Fastidiosipila sanguinis: C5Q98_01850
Help
Entry
C5Q98_01850 CDS
T05345
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
fsa
Fastidiosipila sanguinis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TIM-barrel_EndoS
LRR_EndoS
EndoS_Ig-like
FIVAR
DUF5000
LRR_8
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVM42050
UniProt:
A0A2S0KLY6
LinkDB
All DBs
Position
443145..447014
Genome browser
AA seq
1289 aa
AA seq
DB search
MRKKIFMRLITSVFVCAFVLSAALFNFNVAVSAMDNSSAESMTNVKGLQLPINGGYYRSW
HDKAHDPSRPNSMLDVPKEVNLVFVFPGGEETPEFWRALKEDYVPAMNAKGQKVVRTINL
GMVLKGDKTGDVINYDLDASTYAKRAQQIYDVYVAEHNVDGLDIDYEKHHTLSADGRELL
SEKDIDDATGIIKELKKILDANNKLFILDTTMKATQLDRINYERVNKIFPRISDCFDFVL
MQSYGQKEADFNEFWETYKPYIRPEQYLVGFSWYEENSPKGNQWFDVPGFGEEFLNSRAV
QEHVKWQPDNGVKAGVFSYAIERDGVAHGDNNIVKSDFSNSAKLRELMEESGDYTLLTEK
HIPDKNLLEEIKSKVGPYLRTFRLYDRDLEINNPEIESLQGLELMQNVKSLSLNGLSKVK
EINKDLLPHNIANAIPEAKNEKVFSKLKLSGLASLEKLDLSGLNLETLEFSGVEAWTSLL
EFNLSNNLLDFYEGSKNREILDTLIEHVKNNTSAGDVSLLTLFDNQKPRSFFNSAILEKN
VEVEKDSEANDVFKYIKSQETSTGRVVKDENEFNSFKEESINGTKFVANDYTFEEFKYDI
SNYNARIITHDNQIFSDTRDSGSSIINNEEEETYRVVYFDENNKVAHELKYVVGAEKEIM
INLAENAKVLGTSSMIRDYKELVPNLFDNKLNGFGDGIFTVGARDIEESPFWVAFDLGDG
AKVQKLEIWNATKADAYMLKDMNAKAGELYVLKETNPDTANLSNSEYLENDDNWEKVFSF
SDSSQLKEITNIFGQAYEKNIWKLKVTEVAGTGYYRSLALSEIRLLGQRDNTVDKSALEE
LIKTAKAESEDIKWTDETKSELLAVVKEAEMIFADEEANKGQVSNIQDKLQKAIDALVEK
PEANKDKLNYLVAMLDTIDLNDKTEESIENLKAVELKAKEVLNEKYASQEKVDQAEADLQ
KAINSLVEKTETDVSEVSKADLQKAIAEAEDVNLENVEEDENLIEFKNKLAEAKMLNELE
GLTQEQVEKATTELNEALKGLKFKEMTPDPEVPGEQEPGEQEPGENPGQEEPENPSEEPG
EQEPEEPKEPEVPQEPEAPQDPETEQPEDNEANSEPLKLDPNSPFKDINIISDEGKHTGY
TLWAEKLESSDKKEVFEIKLLDKNGNSVQPKSKISLEITIGFDIDKNEKLSLTHIKSDGT
SENLYVKINGRQVVFETDGFSKFIFAAEKLESENTTASSSMATEATSKAKSESKSTPAKT
GAITYYIPLALIALSLASVIIVVRRKLED
NT seq
3870 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggaaaaagatttttatgaggctcataacctctgtattcgtgtgtgcttttgtttta
tcagcagcactatttaattttaatgttgcagttagcgctatggataattcgagtgcagag
agtatgactaatgtaaaaggcttacagttgcctatcaatggtggttactatagatcctgg
catgacaaagctcatgatccaagtagaccaaattcgatgttagatgttcctaaagaagtt
aatttagtctttgttttcccaggtggtgaggaaactccagagttttggcgtgcgctgaaa
gaagattatgttcctgcaatgaatgctaaaggacaaaaggttgtccgaacaataaatctt
ggaatggtgctaaagggagacaaaactggtgatgttataaactatgatttagatgcgtca
acttatgctaagcgtgcacagcaaatatatgatgtatatgtagctgagcataatgtagat
ggattagacatagactatgaaaaacatcataccttaagtgctgatggtagagagcttttg
agcgaaaaagatatagatgatgctactggcattattaaagagttaaagaaaatcttagac
gcaaataataagttatttattcttgatacgactatgaaagctactcagttggacagaata
aactatgagagagtcaataaaatattcccaagaataagcgattgttttgattttgtatta
atgcaatcatatggacaaaaagaagcagacttcaatgagttctgggaaacatataagcca
tatattagacctgaacaatatttagtaggattttcttggtatgaagaaaattctccaaag
ggcaaccaatggtttgatgtaccaggttttggcgaagagttcttaaacagtagagcagta
caagagcatgttaaatggcaacctgacaatggtgtcaaagctggtgtattctcatatgct
atcgaaagagatggagtagctcacggagacaataatattgtcaaaagtgatttttcaaat
agtgctaagctcagagaattaatggaagaatctggggattatactttacttactgaaaaa
