KEGG   Francisella salina: F7308_0960
Entry
F7308_0960        CDS       T01560                                 
Name
(GenBank) Exodeoxyribonuclease V gamma chain RecC
  KO
K03583  exodeoxyribonuclease V gamma subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
frt  Francisella salina
Pathway
frt03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:frt00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    F7308_0960
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:frt03400]
    F7308_0960
Enzymes [BR:frt01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     F7308_0960
DNA repair and recombination proteins [BR:frt03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     F7308_0960
SSDB
Motif
Pfam: Exonuc_V_gamma RecC_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: AEI35887
LinkDB
Position
980768..984067
AA seq 1099 aa
MALYTYPSNKLEYLVQVLSKLLDVEKKGLFTPTQLIVGSRGMQHWLSMQLAQYRNIAMNL
KYDMINGYILDICYELTAKQEYKKAYTKDILAWRIFRGLDSINNPKLQEYYQNSDLKKYQ
LSVKIAETFSKYISYRSEWLQKWEQGEYINPAKPESDEDWQMLLWQKLVEDVAETPYKVQ
SEALQKLNRQNLEKLNIPSDIYIFGVNTISPKNLGFVFELAKYIDVNILYINPCSEYWYD
LHKSKISAWLDSDDYELQPLLANLGQQGKEFFNQLLENQEKQELEVFEKFDKNSLDFEKL
ADNNQTQLVSLQRNLLELDCQSHAKQKDLSISINSCHSPLREVQVLHDKLLDMIKADPSI
KPRDILVMCPNIEDYSPYIDSVFSRFSTDKKLPCSIADRTLLDSEPLAASFIELLQLPES
NFEVNKILDYLSVPAIQQKFKISDERLETIRYWLKESCIHHSNNGQTFSWSWGLKRLMFG
FSYSDSNHIVDLKLPRQSATATPSYQRGISINYQELNQLMTIPVIEGSEIAELGGLYELL
ELLERYSQELLKPRSLEAWQDYLLEMFDDVFDVTNDEQYIAKKIKDIIVKTVTTAKDVLL
VEEIDLYTIRYCLISQLSEPIINNHFLNGKVTFCSMTPMRNVPFRVIAMLGLNNGKFPRQ
ESAISFDLMARLGRVKGDRTKRDDDRYLFLEAITSARDYLYLSYIGRSVKTNVEQQPSLI
LKELTSYLDLNYGWGKADIKEYPLHPFSSKCYADEYRSYDEAWLKLLQSEPREFYDIKRL
PRQSTTATPSYQRGIDSLSVASKLPQQLSISKLVKIFEDPIKAYTNYGLELYLEDDFEEL
EDSEPFDINSLDKHKFKQDLLNTLENNKDKELTIKTAKLSGKLPESVLTENEIDKEVENI
QKLLDKASLANYESKYFHQEIFGYELEANCYIRDNQILLYTTSTFGIKHRFELYLTALLV
ALSEQQDISATYVYFNKDKNQADANTFAISHLGAKELLEKYLSSAEKIVSKPSLVHLDLA
KAIMEHIKESQKKDANFVEKTTKQKQQAWEGAIKSSESNYKALENNSYFKLFYSEHPKIE
DFEGEEIYRDFFEIINNRD
NT seq 3300 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcgttatacacctatccatcaaataagcttgagtatctggttcaagttttatctaaa
cttctagatgttgaaaaaaaaggtttgttcacaccgacacagctaatagttggtagccgt
ggtatgcaacattggttaagtatgcaattagcacaatatcgtaatattgcgatgaatctt
aaatatgacatgataaatggttatatacttgatatctgctatgagctcacagcaaaacaa
gaatataaaaaagcatacacaaaagatattttagcttggagaatttttagaggtttagat
agtatcaataatcctaagctccaagaatattatcaaaatagtgatcttaagaaatatcaa
ctatccgttaaaatagccgagactttttcgaaatatatatcatatcgaagtgagtggttg
caaaaatgggagcagggcgagtatataaatcctgctaaaccagagagtgatgaagattgg
caaatgctactttggcagaagcttgttgaagatgtcgctgaaacaccatataaagtccaa
tcagaagcactccaaaagcttaatcgacaaaacttagaaaagctaaatataccaagtgat
atctatatatttggggttaatactatatctcccaaaaatcttggctttgtatttgagttg
