIFGVNTISPKNLGFVFELAKYIDVNILYINPCSEYWYD
LHKSKISAWLDSDDYELQPLLANLGQQGKEFFNQLLENQEKQELEIFEKFDKNSLDFEKL
ADNNQTQLVSLQRNLLELDCQNHAKQKDLSISINSCHSPLREVQILHDKLLDMIKADPSI
KPRDILVMCPNIEDYSPYIDSVFSRFPTDKKLPCSIADRTLLDSEPLAASFIELLQLPES
NFEVNKILDYLAVPAIQQKFKITDEQLETIRYWLKESCIHHSNNGQTFSWSWGLKRLMLG
FSYSDSNHIIDDKLMTVPVIEGSEVAELGGLYELLELLEKYSQELLKPRSLEAWQDYLLE
MFDDVFDVTNDEQYIAKKIKDIIVKTVTTAKDALLAEEIDLYTIRYCLISQLSEPIINNH
FLNGKVTFCSMTPMRNVPFRVIAMLGLNNGKFPRQESAISFDLMARLGRVKGDRTKRDDD
RYLFLEAITSARDYLYLSYIGRSVKTNVEQQPSLILKELTSYLGLNYGWGKADIREYPLH
PFSSKCYADEYRSYDEAWLKLLQSEPREFYDIKRLSHSSLERESDTRGVVSDFSYKHSEI
LKQVQDDSLNLLDNQNKKQNSHSGLDPESLGTQICALLPQQLTISKLTKIFDDPIKAYTN
YGLELYLEDDFEELEDSEPFDINSLDKHKFKQDLLKTLENEKDKELTIKKAKLSGKLPES
VLTDTEINQELENIQKLLDKANLANYESKYFYQEILGYELEANCYINNDCVMLSTPSKLG
ITKKFELYLTAILVAYCQQKDICAIYYGLDKDNVDTFKINSISYVTAKQTLERYLMQAER
IVFKPMLAHLSLAEAICDSKNDTDKKKQKAWDGVIIPSEYNHKALENNGYFKLFYSEHPK
IEDFEGLQIYQDFFEVINENK
NT seq 3306 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggctttatacacctatccatcaaataagcttgagtatctggttcaagttttatctaaa
cttctagatgttgaaaaaaaagatttgttcacaccgacacagctaatagttggtagtcgt
ggtatgcaacattggttaagtatgcaattagcacaatatcgtaatattgccatgaatctt
aaatatgacatgataaatggttatatacttgatatctgctatgagcttacagcaaaacaa
gaatataaaaaagcatacacaaaagatattttagcttggagaatttttagaggtttagat
agtatcaataatcctaaactccaagaatattatcaaaatagcgatcttaagaaatatcaa
ctatctgttaaaatagccgagactttttcaaaatatatatcatatcgaagtgagtggttg
caaaagtgggagcagggcgagtatataaatcctgctaaaccagagagtgatgaagattgg
caaatgctactttggcaggctcttgttaaggaggttccagatacaccatacaaagttcaa
agagaagcactccaaaagctcagtcgacaaaacttagaaaaggtaaatataccaagtgat
atctatatatttggggttaatactatatctcccaaaaatcttggctttgtatttgagttg
gctaaatatattgatgttaatattttgtatattaatccatgtagcgagtactggtatgat
ttacacaaaagtaaaatctcagcttggctagatagtgatgactatgagcttcaaccgctt
ttggcaaatctaggtcaacaaggtaaagaattttttaaccagcttctagaaaatcaagaa
aagcaagagttagaaatctttgaaaaatttgataaaaattcgttagattttgagaaactt
gctgataataatcaaacacagctagtaagtctacagcgaaatctattggaactagattgt
caaaaccacgctaagcagaaagatttaagcatcagtattaactcgtgccatagcccactt
agagaagtgcagattctacatgataagcttttggatatgatcaaagcagatcctagcatt
aagcctagagatattttggtaatgtgtccaaatattgaggattattcaccgtatattgat
agtgtgttctcaaggtttccaacagataaaaagcttccgtgttctatagctgatagaacg
ctacttgattcagagcctttagctgctagctttattgagcttttgcagttgccagagagt
aactttgaggttaataagatacttgattatctagctgtaccagcaattcagcaaaagttt
aaaattaccgatgagcaattagaaactattcgctattggttaaaagagtcatgtattcat
catagtaataatggtcaaaccttctcatggagttgggggcttaagagattgatgctaggg
tttagttatagtgatagtaatcatattattgatgataagctgatgactgtgcctgtgatt
gagggtagcgaagttgcagaacttggtggcttgtatgagttgctagagctgttagaaaaa
tattcacaagagctgcttaagccaagaagcttagaagcatggcaagactatcttttggag
atgtttgatgatgtctttgatgtaacaaatgatgagcaatatatcgctaagaaaatcaaa
gatataatcgtaaagacagtcactacagctaaagatgcattgctagcagaagagattgat
ttgtatacaattagatattgtctgatttcgcagttatctgaaccaattattaataaccac
ttcttaaatggtaaagtaacattctgttcaatgacaccaatgcgtaatgttccttttaga
gtgatagcgatgctgggtttaaataatggtaagttcccgcgccaagaatctgcgattagt
tttgatttgatggcaagacttggaagagttaaaggtgatagaactaaacgagatgatgat
agatatttatttctagaggctattacatctgcacgtgattatttgtatcttagctatatt
ggtagaagtgttaagactaatgttgagcaacaaccaagtctaatactcaaagagttgact
agctatttgggtttgaattatggctggggaaaggctgatatcagagaatatccattacat
ccttttagttccaaatgttatgctgatgaatacagaagttatgatgaggcttggctgaag
ttgttacagtcagagcctagagagttctatgatattaaaagactatctcactcctctctc
gagagggagagcgatacgcggggtgtggtgtctgattttagttataagcatagtgagatc
ctgaaacaagttcaggatgactcattaaatttacttgataatcaaaataaaaaacaaaat
agtcattccggacttgatccggaatctcttggcacacagatttgtgctctactcccccag
caactaactatctcaaagctaaccaaaatctttgatgacccaattaaagcttatacaaat
tatggcttagaactatatttagaggatgacttcgaagagctagaagacagtgagccattt
gatataaatagtttagataaacataaatttaaacaagatttactaaagactcttgagaat
gagaaagacaaagaattaaccataaaaaaagctaagctaagtggtaagcttccagagtct
gtacttactgatacagagattaatcaagagcttgaaaatatccaaaagttattagataag
gcaaatttagcaaattatgagtctaaatatttttatcaagagatattaggatatgagtta
gaagctaattgttatattaataatgattgcgttatgttatcaacaccatcgaagttaggt
ataacaaaaaagtttgagctatatctgacagctatacttgtagcatattgtcaacagaaa
gatatttgtgctatctattatggactggataaggataatgtcgatacttttaagattaat
agcattagctatgtaacagctaagcaaactctagaacgttatttaatgcaagctgagaga
atagtatttaagcctatgttggcgcatctatctctagctgaagctatttgcgattctaaa
aatgatactgataaaaagaagcaaaaagcttgggatggtgtgataataccttctgaatac
aatcacaaagccttagagaataatggttacttcaaacttttttatagtgagcatccaaaa
atagaagactttgagggtctgcaaatatatcaagatttctttgaggttataaatgaaaat
aaataa

DBGET integrated database retrieval system