catattcctgataaaaatttacttgaagagattaagtcaaaggtaggtccatacctaaga
acattcagattgtatgatagagatttagaaatcaataaccctgaaattgaaagtctccaa
ggtttggaattaatgcaaaatgtaaaaagcttaagcctaaatggtttaagtaaggtaaaa
gaaatcaataaagatttattgcctcataatatagcaaatgcaattcctgaagcaaaaaat
gaaaaagtatttagcaaacttaaattaagtggacttgcttctttagaaaaactagattta
tcaggattgaaccttgaaactctagagttctctggagttgaagcatggacttcattatta
gaatttaatttaagcaacaacttattagacttctatgaaggaagcaaaaatagagagatt
ttagatacattaatagagcatgttaagaacaacacttccgctggagatgtatccttgtta
acattatttgataatcaaaaaccaagatctttctttaactcagcaattttagagaaaaat
gttgaagtagaaaaagactcagaagcaaatgatgtgtttaaatacattaaatctcaagaa
acttctactggtagagtagtaaaagatgaaaatgagtttaattctttcaaggaagaaagc
attaatggaactaaatttgtagcaaatgattatacatttgaagaatttaagtatgatata
tcaaattataatgctcgaataattactcatgataatcaaatcttctcagatacaagagat
tccggttcttcaatcataaacaatgaagaagaggaaacttatagagtagtatactttgat
gagaataataaagttgcacatgagcttaagtatgtggttggtgctgaaaaagaaatcatg
atcaacttagctgaaaatgcaaaagtattaggaacttcttcaatgattagagattataaa
gagctggtacctaacctatttgataataaattaaatggttttggtgatggtatatttacc
gtaggtgctagagatatagaagagagtccattctgggttgcatttgatctaggtgatggt
gccaaagttcaaaaacttgagatttggaatgctacaaaagctgatgcatatatgctaaag
gatatgaatgctaaagctggagaattgtatgtcttaaaggaaactaatccagatacagct
aatttatcaaattctgaatatctagagaatgacgataactgggaaaaggtatttagcttc
tctgattcaagtcaacttaaagaaattacaaatatctttggtcaagcctacgaaaagaat
atttggaaactgaaagtcactgaagtagcaggtacaggatattatagatcactggcttta
tctgaaatacgtttactaggacagcgtgacaacacagtagataaatcagcgttagaagaa
ttgattaaaactgcaaaggctgagtcagaagatattaaatggacagatgagacaaaatca
gagttgttagcagttgttaaagaagcagagatgattttcgctgatgaagaggcaaataaa
ggtcaagtaagcaacattcaagataagctacaaaaagctatagatgccttggtagaaaag
ccagaagcaaacaaagataagttgaattatctagtggccatgttagacactatagaccta
aatgataaaactgaagaatctattgaaaatctaaaagctgtagaattaaaagctaaagaa
gtattaaatgaaaaatatgcttcacaagaaaaggtagatcaagcagaagcagatttgcaa
aaagctataaacagtctagttgaaaagaccgaaacagatgtaagtgaagtaagtaaagca
gatttacaaaaagctatagcagaagctgaagatgtaaatcttgaaaatgttgaagaagat
gaaaatctaattgaattcaagaataaattagctgaagctaagatgttaaatgagttagag
ggtttgacccaagaacaagtagaaaaagcaacaacagaacttaacgaagcgctaaaaggt
cttaaatttaaagagatgactcctgatccagaggtaccaggtgaacaagaacctggagag
caagagcctggtgaaaatccaggtcaggaagaaccagaaaacccaagtgaagaacctggt
gaacaagaaccagaggaaccaaaagaaccagaagttccacaggaaccagaagcgccacaa
gatccagagactgaacaaccagaggacaatgaagctaattcagagcccctaaaattagat
ccaaactcaccattcaaagatattaatatcataagtgatgagggtaaacatacaggttac
acattatgggcagaaaaactagagtcttctgataaaaaagaagttttcgaaattaaactg
ctagacaaaaatggaaattctgttcaaccaaaatctaagattagtcttgaaataacaata
ggattcgatattgataagaacgagaagttaagtttgacacatattaaatcagatggcact
agcgaaaatctatatgttaagatcaatggtagacaagttgtatttgaaacagatggtttc
tctaagtttatatttgcagcagagaaacttgagtcagagaatactacagcaagttcaagc
atggctacagaagcaacaagcaaagctaagtctgagtctaagtctactccagcaaaaact
ggtgctattacctactatatacctctagctttaatagccttaagcttagctagtgtaata
attgtagtacgtagaaagctagaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system