gctaaatatattgatgttaatattttgtatattaacccatgtagcgagtattggtatgat
ttacacaagagtaaaatctcagcttggttagatagtgatgactatgagcttcaacctctt
ttggctaatctaggtcaacaaggtaaagaattttttaatcagcttttagagaatcaagaa
aagcaggaattagaagtttttgaaaagtttgataaaaattcgttagattttgagaaactt
gctgataataatcaaacacagctagtaagcctacagcgaaatttattggaactagattgt
caaagccatgctaagcaaaaagatttaagcatcagtattaattcatgtcatagtccactt
agagaagtgcaggttttacatgataagcttttggatatgatcaaagcagatcctagcatt
aagcctcgagatattttggtaatgtgtccaaatattgaagactattcaccgtatattgat
agtgttttctcaaggttttcaacagataaaaagttaccatgctcgatcgcagataggaca
ttattagattcagagcctttagctgctagctttattgagcttttgcaactaccagagagt
aactttgaggttaataagatacttgattatttatcagttccagcaattcagcaaaagttc
aaaattagcgatgagcgactagaaactattcgctattggttaaaagagtcatgtattcat
catagtaataatggtcaaaccttctcatggagttgggggcttaagagattgatgtttgga
tttagttatagtgatagtaatcatattgtcgatttaaaactaccccgtcagtctgcgact
gccaccccttcgtaccaaaggggaatatctatcaattatcaagagttaaatcaattgatg
actatacctgtgattgaaggtagtgagattgccgaacttggtggcttgtatgagttatta
gagctacttgagagatattctcaagagttgcttaaaccaagaagcttagaagcatggcag
gactatcttttggagatgtttgatgatgtctttgatgtaactaatgatgagcaatatatt
gctaagaaaatcaaagatataatcgtaaagacagtcactacagctaaagatgtattgcta
gtagaagagattgatttgtatacaattagatattgtctgatttcgcagttatctgaacca
attattaataaccatttcttaaatggtaaagtaacattctgctcaatgacacctatgcgt
aatgttccttttagagtgatagcgatgttgggtttaaataatggtaagttcccacgccaa
gaatctgcgattagttttgatttgatggcaagacttggaagagttaaaggcgataggact
aagcgagatgatgatagatatttatttctagaggctattacatctgcgcgtgattatttg
tatcttagctatattggtagaagtgttaagactaatgttgagcaacaaccaagtctaata
ctcaaagagttgactagctatttggatttgaattatggctggggaaaggctgatatcaaa
gaatatccattacatccttttagttctaaatgttatgctgatgaatacagaagttatgat
gaggcttggctgaagttattacaatcagagcctagagagttctatgatattaaaagacta
ccccgtcagtctacgactgccaccccttcgtaccaaaggggaatagatagtttgagtgta
gcttctaagctcccacaacaactatctatctctaaattagtcaaaatctttgaagaccca
attaaagcttatacaaattatggcttagaactatatttagaggatgactttgaagagcta
gaagacagtgagccatttgatataaatagtttagataagcataaatttaaacaagactta
ctaaatactcttgagaataataaagacaaagaattaacgataaaaacagctaagctaagt
ggcaagcttccagaatctgtacttactgaaaatgagattgataaggaagttgagaatatt
caaaagttattagataaggcaagtttagcaaattatgagtctaaatattttcatcaagag
atatttggatatgagttggaagctaactgttatattagagataatcaaattttgctatat
acaacttcaacttttggtattaagcatcgatttgaattatatttgacagcactattagtg
gcattatcagagcaacaagatatctctgctacttatgtttattttaataaagacaaaaat
caagcagatgctaatacttttgctataagtcatttaggtgcaaaagagttattagagaaa
tatctatcaagtgcagaaaagatagtatctaagccaagcttagtacatttagatttagcc
aaagctataatggagcatataaaagaaagtcagaaaaaagatgcaaattttgttgaaaaa
acaactaagcaaaaacaacaagcttgggagggtgcaatcaaatcttcagagtctaattac
aaagcattagagaataatagttatttcaaacttttttatagtgagcatccaaagatagaa
gattttgaaggtgaagaaatttatagagacttttttgagatcatcaataatagagattaa

DBGET integrated database retrieval system